Os03g0344300

From RiceWiki
Revision as of 12:38, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os03g0344300| Description = Similar to SUMO protease| Version = NM_001056618.1 GI:115452964 GeneID:4332808| Length = 4611 bp| Definition = Oryz...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os03g0344300

Description

Similar to SUMO protease

Version

NM_001056618.1 GI:115452964 GeneID:4332808

Length

4611 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os03g0344300, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:12875606..12880216

Sequence Coding Region

12876188..12876250,12876447..12876519,12876786..12876889,12877149..12877268,12877366..12877479

Expression

GEO Profiles:Os03g0344300

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008396:12875606..12880216 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008396:12875606..12880216 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>attgttggtcgtttggttcagcttgcttgcggaaaaaatggctatgactacaaatctgttaaaagatggactacccgcaggaggttgggttatgagcttattgagtgtgataaaatctttgtccctgtacataaagatgtccattggtgcttagcagttataaacatgaaagaaaggacattccaataccttgattctcttggttgtgtggatcatcatgtaccaagagtgctggctagatatattgcagaggaagtgaaggacaagagtaataaagagatcgacacaaacacttggcacgaagagttagttgatgatattcctttgcagcaaaatgggtgggactgtggtatgtttatgctcaagtacattgatttccacagcagaggattgagcatgtcttttagtcaggaaaacatggaatatttcagaaagagaacagtgatggaaatcttaagattaagagctgactaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>IVGRLVQLACGKNGYDYKSVKRWTTRRRLGYELIECDKIFVPVH KDVHWCLAVINMKERTFQYLDSLGCVDHHVPRVLARYIAEEVKDKSNKEIDTNTWHEE LVDDIPLQQNGWDCGMFMLKYIDFHSRGLSMSFSQENMEYFRKRTVMEILRLRAD</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>3967..4029#3698..3770#3328..3431#2949..3068#2738..2851#ctgctcaaacccccgccgcgccaacctagggcatgctcccaacccccatggccctagccctagccctagccctatccccctcctcctcctcgccatgaccgccctcgcctcccccttcctcctcccccaccgccgccggaagcgccccctcgacgattcccacttccacggcccgcagcgccaccgccgccgccgcctctgcctctgcccggcggccttcccctccccgccgatcccgcccgaggcggcgtcgtcccccgcgttcgacatggggggcttcctctccttcctccggggtaaacctaggcacgacgatgccggcctcggggtgtacaggggctgggtcgacgtccggtcgcgggatctctcggtggccaccgccatggaagacgacgacgcggggtttggcccccggttggtggtgaggcggagggtcggggacccgaggaaggccgccctggaggccgcggcgccgcgtccgcgggtgaagagggagccgtactacaaggaggcgctcgagaggatgaggagccacgacaagaggctgggcgagctcgcttcactggtgaatctagaagaggagaaactcgccgagctgcggaaggcggctgagccacccaaggaggtatcgatatcgttacgtttaccattcctttgtttttatgttatattattttcatagttggtgaatgtgaagatcacaactcactagtggtaaagtgtgcgtattgcgttgaagtgaattaatggaggttcattgtaatgagagcttcggggcatagctacataattgagttcttgaactttttcaagtttaaagtttggacaattttaggcttcctagtatcgctcgccctaaatagatgttttgaattgtcaaaaaaagagagagaggggcaagcaaggatgtcttgacacaatgtggattctagagtcgattctccttttgagtgcttgcgaattcacaagatatgcatttgaatgtagagtttaattgggggaaagtatattcctttgttgattaacctttcttagttgttgctctatatcaaccttttatgcttttgctcactgtcggtttctgcatgttgatctttcactactccaggacctgtctgaactctttacacctctaactgctgaagaggaaaatgaagttcataattgtttgtttggtaggggttcaaggtacctttgatgaccctgctgcatgttgtttgtagcttctatgtttgttgctataacaattgatcatcactcttttgtccttacagtactgaaatcctagcactgcatgagccctccaacattgaagttagcagagagaagttccggtgcttgagactgactgcctggttaaatgatgaggtaactatctatcttgaatatacttatatatgaaacaaactccactagtatctatggtttacttcctttttttaaaaaaaagattgatggtttacatggaccggcgatgaccctgcccatattatcttacgtaatgagggcatgtattcctcttacatgcaggtcattaatttgtaccttgaattattgaaggagagagaggcaagagaaccaaaaaggtttttgaaatgccatttctttaatacatttttttataagaaggttagatcataagcttcttttgctttcacgtattctatcttcgtattcatattaaatgttcttatcgtctctgtactttataactttttttagcatttctggtgtattattggtttataaggatttggtgcaatgaacttatgagtgttcaaatatgatatcactgtaggaacatttatattatatttcagttgtgttattaatttatggacatttttagagtttttccctcaggaggtatataggtaataactgtccagatatcttcatgggtttctcaggttaacatcattactggctttggagccttaattggacacaaatactcaattagcttgtgtttatggcatattaactaatatgctattcatttggctcatttaggtatatattaattcatccatagaaaattatagggcatattatatattgaaaagtcaaactttatagattctgaccaacaattactcaaatcataaatatatttggtgtatcagaattatactgatagattcatatttctgagagcttttcataaaatgttggttgcgcagatattacgaatgtaatttatgagcaatcaatggttaagctcttttcctaaagattttttttttaaaatatgatatgccctatatttactctaggaacagtcaatagcagcatatgtttgacttcagtcatacgacaacaggatacagttctaaacggagggcttagttctccatttgcttttttggttttcttaagttttgttatcacttattcgagacatttgttgtggaaatggtagacagttttatgttttcagtttatccttgcttcattgttcattgaagatttctaaaatatcactccattccaaaggatgatgtttggagaaatgccacccaagtgttagcttcgcaaaataccattacttcttctctttggggggcagtattgtgttggcctgtttggttagggatgggaaattctaggaagttcttcatttgccttcatccactcatttgatatccttttattatgaattttaccatttcattttcatttgtgaatgctgaattgctgatcaccaagtaaatgctaatcttcattgactccctgaattgttggtcgtttggttcagcttgcttgcggaaaaaatggctatgactacaaatctgttaaaagatggactacccgcaggaggttgggttatgagcttattgagtgtgataaagtaaagtatctgttgcattcttagtccttctgttgtcacggatgttggaacatgcttatttgtaattataaacttatcctcagaatttactttgcagatctttgtccctgtacataaagatgtccattggtgcttagcagttataaacatgaaagaaaggacattccaataccttgattctcttggttgtgtggatcatcatgtaccaagagtgctggtaaacttatagctgtagagaaaaaatacaactggggcactcaaaaagtagtacccccttctattgctatttcctgcatggcattttattttttttaaaaaaaaggttgttaaatgtgttatgctctaggggaatttgcatgttcgtagttatttcggtgtttcattaatgtgttgctaagcttgtttaatccatcaaatacttgcagttacagatttgagtgggcttacctgtattttattgtgcatgccactcacaggctagatatattgcagaggaagtgaaggacaagagtaataaagagatcgacacaaacacttggcacgaagagttagttgatgatattcctttgcagcaaaatgggtatgtattgcatgtgctaatgattatttcctgcataaattcagtattatggaacacaatcactttcaatagcttgaaccatgatttgttaggtattatcatgtgttaaaccttcagcggttttctgtatgtttttttaatccatgtttggttggatggccatatgaagaattcattttgtaacataagcattggcacattcatgaacatgttacgatggacaacaatatagttttagttgacacaagcatcgtatatttgaacaggtgggactgtggtatgtttatgctcaagtacattgatttccacagcagaggattgagcatgtcttttagtcaggtgagttggattcatttaagaaatttgagcagaatatcctctgcctctgggctagtgccttaacaatttggacttagcatgtgttgtagacttcattatgtaaatttctcgtgtgagtacataagcttgtttcacaatttctcgaggtgattttacataatcatgcttatcagtgtggtttgttttggaactgcaggaaaacatggaatatttcagaaagagaacagtgatggaaatcttaagattaagagctgactaatcaaatatggatccttttccttttggtgaacagctgattaacttaggttgatattcgtagactaaattgtcaatcgtgtatacattgttggaagttgccggcaaagataggaaatatatttttccagtgagaagctggagttttgtcagtatgtaaacctgtatgttgataacaccagatttctgtaaagttccgttgtttttggtgattcagttggcagaaagaacaagagggggaagagaatctttgcgctcggttgaacaatctgtatctgaagagtttaacttttaggagcctagccgtagtgctactgatacttaccatttgctgctcatttgattgttcttgtagtgctttggtagctggtggggattggcatgctctggtgcatgccagaaaagaggaaaggttgtacccggcatccacaagttaaacaaatgcgtataatggttcttcatttgtaaaccatgtgtttgtgttgtcaaatttactcgggacatccgaaacgtaaaacatcatgttttgtgatttgtttaatgaaaccttatgttctggggcaaaatgttacttaaaaccccaggt</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os03g0344300, RefSeq:Os03g0344300