Os02g0493300
| Gene Name |
Os02g0493300 |
|---|---|
| Description |
Tetratricopeptide-like helical domain containing protein |
| Version |
NM_001053417.1 GI:115446204 GeneID:4329398 |
| Length |
12881 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os02g0493300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:18056180..18069060 |
| Sequence Coding Region |
18057235..18057286,18057511..18057590,18057672..18057842,18058914..18059018,18062392..18062541 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008395:18056180..18069060 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008395:18056180..18069060 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgtcgctctctcgcgtgcctcctcccgcccgcggaagccgccgccggccgcccccgtccagccccgtccccctctccccgcggcaggagatgctcctcgaggcggcatccgacggcgacctcggcttcctcaagcgggtggtgaggtcgctggacggagggaggggccgccccgcggaggcggtggaggccgtgcgggagtgcggcgcgggcgcgctgcacctcgccgccggcgcggggaagctggcggtgtgcaggtacctggtcgaggagcttcgggtggatgccaacgccatctacgaccaaggtgaaacacctctggcttatgcagtcaatggtgcaaatgtagctaccgtgaggtaccttcttgaccatggtgcccatccagaaaaagctgataataaaggattcacccctctccattttgctgctgaagaaggatattgcaatgtagtggagctcttgcttgctaaaggggctcaagttgattcgatgtctgttcgtggtacaccactacatctggctgctactaatggacaacatcgtgtagtgaagattttattggaccacaatgctgattgcaataagattgtatctgctgtctacactcctctcctcgtcgccatttatggttcatcactgaaatgtgtaaagctgctgattaaggctggtgctgatgtaaatggtgttggtaatataacccccttaatagcttctgttggctcaactgagatcatgaagtgcttattggaggccggtgctgatcctaatgtccctgatgaattcggcaggatgccaatagaatttgctgtgcgatgtggtacattgaaagatgtcaatatcctatttcctttgacatctcctatgccgactgtacctgattggagtgtcagaggaataatccgtcatgtgaacacactgccagggcaaaaggactatgagagtggccttgaaaaagaagtggctggtttgaaattacaaggagttgaggcactgaagaggcaggattatcttgctgcatcagacctatacactaaggcgctttgcctcgacttcaatgatgcaaccctgtattcaaacaggagcctctgctttcttcacatgggtgatggagacaaagcttatggggatgcctatacttgtaggatgatgcggcctgattggccaaaggcctgctatcgccaaggagcagctctaatgctgctgaaggaataccaaaaggcgtgtgatgctctcctcgatggtttcaaaatggacccagggaactctgagattgagaacgctctaagggaggcgatggagtccttgaagatatctgatggtgctaagctgacaacctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASLSRVPPPARGSRRRPPPSSPVPLSPRQEMLLEAASDGDLGF LKRVVRSLDGGRGRPAEAVEAVRECGAGALHLAAGAGKLAVCRYLVEELRVDANAIYD QGETPLAYAVNGANVATVRYLLDHGAHPEKADNKGFTPLHFAAEEGYCNVVELLLAKG AQVDSMSVRGTPLHLAATNGQHRVVKILLDHNADCNKIVSAVYTPLLVAIYGSSLKCV KLLIKAGADVNGVGNITPLIASVGSTEIMKCLLEAGADPNVPDEFGRMPIEFAVRCGT LKDVNILFPLTSPMPTVPDWSVRGIIRHVNTLPGQKDYESGLEKEVAGLKLQGVEALK RQDYLAASDLYTKALCLDFNDATLYSNRSLCFLHMGDGDKAYGDAYTCRMMRPDWPKA CYRQGAALMLLKEYQKACDALLDGFKMDPGNSEIENALREAMESLKISDGAKLTT</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>11775..11826#11471..11550#11219..11389#10043..10147#6520..6669#5945..6061#4391..4477#3575..3714#2144..2275#293..463#70..208#cccttccattcttcttccaaccggccaacgcgtcaaccctagcgatcatccagcggcggcaaccttacaatggcgtcgctctctcgcgtgcctcctcccgcccgcggaagccgccgccggccgcccccgtccagccccgtccccctctccccgcggcaggagatgctcctcgaggcggcatccgacggcgacctcggcttcctcaagcgtgcgtgctctacaccccctccgatttcggttttgatgttgttcggccggcgctgcgtgcttgatgatttgccctttcttgcaggggtggtgaggtcgctggacggagggaggggccgccccgcggaggcggtggaggccgtgcgggagtgcggcgcgggcgcgctgcacctcgccgccggcgcggggaagctggcggtgtgcaggtacctggtcgaggagcttcgggtggatgccaacgccatctacgaccaaggtcctcaccctctcactcgctcacacacccgcgaacgccattgtatttagcacgggtcgtgatcctatcgtcgttgtctactcctatttggtagcagtaattaatgcagggagatttgtgccttgctaattgtggaatttgggcgatactaatgtttttgtagtgtcgctgggttattttcagaattcgttggctgatgtgtagttgcgctttgtttagggatgcatttattctcattgactgatcactgatgtgagtttgcctgtgtacgtgtatacccgtacacatttacttgatgccattcatagtgtgctttggtgtgtgagtgcttgtatgcttacttcagtgatgctaattttgacttaatggtactcacttaactggctctgtcacatgatatatagacaaccccttttttttattattgtttttgcagagtccatctatatactaaatttgtgtttagcgcattgttaggaaaggtgattgtttctttggctgcttcttttcttatttttagcaactgctacatcagtcccaattctcaaaaggaccttcatcgggaatggaggtaatatatatgttatcatgagtcatgactgaaaaataaccattcctttgttttcctctgaggttgtggttttcatagctgtctagccccttgattagcatttcttttgaacttgcatttgtttcttggcttcttcagtttgccaattcacactgttgcagtttttcatagttgtctaaccccttgattagtattcataattttatttctcacaattatgctgtagtacatttgaatcctggagttggcattgttcagttgacaaatatcatccatcgtttatacttctattttgggaatgccatcataaatttgcatttgcatctgtatgctacctggtacatgatatgtcgtatttgttaggccctattttcatatagcatattagattttacttatgtaaaatccatatacttaaaactgaattggccaacaagacattggcattagtcagccttattattataagataagttctaaagtactaaaactaagcatggtataggcatgaatatcctgatattttggatccactatgtagggaaaagatacttgcatttacagtatattgatgtaaactcccattctcacatgagttgtccaacaaaggttgagtaaataattccatggttgtttcattgttctccaaatagtccctgtgctgcaaacattatacatgaccttactttttatcttatggtgctttcccaaatccgatgcacactttatttgaatgtcaatgggcggtacgtataacagttattgagtgttcattttaaacatgtttctgacactaccttttgtatcattaactaaatattatcttatggtgtttatttgccttgattaaaaatatgcagtttgttttttatattttggactgctcaaagggaaaaaaagggaacctgccgcatattagataatcaacatttagtaatgtaatgtgatcataatttagaaaggcctatgcgttgcacacttgaactattagtggtttctgttttatctttaggagatggaaggtaaatgtgtagcaaactgtacgcatgctaaaaccccaaaacttgctcttggttgatataatcatttgttcctgatgcttttaacaggtgaaacacctctggcttatgcagtcaatggtgcaaatgtagctaccgtgaggtaccttcttgaccatggtgcccatccagaaaaagctgataataaaggattcacccctctccattttgctgctgaagaaggtttgcatatatcatctttttgcctgtctgctgtacttcaatttatttttcatgtgttagactctagagaaatgaacattatgatatgtatctgagataaactgtttggccattctttgtttatgtaactgatcgaaaaccagtttttctacatgtgaggtggcatatatgctgcttgttcttataccatgccaccatggtattctttttgtacaccagtaagtaagcatttgttaattttgaagttactaatgaatgaaaattttggtacttataatgtttgacttgatgtagactgggtggtctaactctgaccacctgcttactgttaattgggcaacaagctgcctaagtgcttatttgcatatttaggtcttagaccaaatcccttgaacgtagggatttatctgggtatggccatctggcaagctatctacatgttgtagatcttatcaagggtgtctattctaattctctccatataaaactgtccaccttacgtttttaaggtatcgattttaatttgactatatcataaaatttctcacaatgatccactgaagcaattaccttgtttaaggatggggctggcccatatagccccaggttcagatacaaccaactcatcaaggtggtggtcaagggcgctgagagaaagagacaaagacactaataaaggacttagctctctcatcactctggtgttatgggagatttggaagcataggaatgactgtttttaatggtgctaacccttgtgtagctactgtcctccaaacagtggcaaatgagtgtatcatgtggtcgctagccggggcttctaggctaaaggagttaattgataggccaatagcccctcggaggtggggttttttgtgtgtgttgtaaaggctacggcctgttttggatccggtcggtgggcactgctcacttcctgtccttttttttcttctcttaatgaaatgatacacaattctcttgcgtgttcaaaagaaaagtgataccaaagtgttactactatttgccattgattgatcctatgctccttacttgatttacagatatcaaaatatccaaaatttgcccatgggtacttctccaggaattgtttatcatttcttctggctcagaatagatattctaatgcaatatttatatttccttgatcatttatgtccctaatatacatatgttaagggcaaactgaaatctagcagatgttatcaggaaaagtaaatcatatagaataactatcttgcatagtgatacccgttgaaatttcttgttctttttttacaggatattgcaatgtagtggagctcttgcttgctaaaggggctcaagttgattcgatgtctgttcgtggtacaccactacatctggctgctactaatggacaacatcgtgtagtgaagattttattggaccacaatgctgatgtatgccattttttgctttcatgttcctagtttctaattagcgtaatgcccaccgattgtgttggcagcctaataaatatacccagcctaataaatataccatgaaatctaaacgtaaagatgcaaagaaaatataattatcctcaatactgtgtattgcacaactacaggagattggtcaactacctccataatatgcacatttgcaatacatttttctacaaaaaagaagttggagagatatcatgcacatgtctatgtagatccatccacgcagatgttttctattgacgggatgggtgcagagtgcaccatcactcccgactctttttaaagactgcagaccattgtaagataaaattaacatggtttaacggcattgcatggcttgctcctactcataaatattatatttgttcatggaggctgcactgatttttcttccactgaattctacactactattgtttaaaatcataagaaattcaaagttcaagtacagtcgcaacccttgatagataacatttgtagagtagttaccccttttcaagtctctgaagtctgtatagtgagcattgcggttctagtttcatcaatttatctttttgtttacattataatgtgtctttgtttccttttgtcactgaggtttttggccaactgattatttttgcagtgcaataagattgtatctgctgtctacactcctctcctcgtcgccatttatggttcatcactgaaatgtgtaaagctgctgattaaggtactgtggcttgttccttgggatttactgtctacaccactaaataatggttgccctcgaatccaccggttcaaatcattcttaattttgaccttgactgcgtcagatgatattgggatgccacataatttcttattgctagatttattttgaaattacttatataatattttttaatgatttacaacaatatattactccctccgatcataaatatttgataattaggacaagatttggtcaaaatttgaaactttgaccatcaatgacttctaaaatgcttagtttaaaaccccaaagaaaaggtatgcttaggtttgtctagaaaagtgctaccataatttcataaacttaaagttcaagtactatgatagttgatcaaagtttgccctaaaagtcaaatatctatgacaggagggagcaacagaaattaatggtcatgatagttgattaggtaccatgccaatgtccaacaagacctatatttagtgaagagggagtaaatcatctagaatgttttggtgtcaaatatttcatggggaaattcaacatgtatctcctggaaattctaatttcatatttgtgatatgattatagctggctacagattacatgtgttgcccatttatgctggtctgctcctaaccatcctgaaactgccaccaatcagcagagtatgaagggcgaccattttttttttaaaaaaaaaaagtactatggggaaggtgctattatatgtctactactaaaaaggggagtttcatccatctgcacctcccacacatcgggcgttcctcccctcccgaaaaaccaaaaaaagctggttactgagaaaacaaataggtcaaatcccatcttctgttgcacgcaccgcatggctgcaccagctgtgccttgtcagggtcaggcccgccctgcaaactccccaaaactactttggcccagtaggaaaactaaacaatacaaggaaagaagtaaccttgaaaaggtgcagtcaaaaccatgacaacccagaccaaccacgagaaagaaaaggataatttgatgaattcagatagccaacatattcttttgattagtgcatattaactattgtgagtacacgctgccttatttttgctttcaaatgagcttatgttggtaaataatttcatggggtgcaccactaagtttcacagttgcattgctatatgtgcgtcacaagcaattgacgtgatccattttgttattctgtagcaatacatgggcatttgactagttaagaaaaataccatgggaaggtttttatgatgcacatgcacttaaaaatatttcagatatttcgttttgatttgaactttaaagagaggcataatatttggaatttcagaggaaatagatgtatttgtacaacactgcatttctcaatgttattaattaggatatttattttagaggaggcaacccaacatttttttcttggtttaggctggtgctgatgtaaatggtgttggtaatataacccccttaatagcttctgttggctcaactgagatcatgaagtgcttattggaggccggtgctgatcctaatgtccctgatgaagtatgttctcccctcccatcattttgatggcatgttcaccaaccttatttacctaaagatataagatattttgttttaacaaatcattgctgaacatgttgctcttttaggcttcgcagttcttaaacatttatcaaatcaatttatgacgtttttatcccattagtgactaagacaattgcagcaaccatagtatcagatggatacaccgatttagcatgcagcagccttagtcataattgttcgattattgaataatttgaactccttttgtcatattagatttggtaattccttgagtaaattactttgatacttttctcaagtacttcaaagactagattgttgccaattattgcattgaagttctgatgttttttattgtctcttgtgcttctatttcttgccctccaaattgcaattattttatgaactcatattttcttgatcatgagcagttcggcaggatgccaatagaatttgctgtgcgatgtggtacattgaaagatgtcaatatcctatttcctttgacatctcctatgccgactgtacctgattggagtgtcagaggaataatccgtcatgtgaacacactgccagggcaaaaggtactatatgaactgtggcatcaatattgtatctctctttaactaataacttcagtatgcaaattggtatttgatttggctttagaaagtcttcagaattttttttgtttcatccttgaattttgggaagttcgtgatgatggaatttttcatttattttatgtctggttcatgttttcacacccacttgttgaaatgttctttttgttgtggttggtgctagcagtttcaccaaggtgctaattgctagtcagatcgcagactgtacctaggattagcctgcctaggtagcaaatttttgttggccacgcaaaataaaataaaaacagtgcactcagggcatacatgttaggaagaagagggatcagggaggctcagttgctaccctcgagctgcattgccacggcttttggttgctgtgtgccaccctcgagctgctgctgccagagaaaaatgatggcagctgctagtaagaaatacctaacccaagtactctttatggcctgactaagtttcatgggctgctaaccctactagccttctcggttgttcaatcaccaattaatcccccacagccattggattccgcatttgcctcctactcctaatccttttcacactcttggctctcttacaagcgaagtgcctaggcaccacctatatcttctacttttttttttcataacactggatgctagacttgaaacataatgcttttagggagttatacaaatagttgtatatgttggatagtataggagactgcgtaacgtgggacacattttgtattgagcctcaaggggccgatatatattgagtacatggggaggagataaggaaggattacagatatggaaggaatccaaacaaaccaatcatatcctaatatgactctaactaccatatactctaacatccccccgcagtccaagcgtgagcagcgcagacacttggactggagaagaaaccggcaagagtgctcaacacggatgatagccctttgtgccatagtcgatgtagacaaagcgatgggtgcgagggagccgtggtcgatgaagccgtgcgtagagtagccgtggttgatgtagccgaagtagagaagctgatgtcgaggtagccgagccgcaggcgcgcatggggcgccgtagagtggtcgtggacgcacgggaggggcgtcgtggaccaatggtgcgcaaagacgcgttagagacgaagacggtgacacaatcgcggcgatcgtggaggaagatgacgccgaagagctgatgtagtcgaaccgtgaaggacgagacgtcacgtcgggtttgccagacccggggacaactcgggacgaacgcgcgcaacggtgttgccaataccgcgcgggtgaggtaggggaccaccatgaatcatacgccaatgacggtcgcggcgtgagaacggcatagacggagaattgtcggagaagagcgaagtgtagtcgaggaagatacgggcgatgaatcatgctggatgaagacgaaggcgacgaagacgaaggcgaagtagtgggaccaacggcctggatggcgacgtcggtagccatgtagaggtagctgcaccaccggcctagagtggcaacagtggcagattggagatgcggcggcgatgctcgaagtagaggaagaagaccctgagcggctaacgatgaccagtgcggacgacgaggttgtcgatgcgcgaacggcgatgaagacgacgaaagcggcaaagctgcggtccgagaggacatcacagctgcagctccatgtcgatgcagcggcaagaagtccaccggtgatgtagaaatgctgaggagggcgcctctcagcactgcaacaaccagtggaggtgtggaccacaggcagcgacactgtggcctgaggggggcgacgcagcggcaccccaaagcttgatggcttagacgcgtgcttgatgacgatcggttgcagaaatcgtagccgggcgcttgaacgggtgatcaagccgaatatgcgcgaggcggaacgatgaagtcgaagcagagtcgacgccgatgtcggagatgcgtggatgtcgacgaggcggtgagtccacgccaccttgtgcaccacagaagggaccaaagtcatcaagtagcaatcctttgaccggtccatccactgcctttccctgtccccaatcctatccatccacacacgcgtagacagatagaaaagagagacatgaagcagcagattgatggcgaggcaggcagaaaaggtcgacgatgactcggccggcgaggagacggcaacagccgcgagcctccaggcggggacagggtggcgccgggtggaggggacccagtgccccgcgagcgccggcgctggcaccggcggcctcaaatcctagtggtcccgagcggcggacgtccggtgagccggcggaggatggtcccggcaggacaggcgaggtggtaggcgaggaccggcagcggagaagcagcgccgggagctcgtcccccggtcgacggtggtgctggagacggaggagtcggaggcggtggtggccgacgccgccgatgcagatccgggatccaaccaggcggagctcggccgggggcgaggtgatccggtgagggacgaacagggaggaagccggggttgcagggggagaccggtgccggaggtggagccgagctgcgccgttcgtctgtccatcgggatgcgatcgtcggccagtggaggtgacgacgacggcagggccccgtcggtgaggccggcggagcagaacggacactgagggtgaggccggcggagcagaacggacgctgagaatgaagccgacgacgggcggcctgacggcgatacaagagcgccgcgcacggaggttggcagaggagatgcaatctgttgctgctgcttgacgacgactagactcgacgaagaacagtcgtggagatcgatctctccaagacgacgacgacagcgacgaggaagaaaaaagaaaaaatgggtggccgtccccgggagatcgctactcccgagggcggcggcggcggaagcgtgagagcggtgctagatcgcccgctctgataccatgttggatagtataggagaggtatattgcgtaacgtgggacacattttgtattgagcctcagggggccgatatatattgagtacatggggaggagataaggaaggattacagatatggaaggaatccaaacaaaccaatcctatcctaatatgactctaactaccatatactctaacagtatattcatgtaaaaatgttcacatttcttatttgaagcagaagcatatttcatctttgatctcaggtacttagttctgctagttgttgtatctttttccataaaatgtattcattatttgcattcggtgattcaggactatgagagtggccttgaaaaagaagtggctggtttgaaattacaaggagttgaggcactgaagaggcaggattatcttgctgcatcagacctatacactaaggtatataattgcacatcttctctactaattactatctctgtcccagaatatagcaacctatttagatgggacacattatagtcggcctatctagattcgtagtattaggatacatctcatccggttctaggttgctatattctgtgatagagggagtactttttttttttcatcttcttccacttttaaccttacacgtatcagttggaacttcaacttggattgctacaatatttctcacagtgaaggttacagttccccatttactatcagtctctggttgcaaaatgcaaatggaaatccttgtatctagagaattcagcatgatgattgatagtcacaacgtttcagcttaactcttatatttttggcacataaagccatgttttcgctaggtaagccaaaatgacctcattgataatatgagttcctagtgtcctaggtagtcaaacacagcctggggcatattatgcaatcctgtctgacttctgttttaagcatcgattgagtgcatatgactgacatttgtttaagcaccgagtaattgcttgtgatatatgaaacccgagttacacctacttatgatcatttccaaacgtttaaaggcagtcatgacgcatctccagcttttagagtccgtgggaatcagctggattttgcaagccaacaaggtctgggaattgcggcagtactgcagtctgattttattgttgggatggctagaaggagctagccatccaatgtaattaagataggagccacatattttccaacccttcatttaatccaggtggaaggtgaggagttcaggaatcgaaccctggctgcaacgttcacactgaatgtttgtgccaactgcgctagaagcgcatctccagtctgattttaagattgtttactttggctatcttgtcgttctccatggttgctcatatgttaattgttttctatatagtcctacccccaaaaaattgcaaccaaaaccttaacagtagctcttctatgctaaatgaagttatattcatgtgtggcagatgtagtaattgttcacttgattgtgcttgaatgaaggcgctttgcctcgacttcaatgatgcaaccctgtattcaaacaggagcctctgctttcttcacatgggtgatggagacaaagcttatggggatgcctatacttgtaggatgatgcggcctgattggccaaaggcctgctatcgccaaggagcagctctaatgctgctgaaggtgagatcgtttttctttccccttcataatctgaagcaaatctgtttctgtacacaccctactccgtatgtatatatgcaggaataccaaaaggcgtgtgatgctctcctcgatggtttcaaaatggacccagggaactctgagattgagaacgctctaaggtatagtatctctggttacggttttactgcatatctgcgtgttctagtttgtgatggtagtgagtggcctactggccttcgatcctgtgcctcagtaaaccttcaacctatatggtttctagtgttgttgatcaacacgtgcaaacattttacggaagcttgagacgctggagctcgctctaacctgttgtgccacgacgtgctccgtgtatatatgtacgcagggaggcgatggagtccttgaagatatctgatggtgctaagctgacaacctgaatgaagcgtctatactcgagagccacagcctgcaggttctttctttctaagtttctatctttgttttatacttccgtatgctttagcagcagcaagagccgttgaattgtgaatatgttggccggcagcatattgctaactttgctatagcactgtagaagttgattggtgcatttaaggttgttagtgggtcaacccgcgaatccacattgcaagcaaccgggattattggcctggaggaataagttcactttaggtccttcaaattgtccccaagtctaaaattcatccctaaatcataataccagatatgatgcgtctctcaactcctaaaaccagtgcactcctaaaaccagtgcaaataaagtcgcaaggcggtttggatagtggtttagactgatgtggcacctatgtaacgttaatgtggattgttggccacactttgccacaactaacgttaggcaagttgtggcagtcataaaagtgtggtagataaaatgctagccataaagtgtggcaaagttggtaaaaaatattaagtacatgtgggatatactattgaaaaagtgtggtaaggcataactgtggcactaaaccttttcctacgtgctcaaggctgttgcgtcggcgtgcggggaccgacggccaccgagctagacctctccgtccctgtgtgctacggcgagcaaatgtgtgccgaactctcagcatgtcatattcctgcacctgcagttgttgcgtgttcataacagctggatcgtggaggtcacaaggctgatcaatttttatcaccttcgttttgtaatatacgagacatttgactttcttttaagttaactagggtttggtccggccggatgaaatctatgccgttgattgccgattcgacgatcccacggctgagaaagggctgccacagctggacggttagatcggctctaccgcgagatctcagccacagctggacggttagatcggctctaccgcgagatcgaacggacgatgttggtgggggaaccaatatgtaattaataaaaacatagggtcttttttgc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |