Os01g0316600
| Gene Name |
Os01g0316600 |
|---|---|
| Description |
Similar to ASF/SF2-like pre-mRNA splicing factor SRP30' |
| Version |
NM_001049414.1 GI:115436241 GeneID:4327263 |
| Length |
5766 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0316600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:12101570..12107335 |
| Sequence Coding Region |
12104174..12104248,12104333..12104438,12104520..12104566,12104636..12104693,12105079..12105128 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>FEDPRDADDAICGRDGYNFDGYRLRVELAHGGRGQSYSYDRPRS YSSGRRGGVSRRSEYRVMVTGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFSDVYREAGATVGIVD YTTYEDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYIRVREYDDRSRSRSRSYSRSRSYSRSTMAAL IVDCIVPQICFSVTVTCG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>2605..2679#2764..2869#2951..2997#3067..3124#3510..3559#3939..3995#4120..4263#accgctctccctctccccgtcaggtgcgttcgtcggaaatcatcgggaaaaaccccgaaatcctctcccagctttcccttttttttttcccttcttctccgcgcgcgtgttctcctcgatctctccgatcatcatcgcgtgtggtggccgattggctgcggttcccttcccggaaattctgcggcgcgcgccgccatttttatccgtctgtctacagggtagggagttctcagattagaaaccaggggttctcccgttttggcgctagttatggtagagatttcgttacctttgcatatgccatggcttcgtcggctctatgcacggagcctatgtatgtatgtatgtatgcttttatttttaagtttgtctcgtctagagtacgcggtggcgatgggaaacagccgctagatttgtttattgtttctttaccctaatcacaggtatgggtatttgagattagttacgaaacatcttagatatatgcggctattcagtttttttttttaatgtgcaagaatccaaaagtctattaattagcatgtaaaaggacttgtgctgataaattctttagtttttagtacaagtgtctgtatctagtttcaatacaagttgcaatccagactacgttaataacactaaaagattgtattgatacaaatccatgattattatggcgcattgaagagaggaaacagaggaaggtaggcttgtcctgcacggcttgaagctctgcttgccttggccaaggtttggacagaggcccttttgagttctatacactggttgattactccctgttacaaatctgagcaatctttatcgacgagggcctagctaataatcaggaaaaatagagataaagtggaaagtagataacaaacgccaaactaggaaatagatgactgcatatctttcagccggatatggtccctcctgctgtaggcgcggacccagaatgcttgtacagctggtatttatacctatttggcaggtagataatgatgattgaacatggtattggtgctttgggtgacagttaaatatttctaaggaaatcactgcacaaatatcattttttttgtttgggaaatatcttgtttttgttttgaaaaatttaaagtttatggtgaaatctcttttgtgcagccttggtattatgtaaatctccaaattctgtagtttagtgttatactgtcgaaatttgccctttccccaatctttgctgttgtttgacaatatgcgcctacacaaaattagtacagtgctacgctcctttgtgcttgaaatgtttccccatattatttattaacagaatcttgaatttacaaggtcattttatcttgcatatttgcatctataattttagttgacctgctttaactcctatatatgcagaaacaatgagcagacgcaacagccgcaccatctatgtaggcaatctccctggggacattcgtgagagggaggttgaggatctcttttacaaggtgagctttactgctttacaatctacctcagttcttctcataagcaactaccatttcaatctggtcgtagctgtataggcataatacattgcttattttcctacctgttaagttgccttagcttattaatgtgagaaatagctagcggttgaaggatttaaatcactattatgctagtggttgaaggatttaaataattattattatagtattataagagttataaaggattattgttctgtaattcgtggatgagtctaagggtaaagcaattgcgggaagaaaggaaccatctggccttgtgtcgccaaagaagcgctatttaggaagttgtcttgtctgtattaaatatctgttggctgtttcaacttgcgatgtcttctcctgctgttttggtagtgaataatcattttcttaatagcacaaccattgatgctcttgagcatccatcagcgtaaacagttgggtgtgatttatcctagatgacaactgataacctgtgtgccattgcgaaaaagtagtcatatattgcagatgggaacgtgttgacaaatgatatatttcatgagtcatattcagattaagggtgttgtatttgtacttattttctaagctaatgtggaggtgcagttgtgaaaagtttcactaataagtccaattaagtttatgtatatatgttattccagtgtttttatcccttacaattgcaataagaaccttaatcttgataacatgcatgcttttttttctcataaatttattctaatgcagtacggtcgcattttggacattgacttgaagattcctccaagacctcctggttatgcttttgtttaggtgagtgtccttttgcaacagccatgtcttctgtaagggtacttgtattgaaaattttattgaaatttataatatagtccctattattaccctgatattaatatcatttcttctttaaaggatggttgttttcaataaaatttacttctagatttttttcaagactaagttttagtttaggtatagctaagttttcttaagatgtaagtgcatcttttaagatgtatagctaagtattggatgctaaatagctaatagaaaatatgtgcttttgtagtttgaggatccccgtgatgctgatgatgcaatttgcggccgtgatgggtataactttgatggctacaggttgcgggtatggatatcaaaatgtttttcttccggtcttctggtctgctttggttttctgtgcctgtggctttatattttctgtacgtaggtggaattagctcatggtggaagaggtcaatcttactcatacgatcgcccaagaagctatagcagtggacgacgtggaggtgtttctaggcgttctgaatatcgcggtttgtaattctttctcttgaatgtgttagtcggtgtatcccaacaaagaatgtgatgtttctatttgttggaccatgcagttatggtcactggcttaccttcatcggcatcatggcaggatcttaaggtattggtgttgtacataacttctatttatagatttttctctaatgacctaattattacctacattcaggaccatatgcggcgggctggtgatgtctgcttctctgatgtataccgtgaggctggaggttagtaataaatgttctcttcttgttatgtcatcgtaccatgggccctgggatgagaatcaattgcttatgtgttgatcttagttttaattcattgtcctccgaaatcaagattcatgctttaatattttttctgagaatacaaaagctgtgtattatttcattaagacagagactggatgacgtctgtcagctggtcatcaggcccgtcaaaccccctcaggtcagggaaaaataattataaaagaagtcctaaaatgctaaaactgaaaatgaaagaaacgacaatgtcctatactcagaagcaacctctgagcctgcagaggcctttctatatagtttgcgggctatgtcagtaatatttgtctttctgtttgtgttgcagcaaccgttggaattgtggattatacaacctatgaagacatgaagtatgcggtatgtttgatatcttctgtataaagtgcattctgaaaatattatactttttggtaattgatgagggaacattttcagatgtgttattcctgttatacactttggtcatatacgttgacatttatggcaagatttggtcaaatttttgaaatgttgactatcaattttatattagaataagtttataaaatctaataaatttatgacattatgatagtacttttcaaggtaaatctagcctaccatctttttttttcaacaaagcatttgaaaaattattaatgattgaagtttcataagtttgacataaaaatcaaatatttatgattagagggagtatttggtatgtatctcttatgatcttttgatgatcttgcagattaggaagcttgatgactcagagttcagaaatgcattttcacgggcatatatcagggtatggatttatttgttttttgaccatgagggtttttcctgtttttgctatgataatagataatatgtcttctagatgcatttgattgtgatctttcgtcaacgtgttcttatttctatgataggtgagggagtatgatgatagatcaagaagcagaagccgctcttactcaagaagtcgtagttacagcaggagcactatggcagcactaattgttgactgcattgttccacagatctgtttctcggtcaccgtcacctgtggatgaaaggtatatccttttataacatcagctttttactggcatgccttttttgtcgttaaagagaaacaggagtatgtgttggaatttgggtttttatatactttggaacttccactgtggttcataaaacatatgattgaaaagcttgtaatgtatttccttttttttgaccgactaatgtatgtctccttttaaattgatatgacttaaatttcctctatggcccaatgactaaaacacagtgctggtggctaacttgcaatgttcaaggtttgcttttgtttttcctagatctggccatgcggcaatctggggactgctttcatagattttggatatgttgagaatcgaaaggatggtttggaactttggatagtagagctggattgtgatgcatgtatggcaaatgggcaacaaccagtcctaggagcgagctaggcctgacagtaaggatatgtggagtggatttgtgttattattgagaatttgttgaccgtaggcacttcaatttcatatactgcatgacatggacctaacttacatgagatctcaaagttttcttttaattattcttgcatcctgataaaacaagattatggtacttggtaagcatttttctggaatatgtacgtgcttttttcacaacaaa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