Os02g0800500

From RiceWiki
Revision as of 02:58, 25 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os02g0800500| Description = Similar to Cyclin-B1-4| Version = NM_001186255.1 GI:297721642 GeneID:9266437| Length = 11603 bp| Definition = Oryza...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os02g0800500

Description

Similar to Cyclin-B1-4

Version

NM_001186255.1 GI:297721642 GeneID:9266437

Length

11603 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os02g0800500, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:35001135..35012737

Sequence Coding Region

35010192..35010428,35010515..35010715

Expression

GEO Profiles:Os02g0800500

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008395:35001135..35012737 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008395:35001135..35012737 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>gacgctgcggcctccgaggatggctgggtcctggggcgtggagctctggaattgctgctcggcggcaccgcctacacacaagcgacaagtgcgccacaaatctctctctcgatgcagcaagtgcagcggagggagctgcaactggtcgccgtttctgccatgctgatagattgcaagtacgaggagatttgggccccagaggtgaacgacttcatcttcatatcagatagtgcatacactagggaacagattcttgcaatggagaaggggattctgaataagcttcagtggaatctcaccattcctacaccatatgtcttcattatgatgctatctgcgtctgcagataacaaaagtgacaaggaggtaaagagccatggcttttgtttgtttctgtttaccaccagattatatttcattgctaagcgacaagtttaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>DAAASEDGWVLGRGALELLLGGTAYTQATSAPQISLSMQQVQRR ELQLVAVSAMLIDCKYEEIWAPEVNDFIFISDSAYTREQILAMEKGILNKLQWNLTIP TPYVFIMMLSASADNKSDKEVKSHGFCLFLFTTRLYFIAKRQV</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>2310..2546#2023..2223#atgagtgaagagagagagagagagagagagagcttcgcaggcgacgatggcgagcggcggcgtggtgaagaaggagatcggcgggaaccacgacgtcgtccgcttcggcgtcaacgacagcgtcaagggggacctcgcgccgccgcacccgctccaggccagcgtccacaaggtcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttctccccccctctcgccctcgaaaccctagctaacacgctgaatccccgccgcgcgcgcaggaggccaagttctgggcggacaagaagaggttcggcgcggaagccatctacggatccgccttcaacatccgcaaggatcttgatgcccaaatcctctccaagtaattcactgtcctatccccatgtaatttccgctgcaataccaccatctgtccaagttgatagataggcactagtagttccatctgagcaggcagtattacatgtcttgttggaactgttaggtccgtaaacttaagtgggctggcttattatgggcacgagatatgcatatttgaattcgatgtggtttatatcctccctgtgtttgttaagattgcccttgcagttagctcgttttttttttttttttgtgtgtgtgtgtgtgtgtctagttgtaaatctggtagtagctctttgcatttactgcaagtctgcaactcttttcctatgtgcgtattatatcagtgatgttattgttggtggtcatcagttgtattctgctgacagtgtgcaaattccttctgaaacttcttgttatatacgccaattttcctggttagaatagttgattctcaaaatattgtgcatgtgtagtattttgagcatctccacatatcgatatgctcaggttactaagattttgttgatgctttgtatgttctagtatggatcactcagaatgcttgaatcccttggtctggttgaattcacagtatcttgatgttgtttttgtttgtctgccccttctagtaacaattagcacatcaatacactgcaaataggagaaaaacagcacgcacaactcatctccattgcttttaattgggcaggctaacatgaaagatgttttgattgatgatttatctgttgccaggttccaaaggccccctggtgcattgccgtcatctatgctaggatatgaggcactgactggttccttagatgattttgggtttgaagattatcttaactgtaaggattgctgtcctttgatttcccctgaatcttattgcttgcttttcacatttctttgcaactatttgggaaccaacttttgcttatttattatattcatgtttatgttctttattggagtcagggagtgccaccaaagttctatttaccttcatatgaattcttgtttgtttacttttaacagggcaaaattgtgtagtcgtttttctcgaacataaaactatgtagtcttgtggcatcttggtattggtagtttagaagttcttggaaaacaaagggtcatcttgatagatttttggtgttaggatgtactacctctagactctagtcaaatttattcggcgttagaaacaatgccaaataaatttggctggagggagtacttgaaataataataattatctcaaattggttgttttattccgtcatcatgatatccacaaattatatattttgcttctgtcggtgctttgagcttggtttggctttactttccatgcagaacttacatctcatcaccattcattaatgctgatttatactaatcaccacaaaatacagccgatatagactatatttcagttccaccgcccttgcgacaacttttttcttgtcaagtatttactcgtcctattgttacttataaagaagaagaaaaataaggattcaagcaccaagaagcagccggcgagggaggccgctgctgcgaacagcgagtcgagggcgatggtggcggagagggagaaggaatacgaccggctgtctaagttcctcgtggtctacctcaatgctatttgagacgctgcggcctccgaggatggctgggtcctggggcgtggagctctggaattgctgctcggcggcaccgcctacacacaagcgacaagtgcgccacaaatctctctctcgatgcagcaagtgcagcggagggagctgcaactggtcgccgtttctgccatgctgatagattgcaagtacgaggagatttgggccccagaggtagcaacattttatcccctttgctctgcactgtccatttctagcagggacttgttctgattggatctctgtgtatgtatttgcaggtgaacgacttcatcttcatatcagatagtgcatacactagggaacagattcttgcaatggagaaggggattctgaataagcttcagtggaatctcaccattcctacaccatatgtcttcattatgatgctatctgcgtctgcagataacaaaagtgacaaggaggtaaagagccatggcttttgtttgtttctgtttaccaccagattatatttcattgctaagcgacaagtttaagcgtgtactcaagatttcttttggtgaatgctgatggagcacatggccttcttcttcgctgaattggcactgatgcagtacgggctggtggcatatgcctctgctgtctatgcagccaggcccaatcctcgtcatttctatatatgaagaaattgctggatccatcctctcggctaactaggacgttgttccactagatctccattattcctagtgcaggttcgtcactttgtccccaatcgagctaattctctttccaatcattattgtgattattgcagatttctttgtggcccagttatcaattttcaacagatttcagtatccgaatctgctccttctttccgatacaacaatatttggactagcagattaactactacatttcgctgaactagctccttcggtttcatcacaggtttatttggattacataatcccctatcggtttagttccctttattgttgaacaattggagataatatctttcacggtatggacaaacactagaaatctgttttttaattgctaactatgcaattcctacatacgctaatttgttttccatttttcctgttttgttattattcatgttatttttgcaacaatccagcagctttgtatttcatactggtgttcgtattttttaattgtaccagggaaactctgagcagttatcttcttcacttaatcattgcagataattcgtaccactgagcaaaattcaatgatgcaattattttatatgcaactcatttggtgaacaagatgtatcttgtggcaaacaacgagatgaaaagttacttgatccttcaggcatacctgtgattttccaatctattctttgcacgttcttggaaagattggttgtccctgatagctgtccgtagtgattcatggatactgtgtggcattttactttggggctcattttggatttgataaagaagtcaggtttgctcctaattcaattttttccctgttgatttgcaccaccttttctcaagcctgtcattttaattatatatgctctaccactctactaattaattctcactctgtgtgcaaggatgtgtggtagtgcagtcacatacttacatgttgtgagtctagattattttagtgacacatatcatgatttacaatctgacaacgaatcattctaaaatgatttgctccattaactgtcttaattatcacgaacccagatttggtttgtcacaatattaactcttgataaatcctttcacgtaaatcaacagactacactttgttaagtccgcctcccaaagaaattttgctaccttctgtccacacctctaaacaaaaccacctatgatagctaaaaaaataccaatccgaattaagataataagtttagccgtcaccatcttctcaaattgctttttgcccacataattagtcagagtgatcagctgaatgcttttcccactcagcagtgctctaaaatgttactgacaaattcattttgccaaacaaatttagttcatttacattccagaaatgtatatgtcctatcagttgaacatacttgcagggattattccttgagtccttgtctccttgaagttagttgttattgtgccaatgttgaaatattcagtatatttgctgaattttcatgctttattgctctgcaaaccatggttcctgatttctactctgtgtactattttggttcagactggttaaatgtgttggagtacttcaatttttactgtttcatgagttcaaaatataaattaatcattccagtgaagcatcgtactgtgctattctgagttgtatgctgcaaaggttaaattgtgcctccatccactttcaaactgaaattatcacggaagaatgtacagcaaatattctcttcacctatcttttctgaagtaggaatgtgtcctaatccagtttcactttttaccctgctgctctgaataatcaacagaaagagatgttctactgctttgtacttcatctctggctgctactagcactctgaagaatcaccctgagcttatcacccgtcatttcctctctctcctttctctctgtcttggttgaaattacattttgattggttctttgacaactgtggagcagattgccaagagaaggtcagctcatctgctgaagtatcctactgtgacgattataagccctgggatcagtaacactagagtccattcaagactccataagtaatgccatggcagatgtgcatatttgctcttaatataataaacaccagttgtgtaccttcggataatttatattgcagtttgtcaagaacatagctaaattctaattgagaaaggaagttctgcattgaacggatcacagttcttatgatttagtgtaaatgattcagtcaggccgtgcattttccatagttcattttcaaaaaaaccttgttctttaatgggtctatctgtaaatgcagagagcacataccttattcaaataatcaagatagatcagattattttccttttgataaaatttatcgagttaaattcaagccagatagacccacgggaagtttatatatgatgtgtgtagtatgcatgaaacttaggatgtaggttttcttagtaaagttacatcctacaaaataatgttcggatacactacactttccacattcgcatacaattactaattaaaaaaagatgttatcaccacaacagcccactgtattgtttgcaaacaaacacttcatagccacaattactacaggtggaaaaaaaaaactacctcatctttattaacccccaccttcttgcacatactctgcatccactacttatcaaaactacaacttttagatttgttaactatgtctataaaatactatatccgtctaggaatgcgccttggattctatgtattatcaatgcaatatttaaaacttataattacatttttacaactattcatatacgagttctatacactcagtgctaggtcctaacagaatgctgaggccctcaagttcaaaagattatcacagagccggcaacaactcattgattggtcagtaaaaataaaggtaaataaagaagcgtattcagtattggaaaacgtgcaaacaaatacttattatacatattttcaaaaaaaaaagctatgaaaaattaccatctttcaagtaaagcaacaattcttaacttaaagaaaaacttaaatatttatcgataacagtacaaacctaatgtaaaaaaaagttataaatcaatttattcaaatttgtgacaactctcacggcacgccgcgcaaccacatctagtagtttatatgggcacttgacctccctagtacaaggaaataatcattatttctccctaattaagactttccttgttgaaaaactttccaaatctctaatccttgattgtgttgttgctgcttgctgcgcatgtgcctggcttccatctttgctgcttgctgcacatgtcgccccacatgacaccttcactcttcttagagcagatacagtagcagactataagccagctataaacatatttgaggaagataaaagaggagagataagagcagataaaagaggagagattagagcagcgggctattaacacttcttttgtgttaattcccatcaagacttcttttgtggctggctattaactgtgttatggactatgcacaggtttcaaaggagcatgggggtttcatgagatttatccaggtttcttgcctaggagcatcggcctcttcttctagaatgctgagggccaaggctgctggggaagaatctgtgttgaaggaatttcctgaggtgatcatctgcattaggcaatactgaacttctgtttctatactacccaaagttagaagcaaacatgtcccatttatgttggcggttactttaaccaaacttctgtgttgcatggatcaacaggctacaattatgaggcctgcaactatgattggcacagaagatcggattttgaacagatgggtacagtttgctaaaaattgattcccggtctacaaagtaattgagctttcctgttggctgttgtcgtaatcccttgactcaaaatttagtctagaacattaattgatcagagaatacaggcctcatcatttgccctatggcttgatttgaattttaaaacttgattttgaagttggttttgatgcttttacaacgtagtttctttttcagcattagcttttatttaagccactaaggacacatgtaaaagttttactcataaattactttttttatcactaataagccattacggcttttaatcagtcataggcaatcaatggggacctgcatcttaaacttccacagcaggtgagattacatgaatgcaaccttttggtttttgcaggattcagcctgtttatgttgtggatgttgctgctgctattgtcaactccctcaaggatgatggcaccagcatgggaaagagctacggacttggtggaccagagatttatactgttcatgatctggtaattatcatgcacaacattttgttatgcagcaatgaacgaatcttcaagttggttggtcagagtttttttatataaaaatgttctggatgttacaggctgagctgatgtatgagacaatatgtgaatggccacggtacatcgatgttcctcttcctattgcaagggtatgaacttaaataatatcttgtgttggtcaaggcgaatggccacggtacatcgatgttcctcttcctgttgcaagggtatgaacttaaataatatcttgtgttggtcaaggcaacctgagtattggattgtctcgtcttttgaccgtcatgctttgggttgtgcaggctatcgcatctcctgaaagctgatagattgggattttttttttcaatactctaagcctctaatgaaaggtgcatatggacttttattttagatgttctaactttgttttgtctctacctctcaaattgttactatatatgtactcttcaacctgccgcataggttggcacatgtttataaggtcaaatggaatatatttcttgtgtttttactatcatttggtttagttctttcacacagcaatgttgctatttctattgttgcttcccgccctggaaaaaacacggctcaagccgtgaggtcttcatttgcttctcttgtgaccaattaatctgtaggtttgggtccaaagtatgctttcgcaaccaagtgatgaaaaaaaaaacaatctggttggggatgtcaattggttggttcatacaagtgagttgatttgattatttaatttcctctaaacaatacctctaatatttaatggtcaaggatgccataccatatatactgttggcacttgtataccacgtgcttaggctgccataaaatgatttgccatttctggcaaatgatgtaaatgatgacatagaaaagtaaaaaattgcaggaataaacctatgacattcgcaactttttcaagtgagggatctgttttttggttgcagctgacagtgtcatcacgttgtgggatcctggtaataatatcacatttgttggtatgattaaagaggcactatttagtggtatgctactatctttgaaatgttgtggatgaagcactgtgagttgcttgtgaggaagatcaagcacatggttgctgtaattctgcttctacctacaatatctttttagatttttttttatcaatgaaggattctcctattttagtagttagtaccacatattttgtagcagtttggttgaggtcttgatgaaaaacgaaactcgaaagttctctacatattcccatctttgttatattagaaatcataacattctttgcttaatagtcatttactctgaatatttctattttttgctatagtccaagcattaaatgaccatgctctgatttatagtgttttcaagaatgccgagctattggaatttcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaactgtctttctgattttggggctatattttattcatgtattataattcccatttctcctttggttgggaacttgtgatgtgatagactttggtagtacatttttatgttgctttaagtggagattgagaattgaactttgagaatcatctgcattgcaaatatcactttggtattgctgttcttactctgattaagtttacaaaacgatgattctcattgtatgctgtgcaggagctattcaaggcaaaagaataaataagatcctatcgtcttcaacgtggtgctatcatccttggtcatcagggaaaactcagaagaccatgaaccactccggccactcatagtaagaaacatgatcataaccccatgctaagattggttctgtaaacctagatttttgttttaatctataataccaacaaatttgagccacaaaaaaatcagtacgaagagatcatgcttaattttgtaaatggctgacattcggaaaaaatgtttgccgaatattttattgttagtactatatatttgttttcataagattggcgtggcaagaaccataaccttcttgatggaaactccatctctagaatagtatggatttgaaatttgtgacatgaatcagtaagagaatcaactgcatttggaatataatggtctattatgtgtcacatgttcagttttgaataaattagacacattaaaggctgcaattaagattttaggcactagatcataaatttaagcaccagatcatattcaaacagctaactgctatcatgccctagccaattcggttgtatggatgcattcaaaatttcaattcaggtcagttctgatcaaagatgattggtaaaaaaggtacttcaaaaacattgacctcgtattgactgacggcaggatgaaaagaatacttgtgatatactggtgtaataattgtggagcgatgattcacaaacaaaggatgctgtagttgcttaaatgcatttaagttgcgaggacagcaggtatacatttaaactgtatttggatcagtgatacttttaacaaacatgtaacattgcaaacaagaatttacttaccattcgtttctatttataatggctcaacttttttttagtccgaagatttgccttctagatgcgatatcaggattgtgaatcaggtcaaaagcactgcacctgcgatggtaggatttgccaatgatgccttcataactaactcggaatcaagtttgtagctcccatatatcaccaattgcagacgataaacattacactgaaaaaaaaaatcgcatcctacttaattaggtactggcgccaaagcaaattatgtgtcaatgttgtctttgttgataggaatgaaggtataacacatcagactgcttaatctgcgttaaacatgagaaacctttcttatggtcttgtaatagttattacaataatagaaatgttggtggaaacaactaatggtttagatcttaacttgatgggtggtggatgacactgtttttgtagtagtgttgaattcttggtctacttttgctatttatgaaagaaatgcgctaattttgtgaattttgtctatcctttgcaggacagtggtggtgaacagcgtggcattcatgacaatagagataggcaatggctgaggtcagtactggagcctttggaatttgaaaaggatgatttctttcaaaaaaaaaaaagattggggaccagttcaaatttgaacaaaattataaggaagcttggctaaataggcatatacctcgtacctccatctaatgagaggaaaagaaacttacacaatgtcgagcattaatatcatttttgaatatatttcttcgatggtaccattgtagtttcatctattttacgaatatatttatattgaaattagtggtcaacaaatcaagatgttttcctgaccaacgaaaatgacaggctatttagaaaatgttgaatttattacatagttctggacatcaaatgttatctattgacaccagcaatcttaaattttattcctgttatatattatttacctggctaatttccaactgtttaaacaaatttacccaacatgttgtcactctctttgcaccaactgcgtacagatttaacttgctcttataccaaaataatgaaactctccttcaatgatgtaaaatgattgaaggcagaaagttaatgctacacgggagctagctagctactactactccagaagatactgattcctagcgggcatgtggagttgtactactagttaattaatggggcatgttcaattaatgttggtcgctgtgtgaagtggatcggagtagtagtatttatatgggcacccagcaggcaggggagggatcaaaatcgagcgcacacgtactgtacttactgccagccactaacaagagtcagacaatggactcaaagaaggtcgcgtatgctgtttttatcgtcattctcctaatgacggaggtagcggccgccgctgccgctggaggcagcgcccgtgggactggtggtacaggtacatcatcttgtcatctcttaagtagtactgtagtatcgatcttttcatctgcatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatactgtccttacttgtgcatatatgctttttctttcttcttttgtttaggtgatcgcgccaacgatgaagagaaatttatctttggccatctgagcaaagcaatattaatttacatagccagtcacttcccaggtcacattaaagagtgcgtcaaccacgtcgaaaaccagtgtggctgggctccggcgcctggatgcctgaaagaggcattagccacatgcgccaaataaggcgcccgctgcttcgcttcctctggcggtctggcccctctccgcataaataattgtaataaggggtcctagtgaatatatatatatatatatatgtggtactcactgcagtgagtatgtattatgtactacttattatatagtaataaaatttgaataaagtaatatttgagcct</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os02g0800500, RefSeq:Os02g0800500