Os10g0170600
| Gene Name |
Os10g0170600 |
|---|---|
| Description |
Zinc finger, BED-type predicted domain containing protein |
| Version |
NM_001070769.2 GI:297610164 GeneID:4348187 |
| Length |
3356 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os10g0170600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:4530882..4534237 |
| Sequence Coding Region |
4530882..4530925,4531190..4531390,4531790..4532338,4532430..4532612,4532694..4533955 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcttcgccttcaccaccgctaagctccgacgacgatgcaagatctggttcctccaactccggtgcaaaggcctgctgtcggccgccgcaaccacctataaaaaggaccaccactaggtcaaaaagccgtcttgcgattgcaggagcaccttctgcttcgactaaggcaggagctccttctgctccaagaactccagaagcttcatcttccgccaacggcctgcgcttattcaaatccatgggatttaccacgaattcaactgctggtactggttgtgggagtagcagccagcaagaatcgcagtcacttccaccacaagcagagtctgttaatgattctgagccaatacaagttgaagatgatgagccagaagatgattctgagaattttggcacaaagaggaagcttacttctgttgtttggaaggatttcaagaaagtcaaagtctgtggtgatgtcaaggctgaatgccttcattgccacaagcggcttggagggaagagcagcaatgggacttcacatctacatgaccatttgaaaatttgcacattgagaaagatcaagatggggccaaagacacttgcacaatcttcattgaggttcaattccatagagggagggaaagtttctgtggacacatacacatttgatccagcagtggctaggagagagcttgctgccatgataatattacatgagtatcctttatctattgttgaccatattggctttcgaagatttgttagtgcacttcagccattattcaagatggtgactcggaacactattaggaaggacattatggatacatatgaggaagaaaagaaaagggcattagcatatatggctggagctaagtctagagtgggtattactactgacttgtggacctctgataatcaaaaaagaggctacatggctatcacagcccatttcatcgatgattcatggacacttagaagcattatcatgagattcatatatgtgcccgctccacacacagcagaagttatttgtgaacatctttatgaagcgttggttgaatggaatcttgatgagaagatatcaactttgactcttgataactgcaccacaaatgataaggtgatttctgaactcatcaaaaagatcggcaagcgtaagcttatgctagaggggaaacttttgcatatgcgttgtgctgcccatattcttaacttgattgtgagggatggtttagatgtgataaaagattcaattgcaaaggttcgtgaaagtgttgccttttggacagccacacctaaaagagtagaaaagtttgaggaaattgcaaagcatgtgaaagttaagatggaaaacaagttaggccttgattgcaaaactaggtggaattctacctataggatgctcagtattgctttaccttgtgcacgtgcttttgaccgtgcaatacgggttgagaagctatttgattgtgctcctagtgaagaagaatgggcttttgctagtgaggtagttgataggctcaagttgtttaatgacatcactgcagtattttctggcacaaattatgtgacttccaatattcaactacttaaaatctgtgaggctaaagagcaaattaggaagtgggctgtttgtggtgattctactatagaggaaatgtcagttgaaatgattcaaaagtttgataagtactggaaagatattcaagggccaatggggttggccaccattcttgatcctaggtttaagattgactacctccttgggttcattgaaaccatcactggtcagtcaagtgaagagtgtgcaacgaaagttgctgaggtgaaagacactctatatgatttgatgaaggagtatgaagtggaagatgatgaggataacacggaatcttcagctcctccacttgtcaattctgatttattgtcttcaatcacagcacgtgttactagtaggagaccagcagcaatacgtgttaaatcagagctagacaggtacttagaggatgagttggtttcaattaatacagaaaactttaagattcttgattggtggaaagtggctgggacaagctttcctacattgaggaaggtagcacgagatatatttgctattcctgttagcactgttgcatctgaatctgcatttagcacaagtggaagggttcttagtgagcatcgtagccggcttactccagaactcttggaggccttaatgtgctcacaagattggctgcgaaacaagtatcgagctgataatgaagaagcagcaagcttttggagttgccttcaagatatccaagatcggattgagggacttgctcttgtttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASPSPPLSSDDDARSGSSNSGAKACCRPPQPPIKRTTTRSKSR LAIAGAPSASTKAGAPSAPRTPEASSSANGLRLFKSMGFTTNSTAGTGCGSSSQQESQ SLPPQAESVNDSEPIQVEDDEPEDDSENFGTKRKLTSVVWKDFKKVKVCGDVKAECLH CHKRLGGKSSNGTSHLHDHLKICTLRKIKMGPKTLAQSSLRFNSIEGGKVSVDTYTFD PAVARRELAAMIILHEYPLSIVDHIGFRRFVSALQPLFKMVTRNTIRKDIMDTYEEEK KRALAYMAGAKSRVGITTDLWTSDNQKRGYMAITAHFIDDSWTLRSIIMRFIYVPAPH TAEVICEHLYEALVEWNLDEKISTLTLDNCTTNDKVISELIKKIGKRKLMLEGKLLHM RCAAHILNLIVRDGLDVIKDSIAKVRESVAFWTATPKRVEKFEEIAKHVKVKMENKLG LDCKTRWNSTYRMLSIALPCARAFDRAIRVEKLFDCAPSEEEWAFASEVVDRLKLFND ITAVFSGTNYVTSNIQLLKICEAKEQIRKWAVCGDSTIEEMSVEMIQKFDKYWKDIQG PMGLATILDPRFKIDYLLGFIETITGQSSEECATKVAEVKDTLYDLMKEYEVEDDEDN TESSAPPLVNSDLLSSITARVTSRRPAAIRVKSELDRYLEDELVSINTENFKILDWWK VAGTSFPTLRKVARDIFAIPVSTVASESAFSTSGRVLSEHRSRLTPELLEALMCSQDW LRNKYRADNEEAASFWSCLQDIQDRIEGLALV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..44#309..509#909..1457#1549..1731#1813..3074#3166..3227#3339..3356#atggcttcgccttcaccaccgctaagctccgacgacgatgcaaggtgagcacatctagctgtcctactcccaactcagtacccctccctagacgcctacctatagtaccatatccccctccccctccactaaattcctcttccatggctgcatcattgtctcgttgagtcactaactcacgttcggcggtccacaataagggacgccaatgcggagttggaccagccatcgcatgctataagcgctgcagctgcagccacacccgctgtcgtgcctgttgctggatctgccattgttcatgtgggcagatctggttcctccaactccggtgcaaaggcctgctgtcggccgccgcaaccacctataaaaaggaccaccactaggtcaaaaagccgtcttgcgattgcaggagcaccttctgcttcgactaaggcaggagctccttctgctccaagaactccagaagcttcatcttccgccaacggcctgcgcttattcaaatccatggggttcgatttcacgctaaccctttatacattgtagcttcactttcgtaatcctaagttcctaacaatttagcatgtgcaatttattaatttgcagcttgcttgattttcttagatattgaatgttgtatttagagtatctgtagaaaattagatatctttacatgtatattgtatggttgtacattgaatgttgttaagttataaatatgttatgaacttaagtttttgaaattaaaggaatccgattctgtgtagtgtagatcataagaaatttattattctataggctgtagcagatttcagtatgatttatgtgtagagattcttcatttcaagtttgccaagattattctataggctgaaagatatattgatctatatttatttgtcatttgtcagatttaccacgaattcaactgctggtactggttgtgggagtagcagccagcaagaatcgcagtcacttccaccacaagcagagtctgttaatgattctgagccaatacaagttgaagatgatgagccagaagatgattctgagaattttggcacaaagaggaagcttacttctgttgtttggaaggatttcaagaaagtcaaagtctgtggtgatgtcaaggctgaatgccttcattgccacaagcggcttggagggaagagcagcaatgggacttcacatctacatgaccatttgaaaatttgcacattgagaaagatcaagatggggccaaagacacttgcacaatcttcattgaggttcaattccatagagggagggaaagtttctgtggacacatacacatttgatccagcagtggctaggagagagcttgctgccatgataatattacatgagtatcctttatctattgttgaccatattggctttcgaagatttgttagtgcacttcagccattattcaagatggtgactcggaacactattaggtaatttcagttcatctattatttatttgctggttttgcatttctgaaatttgattagttagtgagtttattgattaatgtttgaatataggaaggacattatggatacatatgaggaagaaaagaaaagggcattagcatatatggctggagctaagtctagagtgggtattactactgacttgtggacctctgataatcaaaaaagaggctacatggctatcacagcccatttcatcgatgattcatggacacttagaagcattatcatgaggtacatgattcacaaatgattatcctcttgtcaccatcttaaattcaacattttaatcttgctgcaatattccatttgtagattcatatatgtgcccgctccacacacagcagaagttatttgtgaacatctttatgaagcgttggttgaatggaatcttgatgagaagatatcaactttgactcttgataactgcaccacaaatgataaggtgatttctgaactcatcaaaaagatcggcaagcgtaagcttatgctagaggggaaacttttgcatatgcgttgtgctgcccatattcttaacttgattgtgagggatggtttagatgtgataaaagattcaattgcaaaggttcgtgaaagtgttgccttttggacagccacacctaaaagagtagaaaagtttgaggaaattgcaaagcatgtgaaagttaagatggaaaacaagttaggccttgattgcaaaactaggtggaattctacctataggatgctcagtattgctttaccttgtgcacgtgcttttgaccgtgcaatacgggttgagaagctatttgattgtgctcctagtgaagaagaatgggcttttgctagtgaggtagttgataggctcaagttgtttaatgacatcactgcagtattttctggcacaaattatgtgacttccaatattcaactacttaaaatctgtgaggctaaagagcaaattaggaagtgggctgtttgtggtgattctactatagaggaaatgtcagttgaaatgattcaaaagtttgataagtactggaaagatattcaagggccaatggggttggccaccattcttgatcctaggtttaagattgactacctccttgggttcattgaaaccatcactggtcagtcaagtgaagagtgtgcaacgaaagttgctgaggtgaaagacactctatatgatttgatgaaggagtatgaagtggaagatgatgaggataacacggaatcttcagctcctccacttgtcaattctgatttattgtcttcaatcacagcacgtgttactagtaggagaccagcagcaatacgtgttaaatcagagctagacaggtacttagaggatgagttggtttcaattaatacagaaaactttaagattcttgattggtggaaagtggctgggacaagctttcctacattgaggaaggtagcacgagatatatttgctattcctgttagcactgttgcatctgaatctgcatttagcacaagtggaagggttcttagtgagcatcgtagccggcttactccagaactcttggaggccttaatgtgctcacaagattggctgcgaaacaagtatcgaggtacatatgatgttttattcatacatcatgcttagcatagattttacaatgcaatggatgcaaaataattgttataattgttatcttgtagctgataatgaagaagcagcaagcttttggagttgccttcaagatatccaagatcggattgaggtattctttcaacaacttgaaattagcaatcaaactcctattgccattatttgttatatccttataaaatacttgactaattgaatatcttttgctacttctttaatttagggacttgctcttgtttga</dnaseqindica> |
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