Os01g0293600
| Gene Name |
Os01g0293600 |
|---|---|
| Description |
Zinc finger, TTF-type domain containing protein |
| Version |
NM_001049333.2 GI:297596588 GeneID:4326714 |
| Length |
2588 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0293600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:10741283..10743870 |
| Sequence Coding Region |
10741283..10741300,10741405..10742878,10742966..10743870 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:10741283..10743870 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgtcaaaaagaacactactcacgtattattctagttcaagcaacacagatccttcacctagcaccgagaatttaagtcagccgaagaggcctagggcagagtttagtcaatcagatataattggtgatccagggcttcgcaaaccaattgaagcttatccacctgaaattagagatcaagtaaagagggcatatgcattgagtggcccaactcaacctaatattactatatttcctcgtaaatggcaaggtggtgagtggagatcctttcaaaaaacttggttcaatgagtttgattggctagagtatagtgtttcaaaggatgcagcttattgcttgtattgttacattttctttgaaccgggaaaacctgaaaagtttgggagtgctgtctttgctaaggaaggttatgtcaattggaagaaaggtaaagataggcttaccgtacatagtaattgcaagactcacaatgatgctaggaataaatgtgaagactttatgaaccaaagaacaagtgtatctaaaaaaattgagattgttagcaaggaggaagaaattagatacaagattcggttgacatcttctttagatgttgtaaggtttctcattgaacaaggtgatgcttttcgtggacatgatgagtctgatacttcccttagcaagggtaaatttaaagagatggttgattggtacaaagacaaggttcctgaagtgaaggatgcatatgaaaagggccttaaaaattgccaaatggtatcacatcatattcagaaggatcttactaaagcttgtgcagaaaaagtgacggcagttattatggatgagattggaaatagaaatttctctgtacttattgatgagtctcgagatgtatcaataaaggagcaaatgggtgtcatcttgaggtttgtgaatgatgaaggaaaggtgatggagaggtttcttggtcttcaacatattgagagatgtacggctattgctttgaaggaagctttatttggtatgatctctagtcataagttaaccatctctaagattcggggccaaggttatgacggagcttctaacatgagaggggaatttaatggtgtgcaaaaattgattcgggatgaaaatccttatgctttttatgtccattgttttgcccatcagctacaactagtagttgttgctgtttcaacttctactccagccattgcagatttttttaactatgtgcctttaatagtcaacactgtgggtgcatcttgtatgcgaaaggatgccttgcttgcaaagcatcacgatgtattgttagaaaaggtggagaatggtgagattaccactggaagaggcctgaaccaagaaagtagcctagctaggcctggagatactagatggggttcacatcttaaaactttgcttcgtattctagtaatgtgggaggctatcatagatgtgctcgagattgttaagaaagattcaaccaaaccaacatttaatggtggagcatttggtttgatgggtaaaatgcaaagctttgattttgtattcatcatgcatttgatgatagacatgttgagcattacagatgacttgtcacgtgctttgcaaagaaaggaccaagatattgttgaggcaatgagtttgctcatagatgtgaaagagctcttgcaggacatgagggagaatggatgggagccactattgaatagggtgatttcattctgtaataaacatgagattaaagtgccaaaaatggacaaggaagttaatgaaagagggacatctacacatcgaaggcacaaggtaacaaataagcattactatcatgttgagatctatcttgcagccattgatgccattttggttgaaatgaaccatcgctttagtgaagttagttcagagttattagtatgcatgtcatctcttaatccacggaattccttctccaattttgatgtggataagcttgtgaggcttgctgaaatttatgctgaagattttttggttggtgatcttatgctactacgaactcaacttggaaattttattagcaatgttaggagaagtaaagaatttcttggatgtaaagatcttgcaaaggttgctgaattaatggttcaaaccggaaagaatagaacttatcacttggtgtataggctcattgagttatcattgatacttccggtggcaacggcttcagttgagagggtcttctcagctatgtctcttataaagatagatttgcgaaacaaaatgggggatgaatggctcaatgacttgatgatttgctacactgagaagcagatttttagaagtattagtgatgaaaaaatcatccaacactttgaagagatgaaaaagcgtcgaatgctagtgcttcaacagaaattagtgattactaatgaagaataa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSKRTLLTYYSSSSNTDPSPSTENLSQPKRPRAEFSQSDIIGDP GLRKPIEAYPPEIRDQVKRAYALSGPTQPNITIFPRKWQGGEWRSFQKTWFNEFDWLE YSVSKDAAYCLYCYIFFEPGKPEKFGSAVFAKEGYVNWKKGKDRLTVHSNCKTHNDAR NKCEDFMNQRTSVSKKIEIVSKEEEIRYKIRLTSSLDVVRFLIEQGDAFRGHDESDTS LSKGKFKEMVDWYKDKVPEVKDAYEKGLKNCQMVSHHIQKDLTKACAEKVTAVIMDEI GNRNFSVLIDESRDVSIKEQMGVILRFVNDEGKVMERFLGLQHIERCTAIALKEALFG MISSHKLTISKIRGQGYDGASNMRGEFNGVQKLIRDENPYAFYVHCFAHQLQLVVVAV STSTPAIADFFNYVPLIVNTVGASCMRKDALLAKHHDVLLEKVENGEITTGRGLNQES SLARPGDTRWGSHLKTLLRILVMWEAIIDVLEIVKKDSTKPTFNGGAFGLMGKMQSFD FVFIMHLMIDMLSITDDLSRALQRKDQDIVEAMSLLIDVKELLQDMRENGWEPLLNRV ISFCNKHEIKVPKMDKEVNERGTSTHRRHKVTNKHYYHVEIYLAAIDAILVEMNHRFS EVSSELLVCMSSLNPRNSFSNFDVDKLVRLAEIYAEDFLVGDLMLLRTQLGNFISNVR RSKEFLGCKDLAKVAELMVQTGKNRTYHLVYRLIELSLILPVATASVERVFSAMSLIK IDLRNKMGDEWLNDLMICYTEKQIFRSISDEKIIQHFEEMKKRRMLVLQQKLVITNEE </aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>2571..2588#993..2466#1..905#atgtcaaaaagaacactactcacgtattattctagttcaagcaacacagatccttcacctagcaccgagaatttaagtcagccgaagaggcctagggcagagtttagtcaatcagatataattggtgatccagggcttcgcaaaccaattgaagcttatccacctgaaattagagatcaagtaaagagggcatatgcattgagtggcccaactcaacctaatattactatatttcctcgtaaatggcaaggtggtgagtggagatcctttcaaaaaacttggttcaatgagtttgattggctagagtatagtgtttcaaaggatgcagcttattgcttgtattgttacattttctttgaaccgggaaaacctgaaaagtttgggagtgctgtctttgctaaggaaggttatgtcaattggaagaaaggtaaagataggcttaccgtacatagtaattgcaagactcacaatgatgctaggaataaatgtgaagactttatgaaccaaagaacaagtgtatctaaaaaaattgagattgttagcaaggaggaagaaattagatacaagattcggttgacatcttctttagatgttgtaaggtttctcattgaacaaggtgatgcttttcgtggacatgatgagtctgatacttcccttagcaagggtaaatttaaagagatggttgattggtacaaagacaaggttcctgaagtgaaggatgcatatgaaaagggccttaaaaattgccaaatggtatcacatcatattcagaaggatcttactaaagcttgtgcagaaaaagtgacggcagttattatggatgagattggaaatagaaatttctctgtacttattgatgagtctcgagatgtatcaataaaggagcaaatgggtgtcatcttgaggttagtagttcacatatgtagttttatatgtttgatttttcagattctattttgagtactaacttagaaataattattgttgtgcaggtttgtgaatgatgaaggaaaggtgatggagaggtttcttggtcttcaacatattgagagatgtacggctattgctttgaaggaagctttatttggtatgatctctagtcataagttaaccatctctaagattcggggccaaggttatgacggagcttctaacatgagaggggaatttaatggtgtgcaaaaattgattcgggatgaaaatccttatgctttttatgtccattgttttgcccatcagctacaactagtagttgttgctgtttcaacttctactccagccattgcagatttttttaactatgtgcctttaatagtcaacactgtgggtgcatcttgtatgcgaaaggatgccttgcttgcaaagcatcacgatgtattgttagaaaaggtggagaatggtgagattaccactggaagaggcctgaaccaagaaagtagcctagctaggcctggagatactagatggggttcacatcttaaaactttgcttcgtattctagtaatgtgggaggctatcatagatgtgctcgagattgttaagaaagattcaaccaaaccaacatttaatggtggagcatttggtttgatgggtaaaatgcaaagctttgattttgtattcatcatgcatttgatgatagacatgttgagcattacagatgacttgtcacgtgctttgcaaagaaaggaccaagatattgttgaggcaatgagtttgctcatagatgtgaaagagctcttgcaggacatgagggagaatggatgggagccactattgaatagggtgatttcattctgtaataaacatgagattaaagtgccaaaaatggacaaggaagttaatgaaagagggacatctacacatcgaaggcacaaggtaacaaataagcattactatcatgttgagatctatcttgcagccattgatgccattttggttgaaatgaaccatcgctttagtgaagttagttcagagttattagtatgcatgtcatctcttaatccacggaattccttctccaattttgatgtggataagcttgtgaggcttgctgaaatttatgctgaagattttttggttggtgatcttatgctactacgaactcaacttggaaattttattagcaatgttaggagaagtaaagaatttcttggatgtaaagatcttgcaaaggttgctgaattaatggttcaaaccggaaagaatagaacttatcacttggtgtataggctcattgagttatcattgatacttccggtggcaacggcttcagttgagagggtcttctcagctatgtctcttataaagatagatttgcgaaacaaaatgggggatgaatggctcaatgacttgatgatttgctacactgagaagcagatttttagaagtattagtgatgaaaaaatcatccaacactttgaagagatgaaaaagcgtcgaatgctagtgcttcaacagaaattagtggtatgctccatgcctccattctctccctaagtctctaaattatttgaattcaaaataagtcattttcgattaatcgttcatttgccttttttttctttgtacagattactaatgaagaataa</dnaseqindica> |
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