Os01g0300400

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Gene Name

Os01g0300400

Description

Protein of unknown function DUF889, eukaryote family protein

Version

NM_001185363.1 GI:297719860 GeneID:9271919

Length

6116 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os01g0300400, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:11062205..11068320

Sequence Coding Region

11062205..11062343,11062423..11062677,11062881..11062961,11063044..11063175,11063280..11063312
,11063549..11063609,11063830..11064525,11064892..11065085,11065215..11065383
,11065404..11065444,11065494..11065855,11066575..11067010,11067311..11068320

Expression

GEO Profiles:Os01g0300400

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggctgagaatagtagcaagaacccgttggttttggatgagtgcatagtctcagcatcatgtccgagtccagtccaatctattctttgtgatccaggacgcaagcgaaaggtccctatgttagaccagcaatccaaagaacctgatcttgcaattttggtctatattaaaggtgccttttgtgctggacaatttagtcagacaacaccctttgttccaaatgtatgcagagataaatttgtctcaacatttaacctaccatcaaggcgagcagttaggcacaggctgatgtttggttctgataatgcacccaacacgacaagtgatagttctcccggtattatcaatctcatttctggtggcccaactcttgctgccgatgaaaccttttgtggtttgccacggccacaaccatgtgttgctgccgagtcgcgtagaaaacgtaaggcggccatgattcacaagagaggcgaaaagttatgtcctgctatttactccccttcatctcgatctgtttggcgtcgcataatcccaaatgataatgttgtacgccaacaatgccatacacagctacagcagcagaatctgtcctcggcttctcaccaagatcctaggcaaccatttgctggtcgccaccaatgtttcgtcgtaatgataattgccacggctcagctgatacatgccaatggcgcttatgtatggggaggaagtgttcacttagcaccatacaagccacctccagaaccattgctcagtttgttgactggacaaaaccctgcattatctgcccacttctttgataatattaggcgttacaactctatgtttgctatgagatctatgggcttgaacatcatagggtctattaatgatggaggaggaccttatgttttcaagattagtgggcagctatgtcattggattggatctctaattccaagagatggcgctagaccagaatattgtcagctatacattttttatactgaaaatgaggttcagaataggatggaagttccatgcattagtggtggttttaaaccaaatgaaaatgtcatttcgtctctgatgaggatgtttgatgatcacaacccaattgtgcaagtgttccggactgctcgggatagattgtctgaccaatcagaagacaggtattatgtcaagctatttgttgtgcccaatcaacatggtggtgtgtatagtgcccctgttgcatctgaggttgttgggttggtggtggttaatgatttaggaaccactaatgaaggctgtgatttaataatacaagacaaggcttctcatctacaaaggataaaagaatctcattgcaagtttatggctatgcaataccctctattgttcccatatggggaagatggcttccataaagatctcaggtttggatgcccacatcttttcatcactttgacatgcaacgcttcatggtcagaaataacacaagctttagccctcattccaaggcagcactcctctgatcgacttgatattgttgatcgtgttttccaaatgaagctaagaatatttatagatgacataacaaaataccagtttttcggtcctatatctggagttgtctatacaattgagttccaaaaacgtggattaccccatgtccatataatcgtatggcttgaaaaggatgggcctcttgatgttgattggattgatgccttcatatctgcacagctaccggacccatctgttgatcgtattggttatgaagcttctccaagtttatgttcaaacagatcgtctccttgcatgaacgatggaaaatgcatgggcgtgttatatatgctcggccaaataacaacattaccacagagaaaggttggtgtagatgtcgataacaactatgttgtagcccataatgttgatctcttggttaagtatcaagcacacatcaatgttgagattgttaatcgtgatggaatggaaaagtacctattcaagtactcaaccaaaggtcctgactatgctaagattgggattcgggataatgttgatctcttggttaagtatcaagcacacatcaatgttgagattgttaattgtgatggaatggagaagtacctattcaagtactctggaatggagaagtacctatttaagtactcaaccaaaggtcctggctatgctaagcacacgtatgtggaatttcctgagttttggacatggcatgctgatggtaaatattggaaacaacgctctcagagccataagggtaaggttggtcgcattgccaatgttggacctaaccagggtgagcgattctacttgcgtatattattgcatgttatcaaaggtgctcaatttttttctgatgtacgcattgttggtggcattcaatacccaacttttcaatctgcatgcgaagcaatggggttacttggtgatgatcatgaatggtctcatgctatcactgatgcagcacagtgggcgcttccatatcaacttcggcagttatttgtcatgatgcttctgttttgtcaagtatcagacccagccaaactgtttgacaatcatgttcagctgatgggtgaggactttgcgtatcgtgtgtcccaacatacacctgggaagacatttctatggaataccctgttggccaacattagaaacaaagggaaaatagtcttggcagtggcatcttctggtatagtagctttgttacttccaggaggtcgtacaccacattcacgctttaggatacctctagacatccaggaggattctatgtgtgctattaagaagaacacccatcttgctgaattgattcaacaaacatctctcattatatgggatgaggcatctgtcaaccataggcatttctttgaagcatttgatcgcacccttagagatatcatgtcatcgatcaatcatgatttagtgaacatgcaatttggtggtataacagttgtcttggatggagactttaggcaaactctaccggttattcctaatgcaagaaagcaacagatcctgaatgcctcgatcactcgctcccgcttatggaaaaattgtgtggtacttgaattaactgaaaacatgaggctcaattgtccaaccttttctcagcaagacaagtttaggcttgagctgtttgcaacatggcttctatctttaggtgatggtgttgtccatgatagtgcacccactgatcgaccagacgccacttgggtggagattccatcatatctcttactaccggctaaagaaaggaaccttgcatgtttgatttcttttgtgtatgattcaataccgcatctatcacagctaccaacctacttatgtgaacatgcaattttggcaccaacgaatgagattactgctgctataaatgcacaaattattagccacacagccactgaagaaatgtcatactatagctttgataccattgatgatgccacaccaaactactgcaatgtgcagtccctttatcctgcagaattcctcaatacagtacacatgagtggtttgccggatcaccatttacagctaaagattggtgtccccatcatgcttcttaggaatctagatccatcaaagggcttatgtaatggaacccacctcattgtaacatag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAENSSKNPLVLDECIVSASCPSPVQSILCDPGRKRKVPMLDQQ SKEPDLAILVYIKGAFCAGQFSQTTPFVPNVCRDKFVSTFNLPSRRAVRHRLMFGSDN APNTTSDSSPGIINLISGGPTLAADETFCGLPRPQPCVAAESRRKRKAAMIHKRGEKL CPAIYSPSSRSVWRRIIPNDNVVRQQCHTQLQQQNLSSASHQDPRQPFAGRHQCFVVM IIATAQLIHANGAYVWGGSVHLAPYKPPPEPLLSLLTGQNPALSAHFFDNIRRYNSMF AMRSMGLNIIGSINDGGGPYVFKISGQLCHWIGSLIPRDGARPEYCQLYIFYTENEVQ NRMEVPCISGGFKPNENVISSLMRMFDDHNPIVQVFRTARDRLSDQSEDRYYVKLFVV PNQHGGVYSAPVASEVVGLVVVNDLGTTNEGCDLIIQDKASHLQRIKESHCKFMAMQY PLLFPYGEDGFHKDLRFGCPHLFITLTCNASWSEITQALALIPRQHSSDRLDIVDRVF QMKLRIFIDDITKYQFFGPISGVVYTIEFQKRGLPHVHIIVWLEKDGPLDVDWIDAFI SAQLPDPSVDRIGYEASPSLCSNRSSPCMNDGKCMGVLYMLGQITTLPQRKVGVDVDN NYVVAHNVDLLVKYQAHINVEIVNRDGMEKYLFKYSTKGPDYAKIGIRDNVDLLVKYQ AHINVEIVNCDGMEKYLFKYSGMEKYLFKYSTKGPGYAKHTYVEFPEFWTWHADGKYW KQRSQSHKGKVGRIANVGPNQGERFYLRILLHVIKGAQFFSDVRIVGGIQYPTFQSAC EAMGLLGDDHEWSHAITDAAQWALPYQLRQLFVMMLLFCQVSDPAKLFDNHVQLMGED FAYRVSQHTPGKTFLWNTLLANIRNKGKIVLAVASSGIVALLLPGGRTPHSRFRIPLD IQEDSMCAIKKNTHLAELIQQTSLIIWDEASVNHRHFFEAFDRTLRDIMSSINHDLVN MQFGGITVVLDGDFRQTLPVIPNARKQQILNASITRSRLWKNCVVLELTENMRLNCPT FSQQDKFRLELFATWLLSLGDGVVHDSAPTDRPDATWVEIPSYLLLPAKERNLACLIS FVYDSIPHLSQLPTYLCEHAILAPTNEITAAINAQIISHTATEEMSYYSFDTIDDATP NYCNVQSLYPAEFLNTVHMSGLPDHHLQLKIGVPIMLLRNLDPSKGLCNGTHLIVT</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..139#219..473#677..757#840..971#1076..1108#1345..1405#1626..2321#2688..2881#3011..3179#3200..3240#3290..3651#4371..4806#5107..6116#atggctgagaatagtagcaagaacccgttggttttggatgagtgcatagtctcagcatcatgtccgagtccagtccaatctattctttgtgatccaggacgcaagcgaaaggtccctatgttagaccagcaatccaaaggtctgctaacaatcaacatatcataaattcattaccttttgtttttgattctatggtgttatttttctgcctctaccagaacctgatcttgcaattttggtctatattaaaggtgccttttgtgctggacaatttagtcagacaacaccctttgttccaaatgtatgcagagataaatttgtctcaacatttaacctaccatcaaggcgagcagttaggcacaggctgatgtttggttctgataatgcacccaacacgacaagtgatagttctcccggtattatcaatctcatttctggtggcccaactcttgctgccgatgaaaccttttgtggtgagctttgcattaaattgtgccttctttgattatttcactaatttctctctgtatttatgggttatatatatgttcatattgacctcaattcaattaacatgctcatcccttgctctgcgactgtgaccattatcgttatgctcacacactctaagttactcccagatttacatacatatgttatattctattggtctcaggtttgccacggccacaaccatgtgttgctgccgagtcgcgtagaaaacgtaaggcggccatgattcacaagagaggcgaaagtaaaatacattattctacattgataggcttttatagaagcttctttttgttgattttgtacaacttttgttggtgttacagagttatgtcctgctatttactccccttcatctcgatctgtttggcgtcgcataatcccaaatgataatgttgtacgccaacaatgccatacacagctacagcagcagaatctgtcctcggcttctcaccaaggtgctgatagtggctaattgatttcttttcagttttctgtgatccactccgatgacatcaaattgtttcctcaattcttgtgggtatctttttcttgctaccagatcctaggcaaccatttgctggtcgccaccaatgtaagttttattattttgccaatctttatgttgtcatatccatcaatttttttagcacatcaggaacatagatgatatgtgtgtttccaatatgcctaggggatatatctcctcattttgcctcaaactcacagttagctttactcaacagcattcgcctacatacaccatgcttttcgactccgcggttctgtcttgatgtttgctctatgatcactctgctgcttgccaaagaggtttcgtcgtaatgataattgccacggctcagctgatacatgccaatggcgcttatgtatggtgatgagaacataccatattgttcattaagctgtcacatatttttatccatcttacttttttatttatgcattttttttctctcaggcactattttttcacctttacatcttggaggacctaactagacatgccagtattgtggtgctctcttttggtatgaggagcgtgtgcgtggtcaaggacgggtagcttcgcctgtgtacaacaaatgttgtaggggaggaagtgttcacttagcaccatacaagccacctccagaaccattgctcagtttgttgactggacaaaaccctgcattatctgcccacttctttgataatattaggcgttacaactctatgtttgctatgagatctatgggcttgaacatcatagggtctattaatgatggaggaggaccttatgttttcaagattagtgggcagctatgtcattggattggatctctaattccaagagatggcgctagaccagaatattgtcagctatacattttttatactgaaaatgaggttcagaataggatggaagttccatgcattagtggtggttttaaaccaaatgaaaatgtcatttcgtctctgatgaggatgtttgatgatcacaacccaattgtgcaagtgttccggactgctcgggatagattgtctgaccaatcagaagacaggtattatgtcaagctatttgttgtgcccaatcaacatggtggtgtgtatagtgcccctgttgcatctgaggttgttgggttggtggtggttaatgatttaggaaccactaatgaaggctgtgatttaataatacaagacaaggcttctcatctacaaaggataaaagaatctcattgcaagtttatggctatgcaataccctctattgttcccatatggggaagatggcttccataaagatctcaggtaccgtcaatgtcaacggtcaaggggtattaagaagaaaaatgtcaccaaagttgagtaatttgcatatagattgcatgatagagctgatgactttagtactcctttacggtgcaagaaattgactcaagcctatgttgttgatggtttttgttgcgtcgaggatggtcgcttgagccattacagggatgagtcatttcagaagaaatttagagctagcccatacaactctttggttcaggctgttagcgctggcattacagaaggatctgcagcaggacagaaaattattttgccagcttcatttactagaagtccacgttattattatcaaaactatcaagattgtgttgcactttgttgtaggtttggatgcccacatcttttcatcactttgacatgcaacgcttcatggtcagaaataacacaagctttagccctcattccaaggcagcactcctctgatcgacttgatattgttgatcgtgttttccaaatgaagctaagaatatttatagatgacataacaaaataccagtttttcggtcctatatctggaggtaatttccatcgctccttaattttgtccacaatttctcatctaacatgccattttttaagatttcttttatttggccaatttcgcccttcaatgattcttatttgcttctcctttttcatttttgtagttgtctatacaattgagttccaaaaacgtggattaccccatgtccatataatcgtatggcttgaaaaggatgggcctcttgatgttgattggattgatgccttcatatctgcacagctaccggacccatctgttgatcgtattggttatgaagcttctccaagtttatggtacatggtccctgtggcagttcaaacagatcgtctccttgcatgaacgatggaaaatgcagtaagttttatcctaaagaatttatagagaaaactatggtgctgcccagtgggcgtgttatatatgctcggccaaataacaacattaccacagagaaaggttggtgtagatgtcgataacaactatgttgtagcccataatgttgatctcttggttaagtatcaagcacacatcaatgttgagattgttaatcgtgatggaatggaaaagtacctattcaagtactcaaccaaaggtcctgactatgctaagattgggattcgggataatgttgatctcttggttaagtatcaagcacacatcaatgttgagattgttaattgtgatggaatggagaagtacctattcaagtactctggaatggagaagtacctatttaagtactcaaccaaaggtcctggctatgctaaggttgggattcgggatggagccaatgaaatactacaacaatatcttgaatgggattcgggatggagccaatgaaatactacatcaatatcttgaatgtaggtgtgtaacaccctgtgaagcttcgtggtgcctactacaatttggcatccactacattgatccatctgtggagcgcttacctgtaggtgtgtaacacactgtgaagcttcgtggtgcctactacaatttgacatccactacactgatccatctgtggagcgcttacctgtgcatctcccactttcatctgtggaacatccactacactgatccatctgtggagcgcttaatccatctgtggagcgcttacctgtgcatctcccactttcatctgtggaacatgatccatctgtggagcgcttaatccatctgtggagcagccactacactgatccatctgtggagcgcttaatccatctgtggagcgcttacctgtacatctcccactttcatctgtggagcagccaagcatgtgcgcacccgggaagaatttcccggtcggtcacccatcccaaaattgctacaggccaagcacgcttaacctcagagttctttcaagatcagcttccggaaaggaagttgcaacttgttggtatgagtattctattaatcctattaagccctgagccaaattgactgcatggtttgatgttaataggatatacccacatgcttaccagcacacgtatgtggaatttcctgagttttggacatggcatgctgatggtaaatattggaaacaacgctctcagagccataagggtaaggttggtcgcattgccaatgttggacctaaccagggtgagcgattctacttgcgtatattattgcatgttatcaaaggtgctcaatttttttctgatgtacgcattgttggtggcattcaatacccaacttttcaatctgcatgcgaagcaatggggttacttggtgatgatcatgaatggtctcatgctatcactgatgcagcacagtgggcgcttccatatcaacttcggcagttatttgtcatgatgcttctgttttgtcaagtatcagacccagccaaactgtttgacaatcatgttcagctgatgggtgaggactttgcgtatcgtgtgtcccaacatacacctggtatacatcaaactatcattcaagagcatatcagatcatccaccctg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External Link(s)

NCBI Gene:Os01g0300400, RefSeq:Os01g0300400