Os02g0106800
| Gene Name |
Os02g0106800 |
|---|---|
| Description |
TMPIT-like family protein |
| Version |
NM_001052165.1 GI:115443700 GeneID:4328022 |
| Length |
6047 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os02g0106800, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:397365..403411 |
| Sequence Coding Region |
397406..397609,398483..398561,398648..398742,399289..399393,399496..399575 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008395:397365..403411 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008395:397365..403411 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgaccgacggcgacgccctcgagtcccaggcggcggcggcggccgaggcggcgcgggagctgcgcgaggccgccgcgtccctcgtcgcccgccgctccgccgacgaggacgcgctccgccgccgcgccacggcgctcgacgccgacctccgccgcctccaggcctccctctccaccctcgcccccaccacgctcgacaaggttgaggaggaactggagcgtgccagggtaacaatctcagatagtgacgtggctgcatttctcccaagcaagcggaatgggaagttcctcaagacctttgttggccctgtaaatgtgcgggtggcgagaaaagaagataagctcagagtgaaggacgagtacaacaactacagggatagggctgcctatatgtttctattgttcccatccattctcctcctacttagatggtggatatgggatggatgccttccagccttggcagttcagatgtaccaggcttggctactattcctttacacaagttttgctctgcgggagaatgtgttgattgtaaatggaagtgatattcgtccttggtggatataccaccactatttagcaatgctaatggctctcgttagccttacatgggagataaaaggacagcctgattgttccagcaagcagaggggggtacaacttttcctgcggtgggcaatcatgcaaggaattgcaatgcatctacagaataggtaccagcgtcaaagattgcgcacccggatagctctaggaaaggctaaaagaatggatgttgttgctggagaaacagctggtgtggaagggcagctcttgctactttacccggtccttttcacattacaggttttcgaaggatatgttggagtattacttcttaagacggctttgcacgggcttgcatcggaatggcaggttgtagtttgtgggatcttgctggtggtaatggcagtcggcaactttgtcaacacgatggagactttgatgttaaaattgaggttcaaagcaaaaatgaaaagagcaaagagcaggcaggatctcagtcgccaacaccaaaattga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MATDGDALESQAAAAAEAARELREAAASLVARRSADEDALRRRA TALDADLRRLQASLSTLAPTTLDKVEEELERARVTISDSDVAAFLPSKRNGKFLKTFV GPVNVRVARKEDKLRVKDEYNNYRDRAAYMFLLFPSILLLLRWWIWDGCLPALAVQMY QAWLLFLYTSFALRENVLIVNGSDIRPWWIYHHYLAMLMALVSLTWEIKGQPDCSSKQ RGVQLFLRWAIMQGIAMHLQNRYQRQRLRTRIALGKAKRMDVVAGETAGVEGQLLLLY PVLFTLQVFEGYVGVLLLKTALHGLASEWQVVVCGILLVVMAVGNFVNTMETLMLKLR FKAKMKRAKSRQDLSRQHQN</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>42..245#1119..1197#1284..1378#1925..2029#2132..2211#2468..2558#2657..2764#3165..3251#3498..3563#5675..5824#accaccgctcgtctccaccgcgagcgaaacccaaaaaggcaatggcgaccgacggcgacgccctcgagtcccaggcggcggcggcggccgaggcggcgcgggagctgcgcgaggccgccgcgtccctcgtcgcccgccgctccgccgacgaggacgcgctccgccgccgcgccacggcgctcgacgccgacctccgccgcctccaggcctccctctccaccctcgcccccaccacgctcgacaaggtgactgcatctcgttcttctcttctactcatctccctcttcctcttcctctccccgcgcttgcttccaattcgatctctctctctctctcactcacgcgtcgcctcgtacgggtttcggcggcttggaattgaaacctacgagctgctagtacgttagatcgtgattcgtttcgtgattatctcgcaaagcagaacgcttacgcgcttcacgccttcgcctggaggattgagatgtaaagtttgcacgcccgcgatctggtgctcgtcaaacactggatttgttgcgccatctccctggagatgtctccaatttacatgcttcctattggttttcaaagttaggaatctgaggcgtgtgcatcgagctggatgctggccatggccaacgattattattgttgttttttgtattgaaatctcgaggcagtttaggcaaactatagattccgtcagaaatctgtccccatcctttactgctccgtttagagatccttggaatattcgctctccctcatgcttgtgcaaatttgtaatgcatccactaggttgctcagtacctggattgagaaacattgtccactgctccgtcgttgctaagccaaaaggtttaatctcaacctagagaattattacaacctatctagatttaatctccactgtctcccatgcatttctttagcacgcacaagtgacaaaatttgacctgtttctaaattgatataagagtctccgtccgcatgtccaagtttatcgcactcctttttagattttctacttaccttttgtacctcttttctaatatatagttttcttctgtacttctgttgtgtcatctgtgagaattgtctcattctgccatttatctatataggttgaggaggaactggagcgtgccagggtaacaatctcagatagtgacgtggctgcatttctcccaagcaagcggaatggtatgctatgatttatctcaccccccatgcccgtctcggggaaatataactgttatttatggaattcacttctccttgaaatttagggaagttcctcaagacctttgttggccctgtaaatgtgcgggtggcgagaaaagaagataagctcagagtgaaggacgagtacaacaactacagggtagattttagatgcttcttcgataatttttttttagaaagcttatgcatttactttggatatgatttcttggaccaatttaataaagctatctgtactttttattacttttattttgatgacttaagcattctaaatttccaatgattactccaattggtgtattctttaaattttgatctgtgataagaatcactattgaagagaactactaccattttctacaaaaatctaagtaaatttcagattatcaaggtcaacgagtatggtgtgtattcaatctcagacagcatgctgataaaaccttgaacctgttttgtatgtcatatggtttaattagtaaatacgggaaacatgcaattctggactaatactctagaaatcatgttgaaaggttatgtaagtgttccttttcatgtcgaattcaagcagtcctttctaaattgaacatagtggcttaactggtagagtatacttggtataattttcgctactataaatttttatgtcatgcctgacagtattgatggtttcatttatttgcaggatagggctgcctatatgtttctattgttcccatccattctcctcctacttagatggtggatatgggatggatgccttccagccttggcagttcagatgtaccaggtatttagtgccgtgcagtgattgaccctgaatatattttctctatgtatgactttgctgtccagcagaaacgatctaaagtttatttgttccacttaacaggcttggctactattcctttacacaagttttgctctgcgggagaatgtgttgattgtaaatggaagtgatattcgtccttggtatgtgtctgaatttcattgcttacagaaactgtcaactgcagcactcaacaattttatggcaaatacccatttttaatgcacggacagacaaaagtgcttgatttttttactatatgcgacttataatttgttggtatgggaaagatcttatatcaaaacatcttttaatgatattcgtaaaacccatgtttcgtttgttcacttaatctagcaaaatcaattcctttcttagaatgcattatcatcttttcaggtggatataccaccactatttagcaatgctaatggctctcgttagccttacatgggagataaaaggacagcctgattgttccagcaagcaggtaaatgatcatttttcagagaaaactagcactcactttgtcatcaaaccttcaaatttttggaacgctgaactcagacactatggctttcttttcagaggggggtacaacttttcctgcggtgggcaatcatgcaaggaattgcaatgcatctacagaataggtaccagcgtcaaagattgcgcacccggatagctctaggaaaggtaaggttctgtggttcacgtcttgcttcaagacagtactcaacaacatattcttttagtgccaagtgaaggtgtacaacatgttccaataataagattcaaatgagtatcatcttcaaatgatatgtatacaatgcagatgcttatcaaaagcaatttaatgcactaatttgcttgatgtttgttgatatttgcatatcagctaagagttcggaatatcactgaaactaatttagagaagatgctctggtcttttaatcaaactaagtcttataggcaatggttgttcatacagctcaatagactgttgaaatgatgctgtatattgtatcatctatgtacctttctcaagttttatcggtgttgttatttattctgtttcatatttaattgcatgcaggctaaaagaatggatgttgttgctggagaaacagctggtgtggaagggcagctcttgctactttacccggtccttttcacattacaggtatgtgtaaatgtgtcttgtgagctgaaagcatggcagatccaagttgttagtaattgtagccccccacccagaatatgttgtctcacgttgttggttcttgatattttagtcacttgtttcttttccttgatgaagtttgcttccgatttctggatgttagcacaaagatgattaattaaccattatatatatcttccatattctgcactaatgcgcttaatcttggatgctatgtgttgtcaggttttcgaaggatatgttggagtattacttcttaagacggctttgcacgggcttgcatcggaatggcaggcaagaattatcaactatgtaatgtttgcagttgatagttaatcagatcttcatgagacttaggctgagtttgtttcttagagttcccaattccccttattttccgcgtgcacgctcttcaaactattaaactgtgtttttttacaaaaaaaattctataggaaagttgctttaaaaaacaaattaatccatttttcacgtttttttagctaatactccctccggttctatattaattgacgttttgaacaatgttgaggtcaaacttttataactttgaccatcaataactttaaaaatatttagtttaaagaaactagaacaatatatataaatttgtctttcaaagcactataataaaagtaaacatgcatttatttattgtatatattataatagaaaaactagcatggtggcccgcgcagattgcgcggctagcatcattatattttctatcatataatagcatatatgttttctcattatattattcaaatatattaaaatgacaacataattttaaattttgcaatatgtgtaatattcatattatattttatatacatgttagttattaattatttttaatatcaatttttagttatttgtaaattatatatattcctatatggactctagactcgtcttttaatatttcctttttttaattccgaattttctgtaaattgtatttctatatagactctatgctcttctttcaatattatttatttttatttctgaattttcatattatattttatatacgtgttagttattaatatcaaattttagttatttgtaaattatatatattcctatatggactctagactcgtcttttaatatttcttttttaaattccgaactttttgtaaattgtatttctatatagactatgcttttttttcaatattatttatttttatttctgaatttttattatttctaattgtatttctatgtggactctaaactcatctttcaatattcttcaatttttaatttcgaatttcagttactaataaattgtattcttatgttgaccttaaactcttcttcccatatttttcttaatttcgaattttagttatttgtaaattgtattttttatacagactctagactctacttttaattttattatgtttattccaaattttagttagttttaaattcctatatggactctatactctacttctagtatttcttttttaaattccgaatttctattttttttcttaattgtatttctatatggactctatactctacttctaatattccttatttttaatttcaaatttctattatttcctaattgtatttctatatggactctatactctacttctaatatttcttgtttttaattccgaatttcagttatttcctaattgtatttctatatggactctatactctacttctaatattccttatttttaattccgaatttcagttattttctaattgtatttctatatggactctagtctcttcttctaatattccttattttttaattccgaatttcagttatttcctaattgtatttctatatggactctagtctcctcttctaatattccttattttttaattccgaatttcagctatttctaaattgtatttctatatggactctgctttttctttttctccgattaatgtgagaatttctaagccatgagagcgaacgtggaagctcctttttctattcctttaattatataatagataaggtcaaagatatatcttgtagaccgtgtctttgtccaaaacgtcaattaaaattaaactagagggagtacttaattaatcatgtactaatgaactgctccgttttccgtgccggaggggaacgtttccaaccagcagaaacgaatgcagccttagattgcttccttgctcaaatctactgctgtttggcctttttgctcagtcatctgcataaaatgcatttccgtaatatttgaaaggaaaaagaactttttagaaaatgtaatgtgctgatgaagctataagctaaacaatcccaaagcatccttgagatgctgattgtcctcaactgataatttataacgctgccatttttcacttgccaggttgtagtttgtgggatcttgctggtggtaatggcagtcggcaactttgtcaacacgatggagactttgatgttaaaattgaggttcaaagcaaaaatgaaaagagcaaagagcaggcaggatctcagtcgccaacaccaaaattgacaaagtgacccataatggtgactccatgcttggaaacagcgaatgctgacacaccatctctcttgtaaatcccttaatccataaactgttttggctgcccatgattttgtgttttggtaattgtttcacattgaagttcatattctacggtcaatgcacgattaaaaacactgttaactttaccacagatgggaacgctaaatttatgtgatttgtatgtgct</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
