Os02g0208900
| Gene Name |
Os02g0208900 |
|---|---|
| Description |
Similar to ZIGA2 protein (Fragment) |
| Version |
NM_001052797.1 GI:115444964 GeneID:4328692 |
| Length |
8618 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os02g0208900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:6139092..6147709 |
| Sequence Coding Region |
6139452..6139550,6141837..6141898,6142044..6142131,6142215..6142276,6142363..6142456 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008395:6139092..6147709 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008395:6139092..6147709 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgagcaggctcaaggaggacgagaggaacgagcggatcatacgcgggctgctcaagctgcccgccaacaagaggtgcatcaactgcaacaatttgggaccacaatatgtctgtacaaatttctggaccttcatttgtaccaattgcagtggagcacaccgagagttcacgcatcgagcgaagtcagtttctatggctaaatttactgcacaggaagttagtgcccttcaagaaggaggaaatgagcgtgctagagaaatattcttcaaggaatgggatgctcaccgcaattctttccctgacagcagtaatgcggataaattgaggaactttattaagcatgtttatgtggaacggagatacacaggagaaagaagtgcagatcggccaccgaggggaaaggatgataaggatgagtatagtgaaaacaggagatctgatggaaattggggtggttcaagaagtccgccatacaatgaaagctattctgatcgtcgcagttatagtggaaggagcgatgacagaaattccagatattcctatggagaacgaagtcctggctatgaacataatgattataagaaaagcccccgctactttgaagttgatgatagaaatcgtgaggatagatctggaaaaacaactccagttcaacggtttgaggaccgcaggccttctgaaccacagaggccagataatgggtctccaaattaccagaaggaaaccgatggatctagccctgttgtacggccagtgagggatatactgggtgataatgcacctcaactacgggttggtgagcctcctaagccaaatgtagcgagaacgattgatcctccgagaccaatcgatcctccaagaccgattgatcctccaagaccgattgatcctccaaggccaattgatcctccaagaccaaatggaaccagaaccatcgaacctccaccacagatgcagaggacatcaactgccagcagtattggttcttcagaggggacctccgaacagataaaagtggcaagtacgataagtttaattgatttcagtgctgatcctgagccttctgcatctgtgccacctccacaatctacacctacatcacaacagcagcctgctagtgcacagccagtgcaacctgttaatgcaccagcacaacagcctgctgtggaacaagggaaaaatgtgtcatcagtgagcagtggtggtggtgactgggcatcgtttgattctttcggccagcaacaaacaccacaaactggcaatagtgtagatccccttgagtctgcacttgctcaactatcattttctgaaacaccctctgcacccaattcatcagcttttccagcttcggtcatgcccacttcagttccaaatgatggagggtcatccatgatggggcagtcacattcttcattttttggtgcaccccctggagtctcaggtcaccaggcctcaacaggaatgtctatccatggatcttcagttcaacaaactggtctagctgctccggcagctggacttccgttccaggtctctgcgaattcccgagcaactagtggcattcaagaagcagcacctaatactgacagtagatccattggccggaaagaacttccagcggatatctttacttcgttatatccaccaggacctcaaacaatagggggttggcagagaacaccccaatttggaatgggatatgccatgccatatcagactgcaatgggaatgcaagcatatcctcagatggcatttgctcaacctgcatatcaacaacctgtatatccgcaacagcaacatgcatacccccaacctgcgaaagcatcaaatccttttgatcttgggaatgagccagctccagttcaagctcacacgcagcagcccctacctggaccactgggagcatctgctggcatgactcccccaggtttacttggtacctcgagttttggagtccttccacagcaacctcagcagctgtaccagtcacctgcacctccaaatcattacatgatgcagcaagttccaaacatgtctgagcagttacctaataccatgcttccaatgcaacaaggaggtttgggttccctcaacatgggctttgatcaacaagctgctcccaggtacccccagccaagcaccccaccttcctatggctctgttgggggaaatccttttgggtaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASRLKEDERNERIIRGLLKLPANKRCINCNNLGPQYVCTNFWT FICTNCSGAHREFTHRAKSVSMAKFTAQEVSALQEGGNERAREIFFKEWDAHRNSFPD SSNADKLRNFIKHVYVERRYTGERSADRPPRGKDDKDEYSENRRSDGNWGGSRSPPYN ESYSDRRSYSGRSDDRNSRYSYGERSPGYEHNDYKKSPRYFEVDDRNREDRSGKTTPV QRFEDRRPSEPQRPDNGSPNYQKETDGSSPVVRPVRDILGDNAPQLRVGEPPKPNVAR TIDPPRPIDPPRPIDPPRPIDPPRPIDPPRPNGTRTIEPPPQMQRTSTASSIGSSEGT SEQIKVASTISLIDFSADPEPSASVPPPQSTPTSQQQPASAQPVQPVNAPAQQPAVEQ GKNVSSVSSGGGDWASFDSFGQQQTPQTGNSVDPLESALAQLSFSETPSAPNSSAFPA SVMPTSVPNDGGSSMMGQSHSSFFGAPPGVSGHQASTGMSIHGSSVQQTGLAAPAAGL PFQVSANSRATSGIQEAAPNTDSRSIGRKELPADIFTSLYPPGPQTIGGWQRTPQFGM GYAMPYQTAMGMQAYPQMAFAQPAYQQPVYPQQQHAYPQPAKASNPFDLGNEPAPVQA HTQQPLPGPLGASAGMTPPGLLGTSSFGVLPQQPQQLYQSPAPPNHYMMQQVPNMSEQ LPNTMLPMQQGGLGSLNMGFDQQAAPRYPQPSTPPSYGSVGGNPFG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>361..459#2746..2807#2953..3040#3124..3185#3272..3365#3482..4036#4188..4679#4776..4946#6522..6626#6712..6861#7181..7307#7394..7457#7956..8073#gagaaaaaaaggtttaattaaaagttttttttttcagttttattattattacttacttacacgcgcagcgaagcagccagcgaacgaaagaggcgaagccttcgcgtcgccgctcgccgccacctcgtcttccgctgcgagatctcgcgcgagcgccgccatcggaggaggaggcgcgtcggcaggtgagtgctcgccgattttggcggtggctttgctctaattgtgggcggatctggctgggttggtcggatctcgagccatttcggtgggggatatttttgtttgatttttttttttgcggcggtggggttttagggtttgtggcggcggcagcggcggccggggatccgggcggcgatggcgagcaggctcaaggaggacgagaggaacgagcggatcatacgcgggctgctcaagctgcccgccaacaagaggtgcatcaactgcaacaatttggtgagttcccgctggctttctactgttcgcttgctaaatgtggtaggatttcggcggggttggctaggatctaggggaagtggtttttgagctcgcttggctttatacttcagcgttgctagtaatggcgagggttttagagctacccgcgaatgtttgcggcatactaggagatctcattggctggctggataggtaggtttccgatcggatagcggtattttattaggctggttgatactggatcacaattcagtaaattgggacggagagtaatgcgtggagctattgctggatgtaatgccatgccctgtaatcacacagcatattctttttcatgtaattaattatgtagacgacaaatgttgctactttctgccagatatacatcacgcgttacgacttaggactagaacaatggccaagaggtacctaagatacaagtatcaagaaagtaatggcgcttatgagctgctaaagtattcttatctttgcggaaaaacggattatgagcgtctcaaagttatcatgttcatatctttgcagtcaaagtcaatggtgaatgtcacacttgcttacattgtctgtggtgtgacaaaacaaagcagcccttcaaaaagcagcacaagcagaaaataaaataaaaagaacacctctttataattgaattacaacatgtggaattttaataaatccctagtcgaaaaacagctttgacatatactctttgctattatagttgatgaagaattgaagatcataagcaaaaaaaattagaaaccactatggtcgtcttggaccaaaacgtgtattttgtgacattctggcacttgcaaggcagtacatgctactccctccttcccaaattgatcatcatgtaatggaattcaaaatttctcaaattgatcatcatataaccgcatggacacggatttcatcataatacaattaatgcagcatgggagaatgtgtgcatgctaaggtgtaattggcatggtgttttgatcgatgcatgcattgtgggagaatgcgtgcatggtgtcttgattgatgtgatttaaattatccttggtcttggtgcataaacatatatgatgatcattttgggaaggagggagtaatattctactatataccaagattgttaactctccagatgatgtctaaaaattcacgtgttgtttcaaccacctgaatagcttagttgaccttgcgttcatggatgtttaatattttttcccttctgtttatgccctaaactctgtcgtgctaatacatgcacatttgcacgctgcactttaggctctatgcatttctttaagcttgattttttccttttctttttctgctagcatagtatctgctatttaaggcaaatagcattcttgacttgactgatctgctagttgttttgggcattaataatttaccacagctatcaataaggaaactatattatcatggcccatttggatgtctattgttctggcagttgacttcaccttttttactcttttagagtatgccaattagtgattgcttctattattatgcaaaataaatgattttttttcttaaactgctattgcaacagtggggtcctatataattagatgccatcagttgttgcaaatgttttctactgttggaaaagcatgaatcatctgcagtccacatgacattttcactacataagccttttttggtagttcgtttattactcgatctacagcgcaatgaggttatttggaaatctccaactagtcatcacagcgagccttgcctaattttctctaccacaagtagaataaattactccctccattccaaaatatagtaactttcagctatgaatccggacaagtaaatgtctagattcatagctaaaagttgctatattttgggacggagggagtattatgctttctaattctatggtgcacccaaaataatgtcaaaatctatcatttggaacttgaagagttttgcaatatgtgtactggagggaatcggcagtagaagcagctaggtttgcctaataatgtcatgtcaagattatggaggattgcactccactcttgcaattaggtggactctaagatagttcaagcttatatttatgcccatattttgcttcagcagagtactccttgcttaggtgctccacacatgtttttgttgggaaagtagacttaattagtgggtatttgtgtaatactgatgtgcattactttgtttcctaattttttttgtatattactgaatcacatatattgatattaacagggaccacaatatgtctgtacaaatttctggaccttcatttgtaccaattgcagtggagcacagtaagattcttattcagttctgttttgttacacttgtaatatgtcgaacctctctagcttcactgtccctttggtcaaattagatgcattttagtgaagtcagtgatcctaattttattgatgacaaaatttgttttgcttctagccgagagttcacgcatcgagcgaagtcagtttctatggctaaatttactgcacaggaagttagtgcccttcaagaaggaggaaatgaggtgacttgtcctctcttttctttttcatgttttctaccattttaggcctttctaatttgacatgtgttttgcataacctgtagcgtgctagagaaatattcttcaaggaatgggatgctcaccgcaattctttccctgacagcaggttacctttctgtttagccataccatatttagattacaacttgtttcctttatcttggaattctgacctgtttcttttggtctcagtaatgcggataaattgaggaactttattaagcatgtttatgtggaacggagatacacaggagaaagaagtgcagatcggccaccgaggggaaaggtgatatgttggctaattataactatccttgtttttttgcagttgccattgcttgttggaaattgctattatactatcctaaattcgttatttccttatttctttgtatcttctaggatgataaggatgagtatagtgaaaacaggagatctgatggaaattggggtggttcaagaagtccgccatacaatgaaagctattctgatcgtcgcagttatagtggaaggagcgatgacagaaattccagatattcctatggagaacgaagtcctggctatgaacataatgattataagaaaagcccccgctactttgaagttgatgatagaaatcgtgaggatagatctggaaaaacaactccagttcaacggtttgaggaccgcaggccttctgaaccacagaggccagataatgggtctccaaattaccagaaggaaaccgatggatctagccctgttgtacggccagtgagggatatactgggtgataatgcacctcaactacgggttggtgagcctcctaagccaaatgtagcgagaacgattgatcctccgagaccaatcgatcctccaagaccgattgatcctccaagaccgattgatcctccaaggccaattgatcctccaagaccaaatggaaccagaaccatcgaacctccaccacagatgcaggttattattttcctctgatgtttcctttttttttttgcagacattgcttttagaaatatcaccatgttcttgtctccatttccacgttaagctgataattttatcagtaggttcaattcattagcttacaatacatacttcataattgtagaggacatcaactgccagcagtattggttcttcagaggggacctccgaacagataaaagtggcaagtacgataagtttaattgatttcagtgctgatcctgagccttctgcatctgtgccacctccacaatctacacctacatcacaacagcagcctgctagtgcacagccagtgcaacctgttaatgcaccagcacaacagcctgctgtggaacaagggaaaaatgtgtcatcagtgagcagtggtggtggtgactgggcatcgtttgattctttcggccagcaacaaacaccacaaactggcaatagtgtagatccccttgagtctgcacttgctcaactatcattttctgaaacaccctctgcacccaattcatcagcttttccagcttcggtcatgcccacttcagttccaaatgatggagggtcatccatgatggggcagtcacattcttcattttttggtgcaccccctggagtctcaggtcaccaggtacttccgtttgcagaggaatatcagaagtcgatctgtgtaccttccatttctttttttgccttgaaataggttttcacttgatacttttcttaggcctcaacaggaatgtctatccatggatcttcagttcaacaaactggtctagctgctccggcagctggacttccgttccaggtctctgcgaattcccgagcaactagtggcattcaagaagcagcacctaatactgacagtagatccattggccggaaagaacttccagcggtatgtgattaactgcttgtagagaattgaacatctagcattgcagcattttctagtccctgcactactgacttgtttcatcttccccacccctttgcttcattggcttcatttagatatgtaatccgttaatttgtatgttctacagtatagcttgtgcaatatgcgatgccattttctaaacttattgtaaccatattttgtgaatcataaagctgaaattaccaaatttgtggacagggcatagaaccaactacttaccagattagtagcacaaccgttttctctttgacgctttagaatccatgttgtaagttgcagaggaactgcattattttatacctataatatataggatagcagtatgaggcactttgttgttgcctaggcttccaagtcgatacctgttggtgtattacctataatatataggacagcaatatgctttgaggttcaggacttatgatatggttatcctcccatgaactaatttcatgacatataatcactgcagtccaactaaattgagtactagtcaatatgagttcttagttcggatttcacttaccatatgcatatggggtacatttcatacccaagctccaaaattcttgttgagcatatacatgtattggattatagatgtgtccctagatattcaggtgcctttaataatttacataaagttacaaaagttatttgcagtgtcgtgctgaaattttatggagttaaaaagtgtcagataaaaaaagaacaggagtacatgataaaaggtatagagctcaaaactgctaagagactgacacttacagtttttctatggctagtatttccttgaaatcttgtcaaataatgtaaggtgtggtggcccaaggttaaatgatgatcttttgatctgtcagaggtggtatttctgtttagcaagcattagctaactgttaatacgttggtaggatatatcatttcctatgcgatcagttatgttggtttaaaactaggtgagatttgttgattgtttacatattaaattgcattttaatgggggttacatggttattaacttttttttattgagagatgataatatatgcatgtaaaacaatgcatggtatggtagggcaagagttgaataatggtgttaataattgttggtgcatttgaatgtgatatctgggttgactaaccagatacatggaaataaatcaggttatcgagtgaaaaagctaaacaggcattcaggtcatcattatgcaaaaaaaggaaaaaaagaaaaaaaatatatagctattggtttgagtctatacttccagtaagtaataagtagtgatctgagtcgcccattcatgctggttgtgaccaacaatgcttctcagttcatttgtcttttcgttgtacccctatttcacttgcaagatcgtttaaactaactttgaattgaggacaactgtgcgatccttttccttttctgtgaaaaatggtcatattagagaagaaaaaaaaacctggtggggccactaatatgctccataaaatcattgtgtcagcatagttgacccttagatcatttttttgcaggatatctttacttcgttatatccaccaggacctcaaacaatagggggttggcagagaacaccccaatttggaatgggatatgccatgccatatcagactgcaatggtatctatcattctcatattagcgatttattgtgtatctgatgttgatgtttttcctaactagataaattatttaccaattttagggaatgcaagcatatcctcagatggcatttgctcaacctgcatatcaacaacctgtatatccgcaacagcaacatgcatacccccaacctgcgaaagcatcaaatccttttgatcttgggaatgagccagctccagttcaagctcacacggtatgaatgaagagaatgaaatacctcttttacaaaatatctcaaactaagatcgtttcacttactattcttgtaaatcttgaggtatcttgtctattaattatgcctgattgtttcattaacattgtgatattcgtgtaaatgttggtcctcttcctctaaaaaactgtcaagtgcattagttttatacttgatgatgcactacgatagtgcgaccatattgtttgtacccttgagcaatcccgacctggatcagctggtatgactcaccatctttgtttgctccattaacatggttaatctttgtgtccttgagcagcagcagcccctacctggaccactgggagcatctgctggcatgactcccccaggtttacttggtacctcgagttttggagtccttccacagcaacctcagcagctgtaccagtcacctgcacctccaagtatttccatatctcagcataatctctgaaattgtgctctttattagtatttcttatctgtgtgctaatttgtggttcaacttcagatcattacatgatgcagcaagttccaaacatgtctgagcagttacctaataccatgcttccaatgtgagttgactgctgtatttagtgtatctcctaagttgaaagtgtagtgaagaactttttagcatttttttaaagatactttttgctcgtgttgattttttttttctgccatttttgttgtatcttttgggatgtaggagtaggaagtagcatgcaaccttaaaatagagactaattattaatgagtccattcgaccagattggatggttgacatcaaccactgaaacccgtagctttcagaattatctcacctttgctctactataaacaatagcatccaccttctagtggcatgcccattgtttgtgtcattaaaatctggtactgcaaccaaaggcaccagcctttgcgttggttccgttgtgttatatcattctttcattttaagttttagttcctacaagacgtatttccgtcctaaaatacttccaaggtgttggttccattgtgcaattttttgttgtttcgacgcttatgtccaagttgtggcattacaggcaacaaggaggtttgggttccctcaacatgggctttgatcaacaagctgctcccaggtacccccagccaagcaccccaccttcctatggctctgttgggggaaatccttttgggtaaggtcattatacaatcgacgtgcgatattatctgctcttttggagttcttgtgcatcatcggacaaagggtttgcagtgcccagcgggatcaggaaccatactagccctcgagagaatttgttaattcatactactggttgtgtatttatccgctgtagttggttgtacaactcgtttccacaaggacaatggtcgagcgtaactgcgtctgagcataagctccacccttcggagttcttgatgcgcattccaatagtgtttgtatatttgtgtttgatgcggttgcaacatgtatatttgggaaggatgaggcctcggggcctcgaatggttttttgactttcttttcggattctccatggaccatgtgcaaatcatgtattcttattggcccaggttgtttatttacccccagtgcagttggctattaaaatttatgtggatggtaataccggattatggttgatatgtataattgtgtaaggtccatttttggaatgttgtatgatactcaggacaaaacgaaacttctaagttgttttcacc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
