Os03g0417900
| Gene Name |
Os03g0417900 |
|---|---|
| Description |
Similar to ARE1-like protein |
| Version |
NM_001056907.1 GI:115453542 GeneID:4333120 |
| Length |
10350 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0417900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:18012450..18022799 |
| Sequence Coding Region |
18012804..18013105,18013186..18013243,18013706..18013780,18013872..18014006,18014128..18014307 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008396:18012450..18022799 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008396:18012450..18022799 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggacgctgcccccgccgccgccgaggcgcacgacgggcagagggagcggttcgacctcggggtgttggtcggcgacctcgccctcgacgaggatgtcgccagtgatgaggacgagtcgctggaggggttgaggcaggagctcgacgactgcaaggacgacgaggaagtggcaaatatcctggctaacggcatcaaactgcgtgattacacaaaaggcgtcgagaacaacattcgccaaattgagctggattctatacaggattacattggagaaagtgaaaacttggtatcgctgcatgatcagattcgtgactgtgataacattttgtcacaaatggaaactgttctgactggattccagacagaaattggttctataagttcggagataaaggtccttcaggagaaatctatggacatgggattaaagttgaaaaatcgtaaggctgcagagtctaaattgtcaaaatttgttgaggatataatagtgcctccaagaatgattgacataattgtcgatggagaggttaatgacgaatacatgaaaacacttgagactctaagcagaaaaatcaagttcattgaagttgatgcaatggttaaatcgtccaaggctctaaaggatgttcaacctgaggttgagagacttaggcagaaagcagtctcaaagatttttgaatttgtcatccaaaagttctatgccttgagaaaaccgaaaacaaatattcagattctacagcagagtgttcttcttaaatacaagtacacgatagtttttcttaaggaacatgctaaggagatatatgcggaagttcgtgcagcttatattgataccatgaacaaggtgctgagtgcacatttccgtgcgtatattcaagcattagagaaactacaactggacatagcaacctctaccgacttacttggagttgaaactagaagtacaggattccttttctccatgggaaaagaatctctgaagacccgttcttctgtctttgctttgggtgaaaggataaacatattaaaggaaattgatcagcctgccttgatacctcacatagctgaagccaagtctcaaaaatatccatatgaagttcttttcagaagcttgcaaaaacttttgattgatacagctacttcagagtaccttttctctgatgatttctttggtgaagaatcactgtttaatgacatatttgcaggacctatccaagttgttgatgaacatttcaatgctgtgctcctgaactgttatgacgcaatcggcataatgcttatgatccgaataattcatcagcatcagctaatcatgtttaagcggcgaatcccatgtttggactcttacttagacaaggttaacttatcactctggcctcgcttcaagatggtgtttgatttgcatttgaacagcttacgaaatgcaaatgttaagactctttgggaggatgatgttcatcctcactatgtcatgaggagatatgctgaatttacagcatccctcgtgcatctcaatgttgaatatggagatggtcagcttgatcttaatctcgagcggttgcggatggctgttgaggaattgcttgttaagttggctaagatgttccctaaacaaaagttgcaaactgttttcctgataaacaactatgatttaacgatttccatactgaaggaagctggcactgagggtggaaaagcacaagttcactttgaggaggttcttaagagcaatatttcagtatatgtggaggaacttctactggagcatttcagtgatttgatcaaatttgtgaaatctcgcccgtctgaagacacagcatcaagctcggacaaggccagtgttagtgatgtcgagccattagtcaaggattttgccggtcggtggaaagctgcaattgagcttatgcacaaggatgtcattacatcttttagcaacttcctctgcggaatggagatcctgaaagcggcactcacgcagctgctgctgtactatacaaggatcaccgagtgtgtcaagaagatcaatggtggctctgctctcaacaaggacctggtttccatatcctctatcttatatgagatcaagaaatactccaggaccttttag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDAAPAAAEAHDGQRERFDLGVLVGDLALDEDVASDEDESLEGL RQELDDCKDDEEVANILANGIKLRDYTKGVENNIRQIELDSIQDYIGESENLVSLHDQ IRDCDNILSQMETVLTGFQTEIGSISSEIKVLQEKSMDMGLKLKNRKAAESKLSKFVE DIIVPPRMIDIIVDGEVNDEYMKTLETLSRKIKFIEVDAMVKSSKALKDVQPEVERLR QKAVSKIFEFVIQKFYALRKPKTNIQILQQSVLLKYKYTIVFLKEHAKEIYAEVRAAY IDTMNKVLSAHFRAYIQALEKLQLDIATSTDLLGVETRSTGFLFSMGKESLKTRSSVF ALGERINILKEIDQPALIPHIAEAKSQKYPYEVLFRSLQKLLIDTATSEYLFSDDFFG EESLFNDIFAGPIQVVDEHFNAVLLNCYDAIGIMLMIRIIHQHQLIMFKRRIPCLDSY LDKVNLSLWPRFKMVFDLHLNSLRNANVKTLWEDDVHPHYVMRRYAEFTASLVHLNVE YGDGQLDLNLERLRMAVEELLVKLAKMFPKQKLQTVFLINNYDLTISILKEAGTEGGK AQVHFEEVLKSNISVYVEELLLEHFSDLIKFVKSRPSEDTASSSDKASVSDVEPLVKD FAGRWKAAIELMHKDVITSFSNFLCGMEILKAALTQLLLYYTRITECVKKINGGSALN KDLVSISSILYEIKKYSRTF</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>9695..9996#9557..9614#9020..9094#8794..8928#8493..8672#8293..8343#8021..8121#7038..7096#6842..6957#5805..5990#5137..5218#4346..4437#3362..3505#2522..2602#1760..1843#1092..1193#641..736#359..419#137..240#ccgtcctccgatccgatccgatcccgacaccaccgcctccggtggtagatctggatcggagccaccccgccgccggcgatccccggcatcctcgccacccatcggtagcccctccgccgccgcagccgacgacgacatggacgctgcccccgccgccgccgaggcgcacgacgggcagagggagcggttcgacctcggggtgttggtcggcgacctcgccctcgacgaggatgtcgccaggtacggacggtgacgggatgccgcgccgcccgatctcgtcccgtggataacgtccgagaacgtgagcctttgcgcgctgttttgaataacatttggtttggtttttttttttcgacagtgatgaggacgagtcgctggaggggttgaggcaggagctcgacgactgcaaggacgacgaggtgctgcctgttgatccgatgcttatttatttttgttacttgtagactagtaacgagcttggcgattgagctctctttgggctacgtgcttctcaggtccctgggtgctgcattgttgtctttccgagctcacttatcaattacgagcaagaaacagtgtagccgtctgtttttctttcttgtgtgtggatcgctgattttacttttctgtgtggatgtaggaagtggcaaatatcctggctaacggcatcaaactgcgtgattacacaaaaggcgtcgagaacaacattcgccaaattgagctggattctatacaggtatttatatatgatatggtcattcacgtcaatcatccaagttaatatgcttgatctagagctgctctttttatatacatatgaatatgaactgcagtttgaatttgacgttgagtaggaatacagttacagcatggttttattttattttgaaataagattatttagcttattttgccagatggctataagactacgaatccatccaatgacttgcctattcttaccagagaaagtttacgttgatcaaataattgcacaaatgttgtggaaaaaaaaacttatgatcttcagcttctgatgcttcataaatagaaattggcagtggataaaatgtagtgttccctctttgtaggattacattggagaaagtgaaaacttggtatcgctgcatgatcagattcgtgactgtgataacattttgtcacaaatggaaactgttctgactggattccaggtaaaagcatattctcatatgttctgacaaaactatctgtggcattctcttgtgtgctggctagctgaatgagtagttatactgaacatattatcatcatgtttggaatgtgcaaactttagtattactttgtatcaattagcaattcacgtggtttctgaacttcttctcaaagaggagtctgcctactgtgagctacctgaaaattcaccaggatcatgtctctgcatttttaagctgtccttttgtcaactaaataacatgaaggcaacctccttggaagaactttctttacctgtatcacaattctatgctcaatgtttctagtttttactatgtgatccatgcgagaagttcattgacataattgaatcaaaacatttttagcttattatttactctttcttatcatttaattggatgaccaatgttccctctcaaaccaaaaaagtctttatactttttttttcctgttttctctacctaatctttcacctatagacaaaagtaactcactcttttacgatcactaagtcattctgcaattcttttgacttctgtggtagacagaaattggttctataagttcggagataaaggtccttcaggagaaatctatggacatgggattaaagttgaaaaatcgtaaggtttggttcacttcatactgtacattttatccgcatatatccaattattcctccatttcaatcttttctgatctgagtgcatactaggtccttgatttgaaatatctaggggattggtggtttagcatatattggttgcatcttggatattttatgactgttaaaatttgtaccttccaatatctcaagagtagatgccagagcatacatagtttctgtgttactacaatagttctttacatatcgacacatgaatgatcaccccattgcttgatataatgtttcagaaaatattgcatatgcgattaaggttctatcttacacttctgacaaataatcatgcatcataaattgttaccgaaggaacagccatgtgttgtatcttttttaaggaaatgtgttataactaattggacaaaccgatttgttatttagatttttgtttatcaaataatgagacaagactcaagtacaagacatggcatagaaattataaaatgagccctttttgcaacattataagggcagtcactgtcatctgaatcatcaaaagtagcttatcttggaattgtttcacagtttttatagctttttgcatgttatatatttctttcgttccatgcttaattatctttgatgatcctaatgttggttctcactcatttggaaatactgcaggctgcagagtctaaattgtcaaaatttgttgaggatataatagtgcctccaagaatgattgacataattgtcgatggagaggtgatcactatattcctttcatgttcgtttgcagctaaccttgcaactttctgatatggtaccaataccatgtgtagttatgcagcgcatgtttggttctcttgcccacccttgcgtagccttgcttctacctgatagtgaggatgcctcattttttcttgcataacattgtatttactagtaattgtggacgaggagatccttgtcaatgaaagatagccaattctgactagtcaaggtgtaataccctggccttaagtggtggcccaaatatagtcatttggtggaattaatcctacatgcggcaaagaagagagtgttagagggtgctatggataagtgggtctgctcccttcccccgacacacacataatcacagaggcacacacacaaagctagtgaaaaggggattttagacgctatggtattactattacagagtccttggcaagagatccaaacatgccattatgccaatggtttcttctcttctggctcagccgtgagaatgttcagtttaactgctttatatcctttcgtaggtgatttgtcctttttttaattattttttggtgcagctgttttttttctttgtctttgattgatatatttttttccaacagaagatttcaattgttagtttgatgtgtcatccgtcccaaggatctactttgttatcctagtcaacttgcttcttttgcagttaattctgattaatttgtttgagaactgaaaatgacctatgcatcaacactgcaggttaatgacgaatacatgaaaacacttgagactctaagcagaaaaatcaagttcattgaagttgatgcaatggttaaatcgtccaaggctctaaaggatgttcaacctgaggttgagagacttaggcagaaagcagtctcaaaggtttgaagaacaatcactagtttattacttctagtttcttatgagtgtgagcaggtctaggatttatatcatgctgaaggtgtatgtgcgtttcatctttcgtacatgcttatttttgtcaaaataattataggaaacaatctatggctttcagcatctgttttatgtgggttgaggggattatgtgtcatgcctttgtgctttctgagtttgcaaggttggttagttcatacatgctatgtcatctcagttcaatagagataattggctcagtaatatcatagaaatgagtcaattgaaagtgcctggtatgtccaccattaactagaatgatatgctaataatttatctggtacatttgatggcaaccagtttggtgttactaagaaagatgcagctatgttggctaataatttatctggtacatttgatggcaaccagtgtgtcactttaccatcaaatgtactagccataatggttcatttaaaattaggagttgccctaatttctgctacctctgtttattgctcagttcatacttgatagcgtactccagagcaaatacaagccattgtagatttggtcatttgaagtaagaagtcacatcaatgtccctctggatttctctgaaactttatcaggctttagatatgtttgggaaggcaagattggaaaaaaaatgtctcgtttattcatgagtatgaacttgaactttaataaaatgtccctggattcatggcatcttgctgattgaatttttatatctagccaatccaattgcagaaagctactaaagagttttatggctgatgactgatgcgttcataattgttcttgcagatttttgaatttgtcatccaaaagttctatgccttgagaaaaccgaaaacaaatattcagattctacagcagagtgttcttcttaaatacaagtatgcaaaatggtcttctctgatcctgttttatccacatttagttcttgcatgagcaatgttctatggatagtcattgggatcatgggtcaatgccattttccatgctctcagattcagtctgaagtcaaagacaaacttgtgggtcatgaatctaaagggagaccgagagggatgagatggggttagcaggattcttttttatgttcttgttgtaggtgcctcatgtttctgacactcgtataatttttgtaccttgcactaaatgtgatttgtggaccaagtgcatcaaatgcaccttgtgcctacaagtctccgtatggcattgcagcggattgttatccttttatttggtgcaactgctttaggcattttggtgtctggcaaattgctttccatttaatatataataatattatgtttcaaacaacggtattattgtgttctaaaaatatggaacaacttggagagacgtgatagttggataatatattttgtctaaccttagtttgattataaaacaagtatacttgattttaatttttcgtttgatagctttacaatatgcataacgcagcacaatgcagaactgcaatctgagcctaagttcctctacatggccatgcgattaaatcttctctctctctccctctctctggtgtgcaatttcttgattttcgtttgtgctccccattgcaggtacacgatagtttttcttaaggaacatgctaaggagatatatgcggaagttcgtgcagcttatattgataccatgaacaaggtgaatgttataataaatctcatagctatggtgtgaataggtattagattatcaatgtatgacctggatcctggtccagctttgtgtcccaatcattgccagggtaaggtttactactgcactgctgtacaaagtgtagagtagtagcaggcatgcttgagggtccaaatttagcaactatgtgttaatcctaggcaaagagttcaaaggcccaagctagctgtttcacgcttgtgctgcttccccaaggtggggtttggtcattggtgacttttgggcgatggattgttacagttgcatccctgtccgtttttcttcattctgttctttttgcaattctctgtatgtactgctgtgcttgttgtggtatcaaccttactcataaaaaaataattccatatgtacatacttttgaaactttctgcataggttagggaacactactagtctgtgtgcgatgacttttgacttgtgcaatgcagtgtactagtcgataacaataacaagagcacttgcattgtgtgtcttcttagatattttggagcaaatgctttcttgacatttttaccatattaccaatttgcaggtgctgagtgcacatttccgtgcgtatattcaagcattagagaaactacaactggacatagcaacctctaccgacttacttggagttgaaactagaagtacaggattccttttctccatgggaaaagaatctctgaagacccgttcttctgtctttgctttgggtgaaaggataaacatattaaaggtatttttattcctgacactccaactgacatttagatttttttttttttgataatgtagtttgtcaagtaattcactgttagctgtaatcagtcgatcctatacttatggttgtcttcaactgcattctacttgttaagcatgacacggaggctgggagctaaactgggtcatgtgatgctataaggttccaacaagaactaatggactaacataacaagctatttagttagcggtcaaacatgccacgagacacctatcattgtaaatcatcttatagtgcataattggcacatgaccataaatataatcctagagtaaatgtggctagttgccagacacttagtcctgtcttgttcacattttgagttgtctctaacattgtaacaagacatatggacttgcccacaccatttatggtgattatacaagttcagtaacatgattgtgccatgcaacccccaagtttagggacacaaatgacatgccaacacaaatttaaggattgaggatccagttagcaccataatcaaatttgtggatacatttctctactgtaatagatccagtcaaattctatgaatgcaatgttcttgccatagttgatcagacaagaaaatcttgttgcttgttgtaccaaaaagaattattttaacatgctttgaattcttctcacagaagctattgactgtttcatgcctatatatgttcgttgcagttttggacagaatcatcacctaactttatttagattttgatcttgccattttgaactttgagtaccatattattgttgaagcagcacagtagcatcatttctgtctgtcatgtgggcttttgttggaatgtcaggaaattgatcagcctgccttgatacctcacatagctgaagccaagtctcaaaaatatccatatgaagttcttttcagaagcttgcaaaaacttttgattgatacagctacttcagagtaagcctgatttcccttgtatttttattcgtaatggcttttgaatgagtggcaacctgatagatatccactaactgcaggtaccttttctctgatgatttctttggtgaagaatcactgtttaatgacatatttgcaggtttgttttgtcctatttttgaatgtctatcttatgtggatgtagtaatctaaatggagaagcatctagtgtaaatccatcgctcagttctagcatgtgaatgaacattcatatttaccatttgatgaggtttggatggatcagatttaaagggatgtgacgggacactcataaatgatggctcaaaccgcaaggcagttattatttgtaaatagtggtccatgtggctattacatcctgtttggatctgatccacctaaaattatgaatcaacccagatggagttggcattttagaacctgaagttcaaagatgcgtagatactcccccaaaccgcttttacatcgtcctttacccgtaggaagcacaatgcgtgcaaagactaccatacatttatatgcctgtttttgctggtcatactattgagacatactttgatcaatattgttctgccacagtggcttgaataactaccatacatttagtttgtcaaggccaatcttaattcagatgttttgtggttaccctgatttaaattttgctgaaaattaaaagtccagtctttgttatgaacatttctggctgagcaagtgagcataactcttctcagtcatttagaaaatgtgcaggatgagatttcaggagttgatagaaaatgagaatatgctttgcattacactagtaaccaaagtaatatactatctgttcattttatttaactttaggaaataatccatttattttatcatgtctgacatataaatgctccatgtcatagataatccaaactgattaattgaatatatcaagtcaagccattttatactattaccactgtcatctacctgaaaatagacaatgaatatgtgttttaaatgtttaacataaacatcaaacaagtgatgtctgttacttttcccttaggacctatccaagttgttgatgaacatttcaatgctgtgctcctgaactgttatgacgcaatcggcataatgcttatgatccgaataattcatcagcatcaggtacgctttgagttacctattgaagcagcttagaaatatcaccattcatgcccttgttgactgtccttgctttgaaggaggccacatctctctctctctctctccattttaggtagaaccctttatattgttatatgtgagaaatctaagtggaattgatgttttatgcagctaatcatgtttaagcggcgaatcccatgtttggactcttacttagacaaggtgtgtgctttgtcgcatttttgttgaaattttatacttgtatcgacttttttaagggtcactatgttggatagccaatgcttcgccatgaatctttcttttgtttcaaattcatcaagtccatttgtgcacattgcacacttgcacaggttaacttatcactctggcctcgcttcaagatggtgtttgatttgcatttgaacagcttacgaaatgcaaatgttaagactctttgggaggatgatgttcatcctcactatgtcatgaggagatatgctgaatttacagcatccctcgtgcatctcaatgttgaatatggagatggtcaggttagtttatcaaattcaactcaacccgatttctgaaaagaattattgattcccattccatgcgataagcaacccctttatatggcttatgggaattgtataatgttatttatatctgcagcttgatcttaatctcgagcggttgcggatggctgttgaggaattgcttgttaagttggctaagatgttccctaaacaaaagttgcaaactgttttcctgataaacaactatgatttaacgatttccatactgaaggtaggcggtgaaagttcaagcttcattaagttgtactgtggtgcaatctactagtatcatcttattaaatttgttctgagctgtcatacaggaagctggcactgagggtggaaaagcacaagttcactttgaggaggttcttaagagcaatatttcagtatatgtggtatgcaatgtgccctctgagatagaaataatggaatataatttctgcgtgggcacatttcattggttttactgtgttagggggtacctgtttgcatctgtttaggggctatttggttgcatcctaacttgccagggcaccaaaccgtgatgtgttgtgtgaccacttgccgtttgtcctagtctatttattttagtacgacctctgtattttccatttgattctagaatttttacatgtccagagaaaatagtgggaggcctactgtcagtttagtatttcttttcttaggattacgaagccaatcagaggctagtcccattgatttttaatactggcaacagatgtccattttttctcctttcgtttgaactttattgacaatatttgtaaagagggagctgtgtggatagttaaaattttctaggggtaagctgatataatgaacaaatatttatgcaggaggaacttctactggagcatttcagtgatttgatcaaatttgtgaaatctcgcccgtgtaagttgatccctgttacaacatcaagctggttcctttttttgcaacggcatctcatctttatgtgtgtgttttaccagctgaagacacagcatcaagctcggacaaggccagtgttagtgatgtcgagccattagtcaaggattttgccggtcggtggaaagctgcaattgagcttatgcacaaggatgtcattacatcttttagcaacttcctctgcggaatggagatcctgaaagcggcactcacgcagctgctgctgtactatacaaggatcaccgagtgtgtcaagaagatcaatggtggctctgctctcaacaaggacctggtttccatatcctctatcttatatgagatcaagaaatactccaggaccttttagtcagtactggtcctgccatgtacactggtgtattattctcatgtaacgaaaatcctgatatatgctatgcaggttggttgggtttgacacggaactctgtttctcttgctatttggcagatgttaagaaattacacgggggtgtatctaaaatagtttttcgattgagagtaatggctgtttgtggtagatcgttgagctgattagcgattagctgcctatcagtcagccattcagatgttctttaattgtagtcatagccattcagatgttctttaattgtctggcggtgtttgggaccgtagaaacttatccccgcctgtggataagtgaatagaaacacataaattttgcc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |