Os09g0267500
| Gene Name |
Os09g0267500 |
|---|---|
| Description |
WD-40 repeat containing protein |
| Version |
NM_001069257.1 GI:115478253 GeneID:4346565 |
| Length |
7945 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os09g0267500, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:5660403..5668347 |
| Sequence Coding Region |
5660745..5660901,5662545..5662657,5663456..5663716,5663854..5663958,5664626..5664691 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008402:5660403..5668347 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008402:5660403..5668347 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggggttcgtggatccggcggcgccgctgctggccacgtgcggcggcgacaccgtcaagctgttcgacgtcacggtcgagtccggcgacccctgcgtcctcgcctacacccccgcgccggcacaccccgtcaacgccgtccgctggaaccacaccaatctaattgtagcaagtgctggggatgataaaaagatctcattatggcacaaaaaaggtcaaaatgtaggacagctaccaacatcaactgttgatcgtggggatgacatagaggagtgcatatattctatcagttttagcaacaagggttcacgatatctttgctctggtgggagtggccacatcgttaggatatgggatttgcagcggaagaggtgcatcaaatggttaagtggtcacactgacaccattacgggtgtgatgtataattgcaaagatgaacatttggcttcaatcagcatgaagggggatcttattctccataatcttgcttctggagcacgtgctgctgaacttagtgacccaaatgggcaggttttgagagtccttgactattcacgtaatagtaggcatatattggtgacagcaggagatgatggttctgtgcatctctgggatacaactgcaagaactccaaaggtctcatggctgaagcaacattctgcacccataagtggtgtctgtatttcgccctccagtgataagataattgctacagttggcctggacaagaagttgtacacactcgattcagggtcaagacgaccaacacacactattcctcacgaggcccctttctcatcattggcatacaatgatgatggtacaatattggctgcaggcacaaatagtggtcgtgtggtattttatgatgttcgaggaaaacctcagccattgactattcttcgtgcatacaatagctcagaggctgtgacaggtttatgttggcaaaggtcaaagcctgtcattgttaacgagaatagttcttctgaggttgctcttctgggtgggagtagtgaagaatctgttctcatgccagatcccttgccttcagcaacttcagcttttcattctggaggtgtcatcccaaatcttcggtcttctttggctgcaaacccaagtggatttctttctacctctacctcgtccactgtggaggaaactccatacaggacacggccattgtctggtggaccattatcaaagctacaggctcctcgtagtaacttcagtctaaaggatgatatggatgtattctctccacttgtagatgttcaacctttcacaccgtccagtggcagcctgtgggatgaccatgggagtgatgaaacaaaaaaggatgataaacttggagagaagaaattgtcgacaactagaaaattcccgtttattgaagacaataatgagccacatccaatctcagactggaagtcaatttccaattcaagacaggatgatgcctcatcagcaaccactacatccatgccatcatggaagagtgaactatctatcacttcacctgagacagcaactggaaatgcattatccgataggttaactcaccgccaacaagtctcgcgctttggggcttcagcctttcagactggcagctttgcatttgcaggcttacaagattcagctccaacaactggtaactcactgaaaggttctctaacaagtaatattttaatgaacctacaaaacaagggtgtcttgagcaatgcacgcccttccctggacatatcaacttctagcctccagagttcactgtcctcaggcttaatggccaagactatgccaccagtaaactccgaccagcctggagcagcacaatctagttctcaatggagaccctcaacatatactgatagagtgagcacatcgtctgttttcagtgaaggattagcatcagcctttggttcaccaaaatcaaagaagactggggcagaaacaaaagatgaactgctcagcagtcttctatcaagacaagaagcagcagctgcctcttcatctgccaaccttgtagcaaacaatggggtggtgccaccacaattgccaacatcaggtttgtcagctgatcaacagggagcttcatccttctcacttcagtatgtgcagcggatgcttgaagaatccctagggtctgttcagaagtccatccatgaggacgtgagaaatctgcacatcgaacttctaagacagtttcacatgcaagagatggaaatgtcgggcgtgttgaacctggtcttagagaagttggaaggccttacaaaggaagtgcagcagctaagaagggagaaccaacagctccggcagcagctcctctaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGFVDPAAPLLATCGGDTVKLFDVTVESGDPCVLAYTPAPAHPV NAVRWNHTNLIVASAGDDKKISLWHKKGQNVGQLPTSTVDRGDDIEECIYSISFSNKG SRYLCSGGSGHIVRIWDLQRKRCIKWLSGHTDTITGVMYNCKDEHLASISMKGDLILH NLASGARAAELSDPNGQVLRVLDYSRNSRHILVTAGDDGSVHLWDTTARTPKVSWLKQ HSAPISGVCISPSSDKIIATVGLDKKLYTLDSGSRRPTHTIPHEAPFSSLAYNDDGTI LAAGTNSGRVVFYDVRGKPQPLTILRAYNSSEAVTGLCWQRSKPVIVNENSSSEVALL GGSSEESVLMPDPLPSATSAFHSGGVIPNLRSSLAANPSGFLSTSTSSTVEETPYRTR PLSGGPLSKLQAPRSNFSLKDDMDVFSPLVDVQPFTPSSGSLWDDHGSDETKKDDKLG EKKLSTTRKFPFIEDNNEPHPISDWKSISNSRQDDASSATTTSMPSWKSELSITSPET ATGNALSDRLTHRQQVSRFGASAFQTGSFAFAGLQDSAPTTGNSLKGSLTSNILMNLQ NKGVLSNARPSLDISTSSLQSSLSSGLMAKTMPPVNSDQPGAAQSSSQWRPSTYTDRV STSSVFSEGLASAFGSPKSKKTGAETKDELLSSLLSRQEAAAASSSANLVANNGVVPP QLPTSGLSADQQGASSFSLQYVQRMLEESLGSVQKSIHEDVRNLHIELLRQFHMQEME MSGVLNLVLEKLEGLTKEVQQLRRENQQLRQQLL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>343..499#2143..2255#3054..3314#3452..3556#4224..4289#4380..4601#5398..5922#6032..6613#6701..6883#7515..7625#gcctttcgaaaagaaaactaacaaaatcgtgtgcaaaaactcgaaacaaacaggccggcggccccatgattgcagccagcaaggaacctttgaactcacactatcgagcaacgacacctcagatcccctcttgtcctcctcccccaacggcaccaaccggtcggttcacttcactagcgcaaagtagttcatttcaacccacccaccaaaaaccaaaaaaaccatttcaattttcaaatttcctcctcctcctcctcaaacccccaccacccagcccagccatccccaaaccctaaatccgccgcccgccgccgccctcgccgttgcgccattccggctgcgatggggttcgtggatccggcggcgccgctgctggccacgtgcggcggcgacaccgtcaagctgttcgacgtcacggtcgagtccggcgacccctgcgtcctcgcctacacccccgcgccggcacaccccgtcaacgccgtccgctggaaccacaccagtgagtacccccagcctcgcctcgccggctccaccgcgtgcccgctcgtcccgcctccggctctcctttcccctcccccctccccttcccagatctcccgagttgggtttacttttggcgtcgttcgcgcgaggatctctcggtgggcagccggagcctcccggccatggggatccgtactgtccgggcgattcgagctgagggtgtccgcgctcccctgtctaattgagcgatgcccctgccgcgttgttatgagatagtggcacgagaggatttatttccagcattgtgatctactgggtattgtggagtgggcttggcgcggatagactgcaggctgagagtgttgaactgtcccagtggctcgtcattcttcccgagctctgaaattctgcattgcatcttcagttagataccgcgcttatgttttctgatcctacaatgtagagccagaatttaactatttgtatgtagcgatacacagaatgcaatcaatcgagatatctttttctatttcacgactaatgaatggatgtactctgtttgctaccagtaattttagctgtattacataatcaagatggtgcattgatagactggggtaattgctgttccatctcattatataagcagcaagatagctatgctcgactaatatttgaactgcacattttacctgctggttctataatatgtttggggtaacatatagagatggagtctgagcttgtaagcagtttcatgtcaaatgtgcttgcttaagagcattttgcgttactatgcacatgcatttgggtggtgctcatagttccttagaaattcttaggtattttttgagaatgctcttgtaaacccaagtccaagaagccactgcaccctgtttggaggaactttagcttctgcttgaattatcttagtttgtaggcccaccaaacagggccttgacgtggtagagtgttctttgttgcttcatccttagcaaatctaaccaatgtgatgtttacagcaagccatcagcttacttgcaatatatctgtcatgggatcaggccgataggtcaaggcccagcctgataccaaggaaatccctatcctcatcttgtttacctaggtagctcagttggttagggtactgggtacttccctccatctatatatcgatgtaattgtatcatcattcaagattaagcaatgaatcagaattagtctaatctctccctggtgttcttctccccatcctaagtctcctttctctagcagccgatgccgcccggctatcctcccggtggtgtttatcctgtcacggccttgggttgtgacaatgtccttcagcagttaaaccaaatgcctaaaatgttaatatcccatctaactcatgaacaatggtagttatctctttgttcaatctgcatgttctgtgagcaagaaacaaatggtccctcttcttgatgcctctgtgcttaaataagcacagaggtctgcttagtgcgtaagttattcttagcctaacagtgtgcattcctatctgtctagattttttaccaaagcttagcctcaacatctggaagaaatggttcaataatgccattacatgatgagctcagctacactatatgactttcatttaatgctttaaacctgcagatctaattgtagcaagtgctggggatgataaaaagatctcattatggcacaaaaaaggtcaaaatgtaggacagctaccaacatcaactgttgatcgtggggatgacatagaggtagaagtgcactcttataatatttgtgctcttggctttctccagatagccatgcatggtactcattattctaccaggaattcatctagcatcgattcaaagagtatatatattatctattgttagggtagcattttcaatcattttctgttgatgctgttacacacattatcgatttatgatctttatttgttttagcattagagttattggcaatatgaaaatgttaaatctagactgggttactggactccagaattttgttactgttctagtacatgattggtttgacgacgcattacgggcctgtttggcatagctccagctccagctccacctctcctggagctagagcccagccaaacagttccagttccacctatattgggagtggagctaggtggagcactctcacaaaatgaactagagaggtggagctgggtttagcttgctgccttgctccacaactccactccagagtccagacacaactcctgaagttaagtttaggagttggagctctaccaaacatgccctacctgatttacttatataacgcatcacgtgcaatttgtttaaaattatattctagatatggaaactacgatggtttattattttctgtattattgattcagagttcaaaattatgtttacattttttatttcacgatatgtttcatgtttatttttaattccttctgtcgattcactactagaggaacattgaatctattatttggtaattatgacttgtgagcctgtagcttaactcagcaaattacacatcattatcaggagtgcatatattctatcagttttagcaacaagggttcacgatatctttgctctggtgggagtggccacatcgttaggatatgggatttgcagcggaagaggtgcatcaaatggttaagtggtcacactgacaccattacgggtgtgatgtataattgcaaagatgaacatttggcttcaatcagcatgaagggggatcttattctccataatcttgcttctggagcacgtgctgctgaacttagtgacccaaatgggcaggtgaataactttttactttctgtgtttctgtgtagtatggtgatgctgtcatgccctgttgtggattttaagttctcgagaattcttaaattttccccttctgatttagttttcttgcactttttctgcaaggtcaggttttgagagtccttgactattcacgtaatagtaggcatatattggtgacagcaggagatgatggttctgtgcatctctgggatacaactgcaagaactccaaaggtacctaaagtacattgatgctgcttagttgaacatctcctagggttcatcttaaatcaaagctatgccatttttatataatttgaacaaaagatagaatagagcctcgaaggtagcatgtcatataggtgataaaggaaatctaagtttaataattgccaaagttgactcttcactatctgttaccaatagttagaagcttggaaatataattaaattgattgggaaatattccctcattttgtgaatacttgtcacttttgaccgttttatttgtgcacaaatacttgtcaatttatggttcccaatgtgcattttccctattttatccatattaactcccttgctttctattctctccaccacatatttggtgattcttgaatgaagcatttagttagttttggagggcaatatgacatttcgtatgaaagttgaaagcaaacaattacctagatatgtgtgttatagtcaaaagtgacaagtgaatatatctatctatacaaatgctggttcagattattattttatgaaaaataaagaaaaattccagacagtgatttgaatagtcctctctgtttatggagacttagatgtgattgctacatttacattgctttgtgctttctctaatgctatcatctaactgattttattcatcatataggtctcatggctgaagcaacattctgcacccataagtggtgtctgtatttcgccctccagtgataaggtttggtactagttaatatggttggttcttattgtgtgaatgaataatatcttcatatcttggtattaaggtctataatttattttgtagataattgctacagttggcctggacaagaagttgtacacactcgattcagggtcaagacgaccaacacacactattcctcacgaggcccctttctcatcattggcatacaatgatgatggtacaatattggctgcaggcacaaatagtggtcgtgtggtattttatgatgttcgaggaaaacctcagccattgactattcttcgtgcatacaatagctcagaggtgcgaaattgtacatttttctttttcctcattgctgtctgcaaatatattgcatgatctacaaacagattttgttctctatgtgtaaatgaattaatccattattactattgatttctatatcggtggagcttgcgcacatgtctgctgataacttggttgcttaagtatatcacagaacccttgcttgattttgaatgttgtcaaaagttcatccattttccagtattacattactagcccatttcagtactatgttatgaaaccacattcgaagatcaaatgtatcactccttagaaaaagaagtaatcaaagatggaattttatttaagtgagggtggggattttttttgttgtagtgaaatttcacatacttataatgagcaatttagttattattaggccttctacttggttcacaattccatcttttactatatttccagttttccaccccttcctgaaaaatagagaaaacactcttctatttgcatgtattttgcagactaagtttatattctagagtatgcatatgctcataggaattgttgacgttgagcaaattgcattaggataatgtctgcatgaattatttgttgattttcagtttatgcagaccattttttctttttattctgtactatggccatgttattaacatgataagtgacaactaatctcttgaaggacaaacagttcaataaactgatatgaacctgatgtaaaatttcttcacagatattattgtatctgcactttcattgatgagattttgaatccacaatgtttaatcaggctgtgacaggtttatgttggcaaaggtcaaagcctgtcattgttaacgagaatagttcttctgaggttgctcttctgggtgggagtagtgaagaatctgttctcatgccagatcccttgccttcagcaacttcagcttttcattctggaggtgtcatcccaaatcttcggtcttctttggctgcaaacccaagtggatttctttctacctctacctcgtccactgtggaggaaactccatacaggacacggccattgtctggtggaccattatcaaagctacaggctcctcgtagtaacttcagtctaaaggatgatatggatgtattctctccacttgtagatgttcaacctttcacaccgtccagtggcagcctgtgggatgaccatgggagtgatgaaacaaaaaaggatgataaacttggagagaagaaattgtcgacaactagaaaattcccgtttattgaagacaataatgagccacatccaatctcagactggaagtcaatttccaattcaagacaggttacttgatttattctggtcctatatatcactgtttgacttgacataaccgagtcatgcaaagatgtaaagccttcttaattttgttcttcatatctctattctacaggatgatgcctcatcagcaaccactacatccatgccatcatggaagagtgaactatctatcacttcacctgagacagcaactggaaatgcattatccgataggttaactcaccgccaacaagtctcgcgctttggggcttcagcctttcagactggcagctttgcatttgcaggcttacaagattcagctccaacaactggtaactcactgaaaggttctctaacaagtaatattttaatgaacctacaaaacaagggtgtcttgagcaatgcacgcccttccctggacatatcaacttctagcctccagagttcactgtcctcaggcttaatggccaagactatgccaccagtaaactccgaccagcctggagcagcacaatctagttctcaatggagaccctcaacatatactgatagagtgagcacatcgtctgttttcagtgaaggattagcatcagcctttggttcaccaaaatcaaagaagactggggcagaaacaaaagatgaactgctcagcagtcttctatcaagacaagaagcagcagctgcctcttcatctgccaaccttgtagcaaacaatgtaagaaccacccttttgctagtattctcgtgtgacataaactgataaatgtctgaataacatagtttactggtgctattttaatagggggtggtgccaccacaattgccaacatcaggtttgtcagctgatcaacagggagcttcatccttctcacttcagtatgtgcagcggatgcttgaagaatccctagggtctgttcagaagtccatccatgaggacgtgagaaatctgcacatcgaacttctaagacagtttcacatgcaagaggtaagacaaatcttataagcaaccatgcttatagtgtacattctttctccgcttccatgcactagattacactggattgagttctagtctgtcagcaacctagtttgtcaatggcaaccacctagataacctgttccagggccatgctaaagtctacttaacacgtttggtgcctggagaactctagatgtgtcaagaggagcactggcatcatgagccgttatgcaatctgcagacagcttttcgaaagaaaagtataatagttattccctctgttcccaaatacttacacttcaccagctcatgctttagcatttatcaagttggtggtattttgaacaaaaagcggagagagaatgcttcacagacgacagtgatatcacaagcatgagccaggataaaaggaggcaaattagtgggattggatgaatcttgttaattggggtggtttaggaaaaaaattggtaaaaaatgttcaagtatacttagaaacagacgattatggctggtagcttccatctgttctgatgtgtttgtgcatttgcatctgctatgacattttctttgtgtagtttaatccatgattcgaggactccatatttacccaaggtttaataccttcttgcaacagatggaaatgtcgggcgtgttgaacctggtcttagagaagttggaaggccttacaaaggaagtgcagcagctaagaagggagaaccaacagctccggcagcagctcctctaatctgtatattcttttaggggttagttttgacattgctgtgcttcgctggagcgtacaatggctacaatccccgactgatatttgattatctgtttgtctagttgggttggcgaataggaaatccatgtttgacacggttgtacatagcatccctattcagtctaggagcatattgattaatttgacctgtttgatactttgatcagattgttttattccttttttccctttttgttgtgccatgtttggacattggatgcagtcttgttcgtgtctgcctggcctatgtggaatgctaacaaagaggtttataattgagt</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
