Os03g0841100
| Gene Name |
Os03g0841100 |
|---|---|
| Description |
EGF domain containing protein |
| Version |
NM_001058386.1 GI:115456500 GeneID:4334735 |
| Length |
4377 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0841100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:36211522..36215898 |
| Sequence Coding Region |
36211617..36212872,36212983..36213126,36213339..36213845,36213952..36214960 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008396:36211522..36215898 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgggagaacttctgctctggtcgatattggttatccacatttccattcctctcagaggatgtatactatataatattgggtaccttcttgtttcccatcttatgggttcaacaaaagaaactataatagctagcatgcagctggttttgctatcgatcatagcatccactgtcatgttggtggcatctggagcacctcctcccactgctgctagtcttgctccctgccccaaaacatgtggagaagtgaacatctggtatccttatggtatcgggcctggttgctttcggcagggctttgagcttacttgcgacaccaccagcaaacctttgaagctcttcttgggaaacactatgactcaggtgattagcctctatccttcaggaactgtccttgcctctatcatgtacactatccccatgattcatggagttgacacctacaacttgtcatgggactctcctgggaggaatctcaacgttgagacctacaattacttggcgttcctcggttgtgggatcggggtttacctgttccatccagatactggtaaccttgtgggtcattgcacgatcaagtgtgcctccatggaggaaatgcacatggcaaccgaaggagggatttgcaatggcatgggttgctgcactgtcacattcccggtgttatttcgaggttttagagtgaccattgttaagagtaacgagacaataccgcagcccttcaacaatatcaccatcaaggctttcttaaccttccgtccttacatttttagcattgcggatctcctgtccaataagataaatgcaagcaccattggtgcttccatggcatacctctcgactgtcatcgcagatgaaccaaattgtccaacagctcggttggataataagacacaatttgcctgtggcagtaacaattgcatagatgtggcaaatggaggttattcttgtgcttgcccaggaaattctgatgatggcaatccctaccttcttgatgattgcaaacaagagtttaaccctaccccgaaaaagaattgttctagatcatgtggtagcacaaatattcctttcccgtttgggcttgagccaggctgttttgctaagaggagatttcaactgagttgtgcatcaaatcgcactcttattggaagaccacctgcaaaatatgaagtgacaaatatatcattagatgaaggactcctttatgttaacaagctttcagaatttgaagatgccaacacaaagtatttatcagtatactatggtggttctggatattttggccaacaattaatttatggtttggaaaagtctgatttatctgaagagtatggtgtttggaagtggtctgtgaccaatttgacgtgtgaagatgcaaaaagcaaaagtgcatatgcatgtgttagcacaaacagcgagtgtcttgatgttacacatgggaagctatatattggttatcgttgcaagtgctctcttggatttgaaggaaatccttatgtccaaaatggatgtacagatattgatgaatgctctataccaaactattgtaatgggacatgttataactttaaaggaagctatagttgttgtcctcatggtatgtcttatgatcgagtaagaaggcagtgcacttccaataagaggcaaaatattgttttgggacttgccattgggattagcagtggttttggagttctagctcttacattaattgcagctatattattcaaaaggtggaagagaagcactcggaagaaaattcgaagggcatacttccgaaaaaacaaaggccttctcttggagcagctgatctcatccagtaacaatgttactcctaacacaagaatattttctttggaagatttagagaaagcaaccaacaactttgacccaacacgtatccttggatatggaggccatggtactgtttacaaggggattttatccgatcaacgagtggttgccataaagaggtccaaaattgtggagcagagtgagattgaccaatttgttaatgaggttgccatcctttcccagattattcatcgtaatgtggtgaaactttttggttgttgccttgaatctgaggtgcctcttctagtgtatgaattcatttctaatggcacacttcatggtcttcttcatggtgatctgagcaccaattgtttgttgacatgggatgatcgaatgaggattgctctagaggctgcaggggcacttgcttatctccattcctctgctgcaatgccaatcttccatagagatgtgaaatcaactaatatactcttggatggtaccttcactactaaggtttcagatttcggtgcttctaggtccatttccattgatcaaactcgcgtagttacaatagtacaggggacatttgggtacttagatccagaatatttctatacaagccaattaaccgagaagagtgatgtttatagtttcggtgtgatacttgttgaactcctaacaaggaagaagccaatttttctcaactgtcttggtgaacagaaaaatttgtgccactgttttcttcaaagcctaagagataaaacaacaatggatatactggattctcaagttgtagaggaagctagccatagagagattgatgaaatggcctcagttgcagagatgtgcttaaagactaaaggagcaaagagacctaaaatgaaagaagtggagataagactgcaactcctaagagctgcaagatcaagggcatacaaggaagacttacaaaggagcagcgaaataaagccgttattaactccgaagtacaaatgtacttccctgaacagcaccaagaatgttgaaatgggccttgttgctaatccagaatctcaggttgtctctaggtgctataccatggagagagagatgatgtactcttcacagtttcctcgctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGELLLWSILVIHISIPLRGCILYNIGYLLVSHLMGSTKETIIA SMQLVLLSIIASTVMLVASGAPPPTAASLAPCPKTCGEVNIWYPYGIGPGCFRQGFEL TCDTTSKPLKLFLGNTMTQVISLYPSGTVLASIMYTIPMIHGVDTYNLSWDSPGRNLN VETYNYLAFLGCGIGVYLFHPDTGNLVGHCTIKCASMEEMHMATEGGICNGMGCCTVT FPVLFRGFRVTIVKSNETIPQPFNNITIKAFLTFRPYIFSIADLLSNKINASTIGASM AYLSTVIADEPNCPTARLDNKTQFACGSNNCIDVANGGYSCACPGNSDDGNPYLLDDC KQEFNPTPKKNCSRSCGSTNIPFPFGLEPGCFAKRRFQLSCASNRTLIGRPPAKYEVT NISLDEGLLYVNKLSEFEDANTKYLSVYYGGSGYFGQQLIYGLEKSDLSEEYGVWKWS VTNLTCEDAKSKSAYACVSTNSECLDVTHGKLYIGYRCKCSLGFEGNPYVQNGCTDID ECSIPNYCNGTCYNFKGSYSCCPHGMSYDRVRRQCTSNKRQNIVLGLAIGISSGFGVL ALTLIAAILFKRWKRSTRKKIRRAYFRKNKGLLLEQLISSSNNVTPNTRIFSLEDLEK ATNNFDPTRILGYGGHGTVYKGILSDQRVVAIKRSKIVEQSEIDQFVNEVAILSQIIH RNVVKLFGCCLESEVPLLVYEFISNGTLHGLLHGDLSTNCLLTWDDRMRIALEAAGAL AYLHSSAAMPIFHRDVKSTNILLDGTFTTKVSDFGASRSISIDQTRVVTIVQGTFGYL DPEYFYTSQLTEKSDVYSFGVILVELLTRKKPIFLNCLGEQKNLCHCFLQSLRDKTTM DILDSQVVEEASHREIDEMASVAEMCLKTKGAKRPKMKEVEIRLQLLRAARSRAYKED LQRSSEIKPLLTPKYKCTSLNSTKNVEMGLVANPESQVVSRCYTMEREMMYSSQFPR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>3027..4282#2773..2916#2054..2560#939..1947#cctgtgacggtgtgtacctatctcgctcgtcgccgtcgttggggtcgcgagaccgcggcggcggcgggcggcgaggggccgccggcgccgaggcatccgcgaccgcgaggcgggggatggcgcgcggcgacgacggcgagcggctgcctgtcgctgttggcgtgcttccatggcagcagcagcagcaacaacaacctacggtttctgtttctcccccaaattccaaggcatatcctctcccttatatttgagttcgccatcgtaggaatttcttcagtagttcagttccaaccgaagtgcttgtcttttttttttaatctctaattgtctcatgtgcaattgcatggaagagtagggagagtcttgctatggaattggatggtattttccagcgctctagatggataggcaacatgaatttccctaggatttggtttactgtgacctccgtacggatatccttaaaaccaactgtccttttagttttagaccttttgtatgcttatgtagtgatgtggttccattgatcaacgccttcttttgcaagttagtatgttcataaatccacacagcatgtacacactagacagctttgatactgcattgaccagagttggatttggtagtcgttgtcacaattgggcattagattcaaacagatcttctacctgctcacacagagactaactcttgtctcatactgcaacagaagtcaaacataactttagttgtacatgatgatgtgtttcgttctggtggactacaatatgttcaaccaaaaagaaaggaaatttgtctccaccacaagtcttacatgtcgtcaagagagtggcgaagagtcttaaaagcatcccaagatcatctgcaaattcccccatggctagcttggttgacccggcaaggttgcagaaattgttttcttttccttcttttaatgaatgggagaacttctgctctggtcgatattggttatccacatttccattcctctcagaggatgtatactatataatattgggtaccttcttgtttcccatcttatgggttcaacaaaagaaactataatagctagcatgcagctggttttgctatcgatcatagcatccactgtcatgttggtggcatctggagcacctcctcccactgctgctagtcttgctccctgccccaaaacatgtggagaagtgaacatctggtatccttatggtatcgggcctggttgctttcggcagggctttgagcttacttgcgacaccaccagcaaacctttgaagctcttcttgggaaacactatgactcaggtgattagcctctatccttcaggaactgtccttgcctctatcatgtacactatccccatgattcatggagttgacacctacaacttgtcatgggactctcctgggaggaatctcaacgttgagacctacaattacttggcgttcctcggttgtgggatcggggtttacctgttccatccagatactggtaaccttgtgggtcattgcacgatcaagtgtgcctccatggaggaaatgcacatggcaaccgaaggagggatttgcaatggcatgggttgctgcactgtcacattcccggtgttatttcgaggttttagagtgaccattgttaagagtaacgagacaataccgcagcccttcaacaatatcaccatcaaggctttcttaaccttccgtccttacatttttagcattgcggatctcctgtccaataagataaatgcaagcaccattggtgcttccatggcatacctctcgactgtcatcgcagatgaaccaaattgtccaacagctcggttggataataagacacaatttgcctgtggcagtaacaattgcatagatgtggcaaatggaggttattcttgtgcttgcccaggaaattctgatgatggcaatccctaccttcttgatgattgcaaacaaggtacctacgcaactctagctcctctctgaacagatgttcctttctttattgattgttaattcactacatattttttgtggtcatatatgtttcttaactggaacagagtttaaccctaccccgaaaaagaattgttctagatcatgtggtagcacaaatattcctttcccgtttgggcttgagccaggctgttttgctaagaggagatttcaactgagttgtgcatcaaatcgcactcttattggaagaccacctgcaaaatatgaagtgacaaatatatcattagatgaaggactcctttatgttaacaagctttcagaatttgaagatgccaacacaaagtatttatcagtatactatggtggttctggatattttggccaacaattaatttatggtttggaaaagtctgatttatctgaagagtatggtgtttggaagtggtctgtgaccaatttgacgtgtgaagatgcaaaaagcaaaagtgcatatgcatgtgttagcacaaacagcgagtgtcttgatgttacacatgggaagctatatattggttatcgttgcaagtgctctcttggatttgaaggaaatccttatgtccaaaatggatgtacaggtacacattcctaatgtatctagtgcattcgattttcttgtatgtggcaggagcatggagatatggaatatctgaagagagtgatatgttatccaatgattttcatagtgtggaagttgtagttaatgtgcatttaattgaaaacaaaagcatataggagccatcaagagtttgatatattaaagttcacatttttagttttctgtttgcagatattgatgaatgctctataccaaactattgtaatgggacatgttataactttaaaggaagctatagttgttgtcctcatggtatgtcttatgatcgagtaagaaggcagtgcacttccaataagaggcaaaatattgttttgggtatgtcaggtttttatttattgtttgctgtatgcatgcactccaattgttgaaaatgttatcaaacccctcaaagaataacttttcaattgctgcaattactcctgtaggacttgccattgggattagcagtggttttggagttctagctcttacattaattgcagctatattattcaaaaggtggaagagaagcactcggaagaaaattcgaagggcatacttccgaaaaaacaaaggccttctcttggagcagctgatctcatccagtaacaatgttactcctaacacaagaatattttctttggaagatttagagaaagcaaccaacaactttgacccaacacgtatccttggatatggaggccatggtactgtttacaaggggattttatccgatcaacgagtggttgccataaagaggtccaaaattgtggagcagagtgagattgaccaatttgttaatgaggttgccatcctttcccagattattcatcgtaatgtggtgaaactttttggttgttgccttgaatctgaggtgcctcttctagtgtatgaattcatttctaatggcacacttcatggtcttcttcatggtgatctgagcaccaattgtttgttgacatgggatgatcgaatgaggattgctctagaggctgcaggggcacttgcttatctccattcctctgctgcaatgccaatcttccatagagatgtgaaatcaactaatatactcttggatggtaccttcactactaaggtttcagatttcggtgcttctaggtccatttccattgatcaaactcgcgtagttacaatagtacaggggacatttgggtacttagatccagaatatttctatacaagccaattaaccgagaagagtgatgtttatagtttcggtgtgatacttgttgaactcctaacaaggaagaagccaatttttctcaactgtcttggtgaacagaaaaatttgtgccactgttttcttcaaagcctaagagataaaacaacaatggatatactggattctcaagttgtagaggaagctagccatagagagattgatgaaatggcctcagttgcagagatgtgcttaaagactaaaggagcaaagagacctaaaatgaaagaagtggagataagactgcaactcctaagagctgcaagatcaagggcatacaaggaagacttacaaaggagcagcgaaataaagccgttattaactccgaagtacaaatgtacttccctgaacagcaccaagaatgttgaaatgggccttgttgctaatccagaatctcaggttgtctctaggtgctataccatggagagagagatgatgtactcttcacagtttcctcgctgattgtatttgtttcgacccttgtaatgatttatttatttttcgcttatttttgtagactgtacaaaatgaatggcacagaccaatcgatttctctg</dnaseqindica> |
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