Os10g0396400
| Gene Name |
Os10g0396400 |
|---|---|
| Description |
Leucine-rich repeat, cysteine-containing containing protein |
| Version |
NM_001071067.1 GI:115481877 GeneID:4348553 |
| Length |
5628 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os10g0396400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:13651780..13657407 |
| Sequence Coding Region |
13652199..13652276,13652370..13652459,13653606..13653669,13653752..13654215,13654564..13654762 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008403:13651780..13657407 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008403:13651780..13657407 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>tcaatatatgttgttttatcatccagatgttcccagcttcaaatactctcattgaggcgaactggcatggctcatgtatcactcaactgtccccagttggttgaattggattttcagtcctgccataaactttctgataatgccattcgccaagctgctacagcttgtccgctgttagcatcactagatatgtcatcttgctcatgtgttactgatgagacactgcgtgagatagctaattcatgtccgaatctctctgttcttgatgcatctaactgcccaaacatttcatttgagtcggtaaggcttcctatgttggtagacctgagactactaagttgtgaggggatcacgtctgcttccatggctgcaatagcttacagtcgtctgcttgaggcattacaacttgataactgcagtttgttgacatctgtgtctttggatctgccacatctcaagaacataagtcttgttcacctgcgcaagtttgctgagttgactttgcgaagtcctgttctttcttacattaaagtttccagatgctcagtacttcatcgtgttagcataacatcaaatgctcttcagaaattggtgttgcaaaagcaagagagcctatcaagtttgtcattgttatgcaacaacttgatcgatgtcgatcttagtgactgcgaatcattaacaaatgcagtttgcgaagttttcagtgatggaggtggttgcccattgctcagatcattgattcttgacaactgtgagagtctgagcactgttgaactgaatagtagttccatggtcaatctctctcttgctggttgccgctccatgacattactaaaactttcatgcccaaatctgcaaaatgtgaatcttgatggctgtgatcacctcgaaagggcgtcattttgtccagttggtcttgaatccctaaaccttggaatatgtccaaaattaagtgatcttcacattgaggccccaaagatgtctctattggagctgaagggttgtggtgttctttcccaggcatcaataaattgccctcgcttgacatccttagatgcctcattctgcaggaaactaatggatgattcactgtctcaaacagcagaggcgtgcccgctaattgaaaatcttatcctgtcatcatgtgtatcaattgacctcaatggattgtcctctttgcattgccttcataagctggccttgcttgacctgtcatacacatttttgaccaacttgaagcctgtttttgacagttgcccacagttaaagatcttaaaactttcggcttgcaagtatctcagtgattcatcattagatgccctatacagagagggtgctcttcctatgttggttgagctagatctgtcctactcatccattgggcagactgcaatcgaggagcttctttcatgttgtacaaatttggttaatgtgaatctgaatggatgcacaaacctgcatcagttggtgtgtgggtcagatgactgcagttctggtgacatgcctgttgatgtttgtccacctgattcagcaccagtgaggagtgaagagatcagtgaaaggtctgatcgtctgcttgaagttctgaattgtactggttgtccaaatattaagaaagtcatcatcccttcaatgacaacctatctacgcctgtctaaaatcaatcttaatctgtccacaaatttaaaggaagtggatttgacatgctccaatctttatactttgaacctgagcaattgtagctccctggaggttctgaagcttgattgcccaagactgacaaatctccaacttctggcatgcaccatgttgcaagatgaggaactagaatctgcaatatcgcgctgcagtgcattggagattctcaatgtgcactcttgtccaaagataaatgtgctggactttagcagactgcgtgtggtttgtccaagcctcaagcgcatccaaagcagccttatcacataa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>SIYVVLSSRCSQLQILSLRRTGMAHVSLNCPQLVELDFQSCHKL SDNAIRQAATACPLLASLDMSSCSCVTDETLREIANSCPNLSVLDASNCPNISFESVR LPMLVDLRLLSCEGITSASMAAIAYSRLLEALQLDNCSLLTSVSLDLPHLKNISLVHL RKFAELTLRSPVLSYIKVSRCSVLHRVSITSNALQKLVLQKQESLSSLSLLCNNLIDV DLSDCESLTNAVCEVFSDGGGCPLLRSLILDNCESLSTVELNSSSMVNLSLAGCRSMT LLKLSCPNLQNVNLDGCDHLERASFCPVGLESLNLGICPKLSDLHIEAPKMSLLELKG CGVLSQASINCPRLTSLDASFCRKLMDDSLSQTAEACPLIENLILSSCVSIDLNGLSS LHCLHKLALLDLSYTFLTNLKPVFDSCPQLKILKLSACKYLSDSSLDALYREGALPML VELDLSYSSIGQTAIEELLSCCTNLVNVNLNGCTNLHQLVCGSDDCSSGDMPVDVCPP DSAPVRSEEISERSDRLLEVLNCTGCPNIKKVIIPSMTTYLRLSKINLNLSTNLKEVD LTCSNLYTLNLSNCSSLEVLKLDCPRLTNLQLLACTMLQDEELESAISRCSALEILNV HSCPKINVLDFSRLRVVCPSLKRIQSSLIT</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>5132..5209#4949..5038#3739..3802#3193..3656#2646..2844#2414..2574#1421..1573#988..1158#782..881#592..680#413..511#1..297#tcaatatatgttgttttatcatccagatgttcccagcttcaaatactctcattgaggcgaactggcatggctcatgtatcactcaactgtccccagttggttgaattggattttcagtcctgccataaactttctgataatgccattcgccaagctgctacagcttgtccgctgttagcatcactagatatgtcatcttgctcatgtgttactgatgagacactgcgtgagatagctaattcatgtccgaatctctctgttcttgatgcatctaactgcccaaacatttcatttgaggtttgtttctctttatcctgtgttcattttgtgtttgatggatcttgtctgccacagtatgtgaatttgaagcatgtgtctgacttttattctgtttatttgcctccataattagtcggtaaggcttcctatgttggtagacctgagactactaagttgtgaggggatcacgtctgcttccatggctgcaatagcttacagtcgtctgcttgaggtaattatttagttctccttgtaatggttttctaccttttgtcgtaagtactaatgcagcttcttttggaactgtttcaggcattacaacttgataactgcagtttgttgacatctgtgtctttggatctgccacatctcaagaacataagtcttgttcacctgcgcaagtgagtagggattgcttttgctttgtctcttttagttattgctgtttatttttatgattgttccccattctgtaatatggttgttgtaaatgccatgttaggtttgctgagttgactttgcgaagtcctgttctttcttacattaaagtttccagatgctcagtacttcatcgtgttagcataacatcaaatgctcttcaggtcagctcttatgtttgttaaaaggctgaatttttttactctgtctattgctttctgcgctgacctcttaaacagacattactgatcagagactttgtggctgcagaaattggtgttgcaaaagcaagagagcctatcaagtttgtcattgttatgcaacaacttgatcgatgtcgatcttagtgactgcgaatcattaacaaatgcagtttgcgaagttttcagtgatggaggtggttgcccattgctcagatcattgattcttgacaactgtgaggtatgccacttcaaatttgcatcctctttactttggacagccaatactcagtcatacacaataatgattctggctatccagcttttcttgactcattgtatatatatatatataaacatggctgttgatatacataaagcattaaagcaatttgtcagcctatgcatgcctactgtttttgtgtattcagataataagagttatggtagtgaattgttgttcttattaagttgagttatgctgattttccctcttgtaccagagtctgagcactgttgaactgaatagtagttccatggtcaatctctctcttgctggttgccgctccatgacattactaaaactttcatgcccaaatctgcaaaatgtgaatcttgatggctgtgatcacctcgaaagggcgtcattttgtccagtaagtgtaccattcttttttatctgtttagaaggtgcaaatatattttctttggaactagttttgaacattcagcttatatgaacagttgttttttatttgatgttgattgtgttgattccttagaaagaatagtggggtttgtgatattcattcatcaaaccatataataagagcatatcttgtaatttgcacttctgtcacaaattacaattatttaccgattaattaatacaggaatggtcaaatgggatatcaaacaaatgtttgttgttcattactgtgctgctttgttaatttacacctttttaatatatcttttccttccttccatcacatgtattcattgtgcttgattgtacatgaattgtaaggctcccatcggatggcctaataagccaaagaaaaagccaaattttgaattttcaaacttaattttgatattgattttgagatattttcaacgtagtttctttttcagcattggcttttaagtcactgagaacacatatataaaagttttacctacaaattcatttttattccctaataagccgttttggcttattaaaaaaaagcgaaacgatgggtgcctaaaataatagctagtagtttatttttgggctagcaatttgatttgttcaggaaccctcgtttgtaacttttaggaactctgatttgtcagataaccctccttacaaacatctatgaactgttttattgtggtcgtcccgtaagatagggtgagtgattttgcaaaatggattgtggataaaacgaatgaaagtaatttttttctctgtttatctatcaattccttctgacactggcatcttttaggttggtcttgaatccctaaaccttggaatatgtccaaaattaagtgatcttcacattgaggccccaaagatgtctctattggagctgaagggttgtggtgttctttcccaggcatcaataaattgccctcgcttgacatccttagatgcctcattctgcaggttgtgtcatccttcatatttttcttctaaacatcactgactggtgctaactagctattttgtgtcttcaggaaactaatggatgattcactgtctcaaacagcagaggcgtgcccgctaattgaaaatcttatcctgtcatcatgtgtatcaattgacctcaatggattgtcctctttgcattgccttcataagctggccttgcttgacctgtcatacacatttttgaccaacttgaagcctgtttttgacagttgcccacagttaaaggtgtgtgtggttagtttgttgtactatttaaatcatttttttagtacatgtcacatagcaaatgaaaaaccttggcccagtatgtttactatgtgattttaacatatcactgctggtctgctgcatattttagaattgttgtgttctgtaatactgtttgaaaatacttgcgatgaacttatacaatgtattgcatttatttattggggtgtctgtagcagttcattttcatgctatctttcaaaaattctttattttgaggtttattctacgagaaccattggaaatacatattttaatgaatcattgaaatggctattttctgaccttatgcactcctattggcagatcttaaaactttcggcttgcaagtatctcagtgattcatcattagatgccctatacagagagggtgctcttcctatgttggttgagctagatctgtcctactcatccattgggcagactgcaatcgaggagcttctttcatgttgtacaaatttggttaatgtgaatctgaatggatgcacaaacctgcatcagttggtgtgtgggtcagatgactgcagttctggtgacatgcctgttgatgtttgtccacctgattcagcaccagtgaggagtgaagagatcagtgaaaggtctgatcgtctgcttgaagttctgaattgtactggttgtccaaatattaagaaagtcatcatcccttcaatgacaacctatctacgcctgtctaaaatcaatcttaatctgtccacaaatttaaaggaagtggatttgacatgctccaatctttatactttgaacctgaggtattatcattgtgcatttctgtaccgcccaaggttttatgatgtattatttacttacagcatatacctgtatctttcccagcaattgtagctccctggaggttctgaagcttgattgcccaagactgacaaatctccaacttctggtagagtattctttgggcatcctttatttgagctcttgcttctgcttccacccttacaagcagcttgctttttcactgtcctccagagccatatctcctctgacactggcataattcaacttatacagtttgatggcttggctactttgcttatgggagcttgatttaaattttttcattgtggattgtgcttccatgatacacaattttatgatgactagtgctttgcctgtatgtatcgacatctaaaagaacacagaataatgattttatatggtttagttttttctatccaggcttattagtcggttaattttgggagggggccgtaggtgggagtggtgggcctggtttggttttatggagggttttttttttgcgctgcactcgtaggagagggtgggaggacgaagactccgcttttaaggtagtagagatatgaggcaatgtactaattggttagtaccttgggatgcttttaatgttcaagatgacttgtgctcaaagtacattggtagatagtacaaaaccttggttaaagtctggttgattttctgttattgaacttatgctgcttgggatgattgacaagtgtttgcttcagtgcttaatattgatactttttccctgatctcaaatgtttttttaactaattcgctaaaggcacataatactaagatattcagtagatttttcatctaacataggagtatatgaactgtgcgcagacttatacagtgttgggaattttcttcatgtctcacttgaattactaacttctactccctccatttcatattatttatgtcgctttgactttttttcctagttgcacttctttaggtttaaccaagtttatagaaaaaaaatagcaacactaaattagtttaatgaaatgtaatattgaatatattttgataatatgtttattttgtgttggaaatgttaccatatttttctataaatttggtcaaacttaaaaaggtttgattaggaaaaaagtcaaaataaattatattatgaaacagagggaataatatatgttccatattgtggtctttatttatgtatcagcttagtcattgttttgtatggtgctctattataacagactgttgttttttttccaatatcaatcccctgcaggcatgcaccatgttgcaagatgaggaactagaatctgcaatatcgcgctgcagtgcattggagattctcaatgtgcactcttgtccaaaggtaagcattaacatttcgagtgtgtcctaatccaatcttgtgtgcctgtagtgtttaaatttcttctaatcggtttatttttattacgaacagataaatgtgctggactttagcagactgcgtgtggtttgtccaagcctcaagcgcatccaaagcagccttatcacataatttgaggctgcgattatttcgaggagagttattgaggcaatagtttgcatccgtgcggccccttccatggacgcgggtgattctagcttagattcagaaacaacaacaaaaaagaagcccttcatggcactcttgtacatactagtggcggcagcatcaccattatatttaatggcaacgtatattaggagccagggggtgacgcgagccgcttctcagttgattctcgtgcggtaataagtagtaccatctagctgaatcctggtgggtgttcgaacttgtaattgtttctgtttccttttcttacctcctgtattccgctcctatggagcgatcagatctgtattccggtttacatatgcgttaataatcatcttggttggatctgaactaaaaaatgcaatgcttgattaaatagt</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
