Os03g0428200
| Gene Name |
Os03g0428200 |
|---|---|
| Description |
Similar to Beta-caryophyllene synthase QHS1 |
| Version |
NM_001056951.1 GI:115453630 GeneID:4333167 |
| Length |
9833 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0428200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:18538664..18548496 |
| Sequence Coding Region |
18540144..18540438,18540530..18540673,18540772..18540824 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008396:18538664..18548496 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008396:18538664..18548496 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgaggcagcacatcttggaactcctaatgaagaaattctccgagaagcacaggatgaagaggttagaggccagactttacataccattgtatgaagaagataaggaggagtgcaacgagatgatacttgagctagcaaaacttgacttttatttattgcagcgacttcaccgggaagaagtcaaagaaatatgcgagtggtatcatgggctagagtccccacgtgaactattctatgcaaggcataggcctgcagaagcatatttttgggcgttgggtgtgtattatgaaccagaatatgcaaagcctaggaagttgctagcgaaattcatagcaactattacaccatatgatgatacttttgacaattatggactctggaaagagcttcaaccatttgctgacgtgatgcaacggttttgttccacatcccgatcacactttgagaaaataatattaagcaagtttcagctttatacttatcaaatataa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MRQHILELLMKKFSEKHRMKRLEARLYIPLYEEDKEECNEMILE LAKLDFYLLQRLHREEVKEICEWYHGLESPRELFYARHRPAEAYFWALGVYYEPEYAK PRKLLAKFIATITPYDDTFDNYGLWKELQPFADVMQRFCSTSRSHFEKIILSKFQLYT YQI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>8059..8353#7824..7967#7673..7725#aggcgtagctagctagcttcgttagttcagccacagagagagtacatcgtaagtgttcatatagatcagctggcagagaacaacatggccggcagagtgatcgcacaaggatatagggtggtggatgaggagcgccacgctgtaaactataggtcgagtgtgtggggtgactacttcattaggaacccaatactgcctcataactatcgggtactctctttgttcgaaactatacatctctgttctgttctagaatataagttgtacttttctgcaaagttaatatttcaaaattaacaggtaattaaactagaaatagatggttgtacactactggggaactcatctttagttctggtttacaaccccctttagttccggattgcatacccatctttagtttcggttgaaataatcgggactaaagattcatttttagtaccgggtggtaacaccagttgggactaaaggtttttattcttttttttcattaatttttactgcttgcacattaatttccccaatcgagttgctccctacaatccccaaatcacatattcacaatcacagattcacagattcacatcatcacagatcaaatgcatcacaagttctaaaaaaatacatcataaattctaaaaaaaacatcacaaatacatcacagatcaaatacatcacaaattctaaaaaaaatcatcacaaattcctagaaaacaaattcttcctccgtcgagccgccatcgctccaccgccgccctgctgttgccgtccccgcctggctgccgtcgcctcccctcccaccgaatctggtggaggggagagcgaggccgccgcccccgcttctactgcccagccgccgccaccgcctcccctcctgccggagctggcagaggggagggcgaggccatcaccatcgccgccttgcatctcccaccctgttgtcgccgtccccgcttctcccgcccggccgttgccgccgcctagcccggccgttgcgagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagggaggaggagatcgacatagagagcgagcgaaattgaggagaaagaggcgaggactcgaggagacagagagcgaaagagataataaaggacgtgtgggtctcaatctccctcttttttctgggtcaattgtcgtggggttaggactaaagcatcccaatgtaaggacgtgggagagagatatttagtcctggttggtaataaccggaagtaaaaatgatctttaccaatcgggactaaagatcataaagtgccataggactaaagatcataaagtaccattggacttatgaaccaggactaaacatattatttagtctcggttcctattcgaacagggactaatgtgatttttgcaatcccaacaaagatcacttcttccgtagtggtaccatcatattgtatcattagatttgtaatggaaaatactttcagagtgttaattttgtagtgccaaaatctcatggctcattagctcgctcagctcgtgccggcttggctcagctcaattcagctcgttgtgttttcctaatgagccaagctacgtaccgtttcgacttgttagccataacaagctgctcgcgagcttaacaagctaggggtatatgacagccatcattactggacaagtaattagttgttttgctgttgcattttgtgtgttgccatggaacagaagcatggagacatggatgatatgaatggacctgatttatggatacagattatgtactgaatatgtgtatatacttttatggacttctaaacgtgtgaagattgaacctttgtatttgctagtttgcttgttggagtggtacttagattatatgcaaacatttgcacacttgaacttagattgcatatcaatatggtctgtagattcttgatttgaatgtgctagcccgtgagctaaacaagctggctcaagatagcaaacaagctgagcctagctcgccttctagcttattgaaataatggccgagatgagctagctaactcattatccaaacgagctagacaaaactaagcttagctatagttcgatatcctatgttatccacaaaacaagagtgtcctaaagtgtataccacaaatctagagcatctttaaacaaattttaccaaatatttatattgcacaataaagttattcttttacaatgtttggtttggagaggagctagaatgaaatggagggagtgcctctcgcttgttttactctcctttggaccaagtttaggttgaagcaagtgcctaagtttcaactaaggggcacacatatggtgaaaatatatgaactgtagcaaaaaaatatttttgaaccaggttcctacgcacccccccccccccctcaactcgcatagctccacccctgtatttggtaagagcaatattataagaatacacatggtcacacacacttgtgagcacactcacttgtgtgtaatatttgtgggtaggaccatgaccatgttcaatatgtgcatatttttgactcaagatagcgtgtttcctatcactgctagggaatcgatctttaagaccggttcgcaaccccatttagttccgattgtgataccggacgcacaatccgagactacagataggtattttaaatggctgaaataatcaggactaaaaatcgatctttagtaccagttggtgatggtagcgccaagtgttaccagccagtactaaatatattttttttaaaaaaaaatgcttgctattgcttgacgatttcttatacacacatatacgtgtgtgtgtaaatgccaatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatacatataatgtgaaccgaggtgtatatgcacctcattcctttgagcgacacgtgtacacatgttcttgtacatctagggctcgttatgtctagtaaccaccatcaaagatgtacctgcccccatggagcccctatatacagccgtgtgttgcagggttagatagttacatgttgcgttctcaatttttgcccttgctcatgctgctatacggcgaccccacacatgcgcgatatgaatgcaaaatgtaatgactgcacgtgccgcaggtgtacctctttgcaggaaaaaatgtcatgacaaaaaaacctctgcctcccctccgttttaaaaaattattgataatgtgccttttgataaaaaattatagttgcagtacagaatgtcaaaaataaactgttacaaatattatataaatctgattaaaaaagtctaatcagcttttgaccagattcgttgtatcatggtgaaaaagttacaatataaccgacgttgtaaaaaatgatatatcatttggcatatattaaaattaagaaacacattatttttatttttacatatatatgctacattgcaaaatataattccgtaatcgacaaagaaaataacgtccactacaatttgttgacaccaaaaatgaaatacaacgaaaatatcattttgaaaagtgaggtataaaaaaatgacgtcgcaaaatgatatcatatacttggcatgtgtcgaaatttaaaaaatcacatgtgtgttatttccaaaatggtcatgtatactgaaattccatggataacaaaagaaaagaaacaatattcacatgtgaaatcagtatatagcattaaaatatcagttatagcaagttaacactaatagattaatatatatatatatatatatgatcagtaaaaagccagttttaagaatagcatcggacatgcaaaattagttatagcaactaattaactatcaatattcactcacccaaaaatagaaacaaatttataaaattactcttaccaatgctctcgactcaaccccaatcacatccactaagcttgtcatgtctttatttatggatgaagccgtgcaatgtcctgttctacttggtcaaaaaaatcagtgacaagacaaaacatagccatacttgtcaccctgtacatatgcaccataacgagctgctttagcaattaagggattaactctttcccaagtaccactcaattgtgataacttttaacagcttggacacgcatcttggaacatctgaacggctgagatttgtggtgcatatgaaccttggttgatatttgcttttccatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtaatatacatgtttatatttgtaagtaacatacatatattgtgtccagtctagaaagttgtcgtcttcttcttcatcttcttccattgcaatccctaactctccgtgtgaagtccaacaattatagctggcatgaatcccgactccaacaagtagatatgaagagttcttgatgtagaatactccttctagttttgcattatttgcatggacaacatataaaacccttaggcttgtgggcattggccacactaaaaaaaataagagtaaagtatacgagcggtccttaaacttgtagggatttgtcatctaggtccctaaactctcaaaatgcatatccaaatcccaaaacttgtcatagtgtatcatctaggacccaaatcgccacaaccccttcaggatcctacgtgctgttgatgtggcatgccatacggacatgacatagcattattttgactgacattttttcttttttctttttttcttctcttttttcccctttcttctcctttctctgtgacccgtgcagaaaaaaaaagggaaaaaagaagaatgagaagaaaacgaaaaagaaaaagaaaagaagaagaaaaaagaaaaggacgcatcacgtccatgtggcattgccacatcagcgccacgtaggatcctagaggggatgtgtcaatttgggacctagatgatatattttaacaagctctgagacctggaaatgcattttgagagtttagggacctatatgacacaaccctacaagtttaaggaccgccaatgcactttactcaaaaaataatgcacgctatcaataaaaccattaggcttgtgggtattggccacgctcaaaaaataatgcacgccattaccgattcatctacatgaggaaataccaaatgcaaaggaagtctatgaaagtgaaactacttaaatagttatataataaattaaaacatcataattaaactgaaaactgatggtacacatttttaatgtattctttttatttctaatgattttaacgagttttaagtgcacttaattggagtcatagttaattatgtataaattttatctgtctcaagaaattgtaaatatatttttccatgtattatccttattttaattattttttaaagttctagacatatatttaatgcattctacttatttctaactattttaatgattttcaaatggacttagttttcgattatttttttcttcattttctatatttttcgtttgttgtttttttaacaaatttatacaaatgtttctaattttatgaagtacactaattttccccaaagaaaattttatctctcatcttttttccatatatgttattgagataataatgcatacaaacatagcaagaaatgtaaaatgttaactatgcatcaatagaggatgacgttgctaacctttagatctctttgatttgtataatatcaaaatattttcacaaaaaattttggcagcacctctctttctcctcctttcactagtagcaatggctcgggctggaggaggaagaagagcataaaaaggcaatgatctttagtactcgtttgtgtcatcaaccggtactaaaatgtcgatctttagtactggttgttgccacaaaccggtgctaaatatcctgggaggcttgatatgctctgacaaagtgtgaatcaggactaaagatagcaatgtgtcgttgggtgttttaaccggtgctaaagaggtctttagcactggtccgttaaacatctgagatatttgttgttttgccgattgagcaaagatcggttgtctagtagtgtataatccactgccactgttacttttccatacatcttgtaaatcaatatcaacaaaaatgtaattacttagcatatattattgtttacacatttcatagttatgcattaataatacatagctagccagctttctatggcggcacaatatatagtgtatctcatattggtaaccatttgctgtgtacagaaatcactggagtggatgacggaaagatgtgatgacctaatagttgaaacaagggaaatgtttgtagacatcctcaatccatttgcaaaaatgaagcttatcgatgcacttcaacgtcttggagtatcttatcattttaaagaagaaatagataactccctagaaagtctagtttctgtgaagtttgcgaatgatgatttccatgcgatctcccttcaattccggttgctaagacagcagcggcgctacatgccatgcggtatcgtttcttccctatatctatttatttgagatgcaataattttgaaaaccaccttcaggaagttgaattcattgtagagttacatatatatgacctataaaattctattatagattaaattgctataaattttcaaaatcacatattttctttcaaatcatctaactgctataacaatctgctgcactattttatttaactataactcaagtggaagtaggttaatttcatgtaaaatgtcaggtcatagttgaaatatcaatcattttgatagaatatatatgtttttccataagtttatcagagacatgtaattttcatatcttacaaaatgtacacaattactggttgatcacgttaattgtttggaaaactagactgctacttgtaaaaccctaatacatttgtcgcttgtagtagtggtgctgaggtccatgtgggccacaaaatgttgtactggttgatttaataccaccttggatgttcatattggtgaggcttagcttataagcccgtgggagccggctataaccatagtacagtcaatcagtcaatccttttaaacaaagcgaacaaaaatataagcgatgtgccactccacatgggagctagttaatgtggataatgaatcaaatcctcaacgcaacattttgtaggtagaaaattgagttcttacgtggtatgtaattacaaatttaaaagataaagcctctcaaatagttgataaaattgtaacataacttttttttccttggcaaaaaggacttgtatgtaaaggtgttttccactcatcatctaaatatttcgatgagtattttgtggcagcttatttggatggatatataattctttattctttaaaccttgtgaagaaatttatgaaaatgtctaattaacactctatctggcagttctacatgtcacatataaaatgttggcttgaaattttgtgtgttaggtggttatattctcatctaacatttttgtatcaatcgtgatcagatgcatttaaagaattcattgataaacaaggaaacttaaacggaaccctatgtagtgatacaagagcattacttgctctatatgaggcagcacatcttggaactcctaatgaagaaattctccgagaagcacaggttgaaacaacaaatcaattgaaaagaattgtggattgtattgagaaaccactctctaataaagtgagacatgctcttgagacaccatctttccgtaggatgaagaggttagaggccagactttacataccattgtatgaagaagataaggaggagtgcaacgagatgatacttgagctagcaaaacttgacttttatttattgcagcgacttcaccgggaagaagtcaaagaaatatgcgagtaagttaatttggtggaaatttataacgaatatttccattaccatataataagacattgatgattcagttctttgttttctgttttaaaggtggtatcatgggctagagtccccacgtgaactattctatgcaaggcataggcctgcagaagcatatttttgggcgttgggtgtgtattatgaaccagaatatgcaaagcctaggaagttgctagcgaaattcatagcaactattacaccatatgatgatacttttgacaattatggactctggaaagagcttcaaccatttgctgacgtgatgcaacggttttgttccacatcccgatcacactttgagaaaataatattaagcaagtttcagctttatacttatcaaatataatttaaagttaggattgatttaagttgtaattttcatggtccacacatatgcattgacataactaagtcaatgatatctctatgaatatcttgtacatgtttccccatgataatttcttataggtgggatgaaaagggtgctgagcaacttggaagatgttacaaggaatatgctcaatttatgtttggcaccatgaatgagattgagggtgcactcccaaaaggaacaccaaggaagaatgttaatgttatcaaagatatagtatgtatattctcagttttttttgtaattttttccttttaattacaccattccatccattcaattatatgtgtgtattcatgcatgacatgtttattttattaaagtaaattagtttattattaagtgttttgaaaatacatatgcaaagagcccactcatgtacatatgctttgacttactttattttatagatcactgaagtatgcaaaggctatgtaacagaaatcgattggagagatagtaaatacattcccccattaaaggagcatttgcaaatcacactagttacgtgcttctattgggcaataaactgcactgcttttgttgtttttcaagaaggtgttacagaggaggttatgatatggatgtcaggatttcctcaaattgtcaaggattcatgtattgtttctcgactaatggatgacattgttgctcatgcggtaatcttatactctgtattgtgtttaatactttttttcctttttcatctagtgcataggacatattttccaaaatacacaaaacattttctcatttttttggagagaaagcatctcccacaaatgcaccaaacataattgttatttagatgttctaaaaactaaatttttcacaatgtttggttttgcttgcttttgtgctagagattggaacttcatgtgatgctttactttgcttgtagtttgagaccgaaaggaacaatgttgctaccgctgtaacttgctatatgaaagagtatgacagcacaaaggaggaggccattaaagcactgtggaatgatgtggaaaatgcatggaaagatatgaacgaggagtacctaaaattgacctcaattccgtcttccttgcttatccaggttattaaccttgcacgcatgatggaaacaatgtacaagaaaattgatggatatactgattctgcaatactgaaagaatggatatccttgttgcttgttcagccaataacactctaggtttccatcatatgacttcgctttaatttgattttgatcagagtgtctctattatgaataatcgtgtatccaagcttgcttcggatgatcctatgtaagcagctcattgctgctttattgtcattttccttgtagtgatgtttgtatttcttcatttcaatctcgacattgctgccttatgcagaggagtgtttgtagcatgaattgctaaaaataatatttggcatttgatgtgatcttatt</dnaseqindica> |
| External Link(s) |