Os10g0400800
| Gene Name |
Os10g0400800 |
|---|---|
| Description |
Similar to Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha chain (EC 6.1.1.20) (Phenylalanine--tRNA ligase alpha chain) (PheRS) (CML33) |
| Version |
NM_001071080.1 GI:115481903 GeneID:4348566 |
| Length |
4890 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os10g0400800, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:13894947..13899836 |
| Sequence Coding Region |
13895353..13895406,13895486..13895540,13895755..13895880,13895979..13896045,13896628..13896699 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008403:13894947..13899836 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008403:13894947..13899836 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>tccactcccaggcagctctcccctctcgccgccatggcggatgtggaggcctgcctcctcgcccacctcaactccggcggcgaggtgccggactcccgctcctacgcctcctccctccgcgtcacccacgacgagctcgaggccgtcatcaagagcctctcggctttccgcattgtcgacaccacggacatcaccaaggagacgtgggtgctaaccgatgaagctaaggggtacgtcgcgggtggctcccccgaagcgcagctcgtcgctgcaatcccaccggagggtgcctccaaggacgtgctcagggagaaattgggatctgtctttgacatcggcatgaagacggctgcgaagaacaagtggattggttttgagaaagggaataaggacttggtgttgagaaaggttaacaccatcaaggatgacttgcaagagcaactgaaaagtctagagagtggagaggttctttctgacaaggtgattgatgatttgaaaagaagaaagcttatcacaaaagagaaatcaatttggtatgccctaaagaaaggaccccagtttgtcgcgaagaggaaaaaactggcaactgatgtgacacaagagcatctcagaagtggtgattggaaggatcttgaattcaaagactataactttggagcccagggacaacctattgccattggttatgtgcaacctttgttggaggtgcgagaggaaatccagaacatctttcttcagatggggttcactgagatgccaactaacaattacgttgagagcagcttctggaacttcgatgcactgttccagccccaacagcatcctgctcgggattcacacgatacattttttcttgaagcccctgccgctacaaaacaattgcctgaagattatcttgagaaagtaaaggaagttcatcaacgtggtggttatggctccaagggatatggctatgactggaaacgggatgaagcagagaaaaacctgcttcgtacccacactacagcagtttcaacaaggatgctatacaagctagcacaagagaaaccttttgcccctaagaggtactactccattgatcgtgttttccgcaatgaagctgtggaccggactcatcttgcggaattccaccagattgaaggtctcatttgtgattatggtttgacgctgggtgatctgattggtgtattggaggatttcttctcgagtctaggcatgtcaaagctgcgtttcaagcctgcctacaatccatacaccgagccgagcatggaaattttcagttaccatgaaggtttgaagaaatgggtggaagttggtaactctggcatgttcagacctgaaatgttacttcccatgggactgccagagggtgttaatgttattgcatggggtctttcactagaaaggccaacaatgattctttacggcatcgacaacattcgagacctctttggaccaaaggttgatttcaacctcatcaagagcaaccctctctgccgcttgggactgcagtaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>STPRQLSPLAAMADVEACLLAHLNSGGEVPDSRSYASSLRVTHD ELEAVIKSLSAFRIVDTTDITKETWVLTDEAKGYVAGGSPEAQLVAAIPPEGASKDVL REKLGSVFDIGMKTAAKNKWIGFEKGNKDLVLRKVNTIKDDLQEQLKSLESGEVLSDK VIDDLKRRKLITKEKSIWYALKKGPQFVAKRKKLATDVTQEHLRSGDWKDLEFKDYNF GAQGQPIAIGYVQPLLEVREEIQNIFLQMGFTEMPTNNYVESSFWNFDALFQPQQHPA RDSHDTFFLEAPAATKQLPEDYLEKVKEVHQRGGYGSKGYGYDWKRDEAEKNLLRTHT TAVSTRMLYKLAQEKPFAPKRYYSIDRVFRNEAVDRTHLAEFHQIEGLICDYGLTLGD LIGVLEDFFSSLGMSKLRFKPAYNPYTEPSMEIFSYHEGLKKWVEVGNSGMFRPEMLL PMGLPEGVNVIAWGLSLERPTMILYGIDNIRDLFGPKVDFNLIKSNPLCRLGLQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>4431..4484#4297..4351#3957..4082#3792..3858#3138..3209#2932..3028#2671..2770#2521..2605#2377..2453#2206..2244#2094..2131#1924..2014#1504..1596#1351..1406#998..1054#637..735#411..533#135..320#gaggggctttttcgcaaaacaacgtcaactaacccacacacaccaccctcaaaccctagccgccgccgccgactccccctcgcgccgtccccgtcgccgagcgccgccgcctccgtcaagcccaagcccagtagtccactcccaggcagctctcccctctcgccgccatggcggatgtggaggcctgcctcctcgcccacctcaactccggcggcgaggtgccggactcccgctcctacgcctcctccctccgcgtcacccacgacgagctcgaggccgtcatcaagagcctctcggctttccgcattgtcgacaccacggtactcctcctcccctcccctcccctctcatctccatctccgaatttatccccgggcctcccgaaccctaacgagctatctgccccgcaggacatcaccaaggagacgtgggtgctaaccgatgaagctaaggggtacgtcgcgggtggctcccccgaagcgcagctcgtcgctgcaatcccaccggagggtgcctccaaggacgtgctcagggtgagatatattctgttttttttttcctaggatttttttttatgtttagctggattgactagctttggtacaatgctgacgcttgtattcgtgcccattttaggagaaattgggatctgtctttgacatcggcatgaagacggctgcgaagaacaagtggattggttttgagaaagggaataaggacttggtgttgagaaaggtaatttaagctgagctcaatgtgcagctcgattgggagatttgtccttcttattgttattgttctttgggtgaaatgcgttccaattttgccaatttgtcagttctttgccacagaggtagaaatcggctgaacctaactattttgatatgcagttgtagatccgtgtttactctaggtctgttgggaatgcattttaagtgtgctcctgttcttttatatatctgtgggcatgataactgacgttttgctccttattaaggttaacaccatcaaggatgacttgcaagagcaactgaaaagtctagagagtggagaggtttgtgttgctcgtcactcttatgtttcatctcacaatttgcattttcattggaaacattcactgaattgtgtattggcataatatgaatggtttcgatgttgcttgttgctcattatccatcacacagttttcattataaatatcacaaacaattcttaggtgcctaagatcgttgactggtttttatcggtgcataggagcccatttacctccactgttccacaaaatattgtgtgttaatctgatacgcattttagtgtgcatccttttaagaataaaacttttttatgtaggttctttctgacaaggtgattgatgatttgaaaagaagaaagcttatcacaaaagagtaagtgcctcttatttgaacaagcacaatcatttttttttgtgctgtatattgcaattatttaactaatgtttacatctcctttaatgtcctacaggaaatcaatttggtatgccctaaagaaaggaccccagtttgtcgcgaagaggaaaaaactggcaactgatgtgacacaagagcatctcagaaggtatttgtgccacttctcaagatggttccttaaattgtgcaggacatgttgctggttgattatatgatctaactctgacatatcatgaacacccatctaaatagaaaccaaccgctccagattgccttttggattacctgatcattagctgttagtctgttacttcatcctatcaaagttttcttgcatcagtattgaactatttcatgtatgatattgctgtgaattgtttgtctttgaatattcatatgcatatggaatgttttgtatgcttcgtcttcacaacttttggaaatttcatttcgaattgtattttctgtcttgaagtggtgattggaaggatcttgaattcaaagactataactttggagcccagggacaacctattgccattggttatgtgcaacctttgttggaggtggtttttgtagctccagctctttgtatagcatttctgatagctaaatataacttgaaactaatggtgtttgattcaggtgcgagaggaaatccagaacatctttcttcagatggggtacagtaaaatagtttttcgttactttcacttagtatgggaaaattaattaattcattgtatctatgaaacaggttcactgagatgccaactaacaattacgttgagagcaggtgtgttataatgtttatgctccacaaaatgggcatagtacactctccgtactctgaagtggtctggttgttccagttgataatgatgtgtaaataaaataatattaaaagcgattgctatttctttgttagcttctggaacttcgatgcactgttccagccccaacagcatcctgctcgggattcacacgatacattttttcttgaaggtaaaggtcctgtcagtcttaagatcaaagctgtatgtacactatattaattgttcaagttctgcagcccctgccgctacaaaacaattgcctgaagattatcttgagaaagtaaaggaagttcatcaacgtggtggttatggctccaaggggtatgctctggtgtatattgtgcagcctaacgaaaaaatttataatacaatatagccttttgcagatatggctatgactggaaacgggatgaagcagagaaaaacctgcttcgtacccacactacagcagtttcaacaaggatgctatacaagctagcacaagaggtaaagtaactgacagatggtcctttttcagtttatagttctacattaagttttataatcttagtttaattataccagtgattgtgatatcaatttgtttttatgttctcttgaatgattcatgaggtttattttcttcaataattaccatgaactttcagaaaccttttgcccctaagaggtactactccattgatcgtgttttccgcaatgaagctgtggaccggactcatcttgcggaattccaccagattgaaggtgtgttcttgtttcttgcctatgttttgttctgttgattgaaatctggtccatatcttggatatcatgtggacacagtgaggaagctacttacagttccttctttcaggtctcatttgtgattatggtttgacgctgggtgatctgattggtgtattggaggatttcttctcgagtctaggtgctcaaacttcaactgtcataataatgatgtatcttggttaagttttttaaataatatacaagaacttcctattcaacaaattaacccacgggtgcacattcagtaagatgactaatttaggccgtgtctaaacactactaagagggcggagccatatagtgcatttgtacacaagtcttcgaaaatttgctgttgatttgccaccatggtgataactgttgcttgagtgatgccttgttcatgggtgcttgtattgatctgaataatgctacatttctggtgtaaaaccacgcactaatgcagactctgctggttaatgataaatgatgctgtgctttatacatgggaacacaagagaaccattatatttttttgcctattgcatcatctctatttagattgtgtattgccaagataaatactgtatttcattatgtatgttgcctacttttacacaactctaggcattcagtcattcacatgctatacaattgaacttcctttatatgcctatattctctcttgtcctttctaaattcagcagtcctttttaaattggaaaatttgtctgccttttaggcatgtcaaagctgcgtttcaagcctgcctacaatccatacaccgagccgagcatggaaattttcaggtgacagctttgattgctggcttcatgattcttctagttcatgaatgaactttttttcacaatgtgtttataaaccattcttgtgtttcttttttcagttaccatgaaggtttgaagaaatgggtggaagttggtaactctggcatgttcagacctgaaatgttacttcccatgggactgccagagggtgttaatgttattgcatggggtctttcactagaaaggtataattgagataagctcgaagtgaggtttttcttatttacatttacctgttaattttggcctattgtcaaaatcctctctttggaattcttgtttttttcataaacagtaacaataaaacaaatcttatactaattgaagtgtatgcaatccttatttttggctggactaacaattttaagaaatttgttctgactatactgttttgactaggccaacaatgattctttacggcatcgacaacattcgagacctctttggaccaaaggtattgtgctactaatatgcagagctttctcccgttaacatgatcttttgttctcattttctgatttgtttttttccaggttgatttcaacctcatcaagagcaaccctctctgccgcttgggactgcagtaaaaccttgcaaaagttggttggaagtgattaagtaacaagatttgtttagttgatcagtggttgaacgtgaagagatcatttctggcttaccttgaaacaccaatacatgtgcatttagcagaggtttttgtattacagttttgagtgatatgagactaccagccaatttttgtgtgtgtccatattcgaatactttgatacattttaattgagcacatccaatgtatgaagtggtcatctgccgctgcggttgcttgaatcaaaatatggaccattgttttcttttctttgacaaacttggcgctccaaaaactgttgttgagaagtgtcatcaaacaggatgtaatagttatgatactgatctaagattaataatatctgctgaagctgatgcctttcacacctc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |