Os01g0276200
| Gene Name |
Os01g0276200 |
|---|---|
| Description |
Porin, eukaryotic type family protein |
| Version |
NM_001049261.2 GI:297596538 GeneID:4324258 |
| Length |
4615 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0276200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:9670089..9674703 |
| Sequence Coding Region |
9670089..9670145,9670549..9670644,9670866..9670949,9671030..9671098,9671872..9671973 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:9670089..9674703 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:9670089..9674703 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgggcgcggtcgtcagccacgcctccgccgcggccccgcctcccccacccacgggctacgcgcccttcgtggaccccgcggccgcggcggcgccgccaccggcggagaaggacgcggcggccgacgaggagaaggtggactacatgaacctcccctgccccgtcccctacgaggagatccagcgcgaggccttcatgtcgctgaagcccgatgtcttcgagggattgcgcttcgatttcaccaagatgctcaacccgttcttcggattgagccacagtgtgtccatgggatccatggagctcccatcgcagggggcggatgtgatcaaggtccccacctccaactacgagttcggcgcaaactttatggatcccaagatgatgctcattgggagggtttcgcacgacgggagggtgaccgcgcgcgttaagtgcgatctattggaaaatctttgcctcaagataaatgctcagttgacgaacgagccccattactcccaaggcatgtttagctttgattataagggcaaagattttagatcacagttccaacttgggaataatgccttctatggagggaactacatccagagtgtaactaagaacctctccttgggaactgaagctttctggcttgggcaacaaagaaaatcaggagttggctttgttgctcgatatgacacaaagaaaatggttgcaactggacaaattgcaaccactggattggtttcactcagttacgtccaaaaagtatcagaaaaggtttcccttgcatctgattttatgtacaatcatatggcgaaggatgtaacagcaagtttcggctatgattatatgttgagacagtgtcgtctgagggggaagattgataccaatggcgttgtttctgctcttttggaggagcggttgacccccggcgtgaatttcgttctttctgcagagcttgatcactggaagaaagattacaaatttgggtttggtatggttcttggagagtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGAVVSHASAAAPPPPPTGYAPFVDPAAAAAPPPAEKDAAADEE KVDYMNLPCPVPYEEIQREAFMSLKPDVFEGLRFDFTKMLNPFFGLSHSVSMGSMELP SQGADVIKVPTSNYEFGANFMDPKMMLIGRVSHDGRVTARVKCDLLENLCLKINAQLT NEPHYSQGMFSFDYKGKDFRSQFQLGNNAFYGGNYIQSVTKNLSLGTEAFWLGQQRKS GVGFVARYDTKKMVATGQIATTGLVSLSYVQKVSEKVSLASDFMYNHMAKDVTASFGY DYMLRQCRLRGKIDTNGVVSALLEERLTPGVNFVLSAELDHWKKDYKFGFGMVLGE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>4559..4615#4060..4155#3755..3838#3606..3674#2731..2832#1852..1917#883..933#676..771#484..583#300..381#1..196#atgggcgcggtcgtcagccacgcctccgccgcggccccgcctcccccacccacgggctacgcgcccttcgtggaccccgcggccgcggcggcgccgccaccggcggagaaggacgcggcggccgacgaggagaaggtggactacatgaacctcccctgccccgtcccctacgaggagatccagcgcgaggccttcagtaagcctccgccccccgcccccgcctccctttgcatcccccccttgatctggtggtggttgttgattcggtggtgacgccgtgtgatcctctctcgctgcagtgtcgctgaagcccgatgtcttcgagggattgcgcttcgatttcaccaagatgctcaacccgttcttcggattgagccacaggttcgacttccggttccccccatcatctagtctcgtttttttccctttgtaaattattactagcggttttggctgtatcgtgacaatccttgtgcgcctcagtgtgtccatgggatccatggagctcccatcgcagggggcggatgtgatcaaggtccccacctccaactacgagttcggcgcaaactttatggatcccaaggtttgcaatgcttttcttctgtgaaggggttcatgcttggtgttctaatatggttggtttcagtgttgatccgagtgtggttcatttgccagatgatgctcattgggagggtttcgcacgacgggagggtgaccgcgcgcgttaagtgcgatctattggaaaatctttgcctcaagataaatgctcaggttttttgtttggaaccatatgagccaaactgtgttcaatatgagattagcgctaattaacaccatccttttgtacttactaattagcttaccttgtatgtatcctggcagttgacgaacgagccccattactcccaaggcatgtttagctttgattataaggtcagtctttgtgtacatttggatttgtgatgatgggttttcctagtttggtaaatttatttgatggcaatgtcattccagcgatacatttttttttcttttcttcaacaagctactgtgttttggtatagaatccttctcacttaatgaaagtgtgtcctatattgttgctattttttttattaaaatgatggaataatggaagatatgattgttttttctggcatcttttaaatttccacttaggacaacataaagcctgttatcttgccgaacgattttaagaaaagagatggcatcgaaactttcgtagtattttcataatgcatctcatgaatcattaacagatgactctttcttagcagatgctgaacaatttagtttcaaaggaaagttatggctgatttaatgaaatgcgttatagctcattttcagtctgtttcctacaattactttgcattccaaataaattcctattgtcatgtatctttaatttcaatcgaaaacatcaagaatgtgaagatggaatgcacactctgaaacgtgcccctaatttttactagtttgttaatttgatagacgtgtttgttgatgtagtgatgcatttcttaggagttctcaacaacacataatttccgtagttttcttttgttccctttcctcccagttttaccccttccttttccataatatctagttctgaagaatactactgggaatggccaatgcaagaaactttttctttccatgaaactttgtgttgtttcctgtttaaatttctcgcaagtgtaaaggggtgtatttgagatatagtgtattccagatagatatatcttttatttagtttcttcctatcaattatatctgaaggtgtactttattttataacttgtgttgcttttatatctttgattgcagggcaaagattttagatcacagttccaacttgggaataatgccttctatggagggaactacatccaggtatgtgtttatgtgtttgcatataataaccatgccctttgaggattttctacattttagattcttgtgtaagtgcatagacagctgctatgaagacagttcttgttaatatgatgtaatgactagacagctttttttcccttttccttttctcaacttaaaatttacctagacgaagtactccctctgtccccatttacagggtgtgtaaaatatttcgctaaggcccttgcatgcaatatattttcttcctgatctgcccctattaagcagacaatgcatgtaaacaaagcaccaagccaccaaattctagtaaattgaagcgctccgtttcctcatgcatgaaacggataagccaattaaaatggcgccacactgcatgcaccaattatgtggccagcacctccttgcttgcatgcatgcatgtagcagagcactcttggctgaaagccccagtgtgtcctgtgttttggtacatcaacaacaaccaaaaaaaaaatacgcccactaaactgggagagaggaagtaataatgctaagaagacaaacatatttcaaaaacaatgtgccgtggtagcttctttgtacaataagcataagaatataactccagaaatctcttaagtaactttgtggtgtttgccatgtgattctgttgattaaactggaggataaaagtgattaaacggttcactttttttgttagggtcatgatccaaaagaaaatgcctgatttaactgcatgaattgagttgccgagaatatgtttttattctaacatatatattaaactaatatttttgtgtgtttcagagtgtaactaagaacctctccttgggaactgaagctttctggcttgggcaacaaagaaaatcaggagttggctttgttgctcgatatgacacaaagaaaatggtaagtttgtttacctatctttaagctatttaagaatcatgattacagtgtccacccatgtgaagttgttaggttaccattcatttaccatgtaactaatgcccacggcctcaaaaggctacgttcaaggttttataggatagatttctaagcgctgttctagcgctcagccatatagtcatggggacgcatttgcttaattactactttggggggcttagtcatgagagtgcgtttgcagtcatggcaacaggtcaatacctctggggtgttagttagcacttccacaattgtttgtaatatcgtgtaagcaaatagtcaaaatagcatgcacaagttcatacatgtatatgaatcggactatttgcaatttataatcctgacagccagccttttgttttctcttcaagtttgctgcctctcacaaactctattattacatccctagtgcctcccattgttgaatctaaactaactgcaagcattgtatttttaatttcttgtgcaataagcatgcattagtgataaatgttctaccagatgtaaatacaaaccatgaattgtattgtatgagctcagatggctctttcatatgattagtaaactggtagtggttttttgagacattgttgaaatattgaattgaccctttttttcgttcattgaattgtaagagacattagaattcatattggttacttaattggtagctggatggtcaacttgacattaaatttgtataattaatggagacatgtgacatatatgtgcaggttgcaactggacaaattgcaaccactggattggtttcactcagttacgtccaaaaagtatcagaaaaggtcggtgttctgtaatgatgttttgaacatttgcttttattttctttataccatcttactctataagtttcttcttgcaggtttcccttgcatctgattttatgtacaatcatatggcgaaggatgtaacagcaagtttcggctatgattatatgttgagacaggtatatcttgattgtttccaccttttcggttttttttttgtgcgttggtctagcatggtatgtgggatgtaaaagttgctgcaacaacttgagcatattttgcctcttctatggaacctttttttttcaaaaatggaaaattctatgtttttagagaattttgattattgaagttgtaaccacctcattaaattaaagtatatttatgtttaaccttgcagtgtcgtctgagggggaagattgataccaatggcgttgtttctgctcttttggaggagcggttgacccccggcgtgaatttcgttctttctgcagaggtcagcttgcagccctacttattctatacaccaggctacctattattgattcaatgccctctatttttaacacgtttatgtaagtgggaaaccaagtctggaactggattattgaatcagaaggttaagtagaaacataaattaatgaaatatagatgtctccttagtgagctgcgctgaataataaaataatagcaaaaggtaaagaaacattacacgccttcaaaatcctagccatctcagatgcttgaaattccaagatatcagctttcgtaggcagcagaacttagcatttgagaagcatatctagccatcataggtgaattttatcgtgccctgcatttagttgtatttggagtataattttgaattgacatgatgttgtttctacaatcctgtgcagcttgatcactggaagaaagattacaaatttgggtttggtatggttcttggagagtga</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
