Os03g0804300

From RiceWiki
Revision as of 13:05, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os03g0804300| Description = Zinc finger, DHHC-type domain containing protein| Version = NM_001058153.1 GI:115456034 GeneID:4334485| Length = 556...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os03g0804300

Description

Zinc finger, DHHC-type domain containing protein

Version

NM_001058153.1 GI:115456034 GeneID:4334485

Length

5561 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os03g0804300, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:34421248..34426808

Sequence Coding Region

34421661..34421786,34423215..34423277,34423391..34423479,34423565..34423688,34424916..34425007
,34425111..34425354,34426413..34426625

Expression

GEO Profiles:Os03g0804300

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008396:34421248..34426808 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008396:34421248..34426808 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgcacagatccgcgggcgccacgatggcgtggaacgtgttcaggttctgcactgcgctgagggggctgggctccatcatgatcctgctcgtcctctccatcgtcggggtcacctactacgcggtcgtggtgtacaactacggccccgcgctcttcgccggcggcgccagcaccctcctcgcgctcgtcgtcctgctcctcttccacttcctgcttgttatgcttttatggagctacttttctgttgtattcaccgaccctggttctgttccaccaaattggaatctcgactttgatgaggagaggggagaaactgcccccctttctggcttagatttcaatagccaggtaaactcgcaacaatctatcgctcacaatgacacaggacatccaagggctaggtattgtaggaagtgcaaccagatgaagccacctcgatgccatcattgctctgtttgtggaagatgtgttcttaagatggatcatcattgtgtatgggttgttaattgtgttggggcactaaactacaaatactttcttctcttcctgttttacaccttccttgagacaacactggttaccctttctctattgcctcacttcatagccttctttagtgatattgatatcccaggaagtcctgcagcacttgcaaccactttcctcacctttgtgttgaacctggccttttccttgagtgttctgggttttatgattatgcatgtttcacttgtttctgctaatacaacaacaattgaggcatatgaaaagaaaactacgccacgctggatgtatgatattggccggaagaggaatttcattcaggtttttggaaatgacaagaggtattggttcatccctgcgtactcagaagaggatttgagaagaatgccagttctacagggccttgattaccctgtcaggacagatttggatgggcaagaattgtga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MHRSAGATMAWNVFRFCTALRGLGSIMILLVLSIVGVTYYAVVV YNYGPALFAGGASTLLALVVLLLFHFLLVMLLWSYFSVVFTDPGSVPPNWNLDFDEER GETAPLSGLDFNSQVNSQQSIAHNDTGHPRARYCRKCNQMKPPRCHHCSVCGRCVLKM DHHCVWVVNCVGALNYKYFLLFLFYTFLETTLVTLSLLPHFIAFFSDIDIPGSPAALA TTFLTFVLNLAFSLSVLGFMIMHVSLVSANTTTIEAYEKKTTPRWMYDIGRKRNFIQV FGNDKRYWFIPAYSEEDLRRMPVLQGLDYPVRTDLDGQEL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>5023..5148#3532..3594#3330..3418#3121..3244#1802..1893#1455..1698#184..396#aacctttgccattcccctgtcttcttccatctccaaatccttcttccctaatccccctcgccggcgaagcgcggcggcggcggcggcgccttcttccctaatcccctcgccagcggggagccgcagggcggcggaggcgtgcgtcggctgctgctgctgcgcgggcgggggaggtggggagagatgcacagatccgcgggcgccacgatggcgtggaacgtgttcaggttctgcactgcgctgagggggctgggctccatcatgatcctgctcgtcctctccatcgtcggggtcacctactacgcggtcgtggtgtacaactacggccccgcgctcttcgccggcggcgccagcaccctcctcgcgctcgtcgtcctgctcctcttccacttcctggtaactattggctcgaactcttaaggggggggggggggggtttgggtgtcaaaaacggtgaaaacgattagctggttgggtcgaatctcgcaagtagacgagagattgagtgtttttggagcaatgttaggatacaggtcgaaaattttgttatctgtgttggttgtttttttttggggtacttggttggagtggctatatgcaggctggatactgatttggataaattgatctatagcgaccgtgatctagtaattgtttgcctaatatatgcttctgtacaaaatactggatttgccgataaattgatctgttgttgccatggtataagtaattattttcctaatatatgtttctggacaaaatacatgatttgcctatgatgtatgcttgctacattgttgaaatggatatgggttgcagtgatagatttaaggataaaaaagcggcagaatgagttgataaaatgcaatgttgatgctatattgattagagaaccgcaatgttaactgaagtttccttgcccgaaatagttgattataaatactagcccccgttatattggacatattcgcactgttttgattttgtttttttccacctttattttgataccaattagtactaagtagccctgataccaatcagtactaagtagccctcgttgtatttcctcagattttttgtactaagtaggagtggctacgagtgagctggatacatgttcggacaattgagctgttatgtccatggtctagtatttattttcctatcatgcttcttgacaacatattagatgtttcctgatatacactacccacattgttgaaatgcggatggattgtactgagaagttaagaaaggaaagtgcaaaatgaggtgaacaaaatgcaatattgatgctataatgattaagaatcacaatattaactcaaaaattggatgcgaagaatagttgactataaacattagccctgtaatattaaacattttcgcaccgtttcaattttttcccgcatatttgcttttgacactaattagtttatttctcattgtagcttgttatgcttttatggagctacttttctgttgtattcaccgaccctggttctgttccaccaaattggaatctcgactttgatgaggagaggggagaaactgcccccctttctggcttagatttcaatagccaggtaaactcgcaacaatctatcgctcacaatgacacaggacatccaagggctaggtattgtaggaagtgcaaccagatgaagccacctcgatgccatcattgctctgtttgtaagttgttgatttattcttcaggatcaattttttgttgttctagttattatgaattgtatagtcaacaatattgtgtatttatcactaatcatggtttcaggtggaagatgtgttcttaagatggatcatcattgtgtatgggttgttaattgtgttggggcactaaactacaaatactttcttctcttcctggtatgatattactgtaattgatatatttcttaggatgtgtttagaagggagataggctttggagttttgttatttttaacatattcacaggctgttatttattgtcatgctagtgaaatatgcagattttttttttgttattgctttaaccctatcttttgcaatgagactggtttcattttgcccagtctatttttatgcactgtgttgacaaatcaagatcttatacagcaaactatgtccatccaccccaaaccacacacacgcacgtgaaatgtataatcaatttaagccaccatgaatacttaaaatgcttcttctattcgatgttattagctagaggggtggatctatgatgcaaggacatagatgcgtcaacacgacacaataccgatctgcggattcaccattttcagaaaaataccgatacggcgacacgtctacatattttaataaaaatactttcaaattctcaattatttacaactaaaataatcaataatgtattgcaagcaagtacaatgtacctcaaggacaatccttagctcctaaaaggatggcgctttggtgggggtgtgtagggggatgtgatttatcatgtggctatgtgggccgggccatatcgcatatgtcatatgtgccggagatgaatcgaccatgtatcagaacataaaactaattatttttttctatttaattttacaatacttggtcgatacgtatcggaggcgtattgaagatgtattgatatcggacatgtcattggtcactggtgcataacgtttccatattattatgtttacaagctaataaacaagctaaccaaatattaagtactaaactaatggagacgcaatccaacaaacagttggtagctcctctgtcatgctgctgacccactgcatatgcatcttctgtggcttttgtggctttgatgcatcagagtaattagtgtgttattgttgaatattaattattgcttttctcatctacttggggattccacttatatagcagtgaagaaaataatgcaaaaaaatataaatcagagtaattagtgtgttcacttctctgataataacatattaatattggcagtataaatgctgctgccttggtggtgctttcgtttgacttattttggactactatccttttttcttccacacagctattcgatcctttgatttctgaagctgagttcatgtttttaatgattccatgcagttttacaccttccttgagacaacactggttaccctttctctattgcctcacttcatagccttctttagtgatattgatatcccaggaagtcctgcagcacttgcaaccactttcctcacctttggtaattgcattactttcattcatgagaaattattcttgggcacgtttgactgaggattggcttataatattctttttctctgcagtgttgaacctggccttttccttgagtgttctgggttttatgattatgcatgtttcacttgtttctgctaatacaacaacaattgaggcaagtatctagaatgtataattaaatactcaagtatttatcaatgtctattaaatacttacttttgatatctccaaggtgagattaatttgttacattatttttttatttaggcatatgaaaagaaaactacgccacgctggatgtatgatattggccggaagaggaatttcattcaggttaggctttcagaacatgttaaataatctgttacttcttgtaatggtgcaagcgcacgcgaaattatctttgtttaaaggcttgatacaccttgatgaggtgggattataggacatgcacaaatgcagatattttagagggaagccatacttttggcccctctactatcccttttgtttactccacctgttccaaaataaacaaacgtagtatagggtgtgacacatcccgtactaggtttgtttattttgggacagagggaggtcatattctgaatgccaatgctaattagaaaacgtccccagttatcaaaatcatgtatatgatggttagagagtggtcttggatgatatgacatcatatatatgatgcatagagtcataggctgatgtggcaaataatttacggaaggaaattaatgctcctttttttccagatgaggtaataaatgacatactgtattaaaaaaatgatgatgtggcaaccacaaaacccaaaaccagtcaagaaagctgctttggatgcattttgcaccaattccaacagttgtgtgatgtaaattaaatggtattaaagtacaggttgtaaaccagagtagttcagaaatcaaaagtggaccttttaccccctaatttagacttctgtggtagatccacccattttcactcctcattttattatcccatttcccatacaagtgccaaattttccttatccaaatagcggttctgcaaggacagataagggatgtgatcaacctccagggcaaattaagaatttacttgaacttctatttctaatttgtgaaaattgtatatattgttccaaacttctaatattttaagctgcccgtcatttagagttccatacatttcgagtgtggcattttacaggtgctcaagggccatgatatttatttaacttatggttactttggccagtattactaaaatataacccagcaaagccgctagcctggtagtacactagtactaattcaagttagtactatgtgttatcttcaacatctgaaatatgccttctttttcatttttatttctttttttgctaagcattctactgcaaggttgcaattcttatctgttaaagccctgtttggtagtgagtttagggggtggcaacttccgggttttccattagcactttctcaaactgctaaagggtgtgctttttgcaaaaaaacaactttttatataaaagtttctttaaaaaaaaaatcaaataacctatttttcaagtttgtaataattaatactcaattaaacgtgcgctaatgacttgtcttgttttgcgtgccatgaaaaaccccattccgacatcactactgaactcagtcagccacatgtgaataagtgaacataactttaacaaaaggcaaagctaactaaacagtgttctgttaccaggtttttggaaatgacaagaggtattggttcatccctgcgtactcagaagaggatttgagaagaatgccagttctacagggccttgattaccctgtcaggacagatttggatgggcaagaattgtgatgggacaatttcgcctgtgccctcacttcccatatgcaccaaatatgttccatgtaaattttacggtttccttccgatatcgtagagttaaatatttttaaaggtacaccttagtactgacagcattgctggttgggtactacatggcctccgaagagagtgttcccagaattacttttcaaaccctgtgtaattcacttgtgctgtctgattgggcaaagaacgtagaggtcttgctattgtggctaaaagaggcatgtgatgtaaattctttttagtgtgtttcagatgggtttccagatgtatgatgtacaatgatttgagctgtgcaatagacgtacagttattagagcatgacatgttgataagataacctgtgttaattagagaactggatgtttaagtgttatttt</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os03g0804300, RefSeq:Os03g0804300