Os02g0519900
| Gene Name |
Os02g0519900 |
|---|---|
| Description |
Similar to Elongation factor EF-2 (Fragment) |
| Version |
NM_001053507.1 GI:115446384 GeneID:4329493 |
| Length |
4798 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os02g0519900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:19774849..19779646 |
| Sequence Coding Region |
19776242..19776332,19776973..19779413 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008395:19774849..19779646 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008395:19774849..19779646 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggtgaagttcacagtagaagagctccgccggatcatggacaagaagaataacatccgtaatatgtccgtcattgctcatgtggaccacggaaagtctacacttacggattctcttgtggcggctgctggtattattgcccaggaagttgcgggtgatgttcgcatgactgatacccgtgcagatgaagctgagcgtggtattacaatcaaatccactggtatctctcttttctatgagatgagtgatgaatcactcaagttgtacaagggtgagagagatggaaatgagtacctgatcaaccttattgattcacctgggcacgttgatttttcttcggaggtcactgctgctcttcgtattactgatggtgctttggtggttgttgactgtattgagggtgtctgtgtgcaaactgaaactgtgcttcgccaagcccttggtgagaggattaggcctgtccttactgtgaacaagatggacaggtgcttccttgagcttcaagttgaaggtgaggaggcctatcagaccttctcccgtgtcattgagaatgccaatgtcattatggcaacatatgaagacacactccttggtgatgtccaagtctaccctgagaagggaactgttgctttctctgctggtctgcatggctgggctttcacactctcgagctttgctaagatgtatgcttccaagtttggagttgatgaatttaagatgatggagaggctttggggtgagaacttctttgacccagccacaaagaaatggaccaacaagaacactggctcagctacctgcaaaagaggtttcgttcagttctgttatgagccgatcaagcaaatcatcaacacttgcatgaatgatcagaaggataagttgtggcctatgttgcagaagcttggtgtggtcatgaaggctgatgagaaggagcttatgggcaaggctctcatgaagcgtgttatgcaaacatggctgccagccagtaatgctcttcttgagatgatgatataccaccttccatctccgtccaaggcccagaggtaccgtgtggagaatttgtatgagggtcctcttgatgatgtctacgcaactgctatcagaaactgtgatccagaaggtcctcttatgctgtatgtttccaagatgattcccgcatcagacaaaggtaggttctttgcctttggtcgtgtcttctctgggagggttgcaactggcatgaaggtgcgtatcatgggtcccaactatgtccctggccagaagaaggatctgtatgtgaagagtgtccagcgtactgtcatctggatgggaaagaaacaagagtctgttgaggatgttccctgtggtaacactgttgctatggttggtttggatcagttcatcaccaagaatgccaccctgactaatgagaaggagtcagatgcctgcccaatcagagcaatgaagttctcagtgtcccctgttgtgcgtgttgctgttcagtgcaaggttgcctctgatctgcccaagcttgttgagggtttgaagcgtctggcgaagtctgatcctatggtgctctgtactattgaggagtctggtgagcatatcattgctggtgctggagagcttcaccttgaaatttgcttgaaggatctgcaggaagatttcatgggtggtgctgaaatcattgtttccccacctgttgtttctttccgtgagactgtccttgagaagtcgtgccgtactgttatgagcaagtccccgaacaagcacaaccgtctctacatggaagctcgccccttggaggagggattggctgaggccattgatgacggtcgtattggcccacgtgatgatcccaaggtgcgctccaagatcctgtctgaggagttcggctgggacaaggatcttgcaaagaagatttggtgttttggacctgagacaactggccccaacatggtggttgatatgtgtaagggagttcagtatctgaatgaaatcaaggattccgttgtggctggtttccagtgggcatcaaaggagggtgctctggctgaggagaacatgcgtggtatctgctttgaggtgtgcgatgttgttctccatgctgatgctattcacagaggtggtggccaggtcattcccacggccaggagggtcatctatgcttctcagctcacagcaaagcccaggcttcttgagcccgtctacctggtggagatccaggcccctgagaatgcccttggtggtatctatggtgttctgaaccagaagagaggacatgtgttcgaggagatgcagaggcctggtacccctctgtacaacatcaaggcttacctccctgtcatcgagtcctttgggttctcaagccagcttagggctgcgacatctggccaggccttcccccagtgtgtgttcgaccattgggacatgatgacctctgatcctcttgaagctggctcgcaggcttcaaccctggtgcaggatatccgcaagaggaagggtctcaaggagcagatgactcccctctccgatttcgaggacaagctctaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MVKFTVEELRRIMDKKNNIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVAAAG IIAQEVAGDVRMTDTRADEAERGITIKSTGISLFYEMSDESLKLYKGERDGNEYLINL IDSPGHVDFSSEVTAALRITDGALVVVDCIEGVCVQTETVLRQALGERIRPVLTVNKM DRCFLELQVEGEEAYQTFSRVIENANVIMATYEDTLLGDVQVYPEKGTVAFSAGLHGW AFTLSSFAKMYASKFGVDEFKMMERLWGENFFDPATKKWTNKNTGSATCKRGFVQFCY EPIKQIINTCMNDQKDKLWPMLQKLGVVMKADEKELMGKALMKRVMQTWLPASNALLE MMIYHLPSPSKAQRYRVENLYEGPLDDVYATAIRNCDPEGPLMLYVSKMIPASDKGRF FAFGRVFSGRVATGMKVRIMGPNYVPGQKKDLYVKSVQRTVIWMGKKQESVEDVPCGN TVAMVGLDQFITKNATLTNEKESDACPIRAMKFSVSPVVRVAVQCKVASDLPKLVEGL KRLAKSDPMVLCTIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLQEDFMGGAEIIVSPPVVSFRE TVLEKSCRTVMSKSPNKHNRLYMEARPLEEGLAEAIDDGRIGPRDDPKVRSKILSEEF GWDKDLAKKIWCFGPETTGPNMVVDMCKGVQYLNEIKDSVVAGFQWASKEGALAEENM RGICFEVCDVVLHADAIHRGGGQVIPTARRVIYASQLTAKPRLLEPVYLVEIQAPENA LGGIYGVLNQKRGHVFEEMQRPGTPLYNIKAYLPVIESFGFSSQLRAATSGQAFPQCV FDHWDMMTSDPLEAGSQASTLVQDIRKRKGLKEQMTPLSDFEDKL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1394..1484#2125..4565#agggttttacctcctcccccccgcagcgccgccgccgccacacactcccccacatctccccttcccttccactcctcctcctcctcggatcgggaggcggagcgagcaatcccccaaggtgatttcctgctgctcttctctcatctccccccatcctctccgttgcgtgaatctgttgtgtggttcgtcgtcgattatcttagctaggctagattcctcgcggtggtggtgatttgagtgcgtccatctggtcaaaggttcgaggtaggagtagtagtatgtgtgggtgctctcagttcgttgcatgtttgggttctgtatctggtttggattatcatgtttagtggttggcgcggtagttgtaaatctgtggggttttgtcacgctggttaattttttggtttcgtcccggttccgatcgacgtttctttgggtcgtcaggtgtagcgaatggatgggattggttcgatccgtctggtagggattcgttctgctcgtagatctgctgtggattgctttcgcggtcgcctgctggagctaatttggcaggattaggatggttacccatttctccagggcagatctatgctatgttcgttgattggcgtgtgctggctacagacttgttcatgttgttcactagattgttaaacatgtgacgtcagccggtgattgcttgtctgccacggttttgtttgttgtcctagtgaaatatgcacagatacttaagggccgtgtttttgttttcacaataatggcagtagatgagttgaattcagtttgtcatatcgtttttgtatcaaaacaagtttttttcttactggttaagtgcttctcgcggtcccgccagaatttttatgtactgggtatctctgttatgagtactcccatatcctgcatgtacagtactgcagtggtgaattggtgatgtgctgatggtaatgaatatggcggaagtgtatcagtttgctgcttttgttacatttgatgtgtgttttcaagtttcatcttttttttcttattaatgctgcatctatcaagctgtgcagtttttttctttgatcgtcttaaacctaacagtgtaactgcatcagtgtggtatttggaggtagtattagtaaaactggacatgttaaaaattcgcatttagtaaaactggacatgttaaaaaatcgtatttagtattttgtatcatgtatgatgcttaatttttgtttgcgatatcaattatatttttatttgttgcattgctatgtttttacttgagtcatgccgtgatatatttgtagttagaattttgattttaggttttgtgttttgcatggttctaactgggtttctttttttggtacaggaatttgtatttgtagcgtgatttgcaaagctagtcaagatggtgaagttcacagtagaagagctccgccggatcatggacaagaagaataacatccgtaatatgtccgtcattgctcatgtggaccacggtatgtgccagaatagttatgactggtgtattaatatctgatcataatgttattgttgggtttacttcaattggttatattccatttcttatacaattgacatttgcaataataaattcatcggattctgtgacatgagtcgatcacagtcgatctctgcatgattagtgccacaattacttgtgcaagttaattcatttggaaggtggcgatcattttaatttactctctttgttgagacggggggagtagttaatagtttgatcattactgtgtgttagcttaaatatttatgctgctgtgctggtcaccaaaatggtatgctaattttttgtatgtgctattttgcaattttgcattggaagaatatgttgtgtattatgctcttttatttaatagcttgtttacttttgcttattgctaatttctctttttgatatgtcatgctatgctatccctgtctgtttacttttttgttagtcccaagttcaaaaaaatgcttactattgggatcctttcaagaacaagctatatatgtcccatctattttagatggctttgttttgtgcaaattttcagctttctatgccttagttttgtgcaaatcaaggtgcacttacatgctatgttctctctgcaggaaagtctacacttacggattctcttgtggcggctgctggtattattgcccaggaagttgcgggtgatgttcgcatgactgatacccgtgcagatgaagctgagcgtggtattacaatcaaatccactggtatctctcttttctatgagatgagtgatgaatcactcaagttgtacaagggtgagagagatggaaatgagtacctgatcaaccttattgattcacctgggcacgttgatttttcttcggaggtcactgctgctcttcgtattactgatggtgctttggtggttgttgactgtattgagggtgtctgtgtgcaaactgaaactgtgcttcgccaagcccttggtgagaggattaggcctgtccttactgtgaacaagatggacaggtgcttccttgagcttcaagttgaaggtgaggaggcctatcagaccttctcccgtgtcattgagaatgccaatgtcattatggcaacatatgaagacacactccttggtgatgtccaagtctaccctgagaagggaactgttgctttctctgctggtctgcatggctgggctttcacactctcgagctttgctaagatgtatgcttccaagtttggagttgatgaatttaagatgatggagaggctttggggtgagaacttctttgacccagccacaaagaaatggaccaacaagaacactggctcagctacctgcaaaagaggtttcgttcagttctgttatgagccgatcaagcaaatcatcaacacttgcatgaatgatcagaaggataagttgtggcctatgttgcagaagcttggtgtggtcatgaaggctgatgagaaggagcttatgggcaaggctctcatgaagcgtgttatgcaaacatggctgccagccagtaatgctcttcttgagatgatgatataccaccttccatctccgtccaaggcccagaggtaccgtgtggagaatttgtatgagggtcctcttgatgatgtctacgcaactgctatcagaaactgtgatccagaaggtcctcttatgctgtatgtttccaagatgattcccgcatcagacaaaggtaggttctttgcctttggtcgtgtcttctctgggagggttgcaactggcatgaaggtgcgtatcatgggtcccaactatgtccctggccagaagaaggatctgtatgtgaagagtgtccagcgtactgtcatctggatgggaaagaaacaagagtctgttgaggatgttccctgtggtaacactgttgctatggttggtttggatcagttcatcaccaagaatgccaccctgactaatgagaaggagtcagatgcctgcccaatcagagcaatgaagttctcagtgtcccctgttgtgcgtgttgctgttcagtgcaaggttgcctctgatctgcccaagcttgttgagggtttgaagcgtctggcgaagtctgatcctatggtgctctgtactattgaggagtctggtgagcatatcattgctggtgctggagagcttcaccttgaaatttgcttgaaggatctgcaggaagatttcatgggtggtgctgaaatcattgtttccccacctgttgtttctttccgtgagactgtccttgagaagtcgtgccgtactgttatgagcaagtccccgaacaagcacaaccgtctctacatggaagctcgccccttggaggagggattggctgaggccattgatgacggtcgtattggcccacgtgatgatcccaaggtgcgctccaagatcctgtctgaggagttcggctgggacaaggatcttgcaaagaagatttggtgttttggacctgagacaactggccccaacatggtggttgatatgtgtaagggagttcagtatctgaatgaaatcaaggattccgttgtggctggtttccagtgggcatcaaaggagggtgctctggctgaggagaacatgcgtggtatctgctttgaggtgtgcgatgttgttctccatgctgatgctattcacagaggtggtggccaggtcattcccacggccaggagggtcatctatgcttctcagctcacagcaaagcccaggcttcttgagcccgtctacctggtggagatccaggcccctgagaatgcccttggtggtatctatggtgttctgaaccagaagagaggacatgtgttcgaggagatgcagaggcctggtacccctctgtacaacatcaaggcttacctccctgtcatcgagtcctttgggttctcaagccagcttagggctgcgacatctggccaggccttcccccagtgtgtgttcgaccattgggacatgatgacctctgatcctcttgaagctggctcgcaggcttcaaccctggtgcaggatatccgcaagaggaagggtctcaaggagcagatgactcccctctccgatttcgaggacaagctctaaatttttggccgccgcatgtgttgtgccgttacccttacatgttctagttggtctactgctaagagaactgctttcgttgtcgtatttcatttcccttttgtcgaatgcatgtgtttcacatcaacaatcctatgttcgcgtgctactgagaaactatttttactctgtcgtgatgtaacggatgtggaacctggatcatctttttgctgtctaagttatagtgttcacattct</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
