Os03g0684100
| Gene Name |
Os03g0684100 |
|---|---|
| Description |
Armadillo-like helical domain containing protein |
| Version |
NM_001057452.1 GI:115454632 GeneID:4333739 |
| Length |
5850 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0684100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:28036851..28042700 |
| Sequence Coding Region |
28037122..28037271,28037413..28037684,28037798..28037882,28038234..28038369,28038775..28038923 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008396:28036851..28042700 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008396:28036851..28042700 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgcccggctcctcctccacctcctccccgggaggaaaagccgccgcggtgggcggcgaggcggggaaggagggcggagccgtgccctcgcccgcggcagctgcctccgaccacgctccggtggcgcccgacggctcgccgggaggtggcgcgctgccggcgggcggcgaagcggggaaggaggacgagggcgtcgcctcgaccggctcccgcactccgctggcccctggctcctcctcgggagaaggcgcgctcggggaatgcggcgaggcgaggaacgacgacgaagcgccagcgccagcgccacggctcatcgcctcgcccaccgccgccgccgccgccgccgccaccactgactacccacatgaaggcggcgaggcggagcaggagggcggcaacgcgtcatcaccatgtgaagagcaggaagaggatgacgacgacgacgaggaggaggaggccccgacgcatctccccttcgcaccctcgtcggaatcggagttacctgatgataagtcaacagttgatcccagcttcaccatctctctcataaggaagctggtacctcagggaccagatgtggataaagagttaagtgtgaagcagggacgaacagaagaaaaggatgctagttctgatgttggggaaccaaaacagcctcatgacaaagatctgtgggacaatgaaggttgcaaactgtgggacctttcagttattgaacctcaggcagaacttatggttaacaaccttgtacttgaagtacttttggcaaaccttcatgtgagacaatttcttcgagcaaaggaaatctgtattgggatcataggaaacttagcttgtcataaatctctggccaatgcaatcacttctcataatggattaattgctactgtcgtggatcagttatttcttgatgaccctggttgccttactgaaacattcaggttattgagcaccatttttcagagcaacgcatctatgtcatgggctgaagctctcttacctgatgagattctttcacgtattatgtggataattggaaacacagtgcatgctaccttacttcagaagatactggagtttctatcagctcttgttgatgatcaagatgtcattaccattcttatcgagcccttgataaaagtgggtttagttgactgtgctattggtttgctattaaatgagcttgaaaaatcaatggatgggaacaatctagacaggtcagattctcttgattcaatccttcgacttattgaagaactgtccgccatagacaactgttcaaaagtaatgtcatcaaatgaccaattgattaaagcactaagtaatatagtcaagttaccagataaatttgaggttgagggctattgtgcttctgtggtaatcataatagcaaatgttttgtctgatggagaacatctcacacctattctgtcccatgatttacccttactggagggcctatttgacattcttccattgatctctgatgataatgaagctcgaaatgcattttggtgtatcttgacacgtttactgcaacaagtagaagaaggagaaaccatcacgaactcttcaaaactcgagcagtttgtgtctatcttcttggctaagttcaccctcatgaaagatgacattgaaagacatgggattcaaacagaagctgattcctcagttgagggtgtttctttgaagaatgggctacgcacatctctcaaggcgatctgcagtatcacggagagatggattgcggacaagtcctccttgggcaaagaagatgcttcactgaccgaaaacaccattgaaaatgctaaagagctgctgactttctgccggcgtgcaatgggtattgctgacctgtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAPGSSSTSSPGGKAAAVGGEAGKEGGAVPSPAAAASDHAPVAP DGSPGGGALPAGGEAGKEDEGVASTGSRTPLAPGSSSGEGALGECGEARNDDEAPAPA PRLIASPTAAAAAAATTDYPHEGGEAEQEGGNASSPCEEQEEDDDDDEEEEAPTHLPF APSSESELPDDKSTVDPSFTISLIRKLVPQGPDVDKELSVKQGRTEEKDASSDVGEPK QPHDKDLWDNEGCKLWDLSVIEPQAELMVNNLVLEVLLANLHVRQFLRAKEICIGIIG NLACHKSLANAITSHNGLIATVVDQLFLDDPGCLTETFRLLSTIFQSNASMSWAEALL PDEILSRIMWIIGNTVHATLLQKILEFLSALVDDQDVITILIEPLIKVGLVDCAIGLL LNELEKSMDGNNLDRSDSLDSILRLIEELSAIDNCSKVMSSNDQLIKALSNIVKLPDK FEVEGYCASVVIIIANVLSDGEHLTPILSHDLPLLEGLFDILPLISDDNEARNAFWCI LTRLLQQVEEGETITNSSKLEQFVSIFLAKFTLMKDDIERHGIQTEADSSVEGVSLKN GLRTSLKAICSITERWIADKSSLGKEDASLTENTIENAKELLTFCRRAMGIADL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>5430..5579#5017..5288#4819..4903#4332..4467#3778..3926#2968..3094#2063..2202#1906..1971#1334..1475#1120..1214#95..595#agctcacgaggcaggaaagaaaccccaaacccgcgtcgccgacgccgtcgccggcacactcgccttcgcctcgcccaccaccaaaccacctccgatggcgcccggctcctcctccacctcctccccgggaggaaaagccgccgcggtgggcggcgaggcggggaaggagggcggagccgtgccctcgcccgcggcagctgcctccgaccacgctccggtggcgcccgacggctcgccgggaggtggcgcgctgccggcgggcggcgaagcggggaaggaggacgagggcgtcgcctcgaccggctcccgcactccgctggcccctggctcctcctcgggagaaggcgcgctcggggaatgcggcgaggcgaggaacgacgacgaagcgccagcgccagcgccacggctcatcgcctcgcccaccgccgccgccgccgccgccgccaccactgactacccacatgaaggcggcgaggcggagcaggagggcggcaacgcgtcatcaccatgtgaagagcaggaagaggatgacgacgacgacgaggaggaggaggccccgacgcatctccccttcgcaccctcgtcggaatcggaggtacgtgcgtttgccccctcagttcttgcggttcatcccctttgtctctcttacccgtctctccaacccattttgcgctgcattgctttcacactctcgccctcgtgggcatttcgtcaagcacctggtggcgggtggtgcttcgttactgtcatttaactcgtgggcatttcgtcaagcacttggtgtgcttccttactgtcctttaactcgtgggcattactgtcatctaagtgtccccaatgtcattcaagtgctttcacggagcgtatgtaccatttacagttgaaaacttatatatcatctttgcatgctcaaaattctcgtaatcaagtgttccatgcgaatgtgaaggtttaatccacaattccgcatggttctagataatttttagtgagatttctgtgtgttgcgagcttctgctttagctgacagttgacttattagaaatgacttctggatattttcaatcggtgttccattgctttattgatgttttctctcctgcttgtaattatatgcagttacctgatgataagtcaacagttgatcccagcttcaccatctctctcataaggaagctggtacctcagggaccagatgtggataaagagttaaggtgcaatttacttccagagattttattttcagttagagttctctaaaagtgaaagccgtgtgctagattttcatgctgattttgttatcagctgctaacctctgataccatgtaaacagtgtgaagcagggacgaacagaagaaaaggatgctagttctgatgttggggaaccaaaacagcctcatgacaaagatctgtgggacaatgaaggttgcaaactgtgggacctttcagttattgaacctcaggcagaacttatggtacttatctctatacttgatagttgatatcatgtcatagttgataactgtgcattgaatttaagttctacgatgagatattctgcataattattgattatgattgtgaaattttcggcatgcctctatcccaatagcatgccagcatcaatcaacatttgaacaggaagattagtatcttctactaggagtcgattcttatctattaaaatatattatttacaagaaagcttttcatgatctgcgggcatgtactatttgtaaaagattgtgctactgcaatagaaggtgaatcatcaattgagttctaagattcactgaaactactgcttgcaccatcatcgaatttttgtactgttgtattgtaagtctttaagtgcattgactgcttgcgggaagcgctaactgtgcggatctttaattcttgtaggttaacaaccttgtacttgaagtacttttggcaaaccttcatgtgagacaatttcttcgagcaaaggtgaagtggaatatccttctactactgcctccacgtttttgctagcaaatattttaataagtcttgcttctctgaattttgttctccacaggaaatctgtattgggatcataggaaacttagcttgtcataaatctctggccaatgcaatcacttctcataatggattaattgctactgtcgtggatcagttatttcttgatgaccctggttgccttactgaaacattcaggttggtattcatggaatatggtgaatgtgcgcgtaattatgtagtggaaacctggaaaccaccacataaaagtttccaaaagttttttaaaaaaatctcaccaacgaagtttgatattaaaattgtgtgtggttttctaatatcatctttactatatgtaacatttttcttgaaattttttggaaacttttacggggtggtttccactacatatttacctatgatgcacggcttgtgctaattaagactatctacatagcactttcttgtttgctctgacaagattaaaaacaataagcacgctattgtccctttgactcctttagcaaattgtaaattattgaacctgtaacaatatgtttttagcaatacaagttcttttatcacctgaaattaagcatttatcatgtggaaatgaatcaggcatcttactataatttatgcttacaacatatgttacatgcagacagatagtcatacattacacatatacagcatcactatttagtggattgtggattaaaatgcttgaatatacagctgttcttaagaaaaaaaagtaaaatgtaacttcttttagcacttgtaagtactccttattatgattccttattatgcatctccttttcttcatacacattcatgttatctttctactttttttttccttttctatttttgtatatagactatcatgacaacccgagttctgttctgaagtttactagttgtgcagtcatagtcacacagtctatttgtatacaggttattgagcaccatttttcagagcaacgcatctatgtcatgggctgaagctctcttacctgatgagattctttcacgtattatgtggataattggaaacacagtgcatgctaccttacttcagaaggtgaagtacttgtctatccagtcaactagatcctaataggttgataacttgtattgaccttagcttgatgttgaacattttaggatgatttatctatttgacattctatgtaataattgctacttttattcttttacaaatgatagttagttagatgtgtttgcataatttgttctttttcagttgatcttattatgattcagtgttagaagggcgttatgtaaatcatttctgttgattgttacatgtatggccactatcaatgtaatgaccagacctcttaatccattgtaatgtgtccaggacatccaaacaacttcttgattgcccttctgttaggagttcttatttatttcatcattattggcaactttgatcttacctgcagttgtttctcatgtttcccatgaggccatgagtctgcagacactgaagatataattgcaaactagttttgaccatttatggcctatgaactattttggaattcatccaaaaagctgtgcacttagatatttgatttagtataacttaatatatttgatttagatatttaatatagttatatggtgaaattgtggtacggctgaaatcatctggccaactgacttatggcattatcttttgaatcctgtacatgttcaaaatttgtgactatttcctttgtaaattattgggtgcagatactggagtttctatcagctcttgttgatgatcaagatgtcattaccattcttatcgagcccttgataaaagtgggtttagttgactgtgctattggtttgctattaaatgagcttgaaaaatcaatggatgggaacaatctagacaggtatgatttctgtgaattgaagtctgaactaacttcaaaattgcaaaagtgtacagttcatgtaaaattatctaagaaataagaacagatgactgtcaaatctagtgaactatactctatttacagttcataaagcatacaacatatcctcttgctataaatctaatgcatggataggtccataaatgccatctgaaatgcgggcacttgatgttcaccgataatttagtctttgtattttacagttttcatgttccttctgcttagtctgtttgcattaaccaggaattatggcatagtcatatttccttctaatcacttttttttgggttttcaaactttgagtgaatagtctagcacaggaatggaattttagtaccttgacttttttttaacacatttcaggtcagattctcttgattcaatccttcgacttattgaagaactgtccgccatagacaactgttcaaaagtaatgtcatcaaatgaccaattgattaaagcactaagtaatatagtcaagttaccagataaatttgaggtgagcatgatgctactaacagttcatttatttgattgcatgtcccatttaacgtcgtgtgcagttgaccctgcttactaaatagttttagtctgctgtactaattgatacaaattttaaggtatgccattctggattaaaagcatgaaatatatatttcaagaatatttttttttcttattgaatatatttcgggatcgtagttaggttgataagtgctattacttgtgagtcctcaatagcctcagttcttacctggattttagcacctgaaaatttatgcagattagatataattatgttccagatgagcatgctgatcatgttatatattcacaaactatgcttcaggttgagggctattgtgcttctgtggtaatcataatagcaaatgttttgtctgatggagaacatctcacacctattctgtcccatggtatgccacattttgctgagcaatatctcataattcttagccattgtttgcgagttgaaaacatgactatttagatacagtgtcacagtgtggtgttatattcattgtttcagatttacccttactggagggcctatttgacattcttccattgatctctgatgataatgaagctcgaaatgcattttggtgtatcttgacacgtttactgcaacaagtagaagaaggagaaaccatcacgaactcttcaaaactcgagcagtttgtgtctatcttcttggctaagttcaccctcatgaaagatgacattgaaagacatgggattcaaacagaagctgattcctcagttgagggtgtttctttgaagaatgggctacgcacatctgtatcctttataagaaaattcaatcctgataccatcatgcccttcatggagatacatagatcttagttttcattcccatgataaatgcatctaaacttaatatatcattgcttttcctatgctacatttttttaaaaacagctcaaggcgatctgcagtatcacggagagatggattgcggacaagtcctccttgggcaaagaagatgcttcactgaccgaaaacaccattgaaaatgctaaagagctgctgactttctgccggcgtgcaatgggtattgctgacctgtgagtttggaatacggaggttttgacgtagagggcaaccacgtacgtgaaaaattactaggagttttgctgtatagcacgagatcatccggaagtctgttaaaaccaactaggagttttgctgtagaggatcacagtgatgcatagatcatcagttgctaaagtagatcactactcacatagctctgccaatttacattgatgtggttacattattggtgctagcgatgtaatgaacgcgcataaaaatgatacggtgctagaggtttctgatc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
