Os03g0404800

From RiceWiki
Revision as of 12:42, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os03g0404800| Description = 3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase domain containing protein| Version = NM_001056861.1 GI:115453450 GeneID...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os03g0404800

Description

3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase domain containing protein

Version

NM_001056861.1 GI:115453450 GeneID:4333070

Length

10077 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os03g0404800, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:17187314..17197390

Sequence Coding Region

17187411..17187696,17192907..17192996,17194156..17194289,17195230..17195388,17196561..17196683
,17197091..17197099

Expression

GEO Profiles:Os03g0404800

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008396:17187314..17197390 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008396:17187314..17197390 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggaaacggcgccggccgcgaacggttgtagtggcggccgccggctgcaggaagaagagcccgcagctcggtggtgcgcggtgaccggtggccgcggcttcatggcgaggcacctcgtggcggcgctgctccgctccggcgagtggcgcgtgcggatcaccgacctcgcgccggcgatcacccttgaccccgtcgaggagaaggggctcctcggcgaggccctccgcgacggccacgccgtctatgactccgtcaatgtttgcgacataacgcagttgaccaaagcttttcaaggggtggaagttgtttttcacacagctgctgcagaccctgacatcaacgacttccaactacattacaaggtcaatgttgaagggacaaagaatgttattgatgcttgtgtaacgtgcaaggttaaaaggctgatatacaccagttccagtggtgttgtatttgacggagttcatggcctttttgatgtagatgaatcaatgccatacccaaacaagtttcctgatgcatatgcacaaagcaaggcagaagcagagaagttagtgagaaattccaacggcatatgtgaacttctaacttgttccatacgtcctggtagcatttttggccctggtgacaccattgtaccacatttactttcccactggagaacgatgtttattatcggcgatggaatgaattgtgatgattttgtatatgttgaaaatgtggtacatggccacatttgtgctgagaaaactctctcgactaaagagggttcaaagataagtggaggcaagaatgtgtga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>METAPAANGCSGGRRLQEEEPAARWCAVTGGRGFMARHLVAALL RSGEWRVRITDLAPAITLDPVEEKGLLGEALRDGHAVYDSVNVCDITQLTKAFQGVEV VFHTAAADPDINDFQLHYKVNVEGTKNVIDACVTCKVKRLIYTSSSGVVFDGVHGLFD VDESMPYPNKFPDAYAQSKAEAEKLVRNSNGICELLTCSIRPGSIFGPGDTIVPHLLS HWRTMFIIGDGMNCDDFVYVENVVHGHICAEKTLSTKEGSKISGGKNV</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>98..383#5594..5683#6843..6976#7917..8075#9248..9370#9778..9786#gcagcacactaatcgatcaccgcactatacacaatacgaccattagctattactagctagctatatatccctcccttgtttctttcgagcaagagcgatggaaacggcgccggccgcgaacggttgtagtggcggccgccggctgcaggaagaagagcccgcagctcggtggtgcgcggtgaccggtggccgcggcttcatggcgaggcacctcgtggcggcgctgctccgctccggcgagtggcgcgtgcggatcaccgacctcgcgccggcgatcacccttgaccccgtcgaggagaaggggctcctcggcgaggccctccgcgacggccacgccgtctatgactccgtcaatgtttgcgacataacgcagttgaccaaaggttaattaattcgatcttcttaccgtatacgtacgcttttttcgaaccgctaaacgacaccgtttgtatgaaaattttctatataaaaggttattttaaaaatgaaacaaatctagttttaaagttttcaataattacttcctacatctcatcatatttgcgaatggtattgaggccaagacaagaaaaaaaatctttccttttaaattaaacctcatcgatcaaaacgttatgttagcatgtatgtggatatgcaacgatatcatttttactcctgcagtgataaacgaactgacatgcaaccatagtatttacttgtatataaataaacaaatagacatataatcatgatatttactctacagaaataaacgaattgacacctcttatataatgattattatgagatgagcaaaatgtaatgaatgaagtaatactcagttaatcatatgctaataaaatttctcgttttacgtgtggctaatcggccatttcaaaaagcactttaggacggggtcttagacaacaacgctgtatttaattgctctctctatattgagaaatacgagctgcttattatgtaaaaaaaggaaatacaagaagttttgaaaatatcagtatcggttttttagccggtggtaacaaagtaagtaacaattatgcttgtgcttggaggtataattgccggttataacaccatcagttacaatatgtatagtactatatcactgctattttgtggtttatgaactgggttgcaaaattcgaattctttgacggaaaaaaaatcgtattatacgaataatctactagtaaataatacgatgtgtcaagcaacttttacctcaacctcgatatgcgagaaacttgcttaccgctaaccatctcagagatagcacacagatatgcttcttcccctagaccctttttccgaagcttttggcaaatattttccctacataaaggagtgttggcaaaagtgggtcacggtgtagtgcaatgagtcaacgtttgattgttactaaaatggagtataattatccatatatatactttcaaacaaaaatccgcataagaagagaataattaagttgattgggcctctctgatctgtcacgtgagctaatgctccaatgacaagccaaccacttaaaatcaaatcaaatcaaatatgtgactggtacaatataacagttccaccaagaaaaatcaatggtgatcgatacacttagctagtacaaaatgacatgatgttttctaaataggccatttttcaagatttcactaattaatactcaattaatcatatctaataacgtttctaattttacatgtggctaatcagtcaattccaaacgtggcccttcgacagcaactatgtattcaattgctctctccatcgagaaatacgagctatgctttcattaaagaaaaagcgaatacaagacatgcttgaagaaagtagttcatccgtccttaaaaaaataaaccctaaaccctaaaccctaaaccctaaaccaaaaaccctaaaccctaaacagatctatgccctaaaccctagttctatctagataccctagttctatctagattcatagtcccatcatagatttgtttttatatataggactgagggagtacacgtcatgaatttcgactaataattaattattaaggcatcaacatataatgtctatacgcttttgcttttctttttgttatgttaatttatttggttgatataatataatgtcaaagaaaacaatgaccatatggccgtgacagcatcacagttggttacaaaaatggctatggataacaaatcatcggtactacagaactactccctcattcccaatgtttgacgccgttaacttttttaaacatctttgaccgttcgtcttattaaaaaaattttgtgaaatgtgtaaaactaaatgtatacataaaagtatatttaacaataaatcaaatggtaggaaaagaattaataattacttaaattttttgaataagacgaacgatcaaatatttttaaaaaaagtcaacggcgtcaaacactttagaattgagggagtaggtaccagagacagttcaaactactagcagtaaccggtttttttagccggtggttagtggtaagcaagcttcgcagagatagcatgcagatgcttctcggaaatgctactgagctagcgatcgccctcgctcgcccagagcgatcaattcccccccccccccccgcctcctcctcctccctccacctggtttccttttttggtaccgtattacttttctattttagtaaatttatgcacctcaagtttacacatctaaagtttagagaccaaaagtttataagtcaaaagtttatatatccgattcaaatttgaatttgaattcaaatattttttatatatagtatttctatacatctaaagtttatacacctaaagtttagagacctaaagtttatatatccgacgattcaaatttgaatttgaattatatcttattcaaatttgaatttgaattatatcttattcaaatttgaatttgaattcaaatatccgattcaaatttgaatttgaattcaaatatttttcatatatagtatttctatacatctaaagtttataaacctaaagtttatagacctaaagtttatatacccgattcaaatttgaatttgaatttaaataattcaaatattttatatatatatagtatttctatacatctaaagtttatacacctaaaatttatagatccaaagtttataagtcaaaagtttacatacccgattcaaatttgaatttgaattcaatttttttatacataaatttttccaactttttgtttttttaaaatttttttgtggtgtactgtaataggaagagaagaaggtgaggaggaaggggagaagtgggaggagtgcctataggagcggggggcccgggaccgatcgctgggcgccccccccccccaccccatgcttcttattaactagaccctttttccaaagcttttggcaaatatttaggcattcaatatgagccaaaataaaaaggttatcaattataaagttacaggattttcatataaaattttctccgtccaaattcatgtgtgtcatgtatactataatctttaaatttgcaatgatgagttagcgaaactacacttattaattaccattccggatttgtaatttgaacctgactgataacacaaactggattaattaatgggattaatggttactccctccggtttcattttaattgacgttttagacaatgacatggtctacaaaatatatatttgaccttatttttctattataatatacacaataaataaatgcatgtttacttttattatagtgctttgaaagacaaatctatatacgttgttctagtttttttaaactaaatatttttaaagttattgatggtcaaattataaaagtttgacctcaatcttatgcaaaacgtcaattattatagaaccgaggaagtatgttacatcatggaggatggaggaaacatagcactaggaccataataattaagtctatgaaattcgcgcgggcaacaatccctgtgtaacgtcacaattatcaatataaaaaacggctaagctccaagtaaagtatactttttttcaacaatactttcaaacaaaatcctctgacttgctttttgatttaaattcctagtatagggctaacagtaggcgcataaacaacagaataattattctgtgacatgaggtaatgctcttatgataagccaaccactcaaaatcacaatcaaacaaaatactccatcctcccaaaaaaaaagttacacctattacttttgtcaccaaaactaaagaagaaattaacttatcttgcatgaaacaaagatcaaagagtgtatgcacgcatgcaatacattaatattaagataactcctcatgtttcgatgaaacaattacttacctctccatttaattcttacatgcatagaaacaacaaataaaaacaacttatttgaaagaactcaaataggaaatatgtctaactcttgtaaatggagagagagtatgtgactgatacatcatacagtttcaccaagaaaaaacaatgcagattaagatccaaatactatctcggtttccgttagcatattttttaaattgctaaacggtatatattttgtgcgaaaaatttttatatagaagttgcttaaaaatataaaaaaacattttctaaatttgtaataaataaaacttaattaatcacgtactattttctcgttttacattttctacttaatcctcgtattcgcctatttcaatcgtggcattagtaggaaaagacacgatcatttctaaatggatccttatcacacacaaaattcttttggaagtatacctttttttcaccggtattactagaaagaagtagcgtaagtactaccgttaccaccatgaagcaaggtgcaaattctcggcgagttaacacggtgagtgctcgaactcgtgacatgttcgtgatgtcatcacaagttcacgtgaactcgcatccctacgaagtgaactcatgcgattaattaattaatttgcatcattagtaattaattaattgagcgttatttcttaaattagcgttagtaatcaattagtagtaacatttaattcggcgtgaggccattgttaatttagcattaggaagccagtttgcaaaccaattagcgaactcacacacgcggttaggtgaaaaaaaatatatttcaattttttttctatgacacactatacccacttcattgtcaaataattgacacaagttattcaagttcaatctttcacctcttctcttgcgagaaaaaaaatatatatacttgaaaatatgtcatattatctatacaaaataggaccatacaatttatgatatacttatattatcgattgaactttcatttatcgtaatataatcatttaaaattatttataatcaaactttctttatcgtaatataatcatttaaaattatttataatcaaagtaagatgatcgtgataaaccgtgtcaaccccgaacaccaaacatattagtccattgatatctaattttttcctaatctatgatttatctctataaacaatttttttttataactgcaagtatagaattttcaatctgtcatccatgccatgcagcttttcaaggggtggaagttgtttttcacacagctgctgcagaccctgacatcaacgacttccaactacattacaaggtcaatgttgaaggtatgaaaaatcattgatgaatcatttatggagaagcccctttatacatgatgggcatatgatctcattacttacatgactcagaaatagtcatcaatattattatttataaaaaaagtgcaataaagaactgtttcatcaaagcatcatcacatgatattaaggtacctctcggtggactcgtatcctctcgccaataaaaaaaaccttgtagagatattttttaatactatagggccatttttaaaatgttttatgaggcattcttcaaaatggctcgtaaatgtattttggtgaattgtctctagaaaccaaaccaagagagattttataagttatcactatgccttgtggcatttatgtaacagcatacttttacgtctataagaatgaataagcactttctagaggcattaaattatgccacaactgtagcaaattaatttaaaaaaacaaaaaaaatattactaaaatattgtttatacctctatttttacaaacaggttaaaagaacaccggtatgtaaaagaatttttggggtgtctacaaaaggcccacctatgaaagttaatttttacacgcgagcttattaagaggtttatctgcgaaaatagagttattttcgtaggagaacctgtctagaggcccatatacacgcgaaaagatcacattggtcgtccacacgtcatctctctcaatttctctactccctctccatgtctccttaaattttgctggcatatgtgaaaataaagttatttttctaggagaacttgttaagaggcccatatcgaaaagatcacatcgatcggccacacgtcatctctctccttaatttctctcctcccactccatgtctcctcatttatatcagtctctctgctccttgggagctgtgcgacctcggcagagacaacgacgctgtgggaccatcgcggcgacaacaacactgtgaagcttcgaattttagaattcttttttcacgggtgcactgcccgcttgttttgtccaacgagcatgaaagtagacataaacattcttgaatcttcggtaacatgattgttattaattcaaaaatgtacaccttatttggatttgattagtctcaatttttgtcttttttttgtttttaaaagagtcattttgtgttattacgcagggacaaagaatgttattgatgcttgtgtaacgtgcaaggttaaaaggctgatatacaccagttccagtggtgttgtatttgacggagttcatggcctttttgatgtagatgaatcaatgccatacccaaacaaggttctactatgtgactgaatgcaattttttctttattttggttgctcatgctactagatgctcaagtagtcacaaaatttcttgtacaattatgaatctcatttctttgttgtacccattggtacacgaactaaaaaaaattaatgcccccatgttgtgaaatgttttccttaatcaaatcgatgctaacaaaaaagtttggctgtgtatttttagttacctctctctaaccttcagcctatttttagttagctaaatgatgaatatttgttactccctccatcccaaaatataaggcacaaccattttattcccatgtttcataatataaggtatgcatgcatgcatgcctgcatacattaactagcacatcttggtcctttaaatttagtttgttttaaatcctcttccatcaagcaccacattcacattgtttgcatgtatggatatgattcaaccaaggaggtgattaaattctttcttggtctttgcgttaggaatggttgaaacttatatttgggatggatgtagtaccttctatgtatgtaccttgattgcaccaataattaattattatgtgttccaagcaacaaagaaaagaatgactgtgttgtatgttggtatcaacaaatatattatggtgatgatcactacttgtaggttgaagagggtagtttgtatacttagaacaagggctagatctacaacatagaacatttctacgactatttgaataccaaagtataattgcaaaaaaagtatatatagtactatgtttcaacacatttacatagggatacagggagagatctttttacttttaactactagcctaatttttttagatagttacttaattaagccatatttatttatttcagtatgtataaaattcacacttgattttttgtgtttttaactatgtgtttattaatgttagtttcctgatgcatatgcacaaagcaaggcagaagcagagaagttagtgagaaattccaacggcatatgtgaacttctaacttgttccatacgtcctggtagcatttttggccctggtgacaccattgtaccacatttactttcccactggagaacgatggtatgtagccgtctagtacatatcgtgttaatttctctcatacttcgaaatactaaacaaaatggttctaaaaatagattaatgatactacttttgattgggcacacctcaagtaattagcatatacaatatttgaaatattgatctcatggaagtccccaaattctgcatgtgcatcattgtttgcttctgtaggaaattatatacatataggtagttcacgagacatatgtgcaccttaagtaaataaacatgtacataatttatttagtcatacagaccataactgtggtacattattatttttactcagttatcaagcatatggtttgtgtgtgatatgaagattatgaactagttaattaaccctttgtaagaaactaaccaaataatcggcgttgcaaaaaatatatagtaaacaaatgataacataaattgtaaattctctgcaacaacgtcatataaatttctctacatccataagcactatgaaactcaaaatttttcagtaaatcaacagactaccatccatacaattcatgtttcattaatatgaagccacagataaagaatcatgttatgagtcgcatgcacatacatataaagcaagaaaccgatgacgcttcacgcatggcattcttcagaaatatatgcatatatatgcagtttacacatctctaccgcacacgattgccactccgttgtgtgtttttcacttttgcatctattgtgttatgcgacatggaggctggggccatgaatcccccctaattaagtgtccaacccaattattcaggtagataaataaaatatgatcattgattacaacactatcggctaataaggtgccaactaatagcccatacttattgtatttcccccttaatctctccaactatcccatcatcactacttgcatgcatgtaaatttctctgatagtgtggatgcaaagatattaaggaactcctagctgttggaggttgggctagagcctcaatcatccccaacaatgcacccaccactggggtcaaggctaactaaaaattcgtgtggttatgtggactaacattaatacatgcatatctaagaacattgaatatttcatgttacattatttatatttctcctctacaataaatagaaagggcttgggttctatatcttcttgcagtttattatcggcgatggaatgaattgtgatgattttgtatatgttgaaaatgtggtacatggccacatttgtgctgagaaaactctctcgactaaagagggttcaaagataagtggaggcaaggtatatcactattattgaattgcactagtttcactgctgataaattttcatggtgcatttaactttctctaggcttacttcataactaatatggagcctatgaacttgtgggactttctttatatgcttttagaagaacttggatataaaaggtgatgcttcttcctagatatcatacatataacctaaagtatattcttagcttctaaaatatgcagtctccatacactctaattgatgtaatattgaagttggcaatataaattagaaggatagttgtctatggatgtattgatcatgcaaattgtttgattccttatgttttataaaagttggccactatatgaactaatggaaatattctttattccttataaatgtttgttaatgttggtgcatatctacagaatgtgtgaattcattttgcttcgaccatatctaagacctcatacatggagcaagttctattgctattgaagatgtaaaatttatttgacatggatgataaccaatggtcgatggcaatgatgtctacacatataagtttgatgtattttttttacaaatggctaagtattgtaatcttgttgggaacaatattgattcttattggagaatgggcttccacttgttgcagtcaacataattgtaatatatatctgtgagatttttattgctatatctctttatgcaaaaacattaagtct</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os03g0404800, RefSeq:Os03g0404800