Os02g0252100
| Gene Name |
Os02g0252100 |
|---|---|
| Description |
Similar to SC35-like splicing factor SCL30, 30 kD |
| Version |
NM_001052983.1 GI:115445336 GeneID:4328900 |
| Length |
4304 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os02g0252100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:8582858..8587161 |
| Sequence Coding Region |
8583200..8583323,8583742..8583924,8584025..8584085,8584337..8584377,8584463..8584627 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008395:8582858..8587161 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgaggaggtatagtccaccttatcgcagtccaccaaggaggggatatggtggcagaggaagaagtccccctaggaggggatatggaggacggaaggaacagggttctggcagtctcctggtccgcaacatccctttaagctgcagagcggaggatcttagagttccttttgaaaggtttggacctgttcgagatgtttacctgccaaaggattattataccggggaaccgcgagggtttgcattcgtggagtttgttgacccttatgatgcttctgaggcccaatatcatatgaatcgtcaggtggtttttggccgggagataactgttgttcttgctgctgagtcacggaaaaggccagaagagatgcgcagtagagccagagtcagagggtactctgaccatgaaggccgtcgttcatcccattacgggaggtctcgttcacgttcgcgttcccgctctccccgttatcgtggtcgtccacggtcaaggtcatactctcctgctccaagacgacgagatgactattccgcatccccacagagaaaagacacacatcgtgcaaaatctcctaggcgtcagccaaaagaacatgaagtagacaagaagcggagatcctattctcctgccaataaagatggggaccggcgtgatgctgataatggttatgaaaagaggtcgccgccagctgacagcgatggatcccctccgcaccggaggtcccccaggcaatcctcaggatcgcctccaggatcccgctccaggtctgccgacgggtctcctgcccgcagtgactaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MRRYSPPYRSPPRRGYGGRGRSPPRRGYGGRKEQGSGSLLVRNI PLSCRAEDLRVPFERFGPVRDVYLPKDYYTGEPRGFAFVEFVDPYDASEAQYHMNRQV VFGREITVVLAAESRKRPEEMRSRARVRGYSDHEGRRSSHYGRSRSRSRSRSPRYRGR PRSRSYSPAPRRRDDYSASPQRKDTHRAKSPRRQPKEHEVDKKRRSYSPANKDGDRRD ADNGYEKRSPPADSDGSPPHRRSPRQSSGSPPGSRSRSADGSPARSD</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>3839..3962#3238..3420#3077..3137#2785..2825#2535..2699#1486..1563#980..1125#gcggtcgcctcgctttctccctcgccaactcgcctaccctccccacccccgcgtcggcggcggcggcagcggcagcggcagcgacggagcctcgccggcggcaagcgtactcacccggtaaccctggctcctccccccctccttctccgtacctcgtatgcgtgttcttctgcgctcgtgcgtgcggtgtctgccgccacagaaaaccctaggtccgcctgcggcgtgtcagcgagctcgcccgtcaccgcttagatccgcgcgggattcggcggtttcgcttgctggagatgccttgacgagcggtttaacgagatagggaatgttctatttgtttttaccccgtagctgcaaggtttctgaatctcagatcccctcctgccatgtcggggttgaaggctagggttgttgcttcagagttgtcgtgaattagtcatatatgcagtaaattcttggttggagctggatacgtgggtggttgggagtaattgctattttctagatcaacttaatatgctggatcttggtgttatatcgatgtattcatttgtttgttactgtgttctataccattatcgtatccttagatccaaaggataaaggaaagtcatagttcgaaatttgagctgcaattcaaaatttttggaacagtgtttacaactcagatttgttgactgatgtgaatagcgcatgaacttgcaaggtgcatgattcattgggctatgccaattttgatttggtagtttttaatcttaaatcctttttaacatgatgccatgcttgtgtttgaagacttctttccatgtacttgaagttacctatgggtttttttgttccctatacttttaaattacgctgtagtatattattcttaacaaaaaactatatctgtgctgacaagtttggcagttattctttggttgcatttgtcttcttatcgctaatgttcctgtatttacgtgtaattgcagacaaaacaatgaggaggtatagtccaccttatcgcagtccaccaaggaggggatatggtggcagaggaagaagtccccctaggaggggatatggaggacggaaggaacagggttctggcagtctcctggtccgcaacatccctttaagctgcaggtactggaactgtataaccgtagcacctttttccaatgactatattcttaatgaaataaataaatattccctctgtttctaaatatttgacaccgttgactttttagcacatgtttgaccgttcgtcttattcaaaaactttggtgaaatatgtaaaactatatgtatagataaaagtatatttaacaacaaatcaaatgataggaaaagaattaataattatttaaaatttttgaataagacgaacggtcaaacatgtttaaaaaagtcaacggcgtcaaatatttagaaacggagggagtataatatttcggaggttgcagatttattcaatttgactggctctcttaactctggcagagcggaggatcttagagttccttttgaaaggtttggacctgttcgagatgtttacctgccaaaggattattataccgggtaaagtgttgctaatgactctgttgattggtttgttgattggcaatcgccaaaaaaatgtttgttataatgttaggatagtaaatgtagatagtctgtatgcttctctgtattgtcgctgcaataagcttacaagcttttctaaagttattcaatagactggaaataaaaaaaatcacaacggaggtttggcgtgaacattttccagcttcagtgtggtatcaattactgcagtcaccttttcatttagctccattaattgaaatgcttgaatcatttttttaatctgatgatgtgtttagtaatttttttcatgtcactagagcatgtaattcactaatgtggtaacccatatttttgctttctttctcctacgcacttaatatcataagaagtttttccctgaaactattcccagggtcgtactggattgaagtaaatacgatgttgaagaatgcttttcaatattcctaacaattgatttgtttggcaagatagagtcttgtccgaatgaagaagttcttctatgaagacaagatttgactcattgagaaaattaatttcacgaagagaagataagagagttgtactgggtggtgcatgcgaagataaaagtgagagaagttgatttcaagttctatcttgacttttcgcacattcgggaacttgaagcgaatgcttctgtgaagatgctctttatgaggatcaccatacgtagtgttatacaagaaattcagataatagagcctggacatctaactgctttttgcaacacttgcttcccttttgctggaaatgttcgtaagtttttaactgtgcttcactgagaatcatagagggtacattgagttttgaactgtgatggtaacatggcagacacacactacacatgaacattttgcaccttcttatttgttagttttaccatcaattttcctcaaacaactgtctcataaaatatacatatacagggaaccgcgagggtttgcattcgtggagtttgttgacccttatgatgcttctgaggcccaatatcatatgaatcgtcaggtggtttttggccgggagataactgttgttcttgctgctgagtcacggaaaaggccagaagagatgcgcagtagagccagagtcaggtattgttcccattactgcttgaacgtgcggcttaatattctgttttgtgcttgtttacaatgactttgtgtggttgctttgcagagggtactctgaccatgaaggccgtcgttcatcccattacggtattctctcatttctcatcattcatgatcttgtgcatttctaaatgcacatctagaatcttgtgtgctctgtaattatgcttggaatacttgtcccttttgctgcacacataaccgtatgtttcagatttcagattagtactattggtcaatctcaagtttttgttaattttcttttcttaaatgcatgtaattttctaatttattttgttgccacaccgaattactgaggcatccatctgttcttacagggaggtctcgttcacgttcgcgttcccgctctccccgttatcgtggtcgtccacggtcaaggtagaccaattatagttcctgtttactttttgttgctatatgtgattcctaagccattatcttcattcatgattctctcacttacatgttttctttaaaggtcatactctcctgctccaagacgacgagatgactattccgcatccccacagagaaaagacacacatcgtgcaaaatctcctaggcgtcagccaaaagaacatgaagtagacaagaagcggagatcctattctcctgccaataaagatggggaccggcgtgatgctgataatggttatgaaaagtaagttcgagtgcttcttacttccattgctctttgcaatgcaaaagttctgcattggtttgcttttctcgcctcaaaaatggttgaaagtagcatacgatagacttttagtgtatgatattccagtaaagattgaatggctgttgtgccttgctgttggattaggggaaagcattcgaatattttccgcatactcatgtagtcattttggtcgtatgtgcgttacttatgggatatatataaaaatataccccctccgtcccagaataacttaatctagtacctgtccagattcatagtactaggatatgtcgcatccagtattagattaacttaattctgggatggaggtagtacctacctcatgaaatgccttcttgggtttctggtcatacactgaaagcatttatattcacaggaggtcgccgccagctgacagcgatggatcccctccgcaccggaggtcccccaggcaatcctcaggatcgcctccaggatcccgctccaggtctgccgacgggtctcctgcccgcagtgactaacagaagaacactgcgcacgctgtgctacatcctctctagcttcttgttggtcagaccggaccagtttaagtaaaaacccttttgggcttgttgtaaaacttgtaatgctagcatctgtcgtggtttggtagcggaggacttggatcgtcaccattgtgtgtgctcgcttctcagtggatggagacattttgagtcgtgtgtgatgaaaccttagacttgctgcatggcattgtattgtgttaaacttatccgtatgccttgtgtattcttgtgcttgccatgtgctcatgcgcttgaattgctgtgcacgcggagtcgaactatgccgtcgacttcttttgg</dnaseqindica> |
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