Os02g0581000
| Gene Name |
Os02g0581000 |
|---|---|
| Description |
Similar to Phosphatidylinositol glycan class N (Fragment) |
| Version |
NM_001053776.1 GI:115446922 GeneID:4329782 |
| Length |
8371 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os02g0581000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:23239060..23247430 |
| Sequence Coding Region |
23239060..23239282,23239379..23239570,23240458..23240585,23240697..23240852,23241416..23241674 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008395:23239060..23247430 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008395:23239060..23247430 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggccggccgcgcccgcccgcagccgcagccgcagccgcactcgccgtcggcctccacgcggcggcgcgagcggtggctggtcgtcctcggcgtcgccctccacgccgtctacatgctcagcatcttcgacatctacttcaagtcccccatcgtccacggcatggcccccgagccgccccgcttctccgctccccccgccaagcgcctcgtcctcctcgtcgcggacgggctcagggcggacaagttcttcgagccggacgagcgggggaggtacagggcgccgtttctgcgcggggtgatcgaggagaagggcaggtggggggtcagccacgcgcggccgccaacggagtccaggccaggccacgtcgccatcatcgccggcttctatgaagaccccagtgctgtcaccaaagttgtagaaactgtgagcattgttctacccattgatatcctaggttatcttgtgctggctgtggcctgtgggctactttacttgagatttattaaggacctattttgtgttgaaaatttgggatacacggatggaaggccaatcctgttgagtttgattctgtattcaatcaaagtagacacattatctcgtttggcagtccagatattgttcccatattctgcagcagcctacctcacagtacctggggtacttatccccatgaatatgaagactttgcgacagtttcaaggtcttctcaacaggtcttttgaggatgctaaattgagacaattgctcctacaggataaattggtcatatttctgcacttactgggttgtgatactaacggccatgcacatcgaccctattcaaacatctatcttaacaacgttaaggttgtagatcaaatagctgaaagtatgtacaatctcatggaaagctacttcaacgataaccagactgcttacgtgtttacagcggatcatggaatgagtgacaaaggctacacttgtgggtctgccatgcccgctgaattctgttggaagcttacctacgcattatttgaaattaagcaagagatgaaacaatcaagttcactctacttcaagccttttaagccactggcaaactattctttagtccttgatcaaattgaagatcttatatctgcaaaggactatgaaaatgccatgaagcattctgaagaactccgaagtatggctcttgctggtctccattattttcaaacatatgactggttcatgttgatgacaacaattacccttggatatattggatggatggtgaacctcattctacatgtgctacagtcttatacatcatttcctgctaatcttcaaaaaaggactcaagtgtatgctaagaacacctctgtgaaagtatacatagttggatgcttcattatgggtttttcatccattatactacttttagagaaatctccacttctttatcatgcttatttatttatgacaatattcctttggacaagaattgttcaaaattttgaattcatcaaggcagtatggagagaattatctaatatgccattcaagtacaccatgaatcttctgaacatttcagtcattgcgctgttcatattggagtttctggttatgagcttctttgataggaagctttatacttggtgctttttgatccttgggatacttgcttcatcttgtgttgcaatatttatacaagctagctctgcacttgcagtctatgtgtggctttcatgctggttcctatctttattcacattgatgccagctgaaattccagaaaacaacaacttggtaatttttagtggggccttgataatactgactgcaatggcatcgagatggatggccacaaataataacaacttttggctatatcttactcgagcaaataaacgggatcctcaattctctaagctattttttgttcaggttgtatttgttgcgatatcttctataatggtgtggatatcgacctcgcaccggtctcagaacaaacagctgcacccattgcaccagatgatcaactggttaatagctggttttgctatggtgctaccacttttttcaccatcaagtgttctatctcgccttacatctatcttcttgggatttgctcctccatttctattgctctctattggctatgaagcggttttctatagtgcttttgcaatggtacttatgggatggatatttgtggaatctgccaacttgtattgctcagaacaaaatggttctgcacgccgtagtagcattgtggagggctcaattttcggctatgatgaaagatgcttacaactatctgatctacgaatccctctgttatttacgatcttatttaatgttgcgttctttggaactgggaattttgcgagtattgcaagctttgaaatttcatctgtgtaccggttcattacaatatttagtccgttcctgatggcagcacttcttatcttcaaattgttcattccatttatgcttgtcatatgtacatttagtgccataaccaaggttgtacgtataccacggctgggctgttatttccttgtaatactgctgtctgatgtaatgacgattcatttctttttcctggttcgaaatacggggagttggatggaaattggcaatagcatcagccatttcggaatcgtgagtgcccaagtagtttttgtgttgctgcttttcgccctcacaaatatattcacaaaagatattgaggtctcatctcggcaactaagctcaaggaaagttatgtaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAGRARPQPQPQPHSPSASTRRRERWLVVLGVALHAVYMLSIFD IYFKSPIVHGMAPEPPRFSAPPAKRLVLLVADGLRADKFFEPDERGRYRAPFLRGVIE EKGRWGVSHARPPTESRPGHVAIIAGFYEDPSAVTKVVETVSIVLPIDILGYLVLAVA CGLLYLRFIKDLFCVENLGYTDGRPILLSLILYSIKVDTLSRLAVQILFPYSAAAYLT VPGVLIPMNMKTLRQFQGLLNRSFEDAKLRQLLLQDKLVIFLHLLGCDTNGHAHRPYS NIYLNNVKVVDQIAESMYNLMESYFNDNQTAYVFTADHGMSDKGYTCGSAMPAEFCWK LTYALFEIKQEMKQSSSLYFKPFKPLANYSLVLDQIEDLISAKDYENAMKHSEELRSM ALAGLHYFQTYDWFMLMTTITLGYIGWMVNLILHVLQSYTSFPANLQKRTQVYAKNTS VKVYIVGCFIMGFSSIILLLEKSPLLYHAYLFMTIFLWTRIVQNFEFIKAVWRELSNM PFKYTMNLLNISVIALFILEFLVMSFFDRKLYTWCFLILGILASSCVAIFIQASSALA VYVWLSCWFLSLFTLMPAEIPENNNLVIFSGALIILTAMASRWMATNNNNFWLYLTRA NKRDPQFSKLFFVQVVFVAISSIMVWISTSHRSQNKQLHPLHQMINWLIAGFAMVLPL FSPSSVLSRLTSIFLGFAPPFLLLSIGYEAVFYSAFAMVLMGWIFVESANLYCSEQNG SARRSSIVEGSIFGYDERCLQLSDLRIPLLFTILFNVAFFGTGNFASIASFEISSVYR FITIFSPFLMAALLIFKLFIPFMLVICTFSAITKVVRIPRLGCYFLVILLSDVMTIHF FFLVRNTGSWMEIGNSISHFGIVSAQVVFVLLLFALTNIFTKDIEVSSRQLSSRKVM</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..223#320..511#1399..1526#1638..1793#2357..2615#3171..3245#3697..4019#4450..4683#4764..4951#5143..5278#5372..5480#6397..6499#6597..6783#6876..6974#7075..7133#7990..8095#8207..8371#atggccggccgcgcccgcccgcagccgcagccgcagccgcactcgccgtcggcctccacgcggcggcgcgagcggtggctggtcgtcctcggcgtcgccctccacgccgtctacatgctcagcatcttcgacatctacttcaagtcccccatcgtccacggcatggcccccgagccgccccgcttctccgctccccccgccaagcgcctcgtcctcctcgtcggtgcgtcccccctctactcatccccgacgattgtgaccccccgatttggttgcgatgtttgattttggtgaggattttttggttgcgtgcgtgcagcggacgggctcagggcggacaagttcttcgagccggacgagcgggggaggtacagggcgccgtttctgcgcggggtgatcgaggagaagggcaggtggggggtcagccacgcgcggccgccaacggagtccaggccaggccacgtcgccatcatcgccggcttctatgaagaccccagtgctgtcaccaaaggtgtgccatcccatctcagctctaattctggccatttcttcatgttcaatgcaaactaggatgtcagttggtaagaattcaaatgtaggggttattactagcttgttcatgtcatagctggtagacacagatatggtggtccaaactccaaactatttaggaaaaccatcaaacatggtatcttcggtgctagctagactgctacagtaagttcagtaggactagaatgcaatgcggtggcatggtactcagagaagtttcagctctagttctagcgtgccgctactggttatttttcatgtttgatgcaactaggatgtcagtcggtaagaattcaaatatatgggttactacctagttcatatcataaatggtatacatagattatggtggtccaaaccatagaggaaaaaacaccaaagatggtatctgcagtgctagctagactgctagagcaagttcagtaggactagaatgcagtccggtggcatggtgctcagagtagccgaaacctttaattggctctgatttagcgaatccttgttagtagctatgcttcttctagaaaagttaaatataatttgcttataggttaacttctattttgcagtattgtacttagcggctgattttcttagcctttttctgtggtgttcagagaaaaaggctaagaaaataatcattcccttaccagttacatattcattttttctttgaatttctaaatattctggtaaagttcaattaaacttgctgtaactgaactttaccataatatttacaaccattcccgctgatacctgtggtcagtgtacaactatagtattagtgctactagttttccgctgacatggcatgtcaaaactcatgtactggtatttgttcagttgtagaaactgtgagcattgttctacccattgatatcctaggttatcttgtgctggctgtggcctgtgggctactttacttgagatttattaaggacctattttgtgttgaaaatttgggatacacggtccgttcagacataatttagaaattgatgatatgttttaagagaatcatgttttaattccatatcaaatgtctgtaatgttcacaaaattttcttattacttttttgcaggatggaaggccaatcctgttgagtttgattctgtattcaatcaaagtagacacattatctcgtttggcagtccagatattgttcccatattctgcagcagcctacctcacagtacctggggtacttatccccatgaatatgaagactttgcgacaggtcagatttaatgcagtacatttaggttgctgaattatatatttttttatttccattcggtttttgtgatttccagagaatcatcttctgtttttattgacataattagaaattttttgtacctactcattacttgtaagttgtaacacacaccttttcggagtattccaatgactctaaaagtttatcggcagacttaatgatgataatgtgtaataaatggaaaaagggctctatagctcttctcttagttttggttagagttttttttttaaaaaaaatgaaaactcacaactattattgatgaatccagcaagcttttgtacaagtcatgggtccaaacttgtaaaaattcacaagaagggatttacacgtccaccagaaaaataacaagggatttacctgtccacaagaaaaataaaagtatttttaccaaacatcgcagagtatgaagcatcaaggctctaccttttgaatttggtttgctttggaaccttgtgtttacttgttctgagaccttgattgcagatgcatcattcctggatcattggtcatttgaccagtttcaaggtcttctcaacaggtcttttgaggatgctaaattgagacaattgctcctacaggataaattggtcatatttctgcacttactgggttgtgatactaacggccatgcacatcgaccctattcaaacatctatcttaacaacgttaaggttgtagatcaaatagctgaaagtatgtacaatctcatggaaagctacttcaacgataaccagactgcttacgtgtttacagcggatcatggaatgagtgacaaaggtacgcatactcacaatggtttcatcaattaatttcaatgacccagccttatatggtttgacaattcatgacatgagatctaaatactttctaatgcacttatttttgttgaactttccctgagacagcctcatcagaatggtgactgtcttttacctgctactaatagcaatgccttattcttttcatattaggttacaccatgttatacattatttatgatgtcaatataactcaaagttctactgataggaagccatggagatggacacccatcaaacactgatactcctcttgtagcgtggggggctggaattagaagcccaaagttcttggcctatacagacaaacctgatgatggctttcggtttgttgatgaccacaaacatgatatgcccacaccacaggattgggccctcgaaggatttgaaagagtggatgttaaccaggctgatatatctcctctaatggtttaaaattttccctaggcaaacatattatcatttttccttcagcataattgcttttatcctcaattgtttacaaaaactgcaggctacacttgtgggtctgccatgcccgctgaattctgttggaagcttacctacgcattatttgaaattaagcaaggtcagataataaacactgaaatattatgaaaaaaaatatgtttatgcttccgttgttttctgctcttttggattttctgtttatttccccattatttctgttcaggctgacgaagttgaagcggttctagccaacacaaagcaaattcttaatcagtttcttcgaaagtcacgtatcctttcagaacatgatttaaattttgcttactccaattgtctaaggtccttggatattcttttcttgatggtctcctgctgtcctgctgaagtgagttattgatgagactatataattattaatctgctgttgaagcccacagtttactagctgtgagcctgtgaatatcatgtcaattactttctatatttttatgcaacattatactgcctccgaaatggatatggtggatcatattcatactcgtgaacatgttttccctaacctgtctcagagatgaaacaatcaagttcactctacttcaagccttttaagccactggcaaactattctttagtccttgatcaaattgaagatcttatatctgcaaaggactatgaaaatgccatgaagcattctgaagaactccgaagtatggctcttgctggtctccattattttcaaacatatgactggttcatgttgatgacaacaattacccttggatatattggatggatggtgaacctcattctacatgtgctacagtcttatacatcatttcctgctaatcttcaaaaaaggactcaagtgtatgctaagaacacctctgtgaaagtaagatagccaacctacctgaccttcagttcttcacttaatgagtttatgtctaaaattgatgtgttatgcatgtatttttatgttgctatcttttccagattactcaatctggagtgtagtcaacattttttttccaacttcagtatgtttgtttctatccatttttccaagaaccttttctttaaaaaatatatcagaatttaggttctgttaaacttcttattgtatttaagaggtttgctgctgtctagagctacaggcatttggtagaactctgtgcacagtataggcttgatactagttcattgttgtgaactgttcaaagttgctgttcgatattgcagaattttattggtgtgtgtttcttattaatcctgatgtgtttttcttacactattttggtctatctcatctctcctggttgcaggtatacatagttggatgcttcattatgggtttttcatccattatactacttttagagaaatctccacttctttatcatgcttatttatttatgacaatattcctttggacaagaattgttcaaaattttgaattcatcaaggcagtatggagagaattatctaatatgccattcaagtacaccatgaatcttctgaacatttcagtcattgcgctgttcatattggagtttctggtatgtaccttttgttattggcacccgaagcgtttgaggactacctagatttggcatgaatttcgatgctttctgtgcaggttatgagcttctttgataggaagctttatacttggtgctttttgatccttgggatacttgcttcatcttgtgttgcaatatttatacaagctagctctgcacttgcagtctatgtgtggctttcatgctggttcctatctttattcacattgatgccagctgaaattccagaaaacaacaacttggtgtatgcttctttggccgacaaccccccacccccttccttttttttttccattttgtcaatattagttgcgtgttcattctgtcatataaaattctcttttctagagttaatgcagctggtagcccttattttttttataattattacgagcgtttggttgaaactttggtctgatgaatttttatatgcagaatttttagtggggccttgataatactgactgcaatggcatcgagatggatggccacaaataataacaacttttggctatatcttactcgagcaaataaacgggatcctcaattctctaagctattttttgttcaggtgaaaaatgcaggcaattctttcttgatgttggtatttgttttgtggaagtaatattttggaacaatgttgactgctgttacaatgctttaggttgtatttgttgcgatatcttctataatggtgtggatatcgacctcgcaccggtctcagaacaaacagctgcacccattgcaccagatgatcaactggttaatagctggtaagtgatgatcaactgcaccctctcatctctgctgctaatttctccaatgtttccctggttgacttgtccatgtcccttttcagtttttcagggccatatctgatatgttaacttacaagtgaaaatggctctttaacagataatcttctctagtagttcaatttcctaacatgcgtgcacattgcgccaagcttgaatatggtttgttcagagcattgacaactataaatattccctcagattacatagcattgttgtaacagaagtacctctgattccaaactaagccgttctagatttatcaattctttcccaaatataagacatccaagaacctcaaggcagttttcactcctttttttccccttctttgccctagctaaataatcgttattattctcatcaataaacgatacaccttttccaatgtggtataaatggaaggcaacagtcatttaatttcttaatcttatgcacatgtcttggaattaaaagggagcgcaaacttatttatgcatcaacgatccatttaatcaggataattatatcacagaattgagaacttccccagacgatgttcagtaaccaccttctttcagggtaacagcaggggagagtcataccaatatacacggtacacagaaagaagcaaaacttaatttatcccaacctattggaagttgccgtgaccttagtcagagtcattttatcttctaaaaagtatatatcagttaacaaagattttttcatctaaataaagttatctggcagcttaaatatgaattgatttgtctgaaatcacaggccaactttactctttagttaatgttatggcctggtctattgctcttgctaaaattctaagagttttggttgtactgattttgtgctttaactgattatgttttgacaggttttgctatggtgctaccacttttttcaccatcaagtgttctatctcgccttacatctatcttcttgggatttgctcctccatttctattgctctctattgggtatgctgttaacttctcttatagtgtccacatatatcaagttctggttgccgtaatgttcatatattcatatatcatcaaatcttgacatctgcagctatgaagcggttttctatagtgcttttgcaatggtacttatgggatggatatttgtggaatctgccaacttgtattgctcagaacaaaatggttctgcacgccgtagtagcattgtggagggctcaattttcggctatgatgaaagatgcttacaactatctgatctacgaatccctctgttatttgtaagatgacattctctttcccttgttatattgtgggttgctatgatttatgtaaaatactcaatacattctgtatcttaccgcctttgcagacgatcttatttaatgttgcgttctttggaactgggaattttgcgagtattgcaagctttgaaatttcatctgtgtaccggttcattacaatatttagtgtaagtgtttgtgtcttatgatttcctctttctctataatattaggttttcttttctattattctattactgatcgtctttcatcctctttccttggcagccgttcctgatggcagcacttcttatcttcaaattgttcattccatttatgcttgtcatgtaagttttctcagtgtttactatgatattggaccatcctgcggtgcagtggcggaggcaagatttttgtcatgggtgtacaaaaccgattaaatactccataaaaacatgaattttttttagcaaaaaatatgaaaaagtagttctacatgtgatatgatgagctgaaaattgttgtttctagtgaaaagacaggtatttagccaaaattatattatgtatacccaacaaaaatatcatagttttgacttgaagtaaaggaacttgggtgtacatctgtacactcatgaccctatacagcctccggccctgttgcggtgaatggctgataaaataagttgatacgttgaacatattttgtacttctgtacatccgcttcacaaaatataacgttgaatcattttttgttgcaaaataggtgatgttttaagattcaaaaataagaaaagaatacatacttttagcgaaactaaaaaatgtatccacactctacgtttgtttgttttgtgcgcgataagctatctgaagaacaatatttagagtttggagaagattaattgttgtagcgacaacatatatatttgcctttattccttcatcatgcttttgttccgcagttcataatataccgtgtttgattttaccttcgttttgatatcctaatgggatttaatataagatgcgtaatcttcaaattagttattagtggactgtttaagattgttttagagttcctttttattccttactctgaactctgaagcataatagtaaaggaaaacataaacaaagatgagccaccagattagatgcaatttgtgattaagctgattcatatgttgcgacttattgcagatgtacatttagtgccataaccaaggttgtacgtataccacggctgggctgttatttccttgtaatactgctgtctgatgtaatgacgattcatttctttttcctggtatgtgttcttttcccctgtgtactttgaattatcctttatagtactttgtgctgtagctcttgcttgtacagaaaattgtaagccaaatgttcttcattttacccacaggttcgaaatacggggagttggatggaaattggcaatagcatcagccatttcggaatcgtgagtgcccaagtagtttttgtgttgctgcttttcgccctcacaaatatattcacaaaagatattgaggtctcatctcggcaactaagctcaaggaaagttatgtaa</dnaseqindica> |
| External Link(s) |