Os03g0601500

From RiceWiki
Revision as of 12:47, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os03g0601500| Description = B12D family protein| Version = NM_001057157.2 GI:297601278 GeneID:4333398| Length = 5529 bp| Definition = Oryza sat...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os03g0601500

Description

B12D family protein

Version

NM_001057157.2 GI:297601278 GeneID:4333398

Length

5529 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os03g0601500, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:23224688..23230216

Sequence Coding Region

23224760..23224783,23229377..23229465,23229830..23230007

Expression

GEO Profiles:Os03g0601500

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008396:23224688..23230216 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008396:23224688..23230216 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggggcgttgggttaggcctgaggtttatcctctgatggccgcgatgatgttggcatcgggcatggttgtgttccagcttgggcgcaacgtgtgcaccaaccctgaagtcaagatcagcaagcgcaaccgccgcaacgcagtgccagacagcgcggcggaagcggagaggtacagcatgcatggtttccgccgcttcttcggccggcgtcgcccagaggtgatgccctccatcaaccgcttcttctccaactccgatcgacccaatcatgatgagaacaatgatgattga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MGRWVRPEVYPLMAAMMLASGMVVFQLGRNVCTNPEVKISKRNR RNAVPDSAAEAERYSMHGFRRFFGRRRPEVMPSINRFFSNSDRPNHDENNDD</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>73..96#4690..4778#5143..5320#gagaaaaaaaaaaactagcaaaccattgtgacagtctcaattttgcatttttgctatactgcttgcagatccatggggcgttgggttaggcctgaggtcagtatacagtctcctcttaatatattattctgcacgattattttgttgagatattgtactagtcaagagaggattcatcattttccccaaaattggttatccacttggcttttgtcccaacttggataattttggtagatctaatccacaatagatcgatgaactacttaacttagggtctgtttggtacagctcccactctgagactctaatctcttgaagctagagttgtatcaaatactttcgagaacttgaataataaagaatggagcttttatgccgtttctgaaaattaattatactatgagggtgaagcgacatttctaccgctcctcaattccgctccacccttggagtaacagctgtgccaaacgggcttagttttgctccactctatgtatttacaagaaaaaaacccaattttgcacgcgccaatctcctgccacacccgtctactcttaccaaggttgacaatttttacacaaactgatcgaaaccacgaacttttgaggtttcgacatgggatgaaagcatatcccgaatgaaatttcaaatggttttcaaggattcaattttggaacggcaaattcaaccaaaatttgatcgaaatgtggtgaaattggatcattagtggtcagtatctggcgctcaattggaaatgtgaacccggactattactcatgctcatgaatttgttctttgtattcccgcaactcagtcctgctacaccagctctgcccacctagctagttcccttgtaatggcatcctgccgcataagattgaaagtggcttactcgtgaaacccactaattttctgatgtaaaacttactaatagatgacaaaaagctacgaaactgtttattttgatcaaccagtgggttcgtgggttagccacttaaacccctaccctcgcatagtaagagagtgaatagtgatagcgcatgcatttggtggcttgtttactgttagacctgaaatagaccgctcagatcaaagcacattacagtaatcaatagagtaaattttcccgacaggtaaatcaggcagtggatcgcagctgcattaaactgccattaattgtttcatgcgttgaatcaccgtagagcaatttcagtttactgttgcgggatgactccgtattacagcagaatgaactggatccgcatcggccatgagctgagtagcgtcagagatggataaagttgacagaattaaaggctaggatgtaactgcagaatagtccgtcgtctattcattggaagaatgggaggaggggaatattggtaggaaggatggaggatgggaaaaataatgggatagagggctggtaggtttgggccggggacaagagctaccacgactgcacgagcagctggttggtttgggctgcggcccatttccagcaagcggtagcagtagtttgtcgacaaaaactccttgtatacctcaaaattttctctaatcctttttatatcttcaagttttaatcatctctcttagggcttgcagcacagtacctacatttagttccatgtctacattttactttccgtggatgtagatttttttcattattatacgaaagacgcatacacgcatacaaacatatatacaccactcacttaaatactattaagatcgtaaccgtgtatacataatatataccactccctccgtttcaggttataagacgttttgacttttgttaaagtcaaactgctttaagtttgactaagttattatgaaaatatattcaattattaattttatgaaactaatttagtattataaatattactatatttgtttataaacttagtcaaacttgaaacagtttaactttgaccaaagtcaaaacgtcttataacctgaaacggagggagtagataaaacccggtacattgctacaagataattgtgggacagtagtagatatgacctgaaaaatctacttccatacttactatacatttttctttcatatgctttttatatcgatctaaaggttataaatgattgtgatatatggtggggcttttgaaaaaagagagacaatttacatcttaggcttcatagttaaaaatatataaagtgatgtgtctctatatgagagagaattaatattaacttacagttttacatatatattcactagtacagatccttatatctgtaacgggctttacatgcctggaaatagcgggccgtcacaagaaagtcatctcaatcgggctaaaaaagtgcccgattgagatatggtcgcacggacatattagatagacataaaacttaagcccgtcacggatgacacttatcagtgacgggccgtaatttaggcccgattgagataacattccatatctcaaacgggcttgaagttggggcccgtcacagatgaccatcatccgtgacgtgcaacaacttaaggcccgtcacagatgactcatcagtgacgggctatatactaatccccggttgacatgacttaatcacttaatctctatcgggcattaattaaaactcgtcaccgatgagtatttttctatttttcatatgaaatatttatatttgtaagttgaactatagcaaaataattaacttgcagtataataattcattttacgagtcaaaataattttatgggtagtaaataatatcaaatagaaaagtcatcaacaacaaagttgtataactcatcaatatctataactttaattttggtcatttttctatataacattttttgaacagtttgaatttgaatttgaaaatatgacaactttaaacaacattttcaaatactaaatgatttcaactgaaaaagttatcaacaacaaagttgaataactcatcaagatctataacttttattttggtcatttttctatataacctttttttgaaccgtttgaatttgaatttaaaaatatgataacttcaaacaatatttttaaatactaaatgatttcaactgaaaaagttatcaacaacaaagttgaataactcatcaagatctataacttttattttggtcatttcttcatctgataaaatgttagtaacattgttcataaattttacatatatgtgtatagtttataaaaccagataagagatatgtcaattttatgaacaatgttactgtcactttatcagatgaataaatgaccaaaataaaagttatagatcttgatgagttattcaactttgttgttgataaatttttcaattgaaatcatttagtatttgaaaatgttgtttgaagttgtcatatttttaaattcaaattcaaacggttaaaaaaatgttatatagaaaaatgaccaaaataaaagttatagatcttgatgagttattcaactttgttgttgattgactttttcagttgaagtcgttcactaataaaaaattctatttgaatttctcaaactttgaatttcaaatttcaaattgtttaaatagagtgagatggagaaatgaccaaaataaaaattttgcacctcgatgagctctacaactttggttttggtgacttttccatttaaaatcatttattaaccctaatttttcttcgaagttgtcaaattttgaaaattcaaaatttgaattgttcaaataaacttatttgtacaaaggaccgatacaatagttgtagatctcgatgagttatacaattttgttgtttatgatttttgatggttgtgtatgtgaatgaatgtatatgaatgggggatgttggggtgtgatatatcacggcctagggcttaataggattaatagaatactcataccaacaaactacaactattcttccggaagccgatcttcaaataactttgatattaagcgtgtttagcctggagcaatttcctgatgggtgaccgattgggaagtgaactttgtgcaaagtattggcctgagaagggcgggacggcatggaaaggctccgattgggaagtgaactttgtgcaaagtattggcctgagaagggcgggacggcatggaaaggctagccaaaaataaaaatttattttttttaggattatactcatcagtgacgggcattaacttaggcccaattgagatgactcatctgtgacgggcattaacttaggcccgattgagatgactcatctgtgacgggctatagttaatgcccgtcacagataagggtcatctgtgacgggctatagtttaggcccgattgagataggtcatccgtgacgggctatagtttgacatgtcgtctgggttaaagctatcagtgacgggctttaattagggcccgattaagataggttcatccgtgacggccgtttgcccgattgagataatttttcacatcagtgacttctagcctgttacggacgccgtacccgattgagatgggggttaccgcccgattgagatgatgttatccgttctagtgattcaaaatattccattgtgtggcaaaaggaaaacttatggggcaaataatacattaattttgcctagttaattacatgcgtgccattcacatagatgtaataatatatatacaaaatgtattcccctggacgctgcatctattacctacatatgcaggtttatcctctgatggccgcgatgatgttggcatcgggcatggttgtgttccagcttgggcgcaacgtgtgcaccaaccctgaagtcaagtatgtcaatgcaaaacctcttccaacctaactagcctagattacagaatgtcaatatactgcctctaggttaagaatatttatcatttgagataagagctaatatcaaacttttaaaatctttgaatataaattatttctaaaatatttttagaccatatatatagattagcaaaaaagttctttaattaaattaaattatatatctattaatatttctattatatatattataatataaaatagtggttatagttaatcttttagcgttctagtcaaaaccaccagtattatcaatctgcactaattaagttatggaaatttaacttctaacatgtatttttttcggctatgctctaaataggatcagcaagcgcaaccgccgcaacgcagtgccagacagcgcggcggaagcggagaggtacagcatgcatggtttccgccgcttcttcggccggcgtcgcccagaggtgatgccctccatcaaccgcttcttctccaactccgatcgacccaatcatgatgagaacaatgatgattgatgagtaattcgcattatgtggtgtatttgttcgctataaggaccagcgttatgtgacgtaatatggttagatgtgaactggtttattattttaagaactcggcctgtgtgcatgcaaaaaagaaaaagcaagattggtaaatgtaatgtacttttactttatttgttggttcagcacttgatttttttcttttatcaacaaacttacct</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os03g0601500, RefSeq:Os03g0601500