Os02g0274900

From RiceWiki
Revision as of 11:31, 21 December 2014 by Zhangye (talk | contribs) (References)
Jump to: navigation, search

The rice OsGMST1 gene is a novel Golgi-localized monosaccharide transporter that may play a role in salt stress tolerance.[1]

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

<references>

<references>

Structured Information

Gene Name

Os02g0274900

Description

Major facilitator superfamily protein

Version

NM_001053073.1 GI:115445516 GeneID:4328999

Length

6891 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os02g0274900, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:10103586..10110476

Sequence Coding Region

10104106..10104187,10104289..10104369,10104522..10104551,10104627..10104759,10106009..10106108
,10106212..10106324,10106411..10106504,10107201..10107354,10107463..10107606
,10107702..10107775,10107849..10107937,10108711..10108825,10109581..10109763

Expression

GEO Profiles:Os02g0274900

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008395:10103586..10110476 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008395:10103586..10110476 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgcggtggaagcttaagtcgtcggcgtacaagcgcgtgccgtccagggacgccgccatggatctcgacgtcgagacgccagcgaaaatggcggacggcggggccccgtcgtggcgcatgtcgctgccgcacgtgtgcgtcgccacgctcacctccttcctcttcggcttcgccgggaacaccctcgccgaaggccttgtggtgagcatctgcctgggtggtgcgtttgttgggtgcctgttcagtggatccatcgctgacggaatcggcaggcgtcgcgcgtttcagctcagtgcgctgcccatgatcatcggcgctgccgtaagcgctctcaccaatagtctggagggtatgcttcttggaagatttttggttggaacagggatgggattaggtccaccagtagcttcactgtacataacagaggtttctcctccttcagtgaggggcacatatgggagctttgttcagattgcaacctgccttggaatcgtagtatctctcctaattggtacacctgtgaaggatattgatagatggtggagggtgtgtttctgggttgcagctgttccagcaactttacaagctcttggaatggagttctgtgctgagagcccccagtggctgtataagtgtggaagaacgactgaagcagagatacaatttgaaaaacttctaggtcctcttcatgttaagtctgctatggcagaactctcccgatctgaaagaggcgatgatggagaaaatgtgaagtattcggaattgttttatggtcgcaactttaatgttgtttttattggcacaacgctctttgctttacaacagttatccggcataaattctgtgttctatttctcatcaactgtgttcagaagtgtgggtgtgccccctaaccttgcgaacatatgcatggggatagcaaatttatcaggctcaattgtagctatgcttctaatggacaaactaggaaggaaagtacttctttcagggagcttccttggcatggcctttgcaatgggacttcaggctgttggagcaaatcgtcaccaccttggttctgcaagcgtatatctttcagttggtggcatgctattgtttgtcttgacattttcgttaggagcaggtccagtgccaggacttcttttgcctgagattttcccaaacaaaatacgggccaaggctatggctctgtgcatgtccgtgcattgggtggtaaatttttttgtcagtttgttgttcttgcggcttctggagcaacttggtccacaagttctgtacacaatgttttcctcagcttgtgtggtagcagcaatatttgtgcggcgccatgtggttgaaacaaagggaaagactttgcaagagatagaagtttcgcttctacaaacacaataa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MRWKLKSSAYKRVPSRDAAMDLDVETPAKMADGGAPSWRMSLPH VCVATLTSFLFGFAGNTLAEGLVVSICLGGAFVGCLFSGSIADGIGRRRAFQLSALPM IIGAAVSALTNSLEGMLLGRFLVGTGMGLGPPVASLYITEVSPPSVRGTYGSFVQIAT CLGIVVSLLIGTPVKDIDRWWRVCFWVAAVPATLQALGMEFCAESPQWLYKCGRTTEA EIQFEKLLGPLHVKSAMAELSRSERGDDGENVKYSELFYGRNFNVVFIGTTLFALQQL SGINSVFYFSSTVFRSVGVPPNLANICMGIANLSGSIVAMLLMDKLGRKVLLSGSFLG MAFAMGLQAVGANRHHLGSASVYLSVGGMLLFVLTFSLGAGPVPGLLLPEIFPNKIRA KAMALCMSVHWVVNFFVSLLFLRLLEQLGPQVLYTMFSSACVVAAIFVRRHVVETKGK TLQEIEVSLLQTQ</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>521..602#704..784#937..966#1042..1174#2424..2523#2627..2739#2826..2919#3616..3769#3878..4021#4117..4190#4264..4352#5126..5240#5996..6178#aaaggaaccaacagaagcaaaggtggcattcgttcgtcgcacgagagcaccacagcctcacgacacgagctcatcccccgccatctccgctccgctcctctcctctcctctccgtgctacgccaccaaacccactccccccgagatagagagagagagagagagagatccacagcctcacagcatcaaatcacctcccctttctcccagatccaagccgccgccaccaccccctcgccgtcgccgtcgccccctccggccgatctgatgcccgcgcacgcggcggtggtggtcaggtaactttgtaggccgcctcctcctcgattttttgatttttttttcttctcatgtgctaaccacgccacgccaccaccgctattaatacatccccgaggcgagtgtcgaggcatttaccaccagatcgatctcgccttccgctttcccaaatccctagactgacctcctcctgctgctgcttgcgttgcgttgcgttgcgttgtctctttctccgatcagcgccgatgcggtggaagcttaagtcgtcggcgtacaagcgcgtgccgtccagggacgccgccatggatctcgacgtcgagacgccaggtccgtgcacggttttttctctttttttttccctgcgatttttttttgggtggtgagattttgaggttttttttttctgtgctcggtggcggtttctgcagcgaaaatggcggacggcggggccccgtcgtggcgcatgtcgctgccgcacgtgtgcgtcgccacgctcacctccttcctcttcggctaccactccgggtgcgtgccatccattttctcatttcttcttctggttgtggttgttttcccaactcacggtgtggagcgcgtgcgtgtgattggttggtttggtgcagggtcgtgaacgagccgctcgagagcatctccaccgacctcggcttcgccgggaacaccctcgccgaaggtaagtaagcagccacgattcgggtgaaatttgatgttattgggcatgggagcaattgggtgtcctgtgtttcaggccttgtggtgagcatctgcctgggtggtgcgtttgttgggtgcctgttcagtggatccatcgctgacggaatcggcaggcgtcgcgcgtttcagctcagtgcgctgcccatgatcatcggcgctgccgtaaggtaattcgtggtgtcccacttctgttgacggctacttcctctcaatccttagtccatgcgtggtaatttgtggtgtcacacttctgttgatggctacttcctctgaatccttagtccatgtgtggtaatccatggcatcacacttctgttgatggtcacttccactaaatcctagtccatgtgcagtttggtcagtttggaatgtatttaattgccacttgctagcatttcttattttctagctggagttgttggtttcttggtgttaaacaaataaggtcagtggccactggtagcctggtttcttgttggtattgtatactttatttggaaagttgaatgttgggaacaacaaacttactctttcttatgtatcatattgatatattggtggtgtgacaagtagtagcttgatggattcgtccttccatgggattttgaatctccgagttatgtaggagatgaataaaatgtgtggtcctcttaacacagtgcagagagtagtatattgagaatactaggtttgccatcccgccattaggtaaatttatatggtttcttcgactgactgtggagctagtgtaacttcacatgcaaacatgaaagcaatcgaactttacgataaattgactttcactagccacaatagactgaagagtactgaaaattaattacacgcatcttctagaaaaccatggctcaatagtaaatattcttttcttaattgcgctcatgatgtacttagattgattatccttaaaaagggaaaagttctagcctttcaataattcaacactcttattaattgatagctagtgtacgttttggatatagcataccaagtcacttatgggtgttaagtcttggtttatttattggtgctgtagagttgctgataagttgaataataacaacataaaccatatgtgctctgattaccttgaggtgcttttacattgccattgctacatggcatccacaaactaaagttcacttaagtgcattgaatgataatatttaagatgctaacctttttttgaatctttagcacttttatcttctgcatgttatttaataggatccgttttggtagttgcaccaagactgttatttccgaaaatgcaattgtgtaatacttacatctatgagcacctaatacttgagagctgccggaaggaactatgcctgaacttagttattcctatgattctgtttcattgaaccttcctgaagaagaaacattttgcagcgctctcaccaatagtctggagggtatgcttcttggaagatttttggttggaacagggatgggattaggtccaccagtagcttcactgtacataacagaggtatgtaattggtgttatgcacctatgcctcaatctctgattgtctgtatcaaatattaatcttattcatttgtacctttttcttataatcccttggatccaggtttctcctccttcagtgaggggcacatatgggagctttgttcagattgcaacctgccttggaatcgtagtatctctcctaattggtacacctgtgaaggatattgatagatggttagatgctttcttctgtagctctctacatgttttgtgtagttagtaaatctgatgcatctaactttatcctttgctattaacaggtggagggtgtgtttctgggttgcagctgttccagcaactttacaagctcttggaatggagttctgtgctgagagcccccagtggctgtataaggtgtgtttatcttgggggaagctgcttattttctatctatgatcttccaacttaaatcacccttcaggtgtctgattctctataattgtgcttcggcaaatttgatcttaagtgcctttgctagtcgtaaaatgagatactcatatttgaggaccatcttggagtcactttgtcggaaacgacatttgatctcttaaactatatgcaaataccacatgctgatttttccatgaatgtttgaaggtcactgtcgtattaaatcaaacaattaatctgttggttagaacttgcaatctaccatcatcctgaggttttttgtgcttacaattaataatgggttgacacaaacttattgcctattgttacttagatggtaacacgaatgatatctatagaagagtagtccattggcacatattggtatttgcttcagaaagcacacattagattttcggataaatatcgttgatctttagtttcctcaatactgtgcctgttttctgattgtgcaccatgcaaatacagctctgatatgagcaaaacattttattagttttttttctgagaaaaccaattctcaacacagacttatacaactcccatacttctttatattggcaatttgtattgacatatttatatttaacttgtagcacatacattgaaaattattgacgagtcttatcttttattcagtgtggaagaacgactgaagcagagatacaatttgaaaaacttctaggtcctcttcatgttaagtctgctatggcagaactctcccgatctgaaagaggcgatgatggagaaaatgtgaagtattcggaattgttttatggtcgcaactttaatggtacaagctgttatgtgttttccattctgttgtgtatttgcgctaaactataaccttatttatgtttggccttgaagtttgttcattacaagtccctttttgctacagttgtttttattggcacaacgctctttgctttacaacagttatccggcataaattctgtgttctatttctcatcaactgtgttcagaagtgtgggtgtgccccctaaccttgcgaacatatgcatggggatagcaaatttatcaggtgggctcattggagcatcttctctttttttctgttgttctactgttctgttatattgatggttgatggattttgtttgatgtgtttgcttccaggctcaattgtagctatgcttctaatggacaaactaggaaggaaagtacttctttcagggagcttccttggcatggtaagctatcactgtgattggaacttggaagataatgttgaacattactcactgcacatctttactgctataggcctttgcaatgggacttcaggctgttggagcaaatcgtcaccaccttggttctgcaagcgtatatctttcagttggtggcatgctattgtaagttttagaattttatgtcttccgttactttgattctactatctttcaagttatctgaatttagttattaatgtctaggaggctaaactaaatagctgtgactactagttgaataccttaagcaggaggttttatgctcctattggttaagccaatttatgctacatttttgtgccaaatgtgccaatatcaggcttaaaaatatgcaaaattctctacttattgtatctacaaataggattttttttatggtgctctaaatttgttcagaccatccatttcacatcaacccaaaggatatcatttctcttatacctcattagaggtaatagattataagaaggatggaaacaaattattcaacctgatacaaaacattgttgcgtataaattcttccaagaacttgttcaggcaaccttttggttgcatatggtggaacaattctgtgtcaatatatcgatctgacatgtaaatggcactggggatatcagttgcatacatgatattgttctgctttgcagttgtttcattttgattcccctgacttcaccctcagcgttgttgtgcatccttagttattctttatatgaacaatagggctttccatttggtttaatttgtaactagttaaattatgagacagtttacctttatgctgctcttagcagaactctttaattgttcctgacaattatactttactggctcattaagtacaaatgttatggtaagtctaccagtttcttatagttgagtgcttctttttcaggtttgtcttgacattttcgttaggagcaggtccagtgccaggacttcttttgcctgagattttcccaaacaaaatacgggccaaggctatggctctgtgcatgtccgtgcattgggtaaggagttatgtttccatcacaaaaaaaaaaagacactgcatgtctgtgcattggataggagttcatttttcatcctcaaaaaatagacactgcatgtcaaaatgctggcagttagatcaaacagtgaaattcaacgtggaaatttcgttgctgattttcactttttggtttaatatgttaatatttggtattatgtgtctatgcatgtttcctgttccattaggatgtttaaaaatatgttactgctagtatgtaaccatagctgttcacattgttcaatgataaaaggagcctagtgctaaatacctggtgaagaatttgagctgttgtttagtcaggctgagctagaacaggtatattagatcaattcaaaatattcaagctgctaagtcctcaatagcatttccacactgttttaccaaccctggttatggtaatgaagatcagaatttcagaagtatatttgactctgtaagctgcagctttctctgtgtaacaaaatcgtttcccccaatcgccataagataaaaggtactgtatgctgttaataataaatgaataatggggccagatttttaaattagataataaaaaacttagacatttcgatatggttgattatgtaatggtaaatgataagtgtagggttgcaacaataatttggtagggcgcactatttacttgccatggttcattgtagttctaccatgattcgtatcgacgtcttgacatgctatgcttaaatgctgcaggtggtaaatttttttgtcagtttgttgttcttgcggcttctggagcaacttggtccacaagttctgtacacaatgttttcctcagcttgtgtggtagcagcaatatttgtgcggcgccatgtggttgaaacaaagggaaagactttgcaagagatagaagtttcgcttctacaaacacaataaaggtgctaatcttattctgaatctgacaacacaatttggatctgttaatctgtcttatctaatcttgtctttaacgtggcaattttttatttaaaggtggtttgcgagttgcgatgcacatttgaaactcacaagatgaactgcctggatttttagttgatatttcatatggccatgttgatagcaagcttggttttggaacttgatgatttaccatgtggtattcaggattaacaagcagcaatactctttcattgcagatttcatcagcgagtttgaggcaacaacaacctacatgattagcatctgacactatacttgttgctgaatacctgctgggaaagtctaccgtgaaagttgatcactgaaccaagccaacataccacggacaggcagcgccctacactggaccagggaagtacccagacatgcacctgtgaccagtaagggcgacctagctcgtgcataaaccatccatgtagtgaggttgcatctgtatagttggtcttctgctagatgtatctggtaatctgtgttgtcttcatcatttgtcatttgtacactgtcagtatggagaaaaaaagacgggaagtgtggttactgatggccatagtttgaaccgtggatacgttttttttactgtttaaagaggaataacagcactggctctgccagctacatgaaaataaagtgcgttctgcctgagctaattt</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os02g0274900, RefSeq:Os02g0274900

  1. 1.0 1.1 Cao H, Guo S, Xu Y, et al. Reduced expression of a gene encoding a Golgi localized monosaccharide transporter (OsGMST1) confers hypersensitivity to salt in rice (Oryza sativa)[J]. Journal of experimental botany, 2011: err178.