Os03g0356652
| Gene Name |
Os03g0356652 |
|---|---|
| Description |
Zinc finger, TRAF-type domain containing protein |
| Version |
NM_001186498.1 GI:297722126 GeneID:9267608 |
| Length |
4563 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0356652, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:14294578..14299140 |
| Sequence Coding Region |
14294762..14294924,14295359..14295486,14295746..14295883,14297745..14297880,14298855..14298943 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcggcagcagcaacggcggccgacgccggctccgatccctccgcggccctcgccgccgccgccgccacatccacctgcgcccactgccagcgagaaattccatcgtcaaacattgacttacattcggcacactgcgcacgtaaccttcaaaagtgtgaacactgtggagaaatggtggccagaaagcttatggacgagcactacaatgaaagccatgctccagtaaattgcactctttgcaaggaaattgtaacacgcgagatctgggatcttcataaaagtgaacagtgcccacaaaggattgttgcatgtgaatattgtgagtttgagttgcctgcggttgagcttcatgaacatcaggatgtatgcggaaaccgaacagaattttgtcaaacatgcaagaagtatgttagactacgtgaatggattgggcatgaaatacagtgtcatgcaaatgcaaatgcaaatgcttctgcacagacatcaagtgcccgaatcattccagagagagaagtgcgtcctcctccaccagtaagaccgccacggcctatgcatggtgcacagcacaagcgtctgctcttcacaattgcggtgactggaatcgcagttatgattggttcgatactttttcagagggaggagagtttctaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAAATAADAGSDPSAALAAAAATSTCAHCQREIPSSNIDLHSA HCARNLQKCEHCGEMVARKLMDEHYNESHAPVNCTLCKEIVTREIWDLHKSEQCPQRI VACEYCEFELPAVELHEHQDVCGNRTEFCQTCKKYVRLREWIGHEIQCHANANANASA QTSSARIIPEREVRPPPPVRPPRPMHGAQHKRLLFTIAVTGIAVMIGSILFQREESF</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>4217..4379#3655..3782#3258..3395#1261..1396#198..286#ccttcccttcgcctcgtcttctcctccacctccaccaaactcctcccccccccccccccaaccaatcttcctcgaatcctccggctgcgccaccacccaccccgcgcgcgtcgtcgtcgtcttcgtcgtctccgccgccggctgctcgattggcgccggccaaggaagcggcgaggcggattcactgcgaaggcgatatggcggcagcagcaacggcggccgacgccggctccgatccctccgcggccctcgccgccgccgccgccacatccacctgcgcccactggttcgtgcggcgcgatccccccccccccccgcgccccacctccctctctcggctcggtttgtttgtttgtttgtttgtttgttgcttttccctgtcatgtggcgtgtgcgtatcggtggagggggggaggtgaggctgctgctctgattcgttgtttgatctcgtgtgggagtggatctgagctgaggatgaggatccgatcgattcgatgagcgtttgcgctatcggaatagaatagaggcttctccatcgttgcaatgtaatggatcgaagttcatcagacaattatagtatcgtgttcctaaaaaaaattgaggaataatctattcattggtctacgaaacaaagtacataggctgtaattacgagtgagtgtttttttttcataaagagcaaaatttattgttgctgggacttttatctggaattgttagcactcagcagaagcaactgcatacccttacaattgaactaaggtagcactgattccgttagaaaccaccaatttggtttgaggagaacggagctcattttatgcttggttaatgcgcttacgggaactggggatagtgcttgcactgggtttgcagaccattgtttcatcaaactaacccagtgctatttgcagaaaccaaatggataataatggatcatcgtttggcatatttagtaccagagcacttccgatgcatttcttcgtattaatgcgatatacagtttgcttgcttttacactttctgggtttgtttctaatctcataaaaaaatatgcatgatattagttggagtgctatgggatcagcagcttttagtttcagaatttttctacctgctacccttagtcaaggctagctcaacacaatttatgatatgtggtgcggtgctgatttcatgagcatcatgcccattcttcatttgccatgttggatggtagatacaaattttagttttgtttacgtgttctttctttttcagccagcgagaaattccatcgtcaaacattgacttacattcggcacactgcgcacgtaaccttcaaaagtgtgaacactgtggagaaatggtggccagaaagcttatggacgagcactacaatgaaagccatgctccagtatgttcaaaacctcatcataaatcttgagttttgggctttcaaaacattataccatacttgtgatttgcttgggatgcttccatttcagtgctatctgtttatttatcttaggactcagttgagcaatatgttggcacttgacagttgactgcaccaattaggactttcttttgtggtactcttagaaagttgtattacttgatgcaattcgagggatgtgattaaacctttttttagtttaaaaggggaatatagcctatttctctgttacataatcaaaactgaaataggttttgacagtggcccatgttctggattccctttctgaaaaagaaaaacagagagagaagatccctgcacatctggcatctcctctgtaactctgttagtgggacctgcagttgtcattaactcctgaaaaatacggcttccactatctcatggcacaattctccatgaatgaacgtgcaaaatttaatgtatacatagttacataccaaattgcttaccattggtcattggcgtgaaaacttagttactagccaaatgcctgtgcgctgcaaaggtaacaatctcccaaccaacataaaagaactaatttcaaagtgcactgtaattttctaatatttaattataatcaagagagtatttctatagtagagtaaccctggagtttttttgtagttgtgcatctacaactccagttacatgttggagtttcatagtaacttctgggtactctctacatgttggatcaaagggtggttctgttattccatctcatattttccagctacatggtagcttcgagcttcataggtagaagaggtggatagatggagtagtttttggtaatgtgtagactcggattcaccgtcaccactacactcttttaaagtagtaaagatgaacatgagattgcctgcgctattgaatatatcactgccatagttggatgatgagatctccaacctataatttaattgatcattttaggtacatatttactcttcacaataagctttaatattcttaaactctttccgtagaggggttactggtttttgaagcaagcaaagcatgcagcaataataataactaaatgtgtgaggcttacagttataaacaagaacaattttcgttccatagctaccaaaatcatgccatgaggccacatgttcaattgcatgaactgaactgcattatgcctgcgactttaggatcgctgtggaacgacacctgaactgcacgaattggccaaatcagtgaccctatacaccaaggggcagagagtaggggaagggaagagggagcacgaactgtagctacagccgttgctttttgtgtcaatatgtctgtctccaccataatttcttcacatgttgctcgctgaagccactgttgtctctttgctatttgaagccaccacaccaaggatatgaggcatcagcagcgtttcctggattgtatccagagtctcattacaaaggaaaagaaagggaagggtagagcaagagggaagcactgtggcatgctggttgatggtgggacagtgtggctttttttgtggaataactaattgcacaccacaaaccccatacaccatggttgtggttgctatgcttcatccaaccatcatcagcctgtaaactttttgttgtacgtacaaattggatacacgttctgttatgtttgccaaatgcatgatatttttgcgtaccaactgaaaccaggaactaatgccacattacaattccatatacaatagtaagaatattagaatttacatgttccatgatctatagagcaattgtattttttcggcaatgtatgatcactctaatcatgttacatacaggtaaattgcactctttgcaaggaaattgtaacacgcgagatctgggatcttcataaaagtgaacagtgcccacaaaggattgttgcatgtgaatattgtgagtttgagttgcctgcggttgagcttcatgaacatcaggtgctgttttgttgtttgccttgaaacaatctctctcttttttttttactaacagtatgcccgtgccttcgatttataacaagtaatatactataagatctagagctaattgcaaaaataattgcccttaattctgaaaattatacacaagactatatggcatcaaccaaataccttataatacacacaatatgtaaggaatacatctttttttttaagtcgtagatatatgttttaatcgtactagtttgagatgcaggatgtatgcggaaaccgaacagaattttgtcaaacatgcaagaagtatgttagactacgtgaatggattgggcatgaaatacagtgtcatgcaaatgcaaatgcaaatgcttctgcacagacatcaaggtaaaatcttaggcgtttctcttaacacatgctgattttttatcgttaatgtaaccttggtatgatgtaatgtataattcttatcattttaatacgagagttgcatacttctttgactgttcattttcagtgaaggtagattttctcaagctaaattattgcaatctattatatgcaaattatatacacttagcatttgagccttgatccctgcattctttagtcaatgtaggtcagattcattcaataattcaattagatgtttcccacttctttcaagatgataatgtgtatcagagtaatggaactggtgctttgtatcctgatgattcttgtttatacctttcatgattagcaagatgttactagcaattttactagtccaaatgtgaagtactacaaatcttgtactgataagatgcttcaaatttcagtgcccgaatcattccagagagagaagtgcgtcctcctccaccagtaagaccgccacggcctatgcatggtgcacagcacaagcgtctgctcttcacaattgcggtgactggaatcgcagttatgattggttcgatactttttcagagggaggagagtttctaagtccagtgtctatggtctctccccatcgagttgattccaacagcaacagcataaagagttaccttgatgtataatttacccctcataatcagtctataaaatcactttgtttgtttgatagtacagtccctggcatggctttgttaaaagaattgaaataaccatgaagatgcccattattctc</dnaseqindica> |
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