Os01g0200400
| Gene Name |
Os01g0200400 |
|---|---|
| Description |
Thioredoxin domain 2 containing protein |
| Version |
NM_001048851.1 GI:115435115 GeneID:4327349 |
| Length |
7204 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0200400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:5434423..5441626 |
| Sequence Coding Region |
5434753..5434754,5434839..5434896,5435878..5435978,5436124..5436209,5436625..5436695 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:5434423..5441626 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:5434423..5441626 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggaggttgcgacggcgacggaggcgtcggcgccggcggcgagcaggcggagccacccgttcccgtggctagacctggccatctccgagccctactacttcctccacctcgtcgccttcttctcctacttcgcggcccgcagcacggtgccctcggccgacgacggcctcctcctccgccgggagatccaggcggtgctcacgttcctcgtgctcttcgtcgtgaagatcgtgaaagaggaaaactgggaaacatgcattgctgattcactgctctatgctaagggattattgctggcagttactttggttatcgattattggctgactgtctcctacttactgggatttgttgttatatatgctgttgctcaacagccaccttatgatggtcttggtcattcaaatcatttgactccattgcaactggaaggcctactaacggaggagccaacaacacgattttggctggttgaattccggacttccttttcaggaacatgtatagaagcaagcagtgttctgcctgaactctctaacatatactctaacaagaacatttcgtttggaataattgatcttgggcattttccaaatgctgcagcaaagtttggaatatccatgtgggatcatcttcccacttatatactctttgacaaggccactgaagttgcacgattcccagaaatcatgaatgaatcaaaagtatttgtgccaaaaattacaaagaaacttctctgccagcacttcgaccttgacaggcgactgattgaatacctatctagatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEVATATEASAPAASRRSHPFPWLDLAISEPYYFLHLVAFFSYF AARSTVPSADDGLLLRREIQAVLTFLVLFVVKIVKEENWETCIADSLLYAKGLLLAVT LVIDYWLTVSYLLGFVVIYAVAQQPPYDGLGHSNHLTPLQLEGLLTEEPTTRFWLVEF RTSFSGTCIEASSVLPELSNIYSNKNISFGIIDLGHFPNAAAKFGISMWDHLPTYILF DKATEVARFPEIMNESKVFVPKITKKLLCQHFDLDRRLIEYLSR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6873..6874#6731..6788#5649..5749#5418..5503#4932..5002#4414..4487#3331..3372#2065..2134#1808..1864#363..407#48..230#gggcttttagttcaaactgacagcggagcggagaagcgtcggaggagatggaggttgcgacggcgacggaggcgtcggcgccggcggcgagcaggcggagccacccgttcccgtggctagacctggccatctccgagccctactacttcctccacctcgtcgccttcttctcctacttcgcggcccgcagcacggtgccctcggccgacgacggcctcctcctccgccgggtgagatactgagatgagataccggatctatttgcagtgtaaacgatccggatcgtgccgtttgggtggtgatcgaactatttcggctcatgtggatcggtggtggttggtgtgtttttttttctgctgcaggagatccaggcggtgctcacgttcctcgtgctcttcgtcgtgaaggtacgatcgttctcgtacggtgtttcgtgacgaatgcttgtcctgaatgttactttgctgagtactttacttgattgaggattctgaatctgctaatttgatttaggagtagggagataatgtgagaacaggagctgtgaagttatgatttgattgaacttgagtgtaatgtcattatgtgatgtgatgctaaaaggcggagatttagtgtattttcaattttgcatagggggaatcagtcaaattgtgagcataagtgaacaatgtcagattcgagtgaacccgaatgtaggttaaggttaggtgaaattgcttttaattttaccgccatgtgtatggctatggttagttgtttgatatttgcaagtgtaacaatggtgtcatgtgaagttgttatataagtaatttccatttgtgaaaattgcattgtccagttgacatgagagacaatgctgtgctgttcacttcgagctacttcccaatatattgtacatatgcaaagatgttcacacatgcattatctgtttcttagggcctgtttagttggtgaaatgaaaatttttgagtgtcacatcggacgtttgaccggatgtcggaaggggtttttggacaggaatgaaaaaactaatttcataactcgcctggaaactgcgagacgaatcttttgagcctaattaagccgtcattagcatatgtgggttactgtagcacttatggctaatcatggacattaggctcaaaagattcgtctcgcgatttacatgcaaactgtgcaattagtttttctttttatctatatttaatgcttcatacatgtgtccaaagattcgatgtgatgtttttgcgaaaagtttttggggaactaaacagggccttagtggagttggatttttttggggtgaaagataaacattgtaaaagaagataacattagcatgctatcggaacaattctttggtttggttcataagaaaatggtatttgtagataacaaaaataacgcttgtatcatttggactatcaggttttttagctttagcttgtgtaagagaaaattaagattacatgttaattacgagagtttttccaaagtggagagtgggaggagagttgtacttttgagctctcaatgcacttcctttaacttatgtagaaaaaataaatcacatcgaagtcctcaagatgcttgcctttttgagaaaagatatttgccctttttctgtgttagaagataattaaattgtatgtcagttatctgttttttttacaaagtggatggtgagagtgatgattgtagttttaatccctcaaatgtgcccccttgtacttatctggcaaattagctgagtaaaatctcttgtagattatatttctgaatcaaattattcaatgttctgcagatcgtgaaagaggaaaactgggaaacatgcattgctgattcactgctctatgctaaggtgcattgatacagaatgattctgacctctcatcccatgattcattgatgcgaaatgatcaacttgatttccggtttgatatctaatagcatgcaaaagtagggggaaagtggaatactagaatcattgtagtttattctacaattaacattgcagagtgttgtaaatcttcctttaatttttcttattttgatctgtagggattattgctggcagttactttggttatcgattattggctgactgtctcctacttactgggatttgttggtatgaattttttttttgcgatattattgcgtaatgagtaatacctgtttctgaagtgcaatgaaaatatttgatggatttggtaccctccttgactataaatttacctttcacgtgttgcaggaacttaaaaggatactctattcctatttaagttcctgtagtgtacattctatatttgcccttttattcaagatgtacattcatgttaatgaaatgctgcaatctcctattgtctcttaattatatggtactgtataatgttctctggcatatttagttggagcaatcatgtatcagtctcttggtttgattgatgaaactattataccctgtcctgcttagccaagttagtctatccattagaatatggaacctgtataccagatttttcatgcttatgcccaaggacaactcatcagagagcgtaggtgtgcgtttaccctggctgttgaacacccttctcagttttatagaatgaagaaactggttagattgtgtcaaatgttagattaaacctgtggaatttcatcccaaaaaagtgctcacaacatttcctaccttattgccaaggagtgtaagctgcaatacaattttggcccaattctgtgagtaaattatccatctttttcttcatgcatagcccaattttaacatgaaggaccacaaaagcactgcccctggtttatctttgtaagcaggatgagaacaacttgtttagcttgctctctcatactctgataacaaatttgaggtgtagcctatctgtcgcctcctgttcccctatcagtgattgcaattgattccaattgttgtagtgtagcgatgctgatgctagtgattgtgcagtaaatctgtgattcagtaatctggttttacagtcactacagcacaatatcaagtgtatgtttttgtcatatgggtcctatgctagtcatagtagcaattggcaaacacattaatactgcccatgatagattatccaatatgggacacagtgatagtggattgactacttcctctctttcttttcctggtttctgtcagtttggaggtttcttaattttctcatttgagttttcagctgtatttgaattatattattattccatgtccaaaaacaagtgattttcttttccctaaaaagtatcttttgaaattttcataacgaaagcttatactgttttcttctgcagttatatatgctgttgctcaacagccaccttatgatggtcttggtatgttttatacacctattttttaatcacgaaattccatgcagtattatctcctggcattaccatgttcatgagcacatctaattattctccagcagacaacagttgaaaaatgtattctgatgggcgatcgtgatggcttttaacttgtattagtatattttccctgctacctgcttcactggtttgctattttgctaattgatttgagtaaaattaagttgatataatctgtagctaactagtaaaggttgctattgacttttgaaaccgatacaaggggtgggattgcaaattgctaattataattgtgttgtgctgaaaatgcttttcttcccagctgtctctgaacatgaaatacttgattgagggcagaactgacttgaccattatctctattctttttgtgataagccttttttataagcaaagagccaaagccaattgaaactcaactgaaattggtgtgacttgtctaccacatggaataaaaggcctttagtctataatctcgatggttctaaaagctttgcttatttgggatgaccagtattgcaaacacaaggacaacatatttatgatgttttaaagcaaagtcatgagttttcaactccattaaatagaataaattataatcacagactggcttctagttcaatatcagtattcattttctatttgaatatactcatgcatagggaattagggatgcaagtttgcctacttatgggtaccggtaccccatgacccacactattctattagaaatgtgttttccctcccactttctagttcattattaggtggaaaaattgtaaggaaaatgaactactgttagtcgatgggtaccccataggtcaacccattcgtatccctattcatgcattcatttaacttcttaaataaaatgaaattactggattgcttttgttctattgattagaagtattaaattaactttcctcgttttcgattctaaattgaaaaatcacagcagtttcctcttaagttggattgaaggcattctttttttttatctaggtcattcaaatcatttgactccattgcaactggaaggcctactaacggaggagccaacaacacgattttggctggtaatttgtttcacatcatatttttccttttctcaattaccagtaagaattttattcatgctttgccttttcattttgtgtgagatatctggcgaggtaactaaggttgcattcgttaccgggagttcccaactcactcctctcgttttccgtgcgcacgcttttcaaactgctaaatggtgcgttttttgcaaaaagtttttgtatgaaagttgcttaaaaaaatcatattgatctattttggaaaaaaattgctaatacttaattaatcatgcgctaatggaccgctccgttttccgtgcgcagcagctgtgttgggaacacaaagtaacgaacgcagcctaagcttgaaatatctcccactcctatttattttgttactgcctcaattgagtaatgcaagtggaccaaacagaatttgctcatttttttaattttgaacaggttgaattccggacttccttttcaggaacatgtatagaagcaagcagtgttctgcctgaactctctaacatgcaagtatttctgtttgttggttgtttactcctatgtcaagcttgtgcatctctaattctctatgctactatttgtactaaaagaagtcctccaacaaaattgtactttggccctttgctgcaataaactaataaatctctattatcatttggcattaacactatattctgttccgagagcctgagacttatctgtaagcatgaaatgttcatgacattttttttttacttttcagtctcactctatttacattacatttatcatagcattccttcttttactgataatgacgctagtgctttcccagtcaatgtctgataattagttaataatcttcaaagtacctttttttgtcctgagtatagtatatttcatacttttttatgtaatcttgttcacactttattaatgcagatactctaacaagaacatttcgtttggaataattgatcttgggcattttccaaatgctgcagcaaagtttggaatatccatgtggggtaaatttctagtcttattctgtgcagtattgctcttctcaacttgatatggagtgcctgcatttctttactgtattgtgttcagaattttgtgtctgtttctttcaaaatggttccttattctcatttgaatttcgtttggcagatcatcttcccacttatatactctttgacaaggccactgaagttgcacgattcccagaaatcatgaatgaatcaaaagtatttgtgccaaaaattacaaaggttgtttttttcccactgtgctttcttatttttgttatgagttatgaacaaaataagttgcatcatgtttgcatcttatttcgggtagactagtatgatttggcacagttttgcaattttaacctaccctgttgcagaagatttaacattactagtaccatatgattacttacacatataagcaaattaggcctatgcttaaactctcagcatcaaaccaacataaatataattcctcaaaagtaatctagatgctgtctatggtgtgttgcatcaccctttaaatttgaagttcaaattcaaagtatgatgctagtacttactagtaacaaatgtgataaattctacagaaagtaacaaatggaactgaacttgaaatgttataataagtagggtaatttatatgcgcatccacattttcttctcatttcatttcatttctttatgtgtgcatactggggcagggcgggaggcagcttttgcactaaatatacttttcatacggccaattattccagttgaaggggaaataggaaaccattgttcctgaaaagaaatgaaagaagacacacataggagattagctagtgtgacaggataatggtgcttagagaaacatatctcccacttattgaaatgggtggaaccgataaaaataaaatgaaatggccagcctaaaaaaaggtgcgagagaggatcatatgcagtacagtatgacaacacagttcctttttggtttggccaaaacatccaggttggttacctggcactgtacttcaatcgaaatagtgagaactgacgtgacaaatttattgaagccaccaatgatagaattcctgaaacatcagttagctatcgagtcgtcctcaataacctaagtgtgaaaaattgactgtatcaagtactgctgatgtggtccaattttgtggtattgctttttgtgggggattgttaatattattcttataacttctcttacagaaacttctctgccagcacttcgaccttgacaggcgactgattgaatacctatctagatgtaagtcagccagagattactttcactgtctttttctcttcaccatcaatagaacacctgttaactgaatgcatactgtcgcaggacccatcatctatcccagctgtctcaaaaagaaagcgccaattcccttttgtcgacgaaccagatgaatgaaccggacagttgtgcggcagcaatcacttcagggggtatcttcaagcttgttttattctatgagtttacttgtacccatccaatcaaggacagtatactttagggtagggtgggggtgggcaggattatgatttgcatcttactaccatatgtcacctcttgaattacggaatgttaccacacctgtggagatcttgcaatgatatgccaactatgttttccactgcagttagtgatcaattcagacaccattcgtttcc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
