Os03g0624000
| Gene Name |
Os03g0624000 |
|---|---|
| Description |
Similar to CDPK substrate protein 1 |
| Version |
NM_001186618.1 GI:297722366 GeneID:9269134 |
| Length |
10368 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0624000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:24454699..24465066 |
| Sequence Coding Region |
24454699..24455113,24455686..24455766,24456011..24456079,24456408..24456513,24462918..24463083 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008396:24454699..24465066 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008396:24454699..24465066 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgactactgctgccaccgcgccggatctgtcactccacataagcccgccttcgccgccggacatggccgccggcggcgagacgatggagcagttggctgagccaaagctgtgcctagggtttggcacggcggcggcggcggcggcggagcagtacaacaatggcggctgcaacctccagcagcagcagcggctgcaccaacctagccagatccagagattcaagaagagcgccagcggcggcagccctgtgtgctccggcggcgccaccggcaccggcggcgttgcggcggcgagatccgggaatggcggtggaggtgggaagaggagctctagggcgccgaggatgcgatggacgacggctctccatgcgcactttgtgcaagccgtcgagcttcttggaggccatgaaagagcgacaccaaagtcagtattggagttgatgaacgtgaaagatctcacgctggctcatgtgaagagtcacctgcaggcaacttatttgcttgacctggtgcagatgtatagaacagtgaagggaaccacagacagaacatgtgctgaaggccatgggcagatgagagatatgggctttctgaggagaggaggtggtggagtggatggctttgacgtgcttggtaacacctcttcaattgcaatcgccaatattagaaggcaggcagcagggtcgccgggtgagcatcatcaagagacgatgatgagcagcgcctggtgccagccgcagttcgcccagcagcaaaccactgcttgtgggctgccgctgccttgcccctacatcgtgtccactcaccactacctcatcaaacaaaaccagctgggaggttggaggggatcatcagggcagcagctggcggtacagcaagatgctgcagcccatagcagcctagggatcaagaacatgggacaacaacgtctgcctgctgctgctgctgcggctgcaggcaaccatgatgatgagattgtagtagtcgccagcaggattggacgacgatcgtcgggtactgcaggctttgctaggtcgtcgcctcctgcagcttcaggctgctggacgccgacgacgacgacgtggtcgccgccgccgccgctgacaccgcagaccacgtcgacgacgacgacgatgaggggcagcagcgtcgtcgtcgccgcagcagcgcaggcgtgcatgaagcagcagcagcagcagcagacgccatcgagggtgccaagcctggagatcagcctcgggaggcaggggtggcaaagcggcagcagcttggagcagcagcagcagcatcagcagcgtcatcatcagcagcagcagcggcagcgcagcgtggagtcctcggcgtccaaagaactaacgctactaaagtgctttgcatgcatggcttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MATTAATAPDLSLHISPPSPPDMAAGGETMEQLAEPKLCLGFGT AAAAAAEQYNNGGCNLQQQQRLHQPSQIQRFKKSASGGSPVCSGGATGTGGVAAARSG NGGGGGKRSSRAPRMRWTTALHAHFVQAVELLGGHERATPKSVLELMNVKDLTLAHVK SHLQATYLLDLVQMYRTVKGTTDRTCAEGHGQMRDMGFLRRGGGGVDGFDVLGNTSSI AIANIRRQAAGSPGEHHQETMMSSAWCQPQFAQQQTTACGLPLPCPYIVSTHHYLIKQ NQLGGWRGSSGQQLAVQQDAAAHSSLGIKNMGQQRLPAAAAAAAGNHDDEIVVVASRI GRRSSGTAGFARSSPPAASGCWTPTTTTWSPPPPLTPQTTSTTTTMRGSSVVVAAAAQ ACMKQQQQQQTPSRVPSLEISLGRQGWQSGSSLEQQQQHQQRHHQQQQRQRSVESSAS KELTLLKCFACMA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..415#988..1068#1313..1381#1710..1815#8220..8385#9529..10067#10353..10368#atggcgactactgctgccaccgcgccggatctgtcactccacataagcccgccttcgccgccggacatggccgccggcggcgagacgatggagcagttggctgagccaaagctgtgcctagggtttggcacggcggcggcggcggcggcggagcagtacaacaatggcggctgcaacctccagcagcagcagcggctgcaccaacctagccagatccagagattcaagaagagcgccagcggcggcagccctgtgtgctccggcggcgccaccggcaccggcggcgttgcggcggcgagatccgggaatggcggtggaggtgggaagaggagctctagggcgccgaggatgcgatggacgacggctctccatgcgcactttgtgcaagccgtcgagcttcttggaggccatgaaagtaggttcatatgcatgcatatatactatgcacatacagatcatacagccttggatgtaattaattagttaattaatgctttgcttgcttcttcttcttgttcgattgttccttttgctgtttgacctttttcaattcacatgactgttcttggactagttgaagtttttgcacaatcacatgagacaagggaattgtgtctattcaatatatacacctgcaacttgagtttctcgcgtgttcttgtattaactttcttttttgttcttgtatgaatttcagaggagtcaaattgactttttccccccttagctgttccaatataatgcatcgattgtttgcaatcttgtgactccatttgtagttttcccgtttactttttgaaagcattgttgttcgaagagttttttttttctaatccaatccagtatttgctatcatggtttccttgttgttttgaaattttctcttattcatgtgtaccatatactacggatttaacaagttcgatcgttcattatgaaaaaaaaaatgttgtaaaatgaagctattaattttcactatgtttctaggagcgacaccaaagtcagtattggagttgatgaacgtgaaagatctcacgctggctcatgtgaagagtcacctgcaggcaagtagatctctcactctagtccatatcaacattcaagagaataaaacaatgtaactaaagtatgtataattgtataataataaatttttttatcgattagctctcttttcttttttatttttggtctctctcgctataacattttgcatcttaagacacactagtatgattaactgcaaaagtaaaccaaatggaacacgcgcgaggtctagtctattctctctttttgcctttgttttacttagcttatttgcttgacctggtgcagatgtatagaacagtgaagggaaccacagacagaacatgtgctgaaggtaaaacaaggcctagaaaataataacttcttcttttccagagacatattttcttgcctgagttgatcattcagtaaggtcaaatcacataatgctagctgaattattggcatgggatgtgtgtatggttttgctaggaatgtcccataaagctagcaaagcatgcagtctagctagcactgtatatattgggtagtaccgtttatatatatgattttagtggaggcatatatatatcatatactgaactgttccatccataaccaaaaacacataatttttgcatatgaattagttggtcagacatgcatctatgtggtgcctgcaggccatgggcagatgagagatatgggctttctgaggagaggaggtggtggagtggatggctttgacgtgcttggtaacacctcttcaattgcaatcgccaatattaggttagtatactccacattatatctggtcgattaattaattattgtagcacactaatattgcgcaatgaatgaaataaaagtatcagctagggtttcccttttcttttacacatcagggttgtttctaaccttaatttgattcttccttttttttttgcataatcggcatttgtattataaaaaaattatattgtacgttgtggctgcaaatctctgcgtcttccatttttctccatttgatgcatgttttgttggatttgagcatcttctgtgcatgcaattaaacagatatgtctttatatacatcaatgcatgcttgcaagtatgtggggcagttaaattgcatggcagaaaattttggagctatttgaatgtacatcataattaaactcatgtgccggatctattagatcgactcataattgtctttcgatactaatttgtacaatgctcatgttaactttctctatatcaaattaattatgtgaaggggtacggtttgcatgaaacgacgttttaatttccatttatggtttatggttatacatataattaattgataacatttaattaatagggccttcaatctcaaggatgcaaatatataagtcacattaattaaaaaatcaatattattaatatgtttcgatgttcacatattgtcagaatgtgcaagtttaacagttatattgtcttactatttggcatcgttacttaattaaacttgatattcgacactacattagcaattcccttttcattaacatgaccagggatgcatctaaaatattaataagactgcagccggtttgtgtcgcagaagtactcctgttttgatatgattgttattaattaaatatcctcagtagcgcatttagagagtagatctagtactcctacttgattttcagacacttaacgcatcatttcaatcaggttttgtcctgtgtagaagtacaagttaacaaattatcattaaacgttcagagaatgtacgacagattcaaattaatggatttttagtacaaattaacaacggtccgttcatatatactccagaaaattaggaatgcaaaaaatgaggggatcatcatatcaaacattgtgtgtaatgcatattatccacaaatacacatggtatttgtcatatggatatttgtatggatgaattaagtagatgggagtgattctgaaggattttataattaagaagctgatctgagaaagctacgaacaggaaaattgtgtatattatatatcattattaatatgttccataaagtataaacatattaaattgtattttacattttaaattttttaaaagaacttggggtcgaataattaacaaatattttctgcaagaatcttatgtattttatctaaaggaaggaattctcatatatttatatattgattttttccaaaaaaaacctgttattttggaggaaaaacaagtttcctaaaacaattagtttttacccatgtttttcaaaagcttgttttctcaagaactaccacatgagatgtttgctagcattttacccacgggaaataattattaacaacattattacaaaattaaatatcggttacgtgcaggggcggagctacatgtgcatggggtgcaggaacctagctcagacatttttttagctataatttatctattttcactatatatgcaccttctaaattaaaacttacatactcgttccagtctaaacttgatcttgtcccaatatatagagggtaaagcaagcgattgaaaccctctccatttgattctagcttcacatctggttatgtgtatatcgatctaggatacttaatttcacgcctagaatatacatcaggctggtgaacatttatcaaatacttcaattgacctactatatatgttatatctaggatgactggctgtgaacttaattacagtaacttacttaggcatatgtaaaaaataagtgaagtattcgtgtattattgtgcagattaagatattggtcaaattcatgaatctatatttatttacacatgataaaactttttcctcccattattagtttgggtagtgtgaggttttgagaggatttgctatgacgtgtaactgtatctacaagccttaatttcatacctatgatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatagacacacacacacaagggttgtactttaataaactaaagtttaaaaaaaacacacttttataacccttgtataattgtacgtgtatgatcttagaataactgtactacttaggcctatgtaatagaataaatgaattttatcgcattattattcatatttaagacattactttttgagcaattttacagtccttgaggggtaacatgaggcaccattttttctattgcaaatttggtatctctttatatctagatactatgaggtactaaattttatactaaatttttagtatcttatggtacatccttaaggaccgtagaatgctcttactttttaggtatggtttcatgggttatcactcatttgatggtttcctcgcatactattcccctttcttatatataataacaacttattttctctcattagttttgtgtggtgcggtgtgataggttttggaagggtgcggttgcagtagtgtaccccattgtcaatcctaggatttgatccctggaccaatatttggttatcggtcgtccttttcgacacaatgggaattgagtgctaacaacttctattggctgtcatgcatatttcccttcacttatgcatgaatacatatatctcccagagaacaaggtggctagctatagctaagggtgacaaatcctgcatactgtctgatgtagtagtactactactacagccatgcatatactgtccttctctcgtgattcaaactctcatgcatgacacatcctctggtgtatgctcagcatgcacacagggatagagccatctatcagacgactattatcacatatgctacccagggtggacatggcctgggctgggggacattgattaatgtctttaaaggaaaagtaatgcctactagtagctatcattaatgtttgcaaaaaagaaataaaaattgtactggctgctggaagaaaggtcatgatgcatggcaagactttcttctggcctccccctcttctccttgcttgcagtactgcagttttgttgcagctacagtagctgatctattctctctgaggtcccaatattaagcatgcacagagctactccctttataaaaaaaactcaatttagaagagattatattggctctcaattgagtttttcctgaacggaaggagcagaagtctagccaccataccacgtacggaccgggagtgtagctagctagggtttctctctatatatttttttctctcgctcacttgccgagaaagggggcgcgtttggtcttgtgtgtttctccgtctcttttttgttaatccgcattgcattgcatcttgccgttgtataaatctggtccatacattctgtctgtctagacccgtgttttcttctaggttaagttttttttttatggatggagtagaagtatagcagctgtaggtacgtagcagtggcagcagggatatatgcagcagatagctgagagagggctgcatatatgccttagttgttgctcttgtgatgattcattgatttccatggccagatccatatcaattgtccccctgcacccatgcatcagggctagtggtggccggaatcttggcgtaaaacaagtagaagatgacaagccgctgctgcagctcagcttgcttgcttgcttctgcgccctgcgatcgactacatttccatccatccatccatccatcccttgccttgaccgagcagcccagaaagcctgccatgcacacagcgacctctaattagcgcatgtagtactaagaaaatatttttaaaattttctctaggaaaattaaggggctgttatgtggctcaaaatttgatggccacgcttgtggcaaactttgactaagaaaagggtttatgactagtgggaccaaaagagtagaaagtgtggcataccaaagttatagaaacaaaccaaacactagccacatttggtcaaactaacatacctcaagtgtggcaaaatgtggcaccaaccaaacaggcctaagaagatcggttagttatgagataattaattagttgtgtgattggtaagaaaagaaaacggatgtagaaattaagtcagagatgattacagtttagttagttatatttgaaataaattttaaacgctacaagttactcctctatggccatgtttagttctttggctaaaaactttttaaagtatacggacacatatttaaaatattaaacgtaacaaaataaattacagattccacctgtaaactgcgagatgaatttattaaacctaattaatctatcattagcaaatatatactgtagcatcatatcgttatgatatcatggcgtaattaggctcaaaatattcgtctcgcaatttacatgcaaactgtgcatttggtttttttttcgtctacatttaatactccatgcatgtgtcaaacatttgatatgatatttttaccaaaattttttttatctaattaaacactccctatatatattttgtggccatgtaggagatctattacttaggccctgtttagttcacaccaaacttcctccagctcccaactttccatcacatcacatcacatccaaaactttcctacacacataaactcttaacttttttttttcaaaataccaactttctctaaacttctccctaatttcagaaactaaacttcttcctaattttagatactaaacacagctttagctagtggcgagcatggacaagccaacttggcagcagctagctagctgtagctagcaaacattgcattaacagcacaacgacgacactgtcactgctgctgctaatgccgggctctttgtgcctttgctctcgtgtctctcgatctctgacgatgatgcgttgattgcgtacacaagcgacgacaatgtatgagagcgagcgagatcctctctctgggctctggcctagcttgccaggcgagacggagttaattccttctgtgccgctgtgtacgtacagtatgtacgtacgtgtgagtgtgctagctagctagctgctgctgcatgcatctttgtttgtgtgatgagttgtaatctctgatggttttaactgtttctctgcacgttgtattcattgtgtctgctgctcttgtctgacccccggcctgcgtacgtgtacgtatgtatatacagtatgtatgtatctacgattctacgtcacgtgatccgctacgtatatatctctgtacatgcatatgtactacagtacgtatatcttgctatcatcagatgtacactgcagtctgcaggcatattttctcgtctagttcttttaattccagctgcttcttttgcgcacacacacacacacacacatatatatatatatatatatatatatatatgctagtactacctccggtcatttttaatttattgtcgttttggacatatgtcttagcttgttttctttctaatttggttgtcctaaatattaattcttaattaatacaaagcacaccccaagtcttctgttgtgtagttattagccaaaaaaaaatacgctacatgcagaatgctcccaccatccaaatttatgaaagttttaactaataattaaactataacaatatgcatgtttactgttacgcatgtgatattaagatatattcgtacatattcgagttttatttatattacgtaaattttgtagttgctgataatatattatagaaaaataatacaatgtagtccatgtaaaacaaattttacgtcctatattttagagacggaagtagtgttacagatgtgtaaaaggaaaaaactagctgggagtgtggagcgctagatcgatggggtgtgtggggtcaggctgtgttcgagaggaggggaacgcaaaataaagctcgtattattgcataattagttaagtattaactattttttaaaaaaatagattaatatgtttttaaaagttttttttttgcataaattgtaccgtttagcagtttgaaaaacgtgcgcacaaaaaacgagagaggtgggttgggaaaatgggggaaggaacacagccgcctagctaccgagctgtctgttagaattcctaattaacaaatttaatttgattgatgaaatgtatcacctgttagcgaagaaaattaactgagagccggagtatgatgcaatattaatttatttgtgttgttttattgcagaaggcaggcagcagggtcgccgggtgagcatcatcaagagacgatgatgagcagcgcctggtgccagccgcagttcgcccagcagcaaaccactgcttgtgggctgccgctgccttgcccctacatcgtgtccactcaccactacctcatcaaacaaaaccagctggtatatgcatataattgatcatacattcacatccgtgcttgccgttggtctctacgtatatacagctatataaaggccggttagattgatttagattatcagaaaagtaatgcatatttaatttgcccattatctaagctaaccaccacaaaatataagtaggtttactttatcactgctattttattaatttggtgaaaacaggtgattcaataatcaataattcatactttcataggggtgtctggtttactaccaaatttgtcaaactccgttagcctattattgtttgtttcgttgccacagttaaatcaggccatagtacgttttattttaatctagaggcccacacgtcatacactctttttttaaaaaaattcacatcttgtctaaggtattgccatcaattagcaacacatttgggtggcaatcatgtctggcaatttctggggtgaaataaacatgaccttaaactctagcttaattcctggctttcctccttttgaccttttttttattttctctttcctgtattttggatcatatttttcaatcaatctttaaattaccacacttccagatcccccttatgttttccccttaaaaataattaactaaaactcaataggagtgttattctcattgatgtgtccccacaaaactaaaaattaagtgcatgatggtcacatgcatttatatggatcacatcctgcacattaatgggttttctctgtatacagcgctaggtgtggggatatagaggtttaattaggggagtaattgatatttgcagtgttggggactacaaacagcatattttcaatgtccctgcaggctgtacgtaccttactccagctagctagcactgtaccctctgccatatatacgtgccaaatatttttgcctttggaccggttaattactgtactcgctcctgattgaatgcatgtccaaacagtagtatatactgtatattgcagagcttgtcctgcctcgatgataaatcggccaggtcttcagatgtgtacagtttaatgccgttaattactactcatcatcgatctgcattacatgttgacatggatatgtgtatatatattaattgtgagttttaattaattaatcatgtaaaagatgatgcagggaggttggaggggatcatcagggcagcagctggcggtacagcaagatgctgcagcccatagcagcctagggatcaagaacatgggacaacaacgtctgcctgctgctgctgctgcggctgcaggcaaccatgatgatgagattgtagtagtcgccagcaggattggacgacgatcgtcgggtactgcaggctttgctaggtcgtcgcctcctgcagcttcaggctgctggacgccgacgacgacgacgtggtcgccgccgccgccgctgacaccgcagaccacgtcgacgacgacgacgatgaggggcagcagcgtcgtcgtcgccgcagcagcgcaggcgtgcatgaagcagcagcagcagcagcagacgccatcgagggtgccaagcctggagatcagcctcgggaggcaggggtggcaaagcggcagcagcttggagcagcagcagcagcatcagcagcgtcatcatcagcagcagcagcggcagcgcagcgtggagtcctcggcgtccaaagaactaacgctactaaagtgcttgtgagataattaattaagtaaattgagtttatagtagagtatgtttagcaagtagtagtagtttaagtagtggttaattagttattaatctcaacaagcagaattaatcgaagtgtaacaaaaattaatggccgatccccaagcctgctgctggctagcttaatttcaacaaatatgagggcggatgctagctagattaattcttggctagcttaattaatgtttttgttctgtcttctctgctggttgcttttcatattttccaactttattttttctttctagtgcatgcatggcttga</dnaseqindica> |
| External Link(s) |