Os01g0132100
| Gene Name |
Os01g0132100 |
|---|---|
| Description |
Leucine rich repeat, N-terminal domain containing protein |
| Version |
NM_001048465.1 GI:115434343 GeneID:4325795 |
| Length |
3911 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0132100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:1764034..1767944 |
| Sequence Coding Region |
1764034..1767601,1767934..1767944 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:1764034..1767944 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggctttcatagtttgggcactactactcttccttttacatcttcccacaatagcgaccggatccagtgcccactttggcggtaacaacactgttaggtgccatccaaaccaggctgcagcgctcctccagctaaagcaatctttcttctgggttaattctccggtcatccttccgacatggcaagatggaaccgattgttgtacctgggagggagttggctgcgatgcttcttctcatcttgtcacggtacttgatctcagtgggcggggcatgtacagtgatagttttgaacctgcactcttcagtctcacatccctacaacgcctagaccttagcatgaattccttgggtaccagcagtaccaccaaagatgctgaattcgataggctcacttcgctcacccacctcaacctctccaattcgggcttggatggtcagatacctatgggcatcaacaaactcattaaccttgtgtccttggacctttccaagcgctatgttaacgataacagtgatatctcttttaatgagagtgatgatgagattatctttacaggtgacagttataatcatctgcaggaatccaggttaatgtccctagtagaaaacctaagcaatttgaaagagctctacctcgaccatgtggatatgtctacaaatgtagatgactggtgcaaaacccttgctcaatcagttcctcgtcttcaggtacttagtttagatggttgctctctcaacactcctattcatcactcccttttgaggctccattctctcacagtgataaatcttcagtccaaccctggtatagctgtcaatctatttccagatttcttcatgggtttcgccaatttaactgtgctccgactttctcataataatctcgaagggtggtttcctgacaaattcttccaactgaaaaatctaagaatcctcgatttgtcctttaatatgaatctgttagggcatttgccaaaagttccaacctctttggagacattgagactagaggggaccaacttttcctatgctaaacgaatttcttctagcaatttcaatatgctgaaggagttgggtcttgaagggaaattaatttctaaggattttctcacgtcgtttggtttgatctggtctttatgccatctagaactccttaattcggaattgttaggagattcaggatccaatttgttgtcatggataggggcccacaagaacttgacatgcttgatactatctgagtttgacttctctagcacaaagccttcatccattagtaacttcaagaatttgagaagcttgtggttgtttggctgtaacctcactaggccaataatgtctgcaattggtgatctcgtggacttgcaaagcttggatatgtcaaactgcaatacatacagttcaatgccatcttcaataggcaatctcacaaatttaaaaagcttgtatatcaacagccctgggtttttagggccaatgccggctgcaattggcaacctcaaaagcttgaagagcatggtattctcaaattgtgaatttactgggccaatgccatccacaattggcaatctcactaagttgcagaccttggaaattgcagcttgtcggttttctggaccaataccttattcaattggacaacttaaggaattgagggcgttatttattgaagggtgcaatatgtctggtagaataccaaattcaattgtcaacatgagcaaactgatatatttggggcttccagcaaattatctgagcggcaaaattccagcacggcttttcactcttccagcactactcttcttggatctttttggtaatcatttttctggtcctatacaagagtttgatgctgtgccttcatatctgatgagtttgcagttgaccagcaacgaattgacaggagagtttcccaagtcattctttgaactcactagtttaattgctctagaaatcgacttgaacaacttggcaggctctgtggatctttcatcttttaaaaggttaaaaaagctccgtgatttgaatctttcacacaataacttgtctgtcattatggatgacgaaggcgataactcttcatctacgtatctctctgaacttaaagagctaggacttgcatgttgcaatataactaaatttccaagtattttgactcgtctgagtgacatgtcttatttggacctttcttgcaataaaatcagtgggaacataccaaagtggatatgggagaaatggagcagtagcgtcgtgcatttaaatctctcccacaacatgctcaccagtatggaagttgcttcatatcttctcccttttaataggcactttgaaactttggatcttagttccaatatgcttcaaggacagattcctataccaaacttatcagctgaattcttggattattcacataatgcattctcttctattctgccaaacttcactttatatcttagtaaaacctggtatctcagcatgtccaagaataatataagtggaaatataccacattctatttgcaattcaagcctgctggtacttaacctggcgcataacaactttagtgggccatttccgtcctgcctaatggaacaaacgtacttcagaaacatattaaatttgaggggaaatcactttgaagggatgttacctaccaatgttacaagatgtgctttccagacaatagatttaaatgggaataagattgaaggtcggcttccaagggcactaggtaactgcacatatttggaagtccttgacttgggaaataataaaattgccgacacttttccatcttggctaggaagtctttccaatcttcgtgtccttgtcttgagatcaaaccggttgtacggttctataggttatacgtttgaggacaaatctggagatcacttcccaaacttgcaaatcattgatttggcctcaaacaacttcactggcagtttgcatccgcaatggtttgaaaagtttatatctatgaagaagtacaataatacaggagaaactatcagccatcgtcatagcatatcagatggattttaccaagatactgtcacaatctcatgcaaagggttctctatgacttttgaaaggatcttaactaccttgacagcaatcgacttatctgataatgcattggaaggaagcattcctgagtcggtcggaaaacttgtttcactacatgtgctaaacctgtcacataatgccttcagtggaagaattccaccccagattggcggcataactgctctggagtcactggacctgtcttcgaattggatttcaggggagattcctcaagagcttactaacctgacatttctaaccgtcttgaacctgagcaataaccaattggagggaaagataccagagtcacgtcaatttgcaacatttgaaaacagttcatatgaaggcaacgcaggactttgtggagacccattgcctaaatgtgccagttggagtcctccaagtgctgaaccacatgtagagagctcctctgagcatgtcgatattgtgatgtttctctttgttggcgtgggctttggagttggatttgcagtagctgtccagtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAFIVWALLLFLLHLPTIATGSSAHFGGNNTVRCHPNQAAALLQ LKQSFFWVNSPVILPTWQDGTDCCTWEGVGCDASSHLVTVLDLSGRGMYSDSFEPALF SLTSLQRLDLSMNSLGTSSTTKDAEFDRLTSLTHLNLSNSGLDGQIPMGINKLINLVS LDLSKRYVNDNSDISFNESDDEIIFTGDSYNHLQESRLMSLVENLSNLKELYLDHVDM STNVDDWCKTLAQSVPRLQVLSLDGCSLNTPIHHSLLRLHSLTVINLQSNPGIAVNLF PDFFMGFANLTVLRLSHNNLEGWFPDKFFQLKNLRILDLSFNMNLLGHLPKVPTSLET LRLEGTNFSYAKRISSSNFNMLKELGLEGKLISKDFLTSFGLIWSLCHLELLNSELLG DSGSNLLSWIGAHKNLTCLILSEFDFSSTKPSSISNFKNLRSLWLFGCNLTRPIMSAI GDLVDLQSLDMSNCNTYSSMPSSIGNLTNLKSLYINSPGFLGPMPAAIGNLKSLKSMV FSNCEFTGPMPSTIGNLTKLQTLEIAACRFSGPIPYSIGQLKELRALFIEGCNMSGRI PNSIVNMSKLIYLGLPANYLSGKIPARLFTLPALLFLDLFGNHFSGPIQEFDAVPSYL MSLQLTSNELTGEFPKSFFELTSLIALEIDLNNLAGSVDLSSFKRLKKLRDLNLSHNN LSVIMDDEGDNSSSTYLSELKELGLACCNITKFPSILTRLSDMSYLDLSCNKISGNIP KWIWEKWSSSVVHLNLSHNMLTSMEVASYLLPFNRHFETLDLSSNMLQGQIPIPNLSA EFLDYSHNAFSSILPNFTLYLSKTWYLSMSKNNISGNIPHSICNSSLLVLNLAHNNFS GPFPSCLMEQTYFRNILNLRGNHFEGMLPTNVTRCAFQTIDLNGNKIEGRLPRALGNC TYLEVLDLGNNKIADTFPSWLGSLSNLRVLVLRSNRLYGSIGYTFEDKSGDHFPNLQI IDLASNNFTGSLHPQWFEKFISMKKYNNTGETISHRHSISDGFYQDTVTISCKGFSMT FERILTTLTAIDLSDNALEGSIPESVGKLVSLHVLNLSHNAFSGRIPPQIGGITALES LDLSSNWISGEIPQELTNLTFLTVLNLSNNQLEGKIPESRQFATFENSSYEGNAGLCG DPLPKCASWSPPSAEPHVESSSEHVDIVMFLFVGVGFGVGFAVAVQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..3568#3901..3911#atggctttcatagtttgggcactactactcttccttttacatcttcccacaatagcgaccggatccagtgcccactttggcggtaacaacactgttaggtgccatccaaaccaggctgcagcgctcctccagctaaagcaatctttcttctgggttaattctccggtcatccttccgacatggcaagatggaaccgattgttgtacctgggagggagttggctgcgatgcttcttctcatcttgtcacggtacttgatctcagtgggcggggcatgtacagtgatagttttgaacctgcactcttcagtctcacatccctacaacgcctagaccttagcatgaattccttgggtaccagcagtaccaccaaagatgctgaattcgataggctcacttcgctcacccacctcaacctctccaattcgggcttggatggtcagatacctatgggcatcaacaaactcattaaccttgtgtccttggacctttccaagcgctatgttaacgataacagtgatatctcttttaatgagagtgatgatgagattatctttacaggtgacagttataatcatctgcaggaatccaggttaatgtccctagtagaaaacctaagcaatttgaaagagctctacctcgaccatgtggatatgtctacaaatgtagatgactggtgcaaaacccttgctcaatcagttcctcgtcttcaggtacttagtttagatggttgctctctcaacactcctattcatcactcccttttgaggctccattctctcacagtgataaatcttcagtccaaccctggtatagctgtcaatctatttccagatttcttcatgggtttcgccaatttaactgtgctccgactttctcataataatctcgaagggtggtttcctgacaaattcttccaactgaaaaatctaagaatcctcgatttgtcctttaatatgaatctgttagggcatttgccaaaagttccaacctctttggagacattgagactagaggggaccaacttttcctatgctaaacgaatttcttctagcaatttcaatatgctgaaggagttgggtcttgaagggaaattaatttctaaggattttctcacgtcgtttggtttgatctggtctttatgccatctagaactccttaattcggaattgttaggagattcaggatccaatttgttgtcatggataggggcccacaagaacttgacatgcttgatactatctgagtttgacttctctagcacaaagccttcatccattagtaacttcaagaatttgagaagcttgtggttgtttggctgtaacctcactaggccaataatgtctgcaattggtgatctcgtggacttgcaaagcttggatatgtcaaactgcaatacatacagttcaatgccatcttcaataggcaatctcacaaatttaaaaagcttgtatatcaacagccctgggtttttagggccaatgccggctgcaattggcaacctcaaaagcttgaagagcatggtattctcaaattgtgaatttactgggccaatgccatccacaattggcaatctcactaagttgcagaccttggaaattgcagcttgtcggttttctggaccaataccttattcaattggacaacttaaggaattgagggcgttatttattgaagggtgcaatatgtctggtagaataccaaattcaattgtcaacatgagcaaactgatatatttggggcttccagcaaattatctgagcggcaaaattccagcacggcttttcactcttccagcactactcttcttggatctttttggtaatcatttttctggtcctatacaagagtttgatgctgtgccttcatatctgatgagtttgcagttgaccagcaacgaattgacaggagagtttcccaagtcattctttgaactcactagtttaattgctctagaaatcgacttgaacaacttggcaggctctgtggatctttcatcttttaaaaggttaaaaaagctccgtgatttgaatctttcacacaataacttgtctgtcattatggatgacgaaggcgataactcttcatctacgtatctctctgaacttaaagagctaggacttgcatgttgcaatataactaaatttccaagtattttgactcgtctgagtgacatgtcttatttggacctttcttgcaataaaatcagtgggaacataccaaagtggatatgggagaaatggagcagtagcgtcgtgcatttaaatctctcccacaacatgctcaccagtatggaagttgcttcatatcttctcccttttaataggcactttgaaactttggatcttagttccaatatgcttcaaggacagattcctataccaaacttatcagctgaattcttggattattcacataatgcattctcttctattctgccaaacttcactttatatcttagtaaaacctggtatctcagcatgtccaagaataatataagtggaaatataccacattctatttgcaattcaagcctgctggtacttaacctggcgcataacaactttagtgggccatttccgtcctgcctaatggaacaaacgtacttcagaaacatattaaatttgaggggaaatcactttgaagggatgttacctaccaatgttacaagatgtgctttccagacaatagatttaaatgggaataagattgaaggtcggcttccaagggcactaggtaactgcacatatttggaagtccttgacttgggaaataataaaattgccgacacttttccatcttggctaggaagtctttccaatcttcgtgtccttgtcttgagatcaaaccggttgtacggttctataggttatacgtttgaggacaaatctggagatcacttcccaaacttgcaaatcattgatttggcctcaaacaacttcactggcagtttgcatccgcaatggtttgaaaagtttatatctatgaagaagtacaataatacaggagaaactatcagccatcgtcatagcatatcagatggattttaccaagatactgtcacaatctcatgcaaagggttctctatgacttttgaaaggatcttaactaccttgacagcaatcgacttatctgataatgcattggaaggaagcattcctgagtcggtcggaaaacttgtttcactacatgtgctaaacctgtcacataatgccttcagtggaagaattccaccccagattggcggcataactgctctggagtcactggacctgtcttcgaattggatttcaggggagattcctcaagagcttactaacctgacatttctaaccgtcttgaacctgagcaataaccaattggagggaaagataccagagtcacgtcaatttgcaacatttgaaaacagttcatatgaaggcaacgcaggactttgtggagacccattgcctaaatgtgccagttggagtcctccaagtgctgaaccacatgtagagagctcctctgagcatgtcgatattgtgatgtttctctttgttggcgtgggctttggagttggatttgcagtaggtattctgatgaaaacgagttggattaacaggtggtttcactcggcggtcagccgccaacgaacttgacctgaatatatatgaggtgtagcagacggtttcactctctggtcaaacaacgacgaacctgacctgcatatacataaggtgcaatgcataaatgtgtagcttgatatctgtattttcattagttactacttataacacatggattcagttcttagtactaattacaccacctttagtagttggtatgcgtagtatgtctactcaggatgatacactctgctgtaagcttggaatcatttactggttttctctctttttcctcagctgtccagtga</dnaseqindica> |
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