Os03g0236966

From RiceWiki
Revision as of 12:28, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os03g0236966| Description = Conserved hypothetical protein| Version = NM_001186407.1 GI:297721944 GeneID:9267792| Length = 8641 bp| Definition ...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os03g0236966

Description

Conserved hypothetical protein

Version

NM_001186407.1 GI:297721944 GeneID:9267792

Length

8641 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os03g0236966, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:7261914..7270554

Sequence Coding Region

7261922..7262311

Expression

GEO Profiles:Os03g0236966

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008396:7261914..7270554 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008396:7261914..7270554 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgtgggatacaaaattcggtttccctccagcagcgccgcccaccaccgccgccgcagcgcagaaaaatcccaagcggaggagagaggcggaggcggagggggaggtggcggcggagatgagggaggaggcggtggagcggctgcgcggggtggtgcgggacagcgtcgggaagcacctgtacgcgtccgccatcttcctcgccgacaaggtggccgcggccacgggggaccccgccgacgtctacatgctcgcgcaggcgctcttcctgggccgccacttccgccgcgcgctccacatcctcaactcctccaagctcctccgcgacctccgcttccgcttcctcgcagccaagtgcctcgtgagcttccccacccacgcccttgtttag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MWDTKFGFPPAAPPTTAAAAQKNPKRRREAEAEGEVAAEMREEA VERLRGVVRDSVGKHLYASAIFLADKVAAATGDPADVYMLAQALFLGRHFRRALHILN SSKLLRDLRFRFLAAKCLVSFPTHALV</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>9..398#agtggcgaatgtgggatacaaaattcggtttccctccagcagcgccgcccaccaccgccgccgcagcgcagaaaaatcccaagcggaggagagaggcggaggcggagggggaggtggcggcggagatgagggaggaggcggtggagcggctgcgcggggtggtgcgggacagcgtcgggaagcacctgtacgcgtccgccatcttcctcgccgacaaggtggccgcggccacgggggaccccgccgacgtctacatgctcgcgcaggcgctcttcctgggccgccacttccgccgcgcgctccacatcctcaactcctccaagctcctccgcgacctccgcttccgcttcctcgcagccaagtgcctcgtgagcttccccacccacgcccttgtttagtctgccattttgtcgaacatgttgggtgcatgctgtgtgtagatagaaggtttagtttcactgcccctgttaatgttccagtgcgtggctgcgcttgagcttccttatgaacagcttgtggttgtatggtggcctcaatgttctttcactctgggcattgtttggcagtttttttgacgatttgattctgtgtgtttgcaagcactcgataaaattttgcttgatcagcttttagctttagctgtatgagttgagatagggtcgtttacttcacacaaggtgcgcccaatggcttgcactgggggatttcatttttttggcttcaagtccaatgctctgctgatgcttcaaaataattaacatgatacacctgcattttctcgaccagaatatttttacttgggcattccatcaatgaacgggtgcttagcttggttcttaatagctggtctgatctgggagtttggttgattataatatgtgcttcctgcttcggacttttagataaatgagaattttgtttaagttctatatatgtcagatatataaactgcacatatgattttgactgcttattcaatcaatatccatgacactcgaaacaaaaatctggtttcttataggaaagatcaaaagaactgtataggattagtgatttttttaatgtacttctaagattttactttagaaaattgaaccataccagaaaatattatgattcagtatagatttttctgatttgtgctctggtgtacagtcctgtgtagtcctttattttatctaccgtctttccttttatcttagctactgtttcatcgttttgttttggtttgttaggaggagttgaaagaatggcatcagtgtttgatcatacttggagatgcaaaaatagatgagcatggaaacgttgttgatcaggatgatggcagtgacatttactttgataaggatgctgaagaccatgagatcaatgtgtgttgactcttctttctcttccccatgcctctctctctctctcttagtatggtgattgatagtaatatttgcttgccagatcaaagcggcaatatgttttttacgtggcaaggcatacgaagcactggacaactgtgaccttgctcgacaatggtaaagcatcatttcattttttgtctaattgagtgtattcagtggttctggtgaatgacgatgcagttattttgaagtctttcttctcttacaccttttactcaatatcttcactgagaatgttgggttattcgatactctttagaagatataaagaaaatgagtttttcttgtaaaacgaggacacactgctaatagttgaaataactgttgctacctggaagtactgctaattttctttgtttgaaattaagatttaagcaggattgtctaatcagtgtttttttttgggcatatctggccaaatagcttggttaagatggttttatggctttgttctgctgttatctcaggtacaaagctgcagtgaaggctgatcctttgtgctatgaggtgagaagaatcatgtgactctttagtacaataccttttcaattacatgaaccaccattattttgtatttttggttctactaaatatggaatttggcatccagatgctaacatggaattgggcctctgtggtaaccccagttagttcattcctaacttcttatgtctgtacatggcaggcccttgaatgccttgttgataactacatgttgacatgcgaggaaggtaagttttacaaaatcaatcttcccatctgtcatgtccatcctcttaggatatttcttttaaataatacaatgtttattgttattactggactagttttaagaagatatgcttaatgttggaccttcaatcctctctttgttcttggtacttattgttatgcaatgatatcagaatctgagctattgtcctctctaaaatttggaaaagaagatgggtggctctcagcattctactcttgtttgataaggaaggtacacgacttattaactgcattgctttgcaatttaataaacaatatgtgtatctgcattcacttatatttcttttgatcatggtttgttttgttttatggctttagcatgaaaaagaatatatagtggaagcaaagttcaaggaatttgaacgagaatcttgtagtatttcatctttgagttcaggactgacactgaaaaataatattgacgtgttggcttgcaaagctgaatactatcatcagagtggagagtaccaaaaatgtttcgaactcacatctgcgtaagttggtaaatgattcattgtcggtacatatgtttccttgatcaatattggtttatcattcttgtgatgctatatgtgcctcaggttacttgaaagggacccttttcatttgaaatgcacgttagttcatttggcagctgcaatggagcttggccattcaaatgacctttatattttggcctgcaatctagtgaaggactatcctcagaagtgagtattcccactggcctgcccacattcagacccacataatatttgttatcctgctagatgggcttttccccctttcatttgcatgtaacaatcttagatataatgacagtgttgtgcacattattcatctttctgcaaactttaatgcaacttgtaaaatctagcctttaatagcatcgggattggggtaaaatatgttaactgacctttatttatgtgatgaacaagaagagattgacccccccccccccccttcatgttggttatatagactccaatagttggagggacataatactaaagtacacttgattgtttgtagtcagacatgagcaaacaaagtatattattttaatgtcagctgtggttccatctgtagagctctttcctggtttgctgttgggtgttattactactgtattaagaagtatgatcaagcacgcagatactttgggtaagcatattcttctcttaatttctactgtattatttttatttgaaccttcactatgcatttttgccttaggatagcttagaagataatcctgctgtgccttcgatgttgggatgtaaaataaaatagggtgtgattagtgaatatcctctgcactgcaaatcacaaccatgttcctgcgtaaggcaacacttttgtcatgaaaacatggcagacatggtataacatgtgtgctacaatagtgttaccatctgatggagagaacagtgtccataggtgccattgcctcctgaaatctacgcatatccaactgactgattgatttcttataacaaacaatatatttctttgttaaatatttttagttgtctggaatgatagaacaatgtgataaaaagacagaaatgagtaggttctactcatgtagtatcagtctgtcagatggtttgtaaggtgaaacatatctgtccaataattctccagagtccaagttcaaataaacaatatatattttcttaagacatgtgtctcagttataccagtccaaaggttgcaggttattttgtttcttatttgttcaatgctcattgttcattgaatttaatcatggatgggtttaaccctcttacaacttcttataccttgtattcttgttcaattttaagtagctgtaatatgttttgcactaatatatttcctatcagcaaagctacagggttagatgggacatttcctcctgcttggattggtactggtattgcttatgctgcacaggaggagggtgatcaagcaatggctgcatttcggacagcagctcggctatttcctgggtcagtaattcctttcgaagtaattgtttgtgtaaaaaaacttctttatttgttatgttattatgctgtgtacagtttagcaaaatattaattaaattaatttgattctttttacacttaagtcaactcaatattaacaccagagcatacttgtacttgtttgtctaaggagcaattatcttaacacaattagttgcattaattttcctttgtactatctttcaattgttttggccttttattctggaaattgatattcgtattttttttgggtgtgacaagcttttgtatctgctatgcattaccgattatgagcattgtggatcctttctactttctttcattttttggccttctgttctggaaactgctattcgtgttttttgggacactggcaagcttttgtatctactacacattactgattatgagcattgtggattgagttcctctctttgttttggagtgtagattcttgttgcacttcaattacttcacctctgttgttgtctgtccttcggctcactatttgttgaaattgttttctatttcagatgtcatctgccaactttatacatgggcatgcaatatttgcgaatgcacaatttcaaacttgcagagcaggtaataacttgagaaatcctaccgagactaattttcttatgaggcttccactctgataaagaaactatacttagagctgacttttttccctatattttctcattccatattttgtttttggcaaaaaaggaggtttaatgtggtaatagtagttggtcagatgctgaaaatacatcctgtatttgtaatattggatgggttatagaaaatgagatattatcatgcacaacttccttttacttagtgaatactgtttgttgtagctcacaatgagagcctatcatggagagtatgttatttgcaaagttttatttggcaaggcataatagttttgtcatcatttttttaaacccccttttctttctgctgtgatgcagttcttcacgcaagcaaaatctatctgcccatctgatccgcttatatataacgagatgggggttgtagcttataatatgaaagagtaagagtttctctgttctaaaggtttcttttgtctgcttatcctattattattggaaccagtgatgctccactttcccttgtaagatgctttgctctcatgaaagggaaagcattcctataagttctatatctgatattcctataggaaaaatgttatgctaacatggatgttttgaaagatgtccatgatatacaaggttgatttggtggttctgaaattttgaatagaatatggatgtagtatgcatagtattgtatggaaagctttttgaagtgggatgatgtgaaccctagttcatgttaaggttagcatgtagaaactggctacaccggaggaactttgggataaaagaagaataaaagaaggggaatggctccaggataaataagaaaggataggctattatgatgaactttggggagaaaaaatgtttcatctttcttgattgatttgtaacggatgctttgctgttccctttgtatcgacaagatcttcacatagtattcagtgaagtaaacccaagtaagagagcaactaatttttttccccttagtttccaactaatgctgcaccagctgggccctgcattaacgcaatcacgataacaagtgtgttttatgcatttatagtatgatcattagagtttgaaacgtgtgattgatgtccatgatccatatacaagtttggtttttatttgcttttcaaattctcttcaacttataaaatttcatcccattagatttggttctctgctgaaaaaaatgtttgacacatccagttctagtggtttcagtaaaaagaactgtttgtgctgctattaaagtagttgagaatttgatattctgttttttttaaaaaaaatgtttaggtatcaaaaagcagttcagtggtttgagctaacactggagcatacttcatcctccttgaatgaaatgtgggaaccaacattggtgaatcttgggcatgcattgcggaaactcaagtaagggaaccatcgcatcacattgttacatttaatttcataagtctgttggcatatgacttttttatgttagtttagcaatagatttgtcaagttccaatcccatttatatgctcaatttatgatttttgttatacatgagagaatgggaaaggaagtgttgatttagttcagtcatctcagttgtgcagctgtggttgctttgtttgaagaccttttattacagactagaacaaaataaatcagcaatatgccagtgttattatttgggccagtgtgtgtgagggtaagttcgaacttgtggatttctttgtatccagagccagtcaagcctaaattgcatgaaactttaataagaaaatatgccttagattttgtgcctagcatatcctgacctgaatagcatttctttgcgatgaacagcagctttgctgttagttttgactgatggaataataattaaccgaattatactggttctctttctttttggttgttgtcatcagttgttaaaatatcattcttgagctaaccttttttttttgttgcaacaggaaatatcaaaaggcaatatcatattatgaaaaggcactcacctttcaaaccaaaagtttgagcgcgtttgctggtcttgcttatacttaccaccttatggtactcttctgttcctttcttatccactgctttgaatggtactatctctgttatgctgcactggcatgctgtaaaggcgatgtatcatgtgcatagggcagaagttctgcaaattctgacaaaagaacctggaagatgatacgtgttagatcatggtctttccacatagacttatatttaattatctattggatatctatatgatcagaagttcaaaactaagttttatgtaacctgctacttcaattacaacatcaattcatatatgtgtgctgagcgtttaccgttgaaacatcgggatacttggtatttgttagttcccataggcataagtgagaaacaactagacaaggcatagagatgccattggaagaatcgagaacagagtaatgagagggtgatttaagttctagtagtagtgttttcaggaaaaaaaatttcggtcagagattccttgctaatttacatgaaaatcacgaaggacaattgacctttaagcttaagttgcatttgtagaagcaatattttttagttttaagaatgagacctgatatgcttgattcattgtttcagtttgacacttccacagttactttctgagtatatctgaattttactaatatcatcttttcataacacaggataaattcgaggctgcgataacttactaccacaaggtgacgctctatgatcatttgtacttagctgtcatgtttagaatacatctttctaatcaaacaccttcggcctgtttggttggagggagtttttagaagggattgggagtttagagggatgaggctattaagtgttttgtttggttgggagatatgggaattttggtgggatggggatggggaattgaggaaggaactccctccttttcaatacctgggtaggggcaggtaattgggagggaattcctcctttactttgtctaagcaaatctcagccatccgtttttattaatgacctaatctccaactaaactccctatcaatttccatcacctctaccaaacaagatattgggattaaaaatcaaatttccatcttaatctcatcatcaattccctcgtgtaaactcccaatcctcttccctccagttaccaaacaagccgcttggagctgccaatagttcagcatagggactttcttgtgcgtaatgtatcttcaccgtgtatatatgcaattaagtttttgaagtttaaaactgaagagatataacagtggagaccaatgcctttctattcagtttgttcgttgttttcatgtagcgcagggttagttactaatattttctcgctattttggtcaggctttatggttgaaaccagacgatcaattctccacagacatgctaacgttagccctcgagtccagctgtcaaatcactgctcggacaagatagcataggtgcaatcgctgttcgcaaactgcaacaggtgatgttgtatcttaggagtgttgtatcaattcggatcatctgtagccagtcttgtaaagttagtgtttaatatataattgctcaagctcattcgccgtatcatcaagattttgttaccttcgtactgatgtaaataccgtccattccttgtcatcacgactaatgatgcccaagattattctgcatgtttagaaaggttaaggtcagccgcaattgtgaggtagttttattacattcttatgataactgaggtatttgctgtaaatttgaatggaatcttgatccttttctt</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os03g0236966, RefSeq:Os03g0236966