Os02g0680400
| Gene Name |
Os02g0680400 |
|---|---|
| Description |
Similar to CaaX processing zinc-metallo endoprotease |
| Version |
NM_001054274.1 GI:115447918 GeneID:4330318 |
| Length |
6110 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os02g0680400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:28651522..28657631 |
| Sequence Coding Region |
28651621..28651651,28652489..28652636,28652762..28652846,28652923..28653018,28654034..28654099 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008395:28651522..28657631 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008395:28651522..28657631 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgcttccttacctggaggccgtgctgtgctttatgattctcatgtatatatttgagacatatcttgacatccgtcagcatagagcccttaagttgccaacactgccaaaacccctggtaggagtaattagtggtgaaaagtttgagcgctccagagcttatagccttgataaaagcaaattccattttatccatgaagctgtaactatattaatggataccacaattctgtactatagagttcttccctgggtttggaagaaatctggagagctagcaaccaatgctggcctaaatgctgaaaatgagatactacacactcttgcattcttagcaggtgtcatgatttggtcacagatcacagacttaccattctctctttattcaacatttgttattgaagctaaacatggttttaacaagcaaactatttggctcttcattagggacatgatcaaagggattttgctatccatcttacttggacctcctattgtggctgctattatcatcatagtacagaatggagggccctacctggcaatatatctatggggttttatgtttgcattatctcttgtgatgatgacaatataccccatcgtgatagcacctctgttcaacaaattcactccgcttccagaaggagtactcagagagaaaatagagaaattagcagcttcactcagttttccattgaaaaagcttttcgtggtggatgggtctaccagatcaagccacagtaatgcttacatgtatgggtttttcaagaacaagcgcattgttctctatgacacgttgattcagcagtgtagtagtgaggatgaaatagtttctgttattgcacatgaacttgggcactggaaactcaaccacactgtgtattcctttgtagctgtccagctccttatgttcctacaatttggaggatatacgctagtaaggaactccaaagacctttttgaaagttttggtttcgaggatcagcctgtaataattgggctgatcatatttcagcacactataatacctgtccagcaccttctgagtttttgtctgaaccttgtcagtcgggcatttgaatttcaggctgatgcttttgccaagaaccttgggtatgctcctcagctccgtgcagcccttgttaaactacaggaagagaacttatctgcaatgaacacagatccgtggtattcagcctaccactactcccatccaccccttgttgaaaggctctctgctcttgaagacgcagacagcaaaaaggaaaactaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MALPYLEAVLCFMILMYIFETYLDIRQHRALKLPTLPKPLVGVI SGEKFERSRAYSLDKSKFHFIHEAVTILMDTTILYYRVLPWVWKKSGELATNAGLNAE NEILHTLAFLAGVMIWSQITDLPFSLYSTFVIEAKHGFNKQTIWLFIRDMIKGILLSI LLGPPIVAAIIIIVQNGGPYLAIYLWGFMFALSLVMMTIYPIVIAPLFNKFTPLPEGV LREKIEKLAASLSFPLKKLFVVDGSTRSSHSNAYMYGFFKNKRIVLYDTLIQQCSSED EIVSVIAHELGHWKLNHTVYSFVAVQLLMFLQFGGYTLVRNSKDLFESFGFEDQPVII GLIIFQHTIIPVQHLLSFCLNLVSRAFEFQADAFAKNLGYAPQLRAALVKLQEENLSA MNTDPWYSAYHYSHPPLVERLSALEDADSKKEN</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>100..130#968..1115#1241..1325#1402..1497#2513..2578#2747..2845#2992..3105#3315..3425#3519..3581#3663..3755#4807..4920#5132..5203#5287..5352#5601..5720#gtccccggcccggcccgtgcctcccccagtcctcctctcccccgtctcccgccgcctagcgattcccggagcgcctcctccgccacccatcctgctccaatggcgcttccttacctggaggccgtgctgtgtaagatttcctcgcctcccccatctctcgtttggtgcggtggtacgctcgccttgatcgctgatctgtgtggggatggcgtcgggtttcggttggaacgggggatccgtgcgtaaaccctagggtttttgggtgggcgcttgggtttttaatctccggctcgatttgctcgtgctgtggtggcgattgggcgtggcggcttggtggtagcgggtagggtggattaatctaagttgagtcgagggagcttaatgcgattggcgatggcgttggcgctgggggagaagggccttggcgctgatgcaatgaagttgctgaatgtcggtatcgatgccatgttttatgttgttcgtgattagctgttcctagtatactggtttgcttttgtgttgatgatttgctgagtgcccatcattcaatgatgtgattataggaaccggtgaagtgaaaatgtatggcacagacgcttttgttcttaataaatacagtgaagaccgtctgtgattgagtgtagttagagtggagatgtgcgatagagctgcgaagtcatcttggcttaattgatcatgagggttgaatttctgtatttttgttgtgttgcaacactctctatcatgcagtaggatgcaatatttgtagagtttgtggtgatttatgagtttaagatggcaatatctattctgaaaagaagttacttgtaataggatctgtgacttgcatatgttagctaagactcatgcctctcgagtgaagtcaggtcatggtatatatttacattcaacactggatattgtatatgatgaaataattttttaaaaatttgtattcgttttgcaggctttatgattctcatgtatatatttgagacatatcttgacatccgtcagcatagagcccttaagttgccaacactgccaaaacccctggtaggagtaattagtggtgaaaagtttgagcgctccagagcttatagccttgataaaaggtatgtgtaatactgctctcaccttttgcaaccttacattattcattttactgcaatcgttctaaagtaattcagactgccaattttttggattttgtgtgttgacatttatgctcatgttacagcaaattccattttatccatgaagctgtaactatattaatggataccacaattctgtactatagagttcttccctgggtttggaaggtaaaacaaaatcaatcagcttgcctctgtaaactctttatgcaagtattttgttgtgattagccttcttttgtagaaatctggagagctagcaaccaatgctggcctaaatgctgaaaatgagatactacacactcttgcattcttagcaggtgtcatgatttggtcacaggtatagaataattacttgtacctgccaagcatcttatatgtttattgcacatatatttttaccttcattgcattcaaaattaaattagcttccagttgtcttccagcacattgagttaggtataaactgaagccttagctttccatgattgacaatcgctagctttagtttaacacaaatggtggttgctggattgtctatgtcgttagttactgcatcaaaagttattattagtcaggactgaagcgcatagcatagtgacacctatgaaactattgacatgcatttccctattctgcttttggccctgacagacatgaacagccactctagttcttctctgactggaccatttttcaacttgaaaaatagtggcaaaagttgcctgtattttcttaaatttgcatgtatcaagatcaggatatttgagataagagtcttatctcaaatatagcgcttcgcgaccgctataacagcccgctattgactttgttggaccattataacgcttaaatgttgttcttcatttatggattgtagaactttacattgtttatcttatttatcttatatatctatatgttatttcatactttttatgttatgaaatataggagtaattaaaaatgtatgaatttgatgttaatattgatatatttatggttattttcttatatttgctattggaacttagcgtccgcaatagcgcccgctatccgcaatccgctacacagacactaatccgctaacaacccgctatacactatttattaccttggataagagtaatcatccttttgcccttttctgttgagtacatccagtgacttttacatgttaatctacacctatgttcatagttgcatactgatattgattgtttaggtctacatctactagaactttggcatagtgttctcttatggtgaatcaacttcttttgcaagccatcagctaaaacatgccaactccactatttgatgtgaaacactgatacatacttcatgcaatgcagatcacagacttaccattctctctttattcaacatttgttattgaagctaaacatggttttaacaaggtatgtttgtgttctcaattttagcacctcagttattatatgttttaacatttgaatggtgttcacctgcaagattagtgaagtacaaaagtatcttggcttatgaatttgctatgttctaatccccaacatatttattctgaacctctagctttggacttttttcagcaaactatttggctcttcattagggacatgatcaaagggattttgctatccatcttacttggacctcctattgtggctgctattatcatcatagtacaggtatctcctgtctttctaccacacacttcttcattgttggctagtatctggagaacaggcttacctgttttttgcgggatctgggcccgaataccacaaactcgtagaagtgtgtgaactgattagtttatttctctgtgcttcagaatggagggccctacctggcaatatatctatggggttttatgtttgcattatctcttgtgatgatgacaatataccccatcgtgatagcacctctgttcaacaaattcactccggttagtatctttttctgttgtagagcatacctagtatgctgtaattagttcacttgtctgttttttgtgtgagaaaggtacatgcatccattgtgcatcttctaattcgtgtcccatgttattgaactacgttgacctattaataagccgtacggatggcaaaagctcttttgaggtataactagatatggttgcacatattttaacagcttccagaaggagtactcagagagaaaatagagaaattagcagcttcactcagttttccattgaaaaagcttttcgtggtggatgggtctaccagatcaagccacagtaatgtatgttgattactctaccttcagggttgtggttcattgataactgatagtttgtaattttctgtgtgctttgaactgacaattttctttcaggcttacatgtatgggtttttcaagaacaagcgcattgttctctatgacacgttgattcagcaggttatatgctaagttgtttagtttcattataattttgaattacatgcatgaaactcacctggatccttttgtcggtttcagtgtagtagtgaggatgaaatagtttctgttattgcacatgaacttgggcactggaaactcaaccacactgtgtattcctttgtagctgtccaggtattctctttgatgccatgataaactttgcataacaattgttcatctattttgttgatatagtatttgtgtacttctgggataaaaaatgtgtatgtaatccgaaatgtcccgttggttctcctaaaaggacatgcagcatttttgtgcccctccccccaactttatcattgtatcatgtaatgcatgaatgagaactattgttttggttacagataagaaaagtgcataaatgcaagcatttgatcactaggacagggtagctaatttcaatattgtttctggtaaagaatttactattaagaaaagtgacttccctgtttgttcaaagtaaatactgcatgaccatagcatgaaaatcctgactggtgcttaactggtcactctgctggtacttggttttactggtctacccggtccaattggtgaattgtcaaaaatattatattcaaacgtattttaagtctgatcccgcaactaatacactttttttcaaatatgcataatatcgccaaagaataatatttagctcaatccatttggctagaagcccaacatacttgtgagatgggacccaagtttggtttgactcaaaaaactatttcccctatttttaccataactttctttttttctgaccgaaccaaactaggatctggtcctgggtttttccagttggacccgcctggcccctttttttgtactgtgtttgacatgcctgcttctatgatggatatgatgtgtgatgactgatgagtggctactaggttatgctaagcatgccatttccttagatggatgactatttaacaaaacaaaccttggcataaggttagcagaaaaagttactattcaatatccagagcaaataaacagtgtttagcatgtaagtaggattaatggttctttttcgaaattgaatctgtgatacagtccctttgcatctgttgctggagagtactgctgctttttagtacaaagaaggaaaaaaaacagataaatcttcttttgtgtgttgagagttttttcacttcgtctcctttttatgcagctccttatgttcctacaatttggaggatatacgctagtaaggaactccaaagacctttttgaaagttttggtttcgaggatcagcctgtaataattgggctgatcatatttcaggtatgtttactcatatttgtgaagaatattttcttccttagatatacaaagtctttccctagcacaactacctgcttgtactgtgaaaatagtactacaggtattgtaatttttcatttaagtttgcagtggcttgcattttttggtggatttctagtattgctctattacaagttacaacttgattgacatgtccgttgcttgattgtagcacactataatacctgtccagcaccttctgagtttttgtctgaaccttgtcagtcgggcatttgaatttcaggttcatttttctatttcccttcaaagtttctgctactgctgctttataactttcagttgcacttaccttgatataatttctaggctgatgcttttgccaagaaccttgggtatgctcctcagctccgtgcagcccttgttaaactacaggtaaccatcgaaagatccttttgatttattctcactctaattgctagacacctgaaccgcaaggtctgtctgattcttgttctgttacccaaagtactttcacgctcattattcacttgaactgaacatccgcattagcgttctcttatcgtactgtcggttctcgttgttcgtattgcccttggtcacctgcacaaactgcttgcaaatttgcatagcctaatttggaatttgctttcaaatttcaggaagagaacttatctgcaatgaacacagatccgtggtattcagcctaccactactcccatccaccccttgttgaaaggctctctgctcttgaagacgcagacagcaaaaaggaaaactaacggaaagttgatccacctgaaacaccgaagtctttactcttccatgggttaccttacggtgtcatggaatcgtttcaatgttcgggatgttaatggaatgtgtgagtacatgagaagtactgtaagcgttcaaacatttatcatacaggggaacgttggcaactatgtagctctcgattaagatagtttgccttccattaattggcttacagatattgacatatactccttccatttcacaatgtaagttattctagcattttccacattcatattgatgtattaatatgaatgtgggaaatgctagaatgacttgcattgtaaaacggaggaagtacatgtcagtgtattctcctactactttcgacaagaaatagaagtgaatcagct</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
