Os03g0719800
| Gene Name |
Os03g0719800 |
|---|---|
| Description |
Phytochrome A |
| Version |
NM_001057631.1 GI:115454990 GeneID:4333930 |
| Length |
7810 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0719800, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:29930025..29937834 |
| Sequence Coding Region |
29931072..29931279,29931382..29931678,29931960..29932776,29932994..29935058 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008396:29930025..29937834 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008396:29930025..29937834 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgtcttcttcaagacctactcaatgttccagttcatccagcaggacccgccaaagctcccgggcaaggatattagcacaaacaactcttgatgctgaactcaatgctgaatatgaagaatatggcgactcctttgattactccaaattggttgaagcacagagaactactggacctgagcagcaagctcgttctgagaaggtcatagcttacttgcatcacattcagagagcaaagctaatccaaccatttggttgcttgttggcccttgatgagaagaccttcaatgttatagcgctcagcgagaatgcaccagagatgcttacaactgtcagccatgcagtgccaagtgttgatgatcccccaaagctacgcattggcaccaatgtatggtctcttttcactgacccaggtgccacagcactgcagaaggcactgggatttgctgatgtttccttgctgaaccctatcctagttcaatgcaagacctcaggcaagcctttctatgccattgttcatcgggcaactggttgtttggtggtagactttgagcctgtgaaacctacagaatttccagcaactgccgctggggctttgcaatcttacaaacttgctgccaaggcaatctctaagatccagtcactgccaggtggaagcatggaggtgctatgcaatacggtggtcaaggaactctttgacctcacaggatatgatagagttatggcttataagttccatgaagatgaccatggtgaagtctttgctgagatcacaaagcctggtcttgaaccttatcttggcctgcattatccagctactgatatccctcaggcagccaggtttcttttcatgaagaacaaagtccggatgatttgtgattgccgtgcaagatctatcaagattatcgaagatgagtcgctccacttggatattagcttatgtggttcaacactgagggcaccacacagttgtcatcttcagtatatggagaacatgaactcgattgcatcccttgtcatggctgttgtggttaatgagaatgaggatgatgatgaagttggggctgatcaacctgcacaacagcagaagaggaagaaactatggggactccttgtttgccaccatgagagccccagatatgttcctttcccattgcggtatgcctgtgagttcttagcacaagtgtttgctgtccatgttaacaaggagtttgaattagagaggcaagtacgcgagaaaagcatattgaggatgcaaacaatgctctctgacatgcttctcagggaatcctctcctctgagtatagtatcagggactcccaacatcatggaccttgtgaaatgtgatggtgctgctcttttgtatgggggaaaagtgtggcggctacagaatgctccaactgagtctcagatacgtgatattgccttctggctgtcagatgtccacagggattccactggcctgagtactgatagcctacatgatgctggatatccaggagctgctgctcttggtgatatgatttgtggaatggcagtagctaaaataaattccaaggatatcctgttctggttcaggtcacatacagctgctgaaatcagatggggaggtgcaaaacatgatccatcagacaaggatgacagcagaagaatgcaccctaggctgtccttcaaggcattccttgaggttgtcaagatgaagagcttgccttggaatgactatgagatggatgctattcactcattacaacttatacttagagggacactgaatgatgacatcaagccaacaagggccgctagtttagataatcaggttggtgatctcaagcttgatgggcttgctgaattgcaggcagttacaagtgaaatggttcgtctcatggaaacagcaactgtcccaatcttggctgtagatagcaatggattggtcaatggatggaatcagaaggttgctgagttgacagggttgagagtagatgaggctattggaagacacatacttaccgttgtagaggaatcttctgtaccagttgtccagaggatgctgtatttagctttgcaaggcaaagaagagaaggaagtgaaatttgaggtgaaaactcatggctccaagagagatgatggccctgttatcttggttgtgaatgcctgtgccagccgggaccttcacgaccatgttgttggtgtgtgctttgttgcacaagatatgactgttcataagttggtcatggacaaatttactcgggttgagggagactacaaagcaattattcacaatccaagcccgcttattcctcccatatttggtgctgacgaatttggatggtgctctgagtggaatgctgccatgacgaaattgaccgggtggcatagagatgaggtgatcaataagatgcttcttggtgaggtgtttgatagcaccaacgcctcctgtcttgtgaagaataaagatgcatttgtaagtctctgcattcttatcaacagtgcattagctggtgatgaaacagaaaaggctccattcagcttcttcgaccggaacgggaagtatatcgagtgccttctttctgttaacagaaaagtaaatgcagatggtgtcatcactggagtattttgtttcattcaagttcctagtcatgagctgcaacatgcactacatgtgcagcaagcctcacagcagaatgcactaacaaagttgaaagcttactcctacatgagacatgcaatcaacaaccctctctcaggtatgctttactctaggaaagcactgaagaacacaggtctgaatgaagagcagatgaaggaggtcaatgttgcagatagttgtcaccgccagctgaataaaatactttctgacttggatcaagatagcgtcatgaacaagtctagttgcttggatttggagatggttgagtttgtattgcaagatgtgtttgtggctgctgtaagtcaagtactcataacttgccagggaaaagggattagagtctcttgcaacctaccggagagatatatgaagcaaacagtctacggggatggtgttcgactacagcagattctctctgacttcctattcgtctcagtgaagttctctcctgttgggggttctgttgagatctcttgtagcctgaccaagaacagcattggggaaaaccttcatctcatagacctagaacttaggatcaagcaccagggcaaaggagtcccagcagatctgctgtcacaaatgtacgaggatgacaataaggagcagtcggatgaaggcatgagtcttgcggtttctagaaacctgctgaggctcatgaatggcgatgtccgacatatgagggaagctggcatgtcaaccttcatcctcagcgtcgaacttgcttctgctccagcaaaataa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSSSRPTQCSSSSSRTRQSSRARILAQTTLDAELNAEYEEYGDS FDYSKLVEAQRTTGPEQQARSEKVIAYLHHIQRAKLIQPFGCLLALDEKTFNVIALSE NAPEMLTTVSHAVPSVDDPPKLRIGTNVWSLFTDPGATALQKALGFADVSLLNPILVQ CKTSGKPFYAIVHRATGCLVVDFEPVKPTEFPATAAGALQSYKLAAKAISKIQSLPGG SMEVLCNTVVKELFDLTGYDRVMAYKFHEDDHGEVFAEITKPGLEPYLGLHYPATDIP QAARFLFMKNKVRMICDCRARSIKIIEDESLHLDISLCGSTLRAPHSCHLQYMENMNS IASLVMAVVVNENEDDDEVGADQPAQQQKRKKLWGLLVCHHESPRYVPFPLRYACEFL AQVFAVHVNKEFELERQVREKSILRMQTMLSDMLLRESSPLSIVSGTPNIMDLVKCDG AALLYGGKVWRLQNAPTESQIRDIAFWLSDVHRDSTGLSTDSLHDAGYPGAAALGDMI CGMAVAKINSKDILFWFRSHTAAEIRWGGAKHDPSDKDDSRRMHPRLSFKAFLEVVKM KSLPWNDYEMDAIHSLQLILRGTLNDDIKPTRAASLDNQVGDLKLDGLAELQAVTSEM VRLMETATVPILAVDSNGLVNGWNQKVAELTGLRVDEAIGRHILTVVEESSVPVVQRM LYLALQGKEEKEVKFEVKTHGSKRDDGPVILVVNACASRDLHDHVVGVCFVAQDMTVH KLVMDKFTRVEGDYKAIIHNPSPLIPPIFGADEFGWCSEWNAAMTKLTGWHRDEVINK MLLGEVFDSTNASCLVKNKDAFVSLCILINSALAGDETEKAPFSFFDRNGKYIECLLS VNRKVNADGVITGVFCFIQVPSHELQHALHVQQASQQNALTKLKAYSYMRHAINNPLS GMLYSRKALKNTGLNEEQMKEVNVADSCHRQLNKILSDLDQDSVMNKSSCLDLEMVEF VLQDVFVAAVSQVLITCQGKGIRVSCNLPERYMKQTVYGDGVRLQQILSDFLFVSVKF SPVGGSVEISCSLTKNSIGENLHLIDLELRIKHQGKGVPADLLSQMYEDDNKEQSDEG MSLAVSRNLLRLMNGDVRHMREAGMSTFILSVELASAPAK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6556..6763#6157..6453#5059..5875#2777..4841#gctatttatttattcagctcgccactgccacccgagtgcggctgccttggctttgtctcgtctgcctcctcctcttcttcccgcacagtccacagctccgccactactggagcagagctgagctgagccgagcaggtaccccggtcgatccctcctcttcccccatctttgctgctcttcgcttgtatggttggatgctgccttagctagcatcatctgctgcttgttcgtttcttggagaggaacgggctgtgctgccctgtagtgtggtgttctctttctctgatgattttgggggggacaagagatgtggtgagagatgtttgggagttggggactggagggtgctcttgtttagttcgtattttttgtgatcagggcttagcatctttgagattaacaaaaaaacttgaacttgtatgcgagtgtgatgaactgatgattgatgattcagaaatcccctttcctggggtttgtgatggatggcaagcaaagaggataaaattcggtgcttgtctctgttgagatgggtttttttaggatttgtttagtggtggatttcttggactttgggtgccactgggtggttcttggtagagggggtactgcttcagtgcttctatccatgtgccacgtcagtgtccactgactcacccccaagccttggtacaggaagaggataggaacaaaggtgaggggtagtggaaagcagcaggaacaacttgctgatcctggagaagtgtgctgttgcagaaatattgagaagatttaatctggctttgcttagttgttgttttttattgtcagaaaagccataactcaaaatccccatatgttgggataaagagaaaacaaaatgatgagttcaattgaaaatgttgctacataagagcctactattggaggagcgagtagtccaaactccaaacgatgttgctcgtcctgttaaggggttttgctccaaatttggacttgcaaacaagttaagccacaagttgtttttttagccactgttgtatgcacagcaaagacttataaaacctgtttcagtaatataataagcggcttcagtttttttttagataagcgactcttttatgctttctataaaaccttccaaatgataaaaatgcacttgatgctgatcattcgtattagtccatcatactaatttcatggacatgctaagttcagctgtttagagcaagtccgtcttctgtgatgtctgtgaacttccattcagctaagatatttcacctttttattagtaactacaactgaatatggtttgtagtttctttttggtaaaaaatatagttccatgagatttttagataatgggaaatccgggtctttgcatcagcagatattacaacccaccattacaaaatttgcagcacgtctggctgaaagtaacaaacaccaagaggacaagaaaaccatatgaaaacattgacataaggactaattaaaagaatcaggaatcaatcatatttctaaatctccatccatggcgaagatttgcatgatcattgtctcaaaagtccgccatgcaaactggatattgtccttgtcctcacacttttgcaactggtcctaaaactgatcccagtatgtggcccagtatagtaccttcatatgagatttagttggggttttggtccatgagactagtgaaagtgcagcctccgtgagtccaaggtacctttgacggcttatttcaattattattttaaatgaaaccctttaaaaattatattactttggagaattttttttccctaacagatctattgttgctgtttttacagcgccaatctaaatagttttatgtatagtggtgaaagactcgaagttgtattagattaccatttaccatgcccatgtcagagtggcatacatgtgttaacagagggaatattaggctgaaaaagagtaaatctaaacatcaaactagcagaatttccaagcaattatgcagttagatactaataacatgtttgtatcgaaactaatatgcaacagtgtttcttatgaaatagctctaatatatatcctattaatctcccacactataatctagatccaccacaataagtataatggatatgttttagcgttcctccaatcaacgtagtaatttatagaatgtggaagctttccttttatactgtttttagaatgtaaactagatttcctgcatttcatgcctttgaaaatcttaaagactggccatgtaatgccaatgaaaatcagatgaatgacaaatacaaagtagagaatatcttatcacagattagtgaaggaaattcctcagaaaggttttggctttacaggagatgtcatgcttatttgctaacacaagtgcctgcagttgtatttggagaaactttagtcctctaatgctctaagatttgttgaccgttcttcaatagcatctttaacattgtattattttacttcgtcaaccgttcttacttcatccatcgagttctagcagggctaactttttatatttctcaagctcttgaaagacaaaaacatttctcttttctgaactgctcaggcaacaaggaagtctaatcatgtggttttaggcattgatcaaagttgatagtccacatttatccactagattgaggcatctattgatattagtggattgctatacttttttgttttactgattgatgttttcaacttatattatcttgttcagcaggagtggtatacagcagataagactcttgagtgattcaggtaatcaaggcagaagatgtcttcttcaagacctactcaatgttccagttcatccagcaggacccgccaaagctcccgggcaaggatattagcacaaacaactcttgatgctgaactcaatgctgaatatgaagaatatggcgactcctttgattactccaaattggttgaagcacagagaactactggacctgagcagcaagctcgttctgagaaggtcatagcttacttgcatcacattcagagagcaaagctaatccaaccatttggttgcttgttggcccttgatgagaagaccttcaatgttatagcgctcagcgagaatgcaccagagatgcttacaactgtcagccatgcagtgccaagtgttgatgatcccccaaagctacgcattggcaccaatgtatggtctcttttcactgacccaggtgccacagcactgcagaaggcactgggatttgctgatgtttccttgctgaaccctatcctagttcaatgcaagacctcaggcaagcctttctatgccattgttcatcgggcaactggttgtttggtggtagactttgagcctgtgaaacctacagaatttccagcaactgccgctggggctttgcaatcttacaaacttgctgccaaggcaatctctaagatccagtcactgccaggtggaagcatggaggtgctatgcaatacggtggtcaaggaactctttgacctcacaggatatgatagagttatggcttataagttccatgaagatgaccatggtgaagtctttgctgagatcacaaagcctggtcttgaaccttatcttggcctgcattatccagctactgatatccctcaggcagccaggtttcttttcatgaagaacaaagtccggatgatttgtgattgccgtgcaagatctatcaagattatcgaagatgagtcgctccacttggatattagcttatgtggttcaacactgagggcaccacacagttgtcatcttcagtatatggagaacatgaactcgattgcatcccttgtcatggctgttgtggttaatgagaatgaggatgatgatgaagttggggctgatcaacctgcacaacagcagaagaggaagaaactatggggactccttgtttgccaccatgagagccccagatatgttcctttcccattgcggtatgcctgtgagttcttagcacaagtgtttgctgtccatgttaacaaggagtttgaattagagaggcaagtacgcgagaaaagcatattgaggatgcaaacaatgctctctgacatgcttctcagggaatcctctcctctgagtatagtatcagggactcccaacatcatggaccttgtgaaatgtgatggtgctgctcttttgtatgggggaaaagtgtggcggctacagaatgctccaactgagtctcagatacgtgatattgccttctggctgtcagatgtccacagggattccactggcctgagtactgatagcctacatgatgctggatatccaggagctgctgctcttggtgatatgatttgtggaatggcagtagctaaaataaattccaaggatatcctgttctggttcaggtcacatacagctgctgaaatcagatggggaggtgcaaaacatgatccatcagacaaggatgacagcagaagaatgcaccctaggctgtccttcaaggcattccttgaggttgtcaagatgaagagcttgccttggaatgactatgagatggatgctattcactcattacaacttatacttagagggacactgaatgatgacatcaagccaacaagggccgctagtttagataatcaggttggtgatctcaagcttgatgggcttgctgaattgcaggcagttacaagtgaaatggttcgtctcatggaaacagcaactgtcccaatcttggctgtagatagcaatggattggtcaatggatggaatcagaaggttgctgagttgacagggttgagagtagatgaggctattggaagacacatacttaccgttgtagaggaatcttctgtaccagttgtccagaggatgctgtatttagctttgcaaggtgggtaaattagctatagtggtttttgtctattcccccagtatttttcaagtttctgcttatttggcaattcgatttatcaaaaaaactttggggttgctttctaatgttcaatgcctagatatgctacatttgattgtcatgctcatacattaatacttgacattcagctgcgttgtgggttgattgatttctaaacatttctttgattgatcaggcaaagaagagaaggaagtgaaatttgaggtgaaaactcatggctccaagagagatgatggccctgttatcttggttgtgaatgcctgtgccagccgggaccttcacgaccatgttgttggtgtgtgctttgttgcacaagatatgactgttcataagttggtcatggacaaatttactcgggttgagggagactacaaagcaattattcacaatccaagcccgcttattcctcccatatttggtgctgacgaatttggatggtgctctgagtggaatgctgccatgacgaaattgaccgggtggcatagagatgaggtgatcaataagatgcttcttggtgaggtgtttgatagcaccaacgcctcctgtcttgtgaagaataaagatgcatttgtaagtctctgcattcttatcaacagtgcattagctggtgatgaaacagaaaaggctccattcagcttcttcgaccggaacgggaagtatatcgagtgccttctttctgttaacagaaaagtaaatgcagatggtgtcatcactggagtattttgtttcattcaagttcctagtcatgagctgcaacatgcactacatgtgcagcaagcctcacagcagaatgcactaacaaagttgaaagcttactcctacatgagacatgcaatcaacaaccctctctcaggtatgctttactctaggaaagcactgaagaacacaggtctgaatgaagagcagatgaaggaggtcaatgttgcagatagttgtcaccgccagctgaataaaatactttctgacttggatcaagatagcgtcatgaacaagtacttttcttaccaagtattctaagttactctcttaggctcttgtatttactttcagctacctttgttcttcatcaattgtcagacctaacaggtcgatggtgttgctcttatagtcttatgtgtttgtattatcttcaagtggtcaattttgctctctcaaaatgaaagaatttgttgcaccaagtcccagtggttttttactcattactcagtacaaaccttatatatatattattagttattatcttcaaactaatttcctgctgctgtgttcacaggtctagttgcttggatttggagatggttgagtttgtattgcaagatgtgtttgtggctgctgtaagtcaagtactcataacttgccagggaaaagggattagagtctcttgcaacctaccggagagatatatgaagcaaacagtctacggggatggtgttcgactacagcagattctctctgacttcctattcgtctcagtgaagttctctcctgttgggggttctgttgagatctcttgtagcctgaccaagaacagcattggggaaaaccttcatctcatagacctagaacttaggtatgttagtcatgacatttgcacgcttactcttctttctgttaagacagtcttgaagtataaaatgatgtgtattaactcttgtggatcaatgtttttcaggatcaagcaccagggcaaaggagtcccagcagatctgctgtcacaaatgtacgaggatgacaataaggagcagtcggatgaaggcatgagtcttgcggtttctagaaacctgctgaggctcatgaatggcgatgtccgacatatgagggaagctggcatgtcaaccttcatcctcagcgtcgaacttgcttctgctccagcaaaataatcatgaaatggtatgtgaaattacttaattgactgtttaggctgctcagtttgttttgcttgagaccctgtttagatgggactaaaactttcaagtccctatcacatcggatgtttggacactaattataaatattaaacgtagactattaataaaacccatccataatcttggactaattcgcgagacgaatctattgagcctaattaatccatgattagcctatgtgatgctacagtaaacattctctaattatggattaattaggcttaaaaaatttgtctcgtgaattagctttcatttatgtaattagttttgtaagtagtctatatttaatactctaaattagtgtctaaatatagggactaaagttaacccgagtccactgctgaaactgcgtcttttcctgactcgtgctctatttaagcggctacaagagtgcctatagaaccaccatgtcctgtaggcttcgcttcttccattctgattttttttagctacaaacatatttttctaccatttctgaaatacattggcttatgacatcctcttaatctgtacactttgtcacttggtacagatgactagcaaatatgatttatctaaattgctgtccattttagagataaaactacaaacaattgatttcatatatttatttctcttgcgaacaacttccactttttcaaagtaccagtgtgatacttttgctaaagagttgtgttttctgcagttcgttcgtatagccacgacggtggcttgtgcttaggattggacgtacttgcagactgaagattcactggctgcagataaatggttgactttacagataaatggtcgtatggcacatttggttatgtactgtcgtcttcttcaccatgctaatgtcagtatgtgtaatcttctaagttgcaaatgcgtgctgttgctcgcctgaactcattaagattggaagtgaaaacaccaatctgtaatatgctgtatcttgatgctgagagcattcaagttactactacatgaataaaatatggtttgactttactcact</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
