Os02g0272600
| Gene Name |
Os02g0272600 |
|---|---|
| Description |
Aph-1 family protein |
| Version |
NM_001053062.1 GI:115445494 GeneID:4328988 |
| Length |
5240 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os02g0272600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:9931629..9936868 |
| Sequence Coding Region |
9931792..9931904,9933377..9933532,9933677..9933762,9935082..9935207,9935446..9935573 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008395:9931629..9936868 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008395:9931629..9936868 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgacggtggcggcggggttagggtacgcgctggtcgcgctgggccccgccttctccctcttcgccggcgtcgtcgccaggaagcccttcctcgtcctcacccttctcaccagcactttattctggcttataagtttgataattctctcgggaatatggagggtatttctccctataagatcaggagcttggtggccgtatgcaattcttatccttacatctgttgcatttcaagaaggcattcgtcttgtcttttggaggctttacaagaaaatggaagagatgctggattcctttgctgatagaatatctaaaccgcgcctctgtttgacagacaagatgctaatatcgttggctggtggtttaggccatggagtggctcatgccgtctttttctgcctcagccttttaactccagcattcggcagagctacattttatgttgaaaagtgctcaaggatgccatttttccttgtgtcagccattatttctcttggattcttggtcatccacacattctcaatgattattgcttttaatgggtacgacgagagaaagagaagtgatcaagtatttgtcccagttgttcatctgattgcttctgtaatgacactaatcaatcttgcacctgggggctgcgtaattggtacaccactattatgcgtcatgggtgcagtgacgttgcaatactgctggcaaatggtatggcggagattatctgagcagcagcatcggcagtttagcagctag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MTVAAGLGYALVALGPAFSLFAGVVARKPFLVLTLLTSTLFWLI SLIILSGIWRVFLPIRSGAWWPYAILILTSVAFQEGIRLVFWRLYKKMEEMLDSFADR ISKPRLCLTDKMLISLAGGLGHGVAHAVFFCLSLLTPAFGRATFYVEKCSRMPFFLVS AIISLGFLVIHTFSMIIAFNGYDERKRSDQVFVPVVHLIASVMTLINLAPGGCVIGTP LLCVMGAVTLQYCWQMVWRRLSEQQHRQFSS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>164..276#1749..1904#2049..2134#3454..3579#3818..3945#4906..5046#acttctgctcattccgaagccttcgccgcgtctcgccggcgtacgccgcaggcgccccacctcctccggcgagccagctcggagctagacgcctgccctccccactctcgccggcggtgggcgcgcgggtggagcccctgcgttggccggacggcgggaggagatgacggtggcggcggggttagggtacgcgctggtcgcgctgggccccgccttctccctcttcgccggcgtcgtcgccaggaagcccttcctcgtcctcacccttctcaccaggtctctctccccctcatcctcagccctctcttagaactcccctgtttctgcttttggatcaaatcgttggcgttgtgaacttgtgatgtgggtggcgaaatcgtacatcggagttgttcggttggcgtaaaaagatgagaattaagttgatttgtgcgtccctgccccctccttggtttgattgtgccagggtttcgtgtggaattttactctcgttttctggatgctgctttctggtcgtatcaatacggtgcgactttttacattaggggaaaaaaactgaatctgattaaggagtagatgtgtgtaaaatcgaatcctagattactcggctgtgtacatgatgctactctccctaggtagttggagaccaaagcagaaaaagaattactgaacacctactcttgttgcagataatactttttgatcctatgttggtgtgcagagtccagtgaatttaaatcagtgctgtttactgttggacattgattagctaattcgtgtgccgcaggaagcttatatatttttttaaaaaaaaaagaaacaatgtttttgcctttttggtagtgttggggaatgataaatggctttatataaatttagtaaaaggttgccactgaagaaaattcagttgccagttctgctgtatgggtatgttaactttatggatgtacctattatccggggattttgtgtgtgaagtgttttttttttgtcacaaactgaatacctgatcacatgcctacttaaactttatttaaacatggtcatctatgtctttctgtaatatgcaatccagcaacactatgcaacttctatagaaatgttcacctctgcaccctgcaattaaactcacactatcctcagtatgtccttgatttggatatgtaaaatacaaaaggcccagtgcttactggtactagtacatttgctaattttaagttgtagactgcattactttggggattcccttatcaaacatgctgccaggagatcacacatagacaggaagctgctttattgatgacaccatgggtagtaggatatgattagttctttgggtcccaaaatatgagaaatattttcaaataaaaagatgactccatccaccatattagaaattagaaggattagatgaatttttccatgcaaaattaactcgaaattaatcactagatccacatcggcattggagccttgctgttgtggcagggtttgagcattccatacatcataaatccataattgctacatgatccattatttagcagtactctttgttatgatagtaacaatattcacacaacatgctatcttaattctgctcttatagtacataacaacaactaactactacacaatatgcacacatatgtgaggtacttgtgaaactgattcttgaggttctaaatacaaaatactgtaatatcttcatatttaaatgttaattctgttaatttctgtttgtgcagcactttattctggcttataagtttgataattctctcgggaatatggagggtatttctccctataagatcaggagcttggtggccgtatgcaattcttatccttacatctgttgcatttcaagaaggcattcgtcttgtcttttggaggctttacaagtaggtaaaccataattgaaagttgaacttcacacctttttatggcagtccctgtagtgtattcactatgtatagagatgatataattatggaacttgaagttgatttatgtctttatgatatgtgatggttactgtttttcaggaaaatggaagagatgctggattcctttgctgatagaatatctaaaccgcgcctctgtttgacagacaagatgctaatatcgttgggtaagttcttgcatcactagatcaatatgtccttatttcaagattggcttaatatttctccatccatcgtttatatagaaattatttctctatttggcttgtgtttgccttgaatttttatttaaaataggtacccactgatatctttaccgtcatttcatttctgtgaagaaatacatatttcatttggatatgggatgaatggtacctccatttttttaggtggtctacagttgcaacttttttccacaaaaggaattaaactttaactttgtattattcacaactcacaaatatcccgtaggtttctattttcctgatgtgtcatgggcttgggcccatttcaaggcaggatggcctgtgtggctgtatcacgcgatcaatatacttatttactattcacatggcaacaaacgacttcacatcagttgccttagagataagattagatttgctaatctgtttcatagtagtgaagtcatccaatctttataaggattgattctctctctaatattcaagcaaggaataatcaaggtctttagtctccttccctttctctctcttctcaaccaagtcttagtgccttggtggcagcaatggccaaccaatcaagggtgtctcctaccttgctcctcatacgttcatacttatatccaaccaatgtcttcaacatggagtaataattgcaagctgacgttctaaattttttagttagactatcaaattgacattgactttgatacagataaacaaaaccgtacttgtcctgattttcgttaaaaactactgagtgtaagttttcaacacactcttcatgttcttgttacatggtgcacttaacattttgacatactcttcatattcttgttacacagtgcacctaacagtggacataattataactgcaaacgataggctttgcagtacatatataggtcatcttggaccatccagttttaagttcttatttcatagattacataaaaaagtgcaatatgtggtaggcattaaggattcttagtaaaacaattgcagtgctgagttggtaaggttggaagattcactgcaaaactaccaagcattcttttaaatggagtatagaacagagccaaggcacacatatgtggttcttcatcttgtgattcgaaactagaaaataatcaaaacacaaacttggtctacggtattggctcagctgaatattctaaatgcaaactgtgcattcacttattggttagtgtgagcgtttgtccttcatatcactgtaagtcaaaaatgataactgctattgtttgaactttgaaatgtctttgcagctggtggtttaggccatggagtggctcatgccgtctttttctgcctcagccttttaactccagcattcggcagagctacattttatgttgaaaagtgctcaaggatgccatttttccttgtgtcaggtaagtcatagtttctccttactctctaatacgaattgggctctaggaatgaaaagaagccttccttctaattggattggtggtaaacaattttataatacaactctttctgttaatgttgtgctttcatttgtcaacatattttttaatttcataaatcagggtgatatttgatgcaaaattgtattatgctgaacttgtattgcataatgatgttatctctgtgtgctgtttgcagccattatttctcttggattcttggtcatccacacattctcaatgattattgcttttaatgggtacgacgagagaaagagaagtgatcaagtatttgtcccagttgttcatctgattgcttctgtaatggtaagaactaggtttcaattttttatttgagctgagcatctcttatgacagacctgacaatgcttcaacagattaatgtattttcataatgttgtatgcagcattcattgttttcttcatacaaaatataggttcggctatacaaaatcatggaaacatattaatctgttgaagctttgtcaggtcattccttagctcgacctaacaatgcttcagcagagtagatgtcatgtcttttggaatgtgctaaactactgtatggtataatataaaggaaatgtattagcatttgactgttattggcatcaagataactttatagtaaactgaaacagtgaaatgttgccccaagatgtaggaaaaatatacaatatcatgtataaggtaaatgcattaataggtgttactagctttcgaaagaagtatagttacaaaatctttttacctacttcatatttttagaaaacaacttcatcttgcatggaaagttggagcatttttctatttcttctatcatgaaactatgacatcagtatccatctatatcacaccatatattgttgtaatatcttttatatttccaacttattaattactccctccgtttttttaatatatgacaatgttgactttttgagatacattgaccattcatcttgttaaaaaaatatgtaattatcatttattttattgtgacttgatttatcagtaagtgttctttaagcatgatttaaatatttttatatttgtacaattttttttaaaaaagacgaatgatcaaacgttgattaaaaagtctatggcgttatacattaaaaaacggaggtagtatattatttgagtagcatgtggtatgacatgtgaatgtttcttcttgatcttctcatgtaatcaagtatggtttgcacaatgcactgctgaatttgggcctggcctgattacaccatttgttcatttcagacactaatcaatcttgcacctgggggctgcgtaattggtacaccactattatgcgtcatgggtgcagtgacgttgcaatactgctggcaaatggtatggcggagattatctgagcagcagcatcggcagtttagcagctagtgcctggcaatgctccttacatgtatcttctcatgtccaattttaataatcttttgtttggggtactagggcaagaagttgtaaacgtagcgaattagcgattataccactagtgggattcacatcttatgaaaattgcatgcaattcaacgtcatgactgagacattgaagcccatctgtttggttgctcatg</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
