Os03g0223700
| Gene Name |
Os03g0223700 |
|---|---|
| Description |
Armadillo-like helical domain containing protein |
| Version |
NM_001055960.1 GI:115451648 GeneID:4332109 |
| Length |
8067 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0223700, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:6495679..6503745 |
| Sequence Coding Region |
6496117..6496203,6496811..6497077,6498317..6498385,6498950..6499078,6499161..6499322 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008396:6495679..6503745 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggccgccgacgcgctctccatcatcccgggcgccgtgctgcgcaacctctccgacaagctctacgagaagcggaagaacgccgcgctcgagattgaggggatcgtgaagcagctggcgacgtcgggagaacatgacaagatatcagcagtgatcgctctgctcaccaacgatttcaccatgtcgccccaagcgaaccatcggaagggcggattgattggtcttgcagcagtcacggttggactcaccagtgaggctgctcaacatttggagcaaattgtgcctcctgtgcttacctccttcctggaccaagacagtagagttcgctactatgcgtgtgaagcactatacaacatagcaaaggtggtaagaggggatttcatcatctacttcaacaaaatttttgatgcattatgcaagctttctgcagactctgatgctaacgtgcagagtgctgctcatcttcttgacaggcttgtcaaggatatagtaactgagagtgaccagttcagcatagaagaatttataccactcttgagggagcgcatgaatgtgttgaatccttatgtgagacaatttttggtggggtggataacagtgttagacagtgtgcctgatattgacatgcttggtttccttcctgattttcttgatggtttatttaatatgctgagtgattccagccatgagattaggcagcaagcagatgcagcactttctgagtttctgcaggaaattaaaaattcaccaaatgtagattatggtcgtatggctgaaatacttgttcggagagctggttcttctgatgaattcactcggttgacgtctatcacatggattaacgagtttgtcaagcttggtggggaacaacttgttccttactatgcagatattttgggagccatcttgccctgtatttctgatcaagaggagaagatcagagtggttgcgcgtgaaactaatgaggaactttgtgctataaaagctgatccaactgaaggatttgatattggagccattctctcaattgcaaagagggaattgaatagtgaacacgaggctacccggattgagtcattgcattggttttccactctcttagttcgatatcgtgctgagttcttggcatacttgaatgacatcttcgatccactcctaaatgcactctctgatccttcagatgcggttgttctattagtgttggaagttcatgcgcgcatagctgaagagtctcatcactttcatcatcttgtatcctacttaatccacacttttcacaacaatcatgttctactggagaaacgtggcgcattgatagttcgtcgactttgtattcttttgggtgctgaaaaagtttatcgagagttctctactattcttgagaccgaaggtgaccttgaatttgcatccaccatggttcaggccttgaatttaattttgctcacatcaaccgaacttgctgagctgcgttctcttcttaagaaaacattggttgattcttgtggcaaggacttatttcaatctttatacgcttcttggtgtcactctccgatggctacaataagcttgtgtctacttgcgcaggcatacaatcatgcaatttctgttatccagtctttgggagaggaagatataaatgtgaagtttctcgtgcaactagacaaattaatccgtcttttagagactcctgtatttgcttacttacgtttgcagcttcttgagcctggaaaacatacctggcttctcaaaacactttatggtctcctgatgctactgcctcagcaaagtgcagccttcaagatcttgagaactcggctgaagactgtgcctttcagtgaaaatttgaaacgcacatcttcaacaaatccatactctcagattctacaagtgacagaagatggtaatcgaaatcacgacactcagagctacaatgcaatcaatttcccatcccggctccaccagtttgagagcatgcagcagcagcacagagttcatctaaagaatcaactgcaatcccaaaaatctgcttcagctatagtattatcacaggaaattcaaagatacgaagaagcacattcctcttcgacatcagagattggcaggcccccttcgagaacatccagaggcatttcatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAADALSIIPGAVLRNLSDKLYEKRKNAALEIEGIVKQLATSGE HDKISAVIALLTNDFTMSPQANHRKGGLIGLAAVTVGLTSEAAQHLEQIVPPVLTSFL DQDSRVRYYACEALYNIAKVVRGDFIIYFNKIFDALCKLSADSDANVQSAAHLLDRLV KDIVTESDQFSIEEFIPLLRERMNVLNPYVRQFLVGWITVLDSVPDIDMLGFLPDFLD GLFNMLSDSSHEIRQQADAALSEFLQEIKNSPNVDYGRMAEILVRRAGSSDEFTRLTS ITWINEFVKLGGEQLVPYYADILGAILPCISDQEEKIRVVARETNEELCAIKADPTEG FDIGAILSIAKRELNSEHEATRIESLHWFSTLLVRYRAEFLAYLNDIFDPLLNALSDP SDAVVLLVLEVHARIAEESHHFHHLVSYLIHTFHNNHVLLEKRGALIVRRLCILLGAE KVYREFSTILETEGDLEFASTMVQALNLILLTSTELAELRSLLKKTLVDSCGKDLFQS LYASWCHSPMATISLCLLAQAYNHAISVIQSLGEEDINVKFLVQLDKLIRLLETPVFA YLRLQLLEPGKHTWLLKTLYGLLMLLPQQSAAFKILRTRLKTVPFSENLKRTSSTNPY SQILQVTEDGNRNHDTQSYNAINFPSRLHQFESMQQQHRVHLKNQLQSQKSASAIVLS QEIQRYEEAHSSSTSEIGRPPSRTSRGIS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>7543..7629#6669..6935#5361..5429#4668..4796#4424..4585#4226..4346#3976..4091#3142..3207#2813..2894#2577..2668#2367..2474#2174..2260#1891..1985#1670..1812#1540..1568#1333..1452#1170..1259#723..788#524..637#330..422#gcagccgcgcccggatccccacctcctcctccccctcctcctccagatcacaccaccgtcgtctccaacctccaatccattgagataggcttcgccagggtgccccgcgagcgagcggaggtgggcttaggtctctagggtttggcggggcgcaccccctcgtggtctctcgtcgtcgccttcgcctgttcggggggctagggttgcgtcgacggtggggggtgggggtgcgggtgcggggggcgggcggtcgatgcggcgatcgcgggcgatcgggagggtgtagcggcggcaggggaggggggatctccttggcggtttgttcggagatggccgccgacgcgctctccatcatcccgggcgccgtgctgcgcaacctctccgacaagctctacgagaagcggaagaacgccgcgctcgaggtgagggatttcggctcgtcatagggggtctggttttggaacaatcgacgatggatttgagctggaattgtttttgttcgtggtgggctgtttgtgtatagattgaggggatcgtgaagcagctggcgacgtcgggagaacatgacaagatatcagcagtgatcgctctgctcaccaacgatttcaccatgtcgccccaagcgaaccatcggaaggtttgcttacatcgccgtcatcttcatattccctgctattggggatcagatttgttgaagttctgtggcgcttttttgttagcagggcggattgattggtcttgcagcagtcacggttggactcaccagtgaggctgctcaacatttggaggtctgttagctctttactggtcttatatccccgttgatttctctaatttaatcaaattgctattctgtgtatgctgaactcagtgcttgggatttagtattaaattttaagcagtgtttggttgtactgctaactggacaaaaaatagctgtagttttctttcctgatggtaaaacctaccagttttcaacacaccatataatcttgtccatggattaatctaagtctaaattgtttacttttgtatgttatagtatttacttgagacatctatcctgttaagttagggctatgatggactgcgtttcaggtcttcattaatggtgtgttctatcaagtgtcattttggttgcattaaacttttttgctctattcttccagcaaattgtgcctcctgtgcttacctccttcctggaccaagacagtagagttcgctactatgcgtgtgaagcactatacaacatagcaaaggtaaacattttgtcaagtaatggtacatgaattatgcgtttgctttgctgcattaatcttttctttattgtaggtggtaagaggggatttcatcatctacttcaacaaaatttttgatgcattatgcaagctttctgcagactctgatgctaacgtgcagagtgctgctcatcttcttgacaggcttgtcaaggtacgatcgtttgggcaactgatacatcctgtacgtattgcatccttgattagccctgataaacattgtttgtaatttataaaccaggatatagtaactgagagtgaccagttcaggtatgctacatatgtgatgtcctttttcaatctcaatatcatgcacaacttaatctagtatcgatttctgatagttcctgtatcttaattttgctatttagcatagaagaatttataccactcttgagggagcgcatgaatgtgttgaatccttatgtgagacaatttttggtggggtggataacagtgttagacagtgtgcctgatattgacatgcttggtttccttcctgattttcttgatggtaatgcctctcttacttttcaagtatattacttattacgttgacagttcagcaaccttttatttgtcacccctgcaggtttatttaatatgctgagtgattccagccatgagattaggcagcaagcagatgcagcactttctgagtttctgcaggaaattaaaaattcaccagtaagtccatcctcattgaaattgcttgtctatctgtatcagtcactgaacagtgagatgcaatgcaacatatgtatcttgcccgatgaatatccctttaataactttgtcttcatttataccacaaaattacatttttcattttttgggtatgcttccaatgctgatttgcaaccttaaatgaaaagaatgtagattatggtcgtatggctgaaatacttgttcggagagctggttcttctgatgaattcactcggttgacgtctatcacatgggtatttcttttgtcttctatgttttcttttgttaattttgatatcgaaatctaaaatatttagtctactttgatacacctgagtaatattttgtcacattctgcagattaacgagtttgtcaagcttggtggggaacaacttgttccttactatgcagatattttgggagccatcttgccctgtatttctgatcaagaggagaagatcagagtggtaattccctctcttctttggacacagacaattcttgaagatgtagcctgcttgtctgtcggaagtcatttctttaatctttatttactttttgttggctaggttgcgcgtgaaactaatgaggaactttgtgctataaaagctgatccaactgaaggatttgatattggagccattctctcaattgcaaagaggttctctactaaaccacttgcataggaaatttggtttcatgccgatgtatctatattcatggatcaagagttaaaaatatgtgcagtcacttgtaacatggcatttgtgaaataacaccgagcctttttcaatttcaatttcagggaattgaatagtgaacacgaggctacccggattgagtcattgcattggttttccactctcttagttcgatatcgtgctgaggtgctcaactatgatgctttttggggctacacaacatatattttaacaagctgtacctgcataatttgttcacatttaattttttatggactgtgggaggtttttcttcagacccttaggatttagctcaatttaaactctctcctgaaagtcccaaaggaatccccctctaacatggacatgtggtacacacagttcaaattcattattggatggtttatgttaatatttttttcttgtgtaacagttcttggcatacttgaatgacatcttcgatccactcctaaatgcactctctgatccttcagatgcggtgagctctcttacaaagcctttgaaactgcaccttttcattacaactttctgtgagcagctgattaattgctttatttgttatacaaatgatctgtgaccaagtcttgaaataaaatcaatgaaggtttaacttagtgagaacagtgtgtgctaatttattttttgacttggtgcaaatttagtgcatcgtgggcctattctttcttccatggataatataccaaggggttacttcatcccttcaaatgtttttttataagtaaccctcatggccctatatcagccatctgagtgtttggctttccaaaacatatacaattacacagacatgattgcgcttgcagtatagaaaccataatgggatgcttttcagtgttggcgttggcaatgattgaatccattttcgcttgctgttggcaaggatagatttgctgttgtttcccttccaaaaagaaaaacacctgctgttcttgccattggatttgtaatatcctttgtttcataaatcttaataaagtctacttctccattgtcacctgggcttgacacaattatatgatagctataaataaccttcacatccccccaaccaccactgccaccaaaaaggaaaaatcatgctaaccctttgcatcatagttcaataaatgactgatgggctgatggctttatagggttattgaccattaatattttgctaattcaataaatttgttgtaccgtatcagagagcttggctattgtcatcacattttttcatgtgcaggttgttctattagtgttggaagttcatgcgcgcatagctgaagagtctcatcactttcatcatcttgtatcctacttaatccacacttttcacaacaatcatgttctactggagaagtatgcacatttccccactcaaaagttgattacatagtatatgtttctttgttattagtcctacttttagggttacacagttcactattacataaattgcttaccaaacaatggtttatgacatacttatacagacgtggcgcattgatagttcgtcgactttgtattcttttgggtgctgaaaaagtttatcgagagttctctactattcttgagaccgaaggtgaccttgaatttgcatccaccatggttcaggtatcccccactgttgcaacactatactactgcctaatttaactgtagacattccgtaactgttaaatttcttgtaggccttgaatttaattttgctcacatcaaccgaacttgctgagctgcgttctcttcttaagaaaacattggttgattcttgtggcaaggacttatttcaatctttatacgcttcttggtgtcactctccgatggctacaataagcttgtgtctacttgcgcaggtaatgaccaacttctaacttttgcagtttgtgtttcttacttgggcactgatctttggatgttcttttccaacatgtgtaggcatacaatcatgcaatttctgttatccagtctttgggagaggaagatataaatgtgaagtttctcgtgcaactagacaaattaatccgtcttttagagactcct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| External Link(s) |
