Os02g0184000
| Gene Name |
Os02g0184000 |
|---|---|
| Description |
Zinc finger, DHHC-type domain containing protein |
| Version |
NM_001052640.1 GI:115444650 GeneID:4328524 |
| Length |
8157 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os02g0184000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:4681427..4689583 |
| Sequence Coding Region |
4681834..4682298,4684250..4684398,4684479..4684557,4684827..4684925,4685004..4685081 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008395:4681427..4689583 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008395:4681427..4689583 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgtcggagatcgaggtgctcgaggacaccaccgccgccgccgccgccccggccgccaccatcggaggcggagaggtcgcgggcgcgggcgcgggggaggagggggaggcggcggcggatgcggaggcgctcaaggacgacgtgtacacgggcgcggcgtacggggacctcgagaagctgcaccgcctcgtggagcgggagggccggccggtgacggagcccgacgccctcggctaccacgcgctccagtgggccgccctcaacaaccgcgtcgccgccgcccagtacatcctcgagcatggagcagatgtaaatgctatagaccatacagggcaaacagcactccactggagtgcggtacgtggtcatattcaagttgcagaactacttctgaaagaaggagctaaggtggatgccgctgatttatatggatatcagactacacatgttgcagcacagtatggtcaaacatcatatctttatcatattgttgcaaaatggaatgctgatcctgatgtccctgataatgatggaagaagtcctctccactgggctgcttataaaggatttgcagattctgtacgcctccttttgtttttgggtgcatatagggggcggcaagataaagaaggttgcactcctttgcattgggctgctatccgcgggaatttggagtcatgcactgtgctggttcaggctggtaaaaaggaggatcttatggtgcaagacaataccggcttaactccagcccaacttgctgctgataaaaatcatcggcaagttgcctttttccttgggaatgctagaagagtacatgagagaggatgtggtgggaacagttattttgggaaactatcaaaattaggactcgcccctcttctttggtgtattattattggcttaatttatatatatgtatattcagttatctcaggacaatatagcagtaatatgacattactatttgggttattttcatggttgggaattttccttgctactgccggattggttatgttctataagtgtagcagaaaagatcctggctacattgacaagaatacaagagatgcccaaaatcaaagagatgatgaacctttgttgaagaggggtctagacaaccctgaacttctggctggcaattggtctcagctatgtataacctgcaaaattgttaggcctgtacgctcaaaacattgctctacatgcgatcgctgtgttgagcaatttgaccatcactgcccttgggtgtctaattgcattggaaagaagaacaaatgggaattttttatgttcctgatcctagaagtttctgcaatgattattactggtgtgacggccgtcataagagtagtaggagacccagattctcctgcatcatttggtggatggcttaattattcagccactaaccatccttgggtggtgtcttttgttgtgatggatctctttcttttctttggcgttataactctaactgtagttcaagcatcacagatatccaggaatttaacaacaaatgagatggcaaatgccatgaggtatagttatctcagaggcccaggtggccgattcagaaatccatttgaccatggggtgcgtaaaaactgttctgacttcttgctgaaagggtacaatgaggatattgagagggtagaacagacattacaacctgatgaggaattgggaatgattcaaatgacaagaagtgcagtctcacagaatggcgagagcatgtcacttcatgctaatggcacagaccatggttgtgctgatccacaagggaactcaaaatcccatcgtcactcgcacggttcatcacaatgttgcagtcacagtaagagacctgacaagacccccttggggctaggattgggccttggtcgtaacaacccatctagccgctacacacgttcacttccttccattcattcggagagtagtgcttatttgcccttgtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASEIEVLEDTTAAAAAPAATIGGGEVAGAGAGEEGEAAADAEA LKDDVYTGAAYGDLEKLHRLVEREGRPVTEPDALGYHALQWAALNNRVAAAQYILEHG ADVNAIDHTGQTALHWSAVRGHIQVAELLLKEGAKVDAADLYGYQTTHVAAQYGQTSY LYHIVAKWNADPDVPDNDGRSPLHWAAYKGFADSVRLLLFLGAYRGRQDKEGCTPLHW AAIRGNLESCTVLVQAGKKEDLMVQDNTGLTPAQLAADKNHRQVAFFLGNARRVHERG CGGNSYFGKLSKLGLAPLLWCIIIGLIYIYVYSVISGQYSSNMTLLFGLFSWLGIFLA TAGLVMFYKCSRKDPGYIDKNTRDAQNQRDDEPLLKRGLDNPELLAGNWSQLCITCKI VRPVRSKHCSTCDRCVEQFDHHCPWVSNCIGKKNKWEFFMFLILEVSAMIITGVTAVI RVVGDPDSPASFGGWLNYSATNHPWVVSFVVMDLFLFFGVITLTVVQASQISRNLTTN EMANAMRYSYLRGPGGRFRNPFDHGVRKNCSDFLLKGYNEDIERVEQTLQPDEELGMI QMTRSAVSQNGESMSLHANGTDHGCADPQGNSKSHRHSHGSSQCCSHSKRPDKTPLGL GLGLGRNNPSSRYTRSLPSIHSESSAYLPL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>7286..7750#5186..5334#5027..5105#4659..4757#4503..4580#4296..4353#3671..3770#3446..3584#2693..2855#2458..2538#2204..2316#1191..1331#73..372#gctaagccaaagccaagccacgcgcgacccaatcccccgatccctcctccccctccctccctccctccctccatggcgtcggagatcgaggtgctcgaggacaccaccgccgccgccgccgccccggccgccaccatcggaggcggagaggtcgcgggcgcgggcgcgggggaggagggggaggcggcggcggatgcggaggcgctcaaggacgacgtgtacacgggcgcggcgtacggggacctcgagaagctgcaccgcctcgtggagcgggagggccggccggtgacggagcccgacgccctcggctaccacgcgctccagtgggccgccctcaacaaccgcgtcgccgccgcccagtacatcctcgaggtatgatccatcgccgtcgcccaatccaatccgccccccgagcttgggtaatgctagtgtgtcctcgagcttgcgcgtttaggaattcggttttcctgccctttccccgatcagcaacggagctccccggtgatgtgttgtttgaggtgcagacgaagtgtagctcctgctgggaatgcgctgtgggggatgggcacgagttgtttagttgttgttgcgaatctcgtttggttttttggttggatcgatgaggagagattttggttcatgtggcttgtaatgacaggaaggtatttcgcttttgctctgagggtagcggttttgagcttagttttggtatgtttgtgtttatgtgttggatggatgttaatgctatgttggttgaatggtggctgttggataggtctaggcagggccaatctgcagctcctttagtgttaggaaaccctgtggaacttgcctcttgccatatcttaccaagcgagcaagcatttccaagaatttcgctgaaccataaatgggatcataggaagtttgttcagttaaatgtcatgtccagctgtttagacaatgaagccaacccctttgaaaccttgcttggattgatttgagtatgcctatgctgactggtctatcccagtcaacatgttatgcattgtgtcttttaaggccattggtttcacggttttatgttgaacagtgtagttatatagtacttcttgagttgcatggttttctttgctgctctatagtatgtcctatccttttcagttgtttgctttggtgggatgacggttctcagcttgttgtctggacagcatggagcagatgtaaatgctatagaccatacagggcaaacagcactccactggagtgcggtacgtggtcatattcaagttgcagaactacttctgaaagaaggagctaaggtggatgccgctgatttatatggatatcaggtttgtctttgacttatctattgcatccatggttccttaacacatatatattctctttctgttgtctaatgtattttgattaattcacctggtgaccaactgtttcttactcaagttatgttgcaatgtctctataatgattatgtggtacataatagtttaccattgctttgctgtataatccctatatcagtcactaagatgcttcaaattgtaatttcatacacattgatgctaggttgtatggcttcctgcaagataatgaaatcttttctctcgtcagataccataaaactattacttcctctagtaccccaaaagcatgttgttctagtaagtggcaaagagattaggaatttgtaacattgccatttttggcctttataataaatttaattacttctatctctaccataataatggttaggttgttaggatgggattaaaatgcacaagtattttacttctgtaatcagatcctatattttatcttttaattcttttagcatacagtcattttgtttttgagtttgagtgatctgcagggtttattaccgccttaagctagtcgccagggttgtcaacaaggtactaagtgaagtaggctatagacaaaacagagtcattacaaggataggtttcgaaaaaaaaaatttggcatattcactttgattcggaattaggtctttaattgaaatgtcagtctgtatttttttcctacatatgcagattagttcaacaataaagtaagatatctgcagtagataaattcccggtttgatcttaaaagttgggcagaaaaagtcaagagtcagtcagttaccttgtatttgaagtatttctgacggaatccatctgttgttataccacagactacacatgttgcagcacagtatggtcaaacatcatatctttatcatattgttgcaaaatggaatgctgatcctgatgtccctgataatgatggaagaagtcctctccactggtttgtacctttcccctgtacattttttttcaaagttcaaacacaagccttgtggtattctttatttttgtcacttaatgtgttgtctaacatggcttcatggtgcccctattgatgattcaatattgttcacatttccagggctgcttataaaggatttgcagattctgtacgcctccttttgtttttgggtgcatatagggggcggcaagataaagaaggcacgtgtttagttagtttttctagctcttcctaaaccctatctttatactgatcatgacaatctaacctacaacaagcatttaagcacgcttcccctgcattagttttgttggatatcaaatattcatttccagctcaaatgcttttcattaggttgcactcctttgcattgggctgctatccgcgggaatttggagtcatgcactgtgctggttcaggctggtaaaaaggaggatcttatggtgcaagacaataccggcttaactccagcccaacttgctgctgataaaaatcatcggcaagttgcctttttccttgtgagtgctatgaatattcaccattttttgtttatcatacatgagaatccttctagcttcccaagagtatccttttagcttcccaagattccatcataccgtaaatgttgccatctgattgggaatttaatagttctgttaatatgctttttggctgcttttccatttgtgccacctatttttggcttgttcttcattgacaattattttttatacctaatacgtagtagtaagcattactctcatgatgaatggatgtgctccacggccctgctatttcccaatagactctgtatattgcctgccacagtgccacttaccgttaattcttttactatatgaattaaaatgttttcttaaaataatatgcattgttaataacatggaggtaacaaagtaaaagtttttggataatcactagcatttgtggattgtgaatgctcttgtacttgttctggatattcttttaactattccccagtatagattatcttgcttaaaggtataaaacatttatcgttagcctcagcatgtaatttattcctggcaaatgctaaggattgatttgatgatttgattgttctatgcaggggaatgctagaagagtacatgagagaggatgtggtgggaacagttattttgggaaactatcaaaattaggactcgcccctcttctttggtgtattattattggcttaatttatatatatgtatattcagttatctcaggtacattactgatataatgtcttttcagaaattttgatctttcatactgtggttgtggattactgaatttgtttccttctattcaggacaatatagcagtaatatgacattactatttgggttattttcatggttgggaattttccttgctactgccggattggttatgttctataagtgtagcaggtaaacattcgattatattgtaccaatattccaaaaactggaggaaacatatagacagatccatgtcaattgtgcctctttagacagctcttttcttaagggcctttttaacaaattaatctcactttgcagaaactaatattttcttcatttgcatctagtcgttccttagaagggttttttaacatattaatctcaccttgcagaaagtaatctttctttgtttgcatgtagcctggaagtacaaggtcactttctttatttttaaagaaaactgtgatttctttgctggaacagagcaatttggctatttatcaattaataccacgttttagtgtgctgtcctgaaacattgaggatcttgttattttgcctacactctttaatgcattatgttctggccttgcacatctatataaaattgtaacatgcccaccacatactacttttatttcacattaaagatatttgattcaatcatttaaaaatttgtttgaagaatggccatactattttgttatgcagaaaagatcctggctacattgacaagaatacaagagatgcccaaaatcaaagagatgatgtaagcttgaaagatttagagagccaatgtggcttcctgttaatctgccaaatctcatgttcaattattagattgccaccttcaaaaagttgaaatactagtattagtacataatatgcaatattaattttgagtttttgtgcctctaggaacctttgttgaagaggggtctagacaaccctgaacttctggctggcaattggtctcagctatgtataacctgcaaagtgagttatttccattcaaagtgagtttctccatatatttaacttttacttaaaaacctgattcatctatatcaatagattgttaggcctgtacgctcaaaacattgctctacatgcgatcgctgtgttgagcaatttgaccatcactgcccttgggtgtctaattgcattggaaaggtactaaattcaccctcttctttgttgagttttcttatttgtagtcaaatatcttaattcagaattaggaagttgcctgtttcagccaattggcaattcatgaatagaaacctgatgtctgcagtctgcacccaagcagaggcgaaaaacaagataaaactgttcagccgctagtcaatgatttgccttttgttttgctattcccttttgattacttatggagaattgttttgtctaagattctaacctacaattatttgtgagtgcagaagaacaaatgggaattttttatgttcctgatcctagaagtttctgcaatgattattactggtgtgacggccgtcataagtatgttcacatctttctttaaaacctttacagtttgtagtatggaagatttcttaatctttatcccttttcctttgcaggagtagtaggagacccagattctcctgcatcatttggtggatggcttaattattcagccactaaccatccttgggtggtgtcttttgttgtgatggatctctttcttttctttggcgttataactctaactgtagttcaagcatcacaggtatgaaccaagttggtatttgcctcccttttacctgtcattatactatttgaggtctgacacccagattgaatcagtatgtacacaacccatatatgtaactttgtaacttaataacccatatatatacttgcctttagcttgctgttgcattgctcttttggcagtgcatggatgaattattcaatgaaaaccattactcatcaaaagcagtatttggtcatttccattcacactgatgtataattcccttatcatttacatttgcaatctctgatcaaaatccacctaatgacaccatgcttccattttttgttttactcatttctatgtcaatatatttgggtgtgaactgccagccaacctgcatttcttttgtctagtatatgacttcaacacaaatccaatgtgttaacggccctgttaatatgtacacacacttttagagatcgctcttgctacttgtggcatgattcttcatgcaatcattggtcctatctattatattcttaaaacagacttgaaaggagctaccacgttcattgtggatgctagaaattcccacattaatcggagaaaaagaaaagaagagttcgagtagaaatacatttagaaataagtgaaataaaaaattattgaaagaagagtccatgtagaacacaactagagttcgaaatttttaaaaaataaaaaaataaataacgaaattagaaaaataaaaaataagagttcaagtaagaatacaatttacaaacaaccgaaattggtaataaaaaaaaatattgaaagaatagtccatgtagaacacaatacgagattaactaaaatttgaaataaaaataaaataaattccgaaattaggaaaaaaaaaataagagttcagataggaatacaatttataaataaccaaaatcggattaaaaaataaagactatcgaaagaagagactatctagaacacaacacgagattaattaaaatccagaataaaaaataaaatcagtagtaatacaatttataaacaacaaaatatcaggacggaaaatatggaagtttgtttagaaatagtccatctagaacacaacgataacaaatggcgataaaaaggggagaaacaacaggcccgtaaaggagtagggtggtggctgtttatgggacatctaaaaactataaacaaaaccccaaatagaatcccaatgacgattaagaggagggacgacgggtaggccgttaagcagcatggccatgacggttagcgggacttctagaaagtaaaaaataaaccccaatgttaatcatgctcgttttttaaaatctcaatgataataaagaggggaggctgcaagcgggtcgtagagaagtataatggcggagccgctgacggtttggcgggacttctagaaagtaaaaaaaatgaaccccaacgacaattatgttttgttttttaaatcccaatgatgaagtgaggaggcagcgggcgggccgtagaggagtacaatagcggcgtttgacagggcttctaaaagttgtaaaatgaaagccaatgagacaatgaactctaaaactacaatgtccaatttttaaagattccaagaaggatgagtagaagtcatagtagatcaagcaaacaaataaatgggtgacaaaggagtaaggggtagcgattggcgtgacttaaaaactacaaaattagaaactcggagatgataaggcaatgagatagctatttaacaaaattttaagtaaaatcatatgtaaaaatagataattttgtatgagtgccattgagctagttgtgtttataatagaaaatgattgggcttctgtttgtcccattgagctatactgcaaatgtttttttctcagtccttgcaattatcattccctgcttatatttgggctctatttttaaattacattgtcaatcatttatttcttcttatcccttgcagatatccaggaatttaacaacaaatgagatggcaaatgccatgaggtatagttatctcagaggcccaggtggccgattcagaaatccatttgaccatggggtgcgtaaaaactgttctgacttcttgctgaaagggtacaatgaggatattgagagggtagaacagacattacaacctgatgaggaattgggaatgattcaaatgacaagaagtgcagtctcacagaatggcgagagcatgtcacttcatgctaatggcacagaccatggttgtgctgatccacaagggaactcaaaatcccatcgtcactcgcacggttcatcacaatgttgcagtcacagtaagagacctgacaagacccccttggggctaggattgggccttggtcgtaacaacccatctagccgctacacacgttcacttccttccattcattcggagagtagtgcttatttgcccttgtgattcttttggagaaggcgagctagatcgtatttcaacttgtaggtgtttattgcacaaccacagctttcttttggctatttcttcctgcagtatttgtcgcttggatctggtctcatcgacattgccagggtgtggtatatttggaggcccaatcaaccgactactgaaattgagaatatgaaggagatgcaagttttatgaaggcttcatgaacatccttagcctctcaggaacaccagcgaatgtctgtctaggcgtagcaatattttttgtgcaaaagtgcatctttgtacaatgtctcaacattttgtatgtacaagagggttagctgtccagatactatgatgttttcaagtacagctgtatattggaagaactgtaaatttatatagcgaaaccaaatgctg</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
