Os02g0109400
| Gene Name |
Os02g0109400 |
|---|---|
| Description |
Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase domain containing protein |
| Version |
NM_001052179.1 GI:115443728 GeneID:4328036 |
| Length |
7772 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os02g0109400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:509377..517148 |
| Sequence Coding Region |
509377..509425,510200..510270,510420..510539,510684..510769,510843..510915 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008395:509377..517148 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgccgcccaagaggaagcgcggtggcgggaggccgcgcaaggccccggaggacgccgccgccaaggaaaacggtgagaagacaaacaaggaggaggaaacgcaggcttctcctgaggagaatggcgcagggcagactcaggcctcgagaaccgcaagaaagcgcaggaagggtcctgttgctgatccctcttcgactgaacttccacccaggaagctcagggacaggcggaacgttccagcggtagactacaaggagaataagcacacaaaaaagatggatggaacttcaaccatgtgccatcagtgccaaaggaaggacagtggaagagttgtgaggtgccggaatggtgctgaaaaaaacaggaggcacagatattgtgtcaagtgcatcaaacgctggtacccgcatctaacagaggacgattttgagaactgctgtccagtttgtcacaataactgcaattgtaagacttgtctgcggacaaatgtaataaataagggtgacaaggagtttgccgatggtaagaacaaaattaaatactctctgcgtattgcacgctttttgctcccttggttgaaacaacttcaccaagagcagatgctagagaaaagtgttgaggccacaattaaagggatcgatgtaactgacttggaggttcctcaagctcagtttaataatgatgagcggatttactgtgataactgcagaacatccattgttgacttccacagaagttgtaaaagtggtcactatgatctctgcctcagctgctgccaggagttgcgtcaaggtcttactactggtactgttgtcacttgtgacacagctgttgatgtacctgaaatagaaggcaaggaaggtttgcaagagggaagtagtcatagcagtgctgtaggtcaaggggcttctgatcaacagaatgacaggttgataggtagtgcagctccttcagaggattgcactcctagtttgatatggagggcaaaaagcaacggaagcataccatgcccacctaatgcaggtggttgcggggattgtcttctcgaacttaggtgtttgtttaaggagaactttatttctgatttactggataaagtcaattcagtggtcaataaggaaacagagcaggagttgggaggctctagatgttcctgcttcactgaatccggtgaagtgaacaatgaaacatcacggaaatcagcttgcagagaggactccaatgataactacatatattgtccaactgctagagaagttcaaagtggagctttagatcattttcagcagcattggttgaatggtcagccagtcattgttcgtgacgtgcttgagctaacttctggactgagctgggagccaatggttatgtggcgggccttacgggaaaagagagacaagaaagagcatgaacggctctcagttatagctcttgattgtctgacatggtttgagtttatgtaccaccaggatgtgttggtggtgccagtttcatatctggggttcaacagcaccattgaaactactttatatttcaaactggttgatataaatattcacatgttttttgaggggtattcccgtggagctgttggttcggaggatttgcctgtgctacttaagcttaaagattggccacaacatagttcctttgaggagcgcctgccgcggcatggtgctgagttcatgtctgcactaccatttcgtgagtatacagatccaaaatctggtccccttaatctggcagtgaagcttccaaaacatgttaaaaagccagatcttggtccaaagacatacattgcttatggtgtcgcccaagagttgggaataggtgattctgttacgaagatccattgcgacatgtctgatgcggttaatattctcatgcatactgatgaggtagaactcaaagctgaaaggattacagcaatagagaaaaagaaagagagcttacgtaaagatggcaagaatcttcatgttctgcgaccagaccatgacgatgatacatcaatagctctcagtgaatcaactgaagtgccaagatctcgaggacttgaaaatggctcaagcattaagcagccagcaccaaatgttgctgtaatggaccagggaggtgttcatacagatatggtagctgatgaagctgagggaaacttgagtctgtctaatgggcaatcacccaatcaaagtgatgcacataatatggatattactttctccaagggggaaacagaccattctatctgcacaattaatgggggagaggagatgggcaatggctttgggagggaagataaatgtaaatcttctcatggtgtaggatcatctgaatcttctgattgtcaaagacgcagtaggcgacgtgatgcttgctcttccagtgcaacaggggaaataaacgaaaccagcatggagactaacaaatttaccatatctattgagcccaaagatgatcacccatttgttgagggaaatcagacagagggtggtgcattgtgggatatcttccgacgtgaagatgtcagcaaattgcatgattatctgatgaagcatgcagaagagtttagacattataattatgaaacagtcaaacaggtttctcatcctattcacgatcaatgcttttatctaacaaatgagcacaagagaaagctcaaggaagaacatggaattgagccttggacatttgaacagaaacttggtgaggctgtgtttatcccagcaggatgtccccaccaagtcagaaatttgaagtcatgtataaaggttgcacttgactttgtttctccggaaaatgtgcaagagtgcatcaggctgacagaagaatttcgcttgcttccgaagggtcatagggtgaatgaagataaactagaggttaagaagatagctctatatgcacttgatcaagccattgacgatatcacaggcaaaagttgcaatgaaaggacaaaggatgaaggggaagaggaggcgtctgccccaagtgttagttaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
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| Gene Sequence |
<dnaseqindica>7724..7772#6879..6949#6610..6729#6380..6465#6234..6306#5431..6153#3068..3397#2939..3025#1899..2655#1750..1813#1540..1672#1348..1447#1061..1197#808..954#671..721#1..66#atgccgcccaagaggaagcgcggtggcgggaggccgcgcaaggccccggaggacgccgccgccaaggtaaccgaagcgaagctgcttcgattaggtctcgtttttttttattttctctctcgttccttcgggcaacgcctcggaaaacccggggagttgctatgatgtgctgcgtcttcttcgcgccgttgtcgtcgaggggatgttgggacgtttaaaccctagcggatggattcgtgctagtatctccgagcaacactggctgcttcatgtttgctttcggtgtgttagttttgccgctttgagttgttcccctttctttctgtatttgttattctggtcggggatgtgaagtgggcaatatccttggattccttttcgcgcttgcaatggataatggattttgctcccttttcttcaatcatagtgtactgttatttggataatcgaccatttccctgattttgcttgtctaagctacagagttgtcaaatttcattggatatctaccaatctattggatttctaagcctgggttgctcacggaatgtgcagcactgaagagttcctctgcaattgcgctgaattttccctccacttctttttaagaagagcttaatatgtagttttgcatacgaaatgcttgaccagttattgggtgcggttgcaggaaaacggtgagaagacaaacaaggaggaggaaacgcaggcttctcctgaggttagtgttttcttttcctgccggggactggaaatgcaaacatttaccatgttccgaatgtgtgatggatctctttttggttccaggagaatggcgcagggcagactcaggcctcgagaaccgcaagaaagcgcaggaagggtcctgttgctgatccctcttcgactgaacttccacccaggaagctcagggacaggcggaacgttccagcggtagactacaaggagaataaggtggaaattgcaatcttttatacagcatattctctatggtgtatttgcagttgtatgtcagtaattcattgctaagtccttatatcatgatttccttgatttgcagcacacaaaaaagatggatggaacttcaaccatgtgccatcagtgccaaaggaaggacagtggaagagttgtgaggtgccggaatggtgctgaaaaaaacaggaggcacagatattgtgtcaagtgcatcaaacgctggtttgtgcccttctaaaagcactcaatgttgatcaccttagttgtgtcaccctttcagttcttattatgttagttcatgcacaaatttacatttatatcttagctactaatatggatctgttgcttgtttctgtggcatgatctaagcaggtacccgcatctaacagaggacgattttgagaactgctgtccagtttgtcacaataactgcaattgtaagacttgtctgcggacaaatgtaataaataaggtacacctcttttttttgttgtcccgtttctattttattacctggcctcattgcttcattttgtttgatattttctgttatgcgtttgtcagggtgacaaggagtttgccgatggtaagaacaaaattaaatactctctgcgtattgcacgctttttgctcccttggttgaaacaacttcaccaagagcagatgctagagaaaagtgttgaggccacaattaaaggtattatcatagcttaacacggttcccttttagcactaagtttcttttgttggttcctaatcctaattctgcaacagggatcgatgtaactgacttggaggttcctcaagctcagtttaataatgatgagcggatttactggttggtattgctttatttgtaaagcatgtggactatatgttctttcaagtgtgaactatctaattttttggtttatttgaaacagtgataactgcagaacatccattgttgacttccacagaagttgtaaaagtggtcactatgatctctgcctcagctgctgccaggagttgcgtcaaggtcttactactggtactgttgtcacttgtgacacagctgttgatgtacctgaaatagaaggcaaggaaggtttgcaagagggaagtagtcatagcagtgctgtaggtcaaggggcttctgatcaacagaatgacaggttgataggtagtgcagctccttcagaggattgcactcctagtttgatatggagggcaaaaagcaacggaagcataccatgcccacctaatgcaggtggttgcggggattgtcttctcgaacttaggtgtttgtttaaggagaactttatttctgatttactggataaagtcaattcagtggtcaataaggaaacagagcaggagttgggaggctctagatgttcctgcttcactgaatccggtgaagtgaacaatgaaacatcacggaaatcagcttgcagagaggactccaatgataactacatatattgtccaactgctagagaagttcaaagtggagctttagatcattttcagcagcattggttgaatggtcagccagtcattgttcgtgacgtgcttgagctaacttctggactgagctgggagccaatggttatgtggcgggccttacgggaaaagagagacaagaaagagcatgaacggctctcagttatagctcttgattgtctgacatggtttgaggtaagtaacattatgttaataaaattgcaataagctgcctcttgtagagctgatgctagggattgtcagtcacataatctacacgagtacaattataaacgtgtggagttgaaacattgatcatcgtgatttcttgaggtgtgtagatgtgccagtggaatccctgataccatgaaaatgtacacacaacaaaagaaaaagaactgtatatctacctaatgtcagctcagcttatgtgcctggtagtggtagaacttatgaacttcacatatcaatatattagtttatgtaccaccaggatgtgttggtggtgccagtttcatatctggggttcaacagcaccattgaaactactttatatttcaaactggtaacttcctaataccattgctttcatttaaccataatgcaggttgatataaatattcacatgttttttgaggggtattcccgtggagctgttggttcggaggatttgcctgtgctacttaagcttaaagattggccacaacatagttcctttgaggagcgcctgccgcggcatggtgctgagttcatgtctgcactaccatttcgtgagtatacagatccaaaatctggtccccttaatctggcagtgaagcttccaaaacatgttaaaaagccagatcttggtccaaagacatacattgcttatggtgtcgcccaagagttgggaataggtgattctgttacgaagatccattgcgacatgtctgatgcggtaaataagtgaatttcttgtgatttctggcatttgtatatgtagatttatggattaaaatcttgtttccttttaattcatattgattgtacatattgctatccttggatgctattatatgttatggatagaaagtatcggagacgtaaacatggaaaggaaggggctgctgggaactcaaaattagcagggcctcctgcagtagtctgggaggatatacattcctagtctttatatatcaaatatagtagctatttcctagtattcaggtcaagtttgtatgttgtactaccatatgtccatatctcgcttcttcgtagtttaagagttatccctgttatatgaagggaccaattttgtactagcagcaatcagtcaataaagctgaaggtcttcacccaactctaaatccttgccaaccgagcatctagctgagcaggacaaccctgcttgacctgagagtgctggttcatacctgcctgtgtttctattcctgaccttcttcctcctctttactacattatttcgtatcatagcaatctcctcctccagcagccctagccctctgaccaacccatccctgccatccaccatataaaactccaaagccctggaagagctcttcaaacagctggggtacagacctgggcaagaagatttatatcctcatttctaggcaggatgccatgaacacaagtgatgcaagggctgtagcatgataccctggccctcatggcctcattccaaccagcactagccgcagcagcaatgtcttggcatcagtgctagggcaggatgaagatgcgtgtggtgcgctattctaccacaaattgaccttctcagcatttgatggcaaagaagacccactcccatggtttaatcgttgcgagcaatttttcaaggaccgtgatctcttgaagagggaaggaatggcttgtgtcagaccacatgatgggcgaggcacagaagtgctatatgcagttttaaatgatatgaaggcgttttcttgtggaaaaaaaactgcgactttgtcaacatgcactatggctctccaatgcacagcaatgccttgaaccaattatctctattacaccatactaggatagtggcagagtaccaaaaaaattctttgctctcttgtaccaggtttcaccatctcttctgaaagaacagcaagtcaacttgttcactgctggcctcggccaatcattgcctactgatgtggagttgtaaaatcttacagaccttcagcaccccatgagcctagctcgtgccgttgaacagtggctggaagacaactacagtgacagtacgagcatcgaatatatagaagccatttcctagtttaactttagattgtagtcatgtcaagtctgcaagttattctactatatttagctccttcctagtttaagagtgagc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|
| External Link(s) |
