Os10g0473400
| Gene Name |
Os10g0473400 |
|---|---|
| Description |
Protein of unknown function DUF608 domain containing protein |
| Version |
NM_001071368.1 GI:115482479 GeneID:4348876 |
| Length |
8151 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os10g0473400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:18041759..18049909 |
| Sequence Coding Region |
18042151..18042409,18042647..18043928,18044085..18044146,18044286..18044358,18044576..18044643 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008403:18041759..18049909 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008403:18041759..18049909 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggtgagcggcaacctcttccactgccggaggaactcgtggccggccgaggagtacgtcggccgaaccgccctgcagttgttggacttcgacggcgggtcgcctccggagcaggcatggcggcggcgtctgaacagccacgccaacttactcaaggaattcagcgtcaccttcatggaagcaatgaggatgatgagccttggcctgaggctatggtcgtatgtccgagaggaggcttctcatggaaggaaagctccaattgatccgtttaccaaagagaaatgtaagccgtctgcttcgcagggcgtaccgcttggtgggatggggagtggtagcatttcaagaggtttcaggggagagttcaagaattggcatatcattcctggtttatgtgagacttccccggtcatggagaaccagttttcaatatttgtatctcgcgatggggggaacaaaaagtactcatcggtattgtctcccggacaccatgaaggtttaaagaaatgtaatgactctggaatttcttcatgggactggaacttgagcggtcaacattctacctatcatgctttatttcctagggcatggactgtttatgatggtgaaccggatccagaccttaaaatctcatgtcgtcagatatcaccattcattcctcatgattacaaagatagcagcctcccaacttctgtctttgtgtacactctagtgaacactgggaaagaccgtgcgaaagtgagcctgttaatgacatgggcgaattctatcggaggtttttctcatcactctggaggccattttaatgagcccttcattgcggaggatggagtttcaggagttcttctgcatcacaaaacagcaaaggataatcctccggttacttttgctattgctgcctgtgaaactcagaatgtgaatgtgacagtcttgcctgtatttggcctctctggagaaggccatgattcagccaagcaaatgtgggatagaatgaaacagaacggccactttgaccgtgaaaatttcgaagctggtaccagtatgccttcatcttcaggggagacactttgtgcagctgtctcagcatcaacctgggtagagccacatggtagatgtactgttgtatttggtttggcttggtcctctcctaaaataaagtttcagaagggctgcacatacaacaggaggtacactgaattttatggaacttctgaaagatcagctgttaatttggtacacgatgccttgacaaaatataggatttgggaagaggagattgagaagtggcaaaaccccatactcaagaatgaaaaacttccagaatggtacaagttcacactttttaatgagctttactttctggtagctgggggtactgtttggacagatggccaaccaccagttatcgatgaaaaaccaagtcctggttctaatcaacagaaatcttcaaaaaggggcactagagacactaaacaggaatcagttaaagataaccatgtcaaactgacagcagagcaagtcactaatggtggtgacctggctaatggcgaagagcaaagtgtgtcaaagtatgcagcagtacatggaccacaaatggctaaggcaaccaacggacttgggtcacaagagccaattccatacttgctttccaagaatggccctgaaaatgttggcaaatttttgtacctggaaggagtggaatacatcatgtggtgcacctatgatgtgcatttctatgcttcttttgctctgcttgatctgtttcccaaaatagagttgagtatccaacgtgattttgccaatgctgttctctatgaagacagacgaagaatgaaatttttggctgatggtacttctggaattcgcaaggtcaaaggtgccgttccgcatgacctaggaacacatgatccatggcatgaaatgaatgcgtacaacatacatgatacaagcaaatggaaagatctaaatccaaagtttgtgctccaggtatacagagacttcgctgctacaggtgatatgtcatttggtagagatgtttggcctgccgtctgtgcagtgatggactatatgaatcaatttgaccgtgacggtgatggtctcattgagaatgatgggtttcctgatcaaacctatgatgcttggactgtacacggaattagtgcttactgtggcggtctctggcttgctgcacttcaggctgcagctacaatggctcatcggcttggtgatcggccatttgctgaaaaatacaagctcaaattcatacaagcgaaagcagtatatgaggctaagttatggaatgggtcttacttcaattatgacagtggcacaagcagtaatagccgatctattcaggcggatcagctggcagggcagtggtatgctgcttcttcaggcttgcccccgcttttcgatgagaataaaataagaagtgctctgcagaaaatatttgaattcaatgtaatgaaggttaaaggaggacgattgggagctgtaaatggtatgactcctaatgggaaagtggatgagacatgcatgcaatctcgggaaatctggaccggtgttacatacggtgttgctgcaaacatgctgctccatggaatggagcatcaaggattcaccactgccgaaggaatttttattgctggttggtcagaagaaggatatgggtattggttccaaacaccggaaggctggaccatagacgggcactacaggtcgctcatctacatgcggcctctcgccatttgggcaatgcaatgggcacgttctccacccaaggcaatccttgatgcccccaaggtaaacctgatggacaggatacacctatccccacaaatgatccgggcaatgaacgagattaatgttagaaagatagcacccgacaatagatgtttccctagctctgcatttcgttgtgaatgctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MVSGNLFHCRRNSWPAEEYVGRTALQLLDFDGGSPPEQAWRRRL NSHANLLKEFSVTFMEAMRMMSLGLRLWSYVREEASHGRKAPIDPFTKEKCKPSASQG VPLGGMGSGSISRGFRGEFKNWHIIPGLCETSPVMENQFSIFVSRDGGNKKYSSVLSP GHHEGLKKCNDSGISSWDWNLSGQHSTYHALFPRAWTVYDGEPDPDLKISCRQISPFI PHDYKDSSLPTSVFVYTLVNTGKDRAKVSLLMTWANSIGGFSHHSGGHFNEPFIAEDG VSGVLLHHKTAKDNPPVTFAIAACETQNVNVTVLPVFGLSGEGHDSAKQMWDRMKQNG HFDRENFEAGTSMPSSSGETLCAAVSASTWVEPHGRCTVVFGLAWSSPKIKFQKGCTY NRRYTEFYGTSERSAVNLVHDALTKYRIWEEEIEKWQNPILKNEKLPEWYKFTLFNEL YFLVAGGTVWTDGQPPVIDEKPSPGSNQQKSSKRGTRDTKQESVKDNHVKLTAEQVTN GGDLANGEEQSVSKYAAVHGPQMAKATNGLGSQEPIPYLLSKNGPENVGKFLYLEGVE YIMWCTYDVHFYASFALLDLFPKIELSIQRDFANAVLYEDRRRMKFLADGTSGIRKVK GAVPHDLGTHDPWHEMNAYNIHDTSKWKDLNPKFVLQVYRDFAATGDMSFGRDVWPAV CAVMDYMNQFDRDGDGLIENDGFPDQTYDAWTVHGISAYCGGLWLAALQAAATMAHRL GDRPFAEKYKLKFIQAKAVYEAKLWNGSYFNYDSGTSSNSRSIQADQLAGQWYAASSG LPPLFDENKIRSALQKIFEFNVMKVKGGRLGAVNGMTPNGKVDETCMQSREIWTGVTY GVAANMLLHGMEHQGFTTAEGIFIAGWSEEGYGYWFQTPEGWTIDGHYRSLIYMRPLA IWAMQWARSPPKAILDAPKVNLMDRIHLSPQMIRAMNEINVRKIAPDNRCFPSSAFRC EC</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>7501..7759#5982..7263#5764..5825#5552..5624#5267..5334#4526..4710#4281..4422#4152..4190#4013..4068#3677..3730#2951..3054#2621..2721#1943..2016#1173..1272#989..1065#802..858#565..675#399..479#gcggcttcgcctcgcctcgcttcgcttcgcttcgcttcggagtccagcctcctcctccgctgacctcctcgcggtcttctcgtctccgcgtggagcaactgcctcccgcggcggcgcgcgcgggtgggtggagactggagagtcctctccgcgagaggctgcccgcttcggtttggttttgatctggtttggttgaatcgatcgagaggtggggaggggaggggagcagagggcggcatcggatcggaggagggcgcgatgaggaggaggggcggcgctgggggatcggatccgcgcgcatgattgcggcgcggcgcgggaggggatttgttcgtggatcgtgcctccgatcggcgggagttggatcgggggcgtggtggcattgggggtgagacgggatggtgagcggcaacctcttccactgccggaggaactcgtggccggccgaggagtacgtcggccgaaccgccctgcagttggtgagtccaatttcttgttccttttgggcttgtgcttcctgtgggcgcgtgtttgattttgctggggatgctttggatttcgcagttggacttcgacggcgggtcgcctccggagcaggcatggcggcggcgtctgaacagccacgccaacttactcaaggaattcagcgtcaccttcatggaagcaatgaggatggtatgttacaacgcttggttctctgcatgttgttcaagcagtttgatttctgtaacacctgcgtcgtttcctttttaatgctgctatctgctaatcatttgttttttggaatgtgaaaaatttcagatgagccttggcctgaggctatggtcgtatgtccgagaggaggcttctcatggaagggtaccatcggctgttcttatgctatttatatttcattacttaatggaatttccttttatctaaaattataccaaacatctatgaatataaattgtgtgtggtgataaaatggggtctgctatgcttgcagaaagctccaattgatccgtttaccaaagagaaatgtaagccgtctgcttcgcagggcgtaccgcttggtgggatggggtgtgtccgcctgaattgatgttttaacctccaataatctcatgtttatgcttgtctatttgcactatggatgctgtaattttgataccaatacactggttttgcaggagtggtagcatttcaagaggtttcaggggagagttcaagaattggcatatcattcctggtttatgtgagacttccccggtcatggagaaccagttttcagtaatgctttcttcttctttctgctgttgctggttaatcaacttggtttatggtgatgcataattgaatttttggaccattagctagcttatctgaaggattttcttctgactgctgaaaatgctcctagcccctcactagtcactagtattatttttggggaaagtcttatgacatctacccttcactggtgtctcacatactcatattatggcaattcactaaatatgcgtcaaaaagaatcttttaagtgctatctttgttgttgcggctgtgctcaagtgtgaaatcaactgttgagtggagtgtttttggggacttttgttgagataaaaaggcacgactgtttccactgtttaatgtttgtggatggacgagttccatctgctgcttgtgacactttttgatgagtgttgtaatcagttagcaagttcttgtcaattcgccagctattacacacttatttttcctatcgatgtatataaacttccatggatgtgggccacccaatcaagcccatcaggggctccatacaagatttatgacagcaactgtttataaaatcttgaatcttttgacttagtactcccgagtcactatgcttgtttattttttttctcacaactaaggtgagagtcttgaactgacacatagtaccctgctgttctagatatttgtatctcgcgatggggggaacaaaaagtactcatcggtattgtctcccggacaccatgaaggtttaaagtaagtttcttcatttatattgcaaataacagtctttctttagtttatccaaatttactaagtctgagcttctgagctcgtcattctgcaatcctgtatcttgcacaagggtaagcttcaacaagtagatttgtaattttgcattgcttttctgaagttaaaacttgcagaagttctttattgttgattgaatggtattcacagccaattgtatagtgcatacattgttaccttgtatttgttcttctgatgtgccttgtttcccatatagtatgtggccttttgaaatgcagatccactttgcatactttatataagtgacttgcgcttcaattttaattttaatttgtgattcaaaagccaacggcgctgtgcgtagaaatttatttcaaatatcgacttgcatattatatagcagagagagtgtgagatatataccaaattctttcttgtacatttgtgactcaagagtcaaacatcgctgtgcataatgtgaacagaattctagtttattgtacctatatatatgttgcaatcacgcttcagttatgactcaacaaatttgatatagagtgcacttgtttgatgccttacctgatttcaggaaatgtaatgactctggaatttcttcatgggactggaacttgagcggtcaacattctacctatcatgctttatttcctagggcatggactgtttatgatggtatgccatcatggagctgtggaacattgcttgcatcttgtgatggcacaaacacttctcttttctaccaagagatggatatgctttatgccaagccagcttatatgttgattacataattaattttcaatactattatatggagttatgaacttgatggatatctttttttagtagcagtagacatgttttgaacttaagaatcttatgaatttttccgtgtattcaggtgaaccggatccagaccttaaaatctcatgtcgtcagatatcaccattcattcctcatgattacaaagatagcagcctcccaacttctgtctttgtgtacactgtaagtgactcataaagttagttttatgctaggctggcaggttcttcagctggtatatttccctcatctttttttatttcatatttcctgataagtatattcctttagataatatcatggaatatacatgtggatcggtgttgataacagttgggattaggtttgtggaactaggggattaaccatgtctcgctctaattcttgcttgaatctgatactggttcaataacatttatattaagaaatatgttctggcaacttcagccaagatattccacatgtaacagttctgacatggatcataaggtagagagagccctgcctttttatgtcgacaggagaattttaacatggtcactgttaaaataatattgttggtgcgaacatatatgtcaaaacatttcagaatacagttatatagaaaaatgtttaattacagtgattgttcttagatcatgggacatgctgtttacttgaggagttactgattaatgaatattctactgaattgaatgttcccattaagttttcatatgtatttacatgaagagatgctcttaatcttctcaacctgatgaaattacatgaccatccttccttttgttttctgtgtttattatagctagtgaacactgggaaagaccgtgcgaaagtgagcctgttaatgacatgggcggtaaggacatctaaatcttctgtaacaatatattttctgcatctatcagtatatcaccatttatgtttacttatgcattactgtgctttagactttgtggctcacataagtttttatagtttatatatactagtgcaacaatagtaccatgatggcaaaacacccatgaaaaatgttggacattttcattagtataactctcatccttacttgatatttacttgaaaaattattgttgctgcttcaagtgcctaattaatgattttctctcattaaacgcagaattctatcggaggtttttctcatcactctggaggccattttaatgagcccttcatgtaagtaatttgtagatattttttatacctgttcatacttttagatcagtggtgctcatggcttgatttcataacatggtcagtgcggaggatggagtttcaggagttcttctgcatcacaagcaagtgtcaaaccaaaccttctcccttgttccacatattcttgcatcatgtgttgcctgcacgagctaacagactagcatttgttgcagaacagcaaaggataatcctccggttacttttgctattgctgcctgtgaaactcagaatgtgaatgtgacagtcttgcctgtatttggcctctctggagaaggccatgattcagccaagcaaatgtgggatagaatgaaacaggtgatcgatggcagcctttctttcaacagtggttcagtgcagcaattctacgttcctgacataactaaatattcctctcattcaccttttactttatcttcagaacggccactttgaccgtgaaaatttcgaagctggtaccagtatgccttcatcttcaggggagacactttgtgcagctgtctcagcatcaacctgggtagagccacatggtagatgtactgttgtatttggtttggcttggtcctctcctaaaataaagtttcagaagggctgcacatacaacaggtcagcacactcttggtttgggtacctttgctgattttgtttatatctacagtgagttattctttgtttctgaactccggatcacctatatgacctatctgcaaattcatcttagaccggcatagccccatgtgctatgacatgtaattgatcccaaataaatgtaccatacgttctgttaatccttgggcaaaaaaagtcatataatagcacaagttctcatagatctgttcagaaaagatctcttgaagtgaagagctgggaatgcatcatgaacacctattgttttgagttggtagagaaataccagtatatcttacaacatggttaaatatctcacattgaccaattgtggtggcttgttttatttagttatctatcacattgcttatacataattagccttttccccatggtagcttcttttttatatcacaaaaatatattcactgctatctgttaagagtacatagcaagtgaattccacatgtcaaacttaaaattagtgtgcattacaataccttctaatcgattgatattctatcttatattgcaggaggtacactgaattttatggaacttctgaaagatcagctgttaatttggtacacgatgccttgacaagtatgtctttttgtccagctcttcataaatcttctctagtcacttagacatcttaatcttgtacacattcacacacaatgcagtaattacttgttgctgtcgtaattcacacattctcaacaaagttaaatgatgctgtgatagggacagatgtgcaatgttggtccttggtttctgaccttacgctgttggatgttccttctatgtttttttgcagaatataggatttgggaagaggagattgagaagtggcaaaaccccatactcaagaatgaaaaacttccagaatggtacaaccttagttctatatttctttctgaactgatgtgttctacttcttcagtaaagaactttggcagtaaacatctaaatctcccaaagaaaaacaaaatcttaactagaatatttggggtttcatggtgcttgcaggtacaagttcacactttttaatgagctttactttctggtagctgggggtactgtttggacaggtatgcttcattcaactttgtaatggtgtggtttttgtgcttgttcagttgtacatcataaattacaatctggatgtcgttaggataatttttaaaattgcaccttttactcttgaaacttctttgcggtacctgagtttagcatcacctttgtagatggccaaccaccagttatcgatgaaaaaccaagtcctggttctaatcaacagaaatcttcaaaaaggggcactagagacactaaacaggaatcagttaaagataaccatgtcaaactgacagcagagcaagtcactaatggtggtgacctggctaatggcgaagagcaaagtgtgtcaaagtatgcagcagtacatggaccacaaatggctaaggcaaccaacggacttgggtcacaagagccaattccatacttgctttccaagaatggccctgaaaatgttggcaaatttttgtacctggaaggagtggaatacatcatgtggtgcacctatgatgtgcatttctatgcttcttttgctctgcttgatctgtttcccaaaatagagttgagtatccaacgtgattttgccaatgctgttctctatgaagacagacgaagaatgaaatttttggctgatggtacttctggaattcgcaaggtcaaaggtgccgttccgcatgacctaggaacacatgatccatggcatgaaatgaatgcgtacaacatacatgatacaagcaaatggaaagatctaaatccaaagtttgtgctccaggtatacagagacttcgctgctacaggtgatatgtcatttggtagagatgtttggcctgccgtctgtgcagtgatggactatatgaatcaatttgaccgtgacggtgatggtctcattgagaatgatgggtttcctgatcaaacctatgatgcttggactgtacacggaattagtgcttactgtggcggtctctggcttgctgcacttcaggctgcagctacaatggctcatcggcttggtgatcggccatttgctgaaaaatacaagctcaaattcatacaagcgaaagcagtatatgaggctaagttatggaatgggtcttacttcaattatgacagtggcacaagcagtaatagccgatctattcaggcggatcagctggcagggcagtggtatgctgcttcttcaggcttgcccccgcttttcgatgagaataaaataagaagtgctctgcagaaaatatttgaattcaatgtaatgaaggttaaaggaggacgattgggagctgtaaatggtatgactcctaatgggaaagtggatgagacatgcatgcaatctcgggaaatctggaccggtgttacatacggtgttgctgcaaacatgctgctccatggaatggagcatcaaggattcaccactgccgaaggaatttttattgctggttggtcagaagaaggatatgggtaagcactaccttgttcttcgaataatctcatatttcgcaattcacaacaatgcaacttgcttcgcatcgattttgctctggcgcacctctcttaaaccactcccttatgaataccgttctacttctcactgacaatttcattaaaaatactaattagatattgttgatgctctcttgtttcaaccaccgtttgctttgtgatatagataacatggggtttcttgctgtgttgcaggtattggttccaaacaccggaaggctggaccatagacgggcactacaggtcgctcatctacatgcggcctctcgccatttgggcaatgcaatgggcacgttctccacccaaggcaatccttgatgcccccaaggtaaacctgatggacaggatacacctatccccacaaatgatccgggcaatgaacgagattaatgttagaaagatagcacccgacaatagatgtttccctagctctgcatttcgttgtgaatgctgaccacaaaaaaaaaagagaagcaaaatgcaacaactgagtagtaacatacatatatatactttccttttcggcttttccttggccccttacaagtttcagtggggttcatggggttttccttgaaatcagagggcatataaatctacggaaccactaagctcagtagctcacactctcacagctcgaaaagagctcttgttgtataattgtacagtaaactacaaaatcatatcgtcagcatcatctttgctctgcgtcaaaaagttttgtttacagactctttaactgatgtctgagcttccctttgcgggtatcaattccgagaaacacagtgtatatagattttacaatggacattccgtaatataatcgttaagcgagggatttattct</dnaseqindica> |
| External Link(s) |