Os01g0225100
| Gene Name |
Os01g0225100 |
|---|---|
| Description |
Smr protein/MutS2 C-terminal domain containing protein |
| Version |
NM_001048992.1 GI:115435397 GeneID:4326736 |
| Length |
6944 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0225100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:6888424..6895367 |
| Sequence Coding Region |
6891689..6891823,6892395..6892474,6892981..6893201,6893626..6893696,6893788..6893844 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:6888424..6895367 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:6888424..6895367 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgtcttcccttcaaaacatggaaaggtgtttcccgaatgctcaaataaatggcatgagctctccaaacatcttcctaggaaatggactgtctgaggaagtgtcaactgcaggcattgaaaaaagttcataccagtttacagatgaaatgcgaaacatgtcatataatcgttccgataatgagcacggattcttttggggcgagcttcagagaagctacttgaaggttgcatgtgaggagccccactcaacaacatcatctacaagatcaacaagctcgatatctaagacaccacaacaagtgctcgattcactgttcaaaatacctgaacaacgcacatatgaaccaagttccatggactggaagaaggtagttaagaggctgcagtcattcaattctcccatcacatcgaacaatcaagaaaaaccaaaaaatgggaatgggtatcaagaatttcgtactgtcgctggaaggcattatgatacaatgaaaacatattatcagaaagctgccatggcatattccaaaggagaaaaatcttatgcctcctatctcgcagaggaggggaagcattaccgtgaattagctcgcatggaagatgagagagctagcagggaaatatttgaagccagaaataagcatataacgaatacagtgactattgacctgcatgggcaacatgttaaacaagccatgaggcttctcaaggttcacatgatgatttgtgtgtgcatgccaaccacctttcttagagtaattactggttgtggtgtagaaggcacagggaagggaaaaataaagcgcgcggttgccgagcttgtggagaaggaaggcgttgagtggcatgaggaaaatgccgggaccatagtactaaggcttggtggcccaagggagtatcgtttccttgagcatgacagtgactctgattga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSSLQNMERCFPNAQINGMSSPNIFLGNGLSEEVSTAGIEKSSY QFTDEMRNMSYNRSDNEHGFFWGELQRSYLKVACEEPHSTTSSTRSTSSISKTPQQVL DSLFKIPEQRTYEPSSMDWKKVVKRLQSFNSPITSNNQEKPKNGNGYQEFRTVAGRHY DTMKTYYQKAAMAYSKGEKSYASYLAEEGKHYRELARMEDERASREIFEARNKHITNT VTIDLHGQHVKQAMRLLKVHMMICVCMPTTFLRVITGCGVEGTGKGKIKRAVAELVEK EGVEWHEENAGTIVLRLGGPREYRFLEHDSDSD</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>3266..3400#3972..4051#4558..4778#5203..5273#5365..5421#5660..5727#5795..5901#6032..6099#6442..6564#gagggagctcaaaagatgaggccttcgaagaagaaatcgaagaagaagaagccctcgccggcggcggcggccggcgcggcggcgccgacgacccctccggcggcggcggatgggggagcggggggcgagtcgtgctcgccgcggtcggaaaccctaaccctagctgctgcggcggcggcggcggcggtggcgtcggagacggagtcgagcagcagctgcgaggcgtccacgtgctcgtcgtcgtcgtcggctttcaaccccgggtcgtcgggggcggcctcgacctcctccctctccgccttctcgtcgtcggcctccaccgcgtcgtcgtcggccgccggcgacgagcggcgcgacatggcgtggctgctggacgccttcggcaccgccacgatcgaccaggtggactccgcctaccgcgaggccggcggcgacgccttcctcgcggccggcatccttggctcctcgcccgaaacgcagccctccccgccaccccggcccccggatctctcgccgcgggccggatctggtggcaggaaggccagcaggaggccgaagaaggtagccgtggctgcgaccgggatggttgcggacgtgatcggtaaggcgtacacgcgacctgccacttcgcccgtaaacaaaacgaacgcgtggaagggcaacgcttggaaggacggaagtggtggcgaccgcaagtatagtgttgaagaggccgagcagttcctgtgctctatgctgggggataattcggagcttggcatgggtgtggtcagagacgtgctcggtaagctgcttttgcctaacaagcgtacctgtaaaaaaatgcattttttttaccgttgtaagagcccagcagagttataatacatcaaagaatgaaataaagatagaaacacttactacacacaacaggagagcatctacgattcaaaagatatattttttcccccaaggaatggttggttcttgtttacaaaaagagaatccaaatgccatccataacattgcacagttcataagccaatctagtgaaaggagcaaatatattgtttgattgaactagaaaatatgatgattagtttttagttttcttattctgggtgcgaatcttgtgttaacttcctgatctgctaatattctatatgaattgttattattactccctccagtcaataatatttgacgttagtgctactactactactactaatcttagctatcccaacacaaaatgttattgattagttggggtattattattatttcaaaatgcttgaaatgaaagggcaataggctgtctatctcgttctcaaatctgtggcaattaggtttgactatgcctcttccagcacagatgtgtctgaggctgtgatggtggatttgggatgaagtcctataggaaggttattcagaggattgattttttgtttgaaacattgtagaagccctgaataaatagagcaagattcttgtatgatcagtcacttggacttgtgttatgccaacatacattgtggtgcaccgttgttctcttaggccaagcattgggatgtgaaggagattgttgcctacggtgattgttttatgctaagttcttgcatgaactaagaatggaagcatactgatttccatcatagatcaacgttctacctttcaatgtcatggacattggctggttttcttacatacatgggtagcgttctgcaggttaaaatcatctatacatttagttgaatagctgcatgtttgtaaatgttatttatatgcggaactgctgcataatttactcacacaactgctgaagttatgttttcgtcatgaaactagtcattggatgaaatttggtgtttgtgtttgtgttgaaagttgatccatttttatggtttcattgaatgtaataccaaatctttcacttttatgcttactaaaactagtggagggcaaaagatttcttttaccttaacattttattatttgtgattggccagtcagttggaagtggaaatgaatcttagtggaatgagtttctgatgttacttccctctattgttcaggtcaatatggatgcgatgttgagaaggtaaaggatttatcttattgggtccatttctcagtgacttccagctatgtttttacgtcctgaatagaaaaagtttgccttttggttggagtagaattttacttttcttcgcgggaactattttcaacttgattcttttcccaaactcaaaacaagcaactatgcatttgtgcaagttagcgcactattccgggaatttccactcattaatcatgcacatttgcaaaaataagttgtcatttttttgcacatgaaaacagccatgcaagtaaatgaaatatttttatggtacatgatgtcatgttgaacacatgcacacatgaaaaatacctttggtaatcatttgttaccaatatccatcatgacttatgacattgcgcagacgataccaatttcttgaatagcgttccagttggtctactgtggctgcgaaagagtgcctttctgctagacacaagatgtggacagtaggaaacacatgccgtagtacatgtggaacatgtctagcctttgcagattgcagtgtcttgtgtctattgacaaaaaaacaatcgatggacatcaaataccatcaacagttgcggtcacttgtgacattgatgagtaaggtggtgatggtacagctgtgttgcacagttcttgtatactggatctaacctggcataatccttttttaatattatcaccttattcttataagaaaatctctccatctaatcatatttgtagtagccagtgtaggtaggtcttgatattctaaaccagattggcttgttctcatgataagttggtcacatcgatataaagttttgtcatatctaggtagggatgcacgtgggtcagcccacagttacccactgatccacaccattttatttgatttcaattgtctacctgatacatactaggaaatgggagagatgttcactttcaagtgattggtgtgggtcaatgagcacccatcagtgggcaaacttgatggtttgtaccgaattttcacatattaaaccaaaaggaaggttgtaaagcaaggattgttatctaggttgcatgaaatctaatcaactagcatttcctcttgtttccctgaaagaattgcatgccgtaagttttcagctatttgttcagaagtttaacaaattgaaatgctttcaggctctggatgcattacttgatatctcgggtatgtcttcccttcaaaacatggaaaggtgtttcccgaatgctcaaataaatggcatgagctctccaaacatcttcctaggaaatggactgtctgaggaagtgtcaactgcaggcattgaaaaaagttcataccaggtgtttacttagcactatctacaatcatatgcagatatgccgtactgaaaatttagactattcttagttcactcatgcatatattagtggttattattgaggtcacagtagttatcttttttacaaattatattagtgtgggacctggatagactaccttataattttgtagttattagtgcaggtattattgtatcttcttgcttgctaacatatatgtgttacagccttctaagataagaaggtatctttcaagacaccacttactaccacttgtttttaggagctgctgagttgtggttttagtgctaacaagacaaacaagaatgatataaattgtgttggttttcttgttcacttttgacactgataatgatccttgcacagagtgtgatatcaagcatttggaattcaactttctatttcctattgattgacatgatacatacagtctgataagcatgcttgtgattccttcttgttccttagtaccttctagatacttatattatttcaactaggttctttaaacccctgtaaaactattatctaacattatagttttattcagtttacagatgaaatgcgaaacatgtcatataatcgttccgataatgagcacggattcttttggggcgagcttcagagaaggtgggtaataatttgccaatatataagctgatttttgctagctcatgcgtcaaattgataatatacggatatacctatgcattattcttgcaccccatcctgtataaatattttatttggatatatgtgtttgcgagaagcacaatagaaaatctttgatcatgggacatattctcagtcgatcggatagaaacttaagttgtctagatacatcagattgcatggtgttaattactaaagttgcaactttcctaggaattctaaaatatggtctttataatggacaaacaaattatgtgagcttattttttgcagtcaaggcttgtatctcttgcaatgttttgaccttaccagtttaacctgtaaattttatgctaagtgtaggtgcatatactttgtttatttacttcaattgcgcagattgtataactagttagttgctatctgtaagttcaactctatttttgcacttatgtgactgtttctatgttatccttgctcaacagctacttgaaggttgcatgtgaggagccccactcaacaacatcatctacaagatcaacaagctcgatatctaagacaccacaacaagtgctcgattcactgttcaaaatacctgaacaacgcacatatgaaccaagttccatggactggaagaaggtagttaagaggctgcagtcattcaattctcccatcacatcgaacaatcaagaaaaaccaaaaaatggtatgttgttttagccactgttatttgtgtcgttatttgttaagatcattaatttctttttgcatcacattgaacttttttcctttacttcctttatttctggcaattttttctgtatccatcttctaaatctgtagcatgttttcacattcttattcaatggcttccaaatatcactttagaatgaattctgggaagtgtagctgtttgagctaccatataataagatcaataattgtatgaccttcatttaagactagtttatttatggacttgataatacctttagttttgagcacatgcctcaccctattaatacagtaaaattgttttccccttcttgtttcaactgtcacttgttgtgctttgttattgttacatttgatacttctgaaaagatataacacctacttctctcattaagggaatgggtatcaagaatttcgtactgtcgctggaaggcattatgatacaatgaaaacatattatcagaaagtaagagggattttttaatctgaactactattatcatataccctctatcttttgtatttcttattgcctcctgtcatttcttcctatgcaggctgccatggcatattccaaaggagaaaaatcttatgcctcctatctcgcagaggaggtctgatatcccattttaatttgttaattctgagatgactatgatgattcaataaaagaaagaaggcggggtgatagcagataggttgtagggatttctgatgtagtgcagcatacagttctttaggaacatttcttatgccaatagactgcaattttctcaaagtttaaaactttgcataggctgttaaatctcagtaacttccttatgcctcagtatcaaaattctgtctttttaggggaagcattaccgtgaattagctcgcatggaagatgagagagctagcagggaaatatttgaagccaggtaatttgcataactttcccagctattacttttaaatcacatctgcgtgctaatcttctgtttgcagaaataagcatataacgaatacagtgactattgacctgcatgggcaacatgttaaacaagccatgaggcttctcaaggttcacatgatgatttgtgtgtgcatgccaagtgagtattctagtatgacccgattgggtgctacactgattatcagtgttaatattttttattcaactttgatttggtctaatgcttcatggtcctactgttgtctcctttcttgtgctcttataaacagccacctttcttagagtaattactggttgtggtgtagaaggcacagggaagggaaaaataaagcgcgcggtaagtatttgcttagacaagctgggacctcacatgtgtgcctgcttgttgtcatgcttcgtttcttcattaaatttatagtattatcagcatgttcttgaaactgagctgccctcatgaaatgtttggttgaataccttgataccttcctgtgttatattactttctatctcgtggtggctatatggccccactataatagaatgcttttagcatgcagctcttgacagtgtctgtgttgctgatctttactctttcaatctgtagactagtactcttaattggtcaatctcattacctaatgtaccatgcttttgaattctgtaaaaatggctgtggtaggttgccgagcttgtggagaaggaaggcgttgagtggcatgaggaaaatgccgggaccatagtactaaggcttggtggcccaagggagtatcgtttccttgagcatgacagtgactctgattgagccttgggtgtctgttttgaggagactttacatagattaacggccgttctaatctatgtatctcctgtatctatctgtatttacatgtgttgtaattatggataggtgacctaggtcgtcctctgatgtagggctgtagtttctgacatacaggctctggaatagcaaggagtagagaacaggtgctgtctgatgtaatgatcgttgtaggctctgatgtaatgatcattgtaggctgctaaccttgtaatgaactctagctatgtacctgtctaattgttttgatgtgatgctcaagataacttatgtcttgaatgtcaacattgcaacattcagacaattgatctactaaaggaactatcagaaacaaaattagctgt</dnaseqindica> |
| External Link(s) |