Os02g0826600

From RiceWiki
Revision as of 03:02, 25 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os02g0826600| Description = Leucine-rich repeat, typical subtype containing protein| Version = NM_001055123.1 GI:115449938 GeneID:4331218| Lengt...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os02g0826600

Description

Leucine-rich repeat, typical subtype containing protein

Version

NM_001055123.1 GI:115449938 GeneID:4331218

Length

6412 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os02g0826600, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:36413493..36419904

Sequence Coding Region

36413829..36413904,36414213..36414268,36414396..36414470,36414617..36414713,36414790..36414914
,36415431..36415535,36415663..36415800,36416126..36416199,36416363..36416433
,36416536..36416596,36416850..36416940,36417632..36417710,36417799..36417859
,36417944..36418021,36418113..36418182,36418281..36418355,36418487..36418562
,36418771..36418857,36419112..36419248,36419368..36419431,36419719..36419783

Expression

GEO Profiles:Os02g0826600

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008395:36413493..36419904 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008395:36413493..36419904 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggagcgggtgctcaaatccgccagggagtcgggctccctcaacctctccaatcgatccctcagggaggtacccaaggaggtgtacaacaacttggacacgggggctcaggatgagaaatggtgggagggagttgaccttcagaagctcatattggctcataacaaccttgaggtgttgcgtgaagacctcagaaatttgtcttcgctcgttgtattaaacattagtcacaacaatatttcttccctccccgcagctattggagaccttcctttgctaaaatcgttggatgtatcttctaatcaaataaacgcttttcccgaagagattggttttgcgaccgctttagtcaaggttgactgctcaaataattgccttacagatctcccagttagtcttgccagatgcctggagttgtcagaactcaatgcgtcaaacaacactatatccgtactgccagatgaacttgctggctgttccaagttattcagattgaatctagagggtaacaagctcgtgacgctatcagacaagatgtttatgtcatggacaatgcttacagagatgaatgctgcaaagaatctactgacagccatcccggatggtattggtgcactgtcaaagctaattcgtctggacctgcatcagaacaaaataaccctgattcctccttccataaaagattgctcttctctagcagagttttatatgggaaataacttgttgacatccataccagaggatattggcatgctatcgaacttgggaatacttgatctacactctaaccagctaaaggagtatcctgtcggggcttgtagactcaagctctctttccttgatctatcaaacaactcattatctggtctgcctgctgaactaggtactatgacaaccctaagaaagcttctgcttactggtaatcctatgaggacacttcggagttccttggtttctggaccaacaacagcattattaaagtatctgcgcagtcggctttcatctgatgaaggagcatcaggatctggaagcactccaacaaaagatgatcaaattgctgcagcaagaagattgtctttatcttctaaggaactggacttgagtggtcttggtgtgaccagtgtaccacctgcagcttgggagacaaatgatgtgatgaaactagatctttctaagaattcaatagaagatctgccaaacgagttgtcattatgctcgtcacttcaatctttgattttgtctaacaacaaaattaaaaggtggcctggcaccgtattctcctcccttgccagcctttctttgttaaagctagacaacaatcctttggcagagatattggctactgatcttgaggccctgtctaaacttgaagtactagatttaagtggcagtgcttcttctctacctgaaccctctgcggtttcgaaattacctcacctaaaggaactctacctaagacgaatgaaactccatggatttcctgatagtttattgggcttaaaactgctgcgaattcttgatctgagtcagaattatcttacatctgtgccagagggtatcaaagatttaacttctttgattgagcttgatctgtcggacaacaatataacaacactcccacctgagctgggtttgcttgagcctaacctgcaagtcttgaaacttgatggaaatcccctcaggagcatacggcggactctgctggagcgaggaacgaaagcaattctgaagtatctcaaagaaaagctacctgctgaataa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MERVLKSARESGSLNLSNRSLREVPKEVYNNLDTGAQDEKWWEG VDLQKLILAHNNLEVLREDLRNLSSLVVLNISHNNISSLPAAIGDLPLLKSLDVSSNQ INAFPEEIGFATALVKVDCSNNCLTDLPVSLARCLELSELNASNNTISVLPDELAGCS KLFRLNLEGNKLVTLSDKMFMSWTMLTEMNAAKNLLTAIPDGIGALSKLIRLDLHQNK ITLIPPSIKDCSSLAEFYMGNNLLTSIPEDIGMLSNLGILDLHSNQLKEYPVGACRLK LSFLDLSNNSLSGLPAELGTMTTLRKLLLTGNPMRTLRSSLVSGPTTALLKYLRSRLS SDEGASGSGSTPTKDDQIAAARRLSLSSKELDLSGLGVTSVPPAAWETNDVMKLDLSK NSIEDLPNELSLCSSLQSLILSNNKIKRWPGTVFSSLASLSLLKLDNNPLAEILATDL EALSKLEVLDLSGSASSLPEPSAVSKLPHLKELYLRRMKLHGFPDSLLGLKLLRILDL SQNYLTSVPEGIKDLTSLIELDLSDNNITTLPPELGLLEPNLQVLKLDGNPLRSIRRT LLERGTKAILKYLKEKLPAE</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>6001..6076#5637..5692#5435..5509#5192..5288#4991..5115#4370..4474#4105..4242#3706..3779#3472..3542#3309..3369#2965..3055#2195..2273#2046..2106#1884..1961#1723..1792#1550..1624#1343..1418#1048..1134#657..793#474..537#122..186#gatctctcttctagtcttcttcgtgggtaggctcgtgctgcctctgcctgctggtgcagcagatcagatcaggtctccggcgatggcgatctgaggccggaggctgcttgcttctgcttgcatggagcgggtgctcaaatccgccagggagtcgggctccctcaacctctccaatcgatccctcaggtgcattgtctctctctgctcgctcggttggatcgccatcggcgacatggacgatgatctctcctagtctgtagccgccgcccactgctcggacgcgacgcaatccaatcccttcccgccatgacgccttcacctgcttctcacatcagtttactgcattgcattgtctgattatggccggtgtactaggggaccatgggttaatcgattccagcgcgcgcgcacacagcttcgctcttcttgttcttgatgtctcgctgacgccacacctctgcctgttctgccagggaggtacccaaggaggtgtacaacaacttggacacgggggctcaggatgagaaatggtgggaggtaaatcgattcgcccccttcctgtatgactatttccctacatgctgcataaacaagggatatcaagcaacgccaatcaaatttgtttctgtttctgtttttttccttttgtaattcagggagttgaccttcagaagctcatattggctcataacaaccttgaggtgttgcgtgaagacctcagaaatttgtcttcgctcgttgtattaaacattagtcacaacaatatttcttccctccccgcagctattggagagtatgtactggactatccttatttactactccctccggtcatggaaacatatcgtttgtggacatgtttgaagtcactgccttcaaaaccagtttcataatattatcattctatcaagattttcaactgtttttcgatagagattactggtcaagtttgcaggcatggtttttgtgacaggagggagtaatttccattgttaaccgtggaccactaatatcatctgaacttttttatggctcttttccatgcagccttcctttgctaaaatcgttggatgtatcttctaatcaaataaacgcttttcccgaagagattggttttgcgaccgctttagtcaagtatgtcttctatgtcccttttctaattgatttcattaatgtactgttaaaacaagctcaaaatttggctattcatatttctaaaaccatctgtcacatattttagatgttatgatgttgacaattagtatgacgcctaaatacaagaagcaatgtttgagactatgtatgattatattcatgtaagttgatgcattgttgttgccagggttgactgctcaaataattgccttacagatctcccagttagtcttgccagatgcctggagttgtcagaactcaatgtaagccaccatcgatgtattccttattttctccataaggtttctttgtttgatgaagatatatacagctcatctttatagcttccctcttcatcctctgtcctaaatataatgtaatgccctacctgtaggcgtcaaacaacactatatccgtactgccagatgaacttgctggctgttccaagttattcagattgaatctagaggtatatactccttatagagaatgtcaaagctggatttatcatattttcgtgctgcatttcttttgttcttgaaaactccaattactgcaaaatgtcagggtaacaagctcgtgacgctatcagacaagatgtttatgtcatggacaatgcttacagagatgaatgctggtatgccacacagccacagtaccaaaaataatgtcgaacctatgtgatatccttgagtttctacctgagattaacattcaaacctgtacagcaaagaatctactgacagccatcccggatggtattggtgcactgtcaaagctaattcgtctggacctgcatcagaacagttagtctaccatactatcgcatatgctagctctttattattcatttttatctgtattgatggctttctacttttgttatgtagaaataaccctgattcctccttccataaaagattgctcttctctagcagagttttatatggggttggttatctattttggacaaacttctttaccatgctcttatttttaaacagcacaagttcactctatttgtacttttatgttccagaaataacttgttgacatccataccagaggatattggcatgctatcgaacttgggaatacttgatctacactctaaccaggtcttactccatttattttcacagatactgccaatttaatagtctattattcccctgactcttgttattctgcaccattttaaaatctgaagatactgggagaaaggctcttgatttgatttctttgttgctgggacatcaaatctgtagctgtgtggctcaaaattttagtacatcatttgtttattctaacatgaggcttttttgcttatgactatcttgggatggtttttgagaaaaaaggatcatctcgggatggctaggatacactccagtccagaaaatttcatgaatgtttcgctcccttaacattttcccacttcccaaatcccaagagcttcattaatagtgtatgtaaactgcatgtgatttaccatagtcactcccaccatctataggcttgtctaatcctgtctgttttgttagagggatggcgctatgatatattttgagttcttattaactcagttacttacatgttcggaaggaatggtggaacagtgttgttcagaatatttgatgtaaatattgatccccaaaaccactttattagacaacaacaaacttctcatgttgtaacattgagcttaacttctgcaaccaatcctgctagaattaacagaacattacagaagaaataagttcatttctgttttttttattattttctgataatatgtcacttttccagctaaaggagtatcctgtcggggcttgtagactcaagctctctttccttgatctatcaaacaactcattatctggtctgcctgctgaactaggttggtttttctgctgtgcaatgctcctctcgatgatgccacttttgttattttcctatttggttagctgaaattttatgatatgaaatgattgcatgcatctctatgtgttggatagatcatagggctgattctttttttccatggggtatctgctttgaaaacttagcatgctctatgcaagtgtgctactatcttaatgaactttcgaaactatggacactcacatatgcttcggcatgctatattcaaggtactatgacaaccctaagaaagcttctgcttactggtaatcctatgaggacacttcggaggtatgatgcccatgccattgtcctagtttttcacaaagaggttgtcaggattctaaacagaactgccaacataataatacagtgttccattttggttaccagttccttggtttctggaccaacaacagcattattaaagtatctgcgcagtcggctttcatctgatgaaggaggtaaccaaaaacacaaaatcaatatccatgcattttattgttcataatgatgtatttgtagtgcacattatctgcttcaagctttgccacgtctcctgttttttttctgatttgagaaccattatccatgatcactcgaaagctcaacatatttcctgtgcagcatcaggatctggaagcactccaacaaaagatgatcaaattgctgcagcaagaagattgtctttatcttctaaggtactttaattatttcgacagcatatttgtatatcataagatagatctctttttatgtcttttttaaaaggagctaattcacccacatgtggtatttgccattcatggattgtctcattcatgccaaaagagtaactgatttgtgtgtttctatctgccatgtttcctgtatttttacaaaaacttgtcgactttttcaatgtattctcatgactaccaatgcaagaataaaatatcttggtcattggatcttatggagcctcatggaataaccaatgatcgtttcattttttccacaatagcccctaacttggtgcaatatcaggaactggacttgagtggtcttggtgtgaccagtgtaccacctgcagcttgggagacaaatgatgtgatgaaactagatctttctaagaattcaatagaagatctgccaaacgagttgtcattatgctcgtcacttcaagtgagtttctgaattacagatataatattgatgttgttatacttcaattgatcaattccattgtatgtgtgagataaaagtgtttcgatataactccttactctttttaatctaccatttttttcagtctttgattttgtctaacaacaaaattaaaaggtggcctggcaccgtattctcctcccttgccagcctttctttgttaaagctagacaacaatcctttggcagaggtaatgtcatggtcttcatatcttttcttttgcaaatttcttggtattggatcatgattccctgatgggttaatctctggaagttaatcaacgttgattattgaaattgaagaagttgatggtttagctgttacaacacttagaagaattgaactacagggtgcagaggcaacatggataaagacttgacataattataagccatctagcctattatgtttagacacaagtcattttacatttttttagggattgtcacattgtttctttcttagctttaataccatgtttacagttaatgttttctcatgtgccaagacatcttagacaagattttttttttttggggggggggggggtgggtgtgtgggggtaatgtgctgcatgtatttcttgttcctactttcaagagttggaatgacacattaccaaaagagtgattatttatatatagctgacatacttcgaatctgcatgctaatctgtgatattgtaacacacttgtttttcctgcagatattggctactgatcttgaggccctgtctaaacttgaagtactagatttaagtggcagtgcttcttctctacctgaaccctctgcggtttcgaaattacctcacctaaaggaactctacctaaggttgtaacatatgcaaaacatctaagctatggagtgttctatggaagcttatttatttttctctatatatgagcagacgaatgaaactccatggatttcctgatagtttattgggcttaaaactgctgcgaattcttgatctgagtcagaattatcttacatctgtgccagaggtaaacacttggttctctatttaaggaatatgattttccccctctttctataaatgcttttcacattcccaggtgcatttagaaagttttgaatggcacgtgcgccctttttatttgcttatgcaaaatccgttgcacttacacagggtatcaaagatttaacttctttgattgagcttgatctgtcggacaacaatataacaacactcccacctgagctggtaagttattggctttaatgatgatgtatcggatgcaccgacatcaactgaaagtactgttttgaagttgtacgattctcaaactcactgaaatctctaatcttcttgtggacactattttgagcagggtttgcttgagcctaacctgcaagtcttgaaacttgatggaaatcccctcaggaggtaagaagtaggaacaaattgttgagcccattgcatgcatgcatacattgaaatagaaacccaactcacatggaaccatgtagacctgtgctgctaccgattttatatcgtgcataaccataggattctgcagtgctcaccatataattcggaactacatgtgaaagaacattaaaatggaaaccatcgtaatgccataattttctcagggcatatttagaatatgaaagggaaaaaaaaaagaaagttgcagttcagacatgcaccggcagaaaaatcactgaacttcctgttgatttcgtctgcagcatacggcggactctgctggagcgaggaacgaaagcaattctgaagtatctcaaagaaaagctacctgctgaataaattctggtgggaattaatgtatgctgcatgatgtttattgatcagttcggccctctcgaactgcagttaccttttcctggagtccatttatccccaaattgttttttccttgattgatgtaatttttgcttggctatcttcttggtgatcgttatcattctcctcattttatccgcggattgctgtcacactgaaagcttctcagcttgtgtataaccaaccttgtatgcagtatacagcagatcagaattcggttatgttgtagtattttgacactggaagtcccgcacgtgtgaaaaaaaatctgccgccacaagtgaaactttgtttcttgcc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os02g0826600, RefSeq:Os02g0826600