Os03g0571700
| Gene Name |
Os03g0571700 |
|---|---|
| Description |
Similar to TRANSPARENT TESTA 12 protein |
| Version |
NM_001057056.1 GI:115453840 GeneID:4333288 |
| Length |
9984 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0571700, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:21532827..21542810 |
| Sequence Coding Region |
21533064..21533135,21533269..21533355,21533451..21533569,21537420..21537658,21538477..21538533 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008396:21532827..21542810 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008396:21532827..21542810 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgggtacggagagcgatcagtacccggcgcacctgtcgtcgtcggcgactgtcgccgggcatggcgacgacggcgagtccccggagatcgccggtgccgcccgcctctacgtcgtcggcctcatcccgcagatcttcgcctatgccgccaacttcccgatccagaagttcctgcaggcgcagagcatcgtggcgccgagcgcctacatctccgcggccacgctcgccgcgcacgtcgccctgagctggttcgccgtctacaagcttggcctcggcctgctcggcgcctcgctgatcctcagcctcagctggtgggtcatcgtgctggcgcagttcgcgtacatcgtcgtctccgacaggtgcaggctgacgtgggccggattctcgtccaaggcgttctccggcttgccggagttcctccagctgtcggccgcgtcggcggtgatgctttgcctcgagacgtggtacttccaggtcacggtcctcatcgccggcttgctcaaggatccggagatcgccctcgactctcttgcagtgtgcatgtcaatatcaggatgggtgttcatggtgtcggttggcttcaatgcagcagctagcgttagagtgagcaatgagcttggtgcgggcaacccgagggcagcagcgttctccgtgaaggtggtgacaagcctgtcgctgatcgtggcggcaatcatagcagcgattgtcatgtgcctccgtgagtaccttagttacgtgttcacgcagggcgaagaggtcgcccgtgctgtttccagcatgaccccattgctcgctgttaccatcgtcctcaatggaattcagccagtcctgtcaggtgtggcggttggatgtggatggcaagctttcgtggcatatgttaatatcggatgttactacatcatcggtgttccgtttggttgcgttcttggatttcactttgatttgggtgctatggggatatatggtggaatgatcgtcggattgtttgttcaaactctcattcttgtttatgtcacatttcgtacagattggaatagagaggtaggagaagcaaagaagaggctcaacaaatggggtgacatagcgaagccacttctcgctaacgaagattga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGTESDQYPAHLSSSATVAGHGDDGESPEIAGAARLYVVGLIPQ IFAYAANFPIQKFLQAQSIVAPSAYISAATLAAHVALSWFAVYKLGLGLLGASLILSL SWWVIVLAQFAYIVVSDRCRLTWAGFSSKAFSGLPEFLQLSAASAVMLCLETWYFQVT VLIAGLLKDPEIALDSLAVCMSISGWVFMVSVGFNAAASVRVSNELGAGNPRAAAFSV KVVTSLSLIVAAIIAAIVMCLREYLSYVFTQGEEVARAVSSMTPLLAVTIVLNGIQPV LSGVAVGCGWQAFVAYVNIGCYYIIGVPFGCVLGFHFDLGAMGIYGGMIVGLFVQTLI LVYVTFRTDWNREVGEAKKRLNKWGDIAKPLLANED</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>9676..9747#9456..9542#9242..9360#5153..5391#4278..4334#3688..4150#46..121#cacacatatcgccgtgacgtgcacgccagctcgccgtcggcgaccatgggtacggagagcgatcagtacccggcgcacctgtcgtcgtcggcgactgtcgccgggcatggcgacgacggcggcagcagcacgaggaggagggaaggggcggcggcgggtggtggtggtgggcatgcggcgagtgccgagctggagcgcatcctggcggacgagtcggtgccgtccgcggcgcggctggcgcgcgcggcgcccgtggagctgcggctgctggtggcgctcgcggcgccggccgtggcggtgtacatgatcaactacgccatgtcgatgtcgacgcggatcatctgcggccagctcggcacgctggagctcgccgccgcctcgctcggcaacgtcggcatccaggtcttcgcctacggcctcatggtacgccatgctaactactatacgtagtagtacatatatattttcagtagttgcatgatcctcctatcatggaagaataacgtaatattggtcgattggggtcagattttatcagattgaatatcaaatcaaatcaaataagaataaagagtaggcccgaacctgaaaaccggcctttatattacaaaaattgattctttcaatttggatttgtattggtgttgccttacacaattttttcttgactttattacctttttatttttgcgattggctttcacaaagtataaaacgtataacgtataactcatagtatcaaatgtttggatatctatttacaagggggttgcataggtgctttgataattcgattagtatgcataataatataactcatatttttaaccactagagcaaatcaacaagctctcaattagacacacatcatgtggctgattcgagaaatgactgattaatattccctccgttttatactataaatcgctttagttcttgaaagtttgaccaaacttataaaaaaaatataacaatatttatagcactagattaattttattaaatataaaattgaatatattttgataacttctttattttatgttgaaaatattgctatatttcttttataaaactaaatcaaagttaaaaaagtttgatttagaaaaaagttaaaaaaaacttatgaaatagagatagtatatttgaatatcgacaaattaaattactagttatttctttcggtgcgaataagatcaaggagtgtcggaagtaaaattttattaaattatcttcacatcaaactgttccttgtattgtgttgttcggttcttgttcctattttgcaagggaccgagaagagagattcctatgggtgcaaccggaataatgctttgcatttaattaacttcttttagccgtcagaccaaattaatgcgaacggataatagcgatcgctgtattagagcaagtttagggccggttcactttaatgctattttcaatcataccattttttaaaaagttataaaaaatgtgacgtttaatttgttaccaaaattggtaaatacataagaaatcatgcttaaattttggcaatattacaatcttgccaaaatttaggcattgacaaaatttggtaaggtttattttagctactatctgaacatgcccttaataatataatgaattactagctccaaaaaatagtaaatcatttataactaacttaatagcctataaatacaatagttaactataaatctgtagaccgcttttcctctctacctcttctctttcctccatataagagcaaggctaataatatagccagctgcttactttatagatctttatagcctatctcttagccaactcatatagtggttagctctcttaactattaatatatggtccacctgtcactctcacagatttttttggttcctgtgccaaagccagctataagcttaccacccgcttttcctttttctcctctcctctctcatccacctcagcattaagccttcttatctcatccacctcagcattaagccttcttatagccttcctcagcattaagccttcttatagccttctattatacttgctctaagcacaaatataacgtggtaacatcaataacctgcttaatgatatcatcttattgtacttgttcttaatattctatctgtaagttaacaacgcggttaacacaacagtatacccaacaaataatactatcaatacagtaaagtggatgcagctctctgctttactactagggctatgtttagatccaaagtttggatccaaacttcagtccttttccatcacatcaacatgtcatacacacacaacttttcagtcacatcatcttcaatttcaaccagaatccaaactttgcgctgaactaaacatagtctacacattattgtcatgagaagggaatatatatacctcccttgaagggacaggttggaaagaaaaaaaaattcctttacactagacccaatcatttaattttttttctagacactacaaatataatatatctcagaatatgagaaaaacataggggaacttctacaagtaagaaacaataaaatcaagaaattaccattaaaatttgcctaaactgaatataatagatggcaatgaaactcagctataaggttttgccagttataaggtgacaacagaagaaaaggaaaacagttaaaaaaatccgcaaagccatcctagtattaataagttcattttaagtttttcttttcttaaatacccttaccaaccctcacctactcactcaataatattattttcctattaataatgggcacattggtttttcgctccatcttgttttcaacatctaaggtacaaggtcaaagattaagttaatttaagacatttgtaacataaaacaaaagaagtcatatggtacacagtattatcacttgaaacttgatggagaaacatgtcatgcgtgaggatcaagggcactcaaagatggagcgagagaatcagacaacaagaagcgtacatattgtcatattgatatgaccagctacagagagcgccacttttctcgttttcagatgcctgcgcagaattctgtttcttgctacagctagccatatataccttacctgttttcagatgcctacgcagaattctgtttcttgctaactatttagatcgtgcatacacgtgaaataaaacgccactcaaaagtcaagtgctctctgttgctaattaagtggtgctaactgctaagcaccatgcatgcacacacataagcttctccatgttctaactttatgcaacaaagtttcaaaaagaaaaactttacataaaaagcgattttagagtccttaagaagtctacggtgacaaagcctagataccaattgccgtcaaaagaaaaaaaaagcctagataccaacctttgtgttataatacatggtatcgatctctttgagttttaagagctggagttgataaatattttactagtaattcaattattttaatataagttttaaaaaaaattatccaataaacaatgcgctgcagcttggcatgggaagcgcggtggagacgctgtgtgggcaggcgtacggagcgcacaagtacgacatgctcggcgtgtacatgcagcgttccaccgtgctgctcaccgccaccgccgtcccgctcgccgtcatctacgtcttctccaaggagatactcatcctcctcggcgagtccccggagatcgccggtgccgcccgcctctacgtcgtcggcctcatcccgcagatcttcgcctatgccgccaacttcccgatccagaagttcctgcaggcgcagagcatcgtggcgccgagcgcctacatctccgcggccacgctcgccgcgcacgtcgccctgagctggttcgccgtctacaagcttggcctcggcctgctcggcgcctcgctgatcctcagcctcagctggtgggtcatcgtgctggcgcagttcgcgtacatcgtcgtctccgacaggtgcaggctgacgtgggccggattctcgtccaaggcgttctccggcttgccggagttcctccagctgtcggccgcgtcggcggtgatgctttgcctcgagacgtggtacttccaggtcacggtcctcatcgccggcttgctcaaggatccggagatcgccctcgactctcttgcagtgtggttagtaaagtacagtatcacattcagttaatcatccaataatgcaacctgatgaggatgaagtgtggtgcgtgatcgatgcttgatcttaatgccactgataatgatcttcaaattattcttccagcatgtcaatatcaggatgggtgttcatggtgtcggttggcttcaatgcagcagctaggtaattgtgtaattctctcttctaaggaccaggcattgacacttaaccaacaacgtgtgtacagtagtggacacatgcatcgtttcaatcataaatagtgaaatcaattacattccatcgagtaagtgagatcgagatgcttttttttatgcatgtgaacatatatccaacaaacttcctaattaatgtcacgtcttactgccatttggaggtctcatcaatccctatagggtcccaagtggttaggtatcgatatggatctgcacgtacattgcattttacccaggtgcatgcaggggtgggtcaggacgatatcccaacaaagcgagatttagtacctccatagtacatgtttatgtacttatggatctgcaaattgatataagcttaaagtgcatcatctcacaatctcaattgtactactaaatggaactcatttatatatattatggccctgtttagatccatttgaaatggcaaatggcaaatgacaaaagttttggtggcaaaagttttggtattgcaaaagtactgattggtgtttagatgtatcctaaacttttgtcattctagcactaaagtgagagagagagaaagagagagggagtggtcccaaaacactttttggcacaatttgctactatggactagcaaatgccaaatgccaaattgccaagttttactactagtatttagatccaaaatggcaaaaagtgctttaaaatggcaaattgctacttttgccatttcgaaggatgtaaacagggtctatgtacttacttcctaagtaataatgtatacggtgtttaattgtgcagcgttagagtgagcaatgagcttggtgcgggcaacccgagggcagcagcgttctccgtgaaggtggtgacaagcctgtcgctgatcgtggcggcaatcatagcagcgattgtcatgtgcctccgtgagtaccttagttacgtgttcacgcagggcgaagaggtcgcccgtgctgtttccagcatgaccccattgctcgctgttaccatcgtcctcaatggaattcagccagtcctgtcaggtacgtatctagtatatatcctcatttctcgcttgtccttaatttaatttgatattgaccggccagctatctaccaccggcacgtgaatgtcgagtttcaatgtgtattgtttttatatatttttagaaactttagtttaattcctgctaaaatggaatatagctagtataacaataaattattgtcttatatatttattgagttagatgtcgacatacaataatctaggagtaaaaaaatatgtatacctcagtccctaaaagacttcttattgaagtatttgttagttcattgcattgtcgcatgcataacaagtaaaagaaaataaatagttagttacttaagcagtcagataatcatatttacaaaatatggactgcatacgacaactaaatgctgataacgaagaaccattcgaataaactaggaaggaagcccgcgcatttgcgcgggcatgtgttgtacgttaagtttgagataagtacaagagcaaaatattaaacggagaacatctgccacgatttgtccatgaattattttcatcagcattaattgctcaatatgttaatttctgacctattagttttacattatatcatatttaagtaatatctataagcaattatttataatcttctttatcatttgaaaataaggtagaccttttttttagaaaacatgtaaacgaaagtaaagtaaggtgtttttttaaattgcatatctattataataattcatttaaggatgaattgggtgggaatgaagcttcactaaatgtatgggtttatataggctaatacgattgatgtagtttgagaggtcatccatctatgaacatttcatgtagggtgggtgagaggctccatacaacccaacatgaatacaataatgatgaaatataattgtgtagtaatattttagaaattttatgtatcatgaatacatgcttaacttttatataagatagatctaatggttataattaatagttcatcgatttaaaaggcataaaagtattccaataacgtagcttaaaaattatgattgttttaataatcaacgttattgcgaagtgagcgcagctcaattaattaggtttcatgtggtggaacttgcccacctggttcaagtcctagacttgacacgggtgcccgtatttacggctaattattctttcagtggtaggtgatgtacctatcgacagcgagacacccgtggtgactcaaaatgtgtcgactcagtttcttggaggtactcaaaggggtgctgtgtttctaaaagaaatccaatattattgattgtttctattttagtttaatagctaagaaatagcaaggagacaacaaaacttatttgcatttgttcttaaaaatatatggattagtgaacaatagctagtccgtataatatatataatccaaagtaatgaattttttaataatatagttaacttgattctttaattttaaattttatagtaaataatctaatttatctcttacttaggctacattcgatctcattggttgagcttatgcagtgcacgaaaaacgatgtaggtcatcaacgcaatattaattaagtattaaatattacaaacatgaaaatagattttttttaaaagtatagaaagtatttgcaaaacatgaacagtttaatagttcggagaatatgctcaagataaggtatagtcaatttgataagcacttaagaattcaaccttaaatttattaattatgtacttaaaaaatatatacaaatcaaaagcgcagattgagtcattaacggctaaaatcctgactgtgttttgttagaaaacaatgcgacatatttttaatttctgacaatatgtcctgagtaatattttaattactcattatttcatcttgaactatcaatgtaggcccattgatgcaaataaaatctatctattctcaacaattgtagtgtgaaatgatacgtttatttgatattttatattatattatagatctatttttggatgtgcatgttttatgaagtaatatatttttcttgtactaccacattcactaaatatatatttgatgttgattaccataaagaaaataaaaaaaatccagaggaattataatagaaaaactagcttaaaatcgttgttttctttcggtagtttcactaaatatttaacgttggctgtcattaaaaaaatacggagaaagtgaaaatccagtttaaaagctatgttttttttccaagtagtacgtatatatgcagtatgctttttttcttttttgttgtatgtcatttcttcttttctcgtttgtggttgttaacttgtacgtacgtatgccttcttggcttattccggccaatattttttaggtaagaattacatggtaaattaggagggatatattactatttataatggatctaatctaacggtgtaaattaataggtccaccaacttaaatgaaaatcgagggctagattagtttccttttctttaaatttctaagattttctctattttattaaagcgccatgtggcaacttgagagcatttttagagcgctatgtggaagcatgagagcgtttgtagaaagtttaatggacttttagtatataatagatagatagatagataatagataatagatagataaccgaaataaaattatatatccagaatagacctaagaaaacatggtcctaagtaataggcattctattaactttgttttaataatgtaatatctattttctctctgtcaaaaaagttagattgccccactcacaatactaaaaaatgattttctggacgagcactccaataggttgtagatgggccataagtgttcgtgtcttcaaaactcgaccaccattttcccatacggctccttaagagatccgcatgcaaaaattattttttccaagcgggtcacttaaaatgttcgcgtgtgggctctttaactcacccgcatgcaaaaatcccccctctcctcttcccactcttttattactgttctccccagctctcttctctctgtctcccaccgcccactatcctctcccggctctctctctctctccccaactcctctcaaactcctctcccctatacctcttctcccggcctcctcctctccccaccttctcgcccctttcctccggtggcgggatccggtggtaggaatgcgtcacggcagcatatctggcggtgtcgagatgcggcggtggcagatccagtggtggggaggcacaggagagacggatcaggctccccctcccatgcggcgacagcaacgacgacttgcggtggtggcaagcggtggacccagccacccctactcccgcaagatgacgaggacaaggacaaggatggggacggtgacaagatgacgacgacgacgacgacggcttcgagcaacgatggcgacaatgacccggcggcttcgagcaatgaaggcggcgacgagtagggcggcggggtcttctagggttagagtttcgtgatttttggattttattttattttttctttttatttttgtgtgtggatgacgtaagcatctggactatttccatgtgcgggtgcgccacccacacgcaaaaaaaaaagattttcgcagaccccttggtgcatgtgggtcgcccagccgcctacgaaaaatggattcaaccttatggaaaaatgcatttggtagtagtggatcacttcaacctctccgggtgcagtttcaacacatttgttgatggctatatatttctctgcatatatgtaatattcggcttttccataaaataatatggttaactaagcatgtcgggaaattgtacctaaatccttataacactattctataggtgtggcggttggatgtggatggcaagctttcgtggcatatgttaatatcggatgttactacatcatcggtgttccgtttggttgcgttcttggatttcactttgatttgggtgctatggtaatgtcttattctacaacataagtgttattccatgtcatttatattactgtaattaaatgtaagcaataattatttttatgtttgacatgaaggggatatatggtggaatgatcgtcggattgtttgttcaaactctcattcttgtttatgtcacatttcgtacagattggaatagagaggtagttggaatctgttcaaatttctccaatttaaatctacattgaattttcggtatttatggttctttgatccatcttttccatatgtaagtgagataatgcttccttaccttcaatataatgtttcttacaggtaggagaagcaaagaagaggctcaacaaatggggtgacatagcgaagccacttctcgctaacgaagattgaacaaaatggcatatttagagtgccaagttgatttgatatgatgctatatatgggaagctggatgtacgtttctagtttgagacattatgccgtatatgtgtatagggccaaattaatctacgtaccagccgaaatttgatgtttcttctgaatgtactcttttgatttgttattaatctttcgtactggctaatgtaaccaaaatgcccaaattaatctagacatcttgttccctgt</dnaseqindica> |
| External Link(s) |