Os01g0172000
| Gene Name |
Os01g0172000 |
|---|---|
| Description |
ALG3 family protein |
| Version |
NM_001185271.1 GI:297719676 GeneID:9266078 |
| Length |
3566 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0172000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:3704424..3707989 |
| Sequence Coding Region |
3705219..3705297,3705380..3705486,3705833..3705949,3706077..3706165,3706668..3706721 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:3704424..3707989 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgacgtttctccatgctgccatggttttgattatgtatcacaagtggtaccttggtctagtaattttcagtgcagctgtctccattaagatgaatgtgcttctttttgctccatcgttattactactgatgctgaaggccatgagcatcaaaggagtcttctttgctttattaggggctgcagcactacaggttttgttgggtatgccattcttgttatcacatccagttgagtacatctcacgagcattcaatcttgggcgtgtcttcatccatttctggtctgtaaattttaaatttgtccctgagaagttctttgtatcaaaagagctagctgttgcattgttggttcttcacctcactactcttttggtctttgcacactacaagtggcttaagcatgagggtggcttgttccatttcttgcattccagattcaaagatgccacatcaattggacagttaatttttgccaagcccaaactgtcaactcttaacaaagaacatattgtaacggtcatgtttgttggaaatttcattggcatcgtgtgcgcacgatcattacactaccaattttattcctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MTFLHAAMVLIMYHKWYLGLVIFSAAVSIKMNVLLFAPSLLLLM LKAMSIKGVFFALLGAAALQVLLGMPFLLSHPVEYISRAFNLGRVFIHFWSVNFKFVP EKFFVSKELAVALLVLHLTTLLVFAHYKWLKHEGGLFHFLHSRFKDATSIGQLIFAKP KLSTLNKEHIVTVMFVGNFIGIVCARSLHYQFYS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>2693..2771#2504..2610#2041..2157#1825..1913#1269..1322#1124..1190#949..1019#acctcgagctgcccggagcttggctgtggaggcggccatggcgcgggtgggcaagcacggcgagtcgtcgccgccgtccgaccgtaggccgctccacttcgcggcgttcctgctgctcgccgacgcggcgctcgtcgccctcatcgtcgtcttcgtcccgtgtgcgtaccagcatctttttcctccgctttcctcctagccatcgcagctcacctcacggtttcttgcgtgcttgcttcgattctgcagataccaagatcgactgggacgcgtacatggctcaggtatcatcagctcagatcgttggcgaatttcggctttgatttttggtcgctgctgatatagatgcgaactaatttgggtgcgagaaggtggacgcgtttgtggaaggggagagggattacaccaagatcgagggcgacacggggccgctcgtctacccggccggcttcctctacgtttactccgccatcaagcttctcaccgccggccaagtcttccccgcgcaggtcgccgattgtcttcttgtctgctctgttctttccttggctcctcgccttcttcatgtgctcagttgtgctaaattttgatgagttgttgcagattttgtttggtgtcctgtacattgtgaaccttagccttgttctgctgatgtacgtcaagactgaagtggtagggatgcctgtgttctctcctggtttgctcttagtttagcaatactcatctgatcactttgctagttcaagcaggacaatttgatcgaaccgcggaactattttgggttgtattaaacatcctccatgactgatgtgtgcctaatgttatttctgaacctccctgtttacccataatttttgacagcttccaaggtgggctttaggtttgctttgcttgtcaaagagggttcactccatctttgtgctccgccttttcaacgattgtttcgctatgacgtttctccatgctgccatggttttgattatgtatcacaagtggtaccttggtctagtaattttcaggtgattaccaacaatatgatactgcatccatgtgctttaagatatcattttcattaatacttatcaatttgctttagaacttgctgaaatcactcttcctccagtgcagctgtctccattaagatgaatgtgcttctttttgctccatcgttattactactgatgctgaaggtacaatcccctctagcttgttactggtatcttcttgtgatgccaatagctagcctaacttttttttttttggtacaggccatgagcatcaaaggagtcttctttgctttattaggggctgcagcactacaggtgcattgtgttttgcaaactcatattatcattattccgacttctaaaaatgctttgcttgttaagggctttcctagcgacatgcattactattcaggccatactatgcttggcagttccttcagagttattcttatctgataaatagattttgccaaagtaatgccgctaggtttaacaaaatggtatatctacctgtgctgcccctgcattacaagggcttaaattgccccttattagggctataggggtaatagaattttgggcagtttaattataataaattttctgatcaatgtaaattgataatgaatcatttttacaccagattgtatctatggcatagtcgacattttgcattaaaaggtggtggtggttgttttgaaactgtgatctaagaaaacatgaaaatgtttgtggtactttaatcagctagggagtgattagatgaatatgcagcatcacactattgatgctaatgcttcacgtttcctatctataggttttgttgggtatgccattcttgttatcacatccagttgagtacatctcacgagcattcaatcttgggcgtgtcttcatccatttctggtgcttataccatctttctctaatattgaagtttgaatcattctaagagtagcattatgactggttttctatatgaatatgtggcacaatacatattttatttttcctatacttcaatctttttcaggtctgtaaattttaaatttgtccctgagaagttctttgtatcaaaagagctagctgttgcattgttggttcttcacctcactactcttttggtctttgcacactacaagtggcttaagtaagtattcaggttgtctgtgatcgattgtattgatattattgtatgatctaggcttgcatccctatgtatgctcttatggaaaagcttgtaactctccaatgctagctttatgggccctttaaccagtgctccttatttacatttatatgttaagatggtccaatctgaacatgtcaattcatgctgtgtttgttcaagtattttctatcttcagaaaatttacatttttgtttaatttagtcgatgacagcataattggactactgctagcttcattttataatggttcactataaccatttggttggacaaatgcttgacattgttgtattcatgttgacaggcatgagggtggcttgttccatttcttgcattccagattcaaagatgccacatcaattggacagttaatttttgccaagcccaaactgtcaactcttaacaaagaacgtatgttggaacataaaactcgaaaaaagaatttctccaattcctttcctgaactaattagataaacacaatttccatccagatattgtaacggtcatgtttgttggaaatttcattggcatcgtgtgcgcacgatcattacactaccaattttattcctggtaagttcagttgagttcacttcagttctttttcaccctcactataagttctaaagagcaggtatttctgttaatgttttgatgtgaatgctgaaaatgcacttctttctgttcacgtttgcaggtacttctattcactgcctttccttttgtggaaaactcgttttccaacatttgtgaggtaacacgctactattgcatggtccttttccacttcagttggcatattcagaaccattttggcaaaccacttggatttattctcttatatcaccgccctttgttctctcagggtcattttatttcttgctgtggagctctgctggaatatctatccttccactgcctattcgtcactgctgttgctattcattcacatctccatcttgtttggcttatggagctcacctgcagagtacccctatgccaatggaaagaaatgaaaaaacagtatcgacaagcacggcacggcaatatcatacagttttaactttgagataggctttagttgtttcttcccttgttatacaggcaagatcaagaaggggtatggaaatctgaagttgtaattcaacacactgtatttttgatatgtcaatgctcttgctgtcagtaggctctagtttcctggatgatcatttcgtcctaccgaacatgtaccatagataacttgttaacaacatagcagctgctctggcaattctttgtacgtccattgagtaccattgatgttatcttgcagaatattctgaaaaataaaaatatatagacaggcccagatctctggcattgtgg</dnaseqindica> |
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