Os01g0365300

From RiceWiki
Revision as of 04:40, 25 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os01g0365300| Description = Hypothetical protein| Version = NM_001049572.2 GI:297596767 GeneID:4325724| Length = 3056 bp| Definition = Oryza sa...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os01g0365300

Description

Hypothetical protein

Version

NM_001049572.2 GI:297596767 GeneID:4325724

Length

3056 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os01g0365300, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:15067582..15070637

Sequence Coding Region

15067615..15067710,15068521..15068658,15068960..15069157

Expression

GEO Profiles:Os01g0365300

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008394:15067582..15070637 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008394:15067582..15070637 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgtttagacttgttcaagtgttgcaagcaatttctatgtgtgcgttcttgcttgtagatgcaagagctgtccgattgtatccttctcttcaagaggaaaataattcattagggcaatatctgctacatgctgcacccaatcagaagatgatgctgtataagacattcatgatgtcaaactccattctgacaagaaaagttgtacacgacattaattcagcgaaggtgtcatattttgccacgcatcaatctactggtcctaatgagaattactacgggctacgtgcgacgatggatgtgtatggtcatgaactaaaacccggtcagctgagtggaggtgcactttgggtcagtcatttcggtgacgatggcaaactatcaagctataatgcagttggcgctggttggcatgtaagcaactataatatttaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MFRLVQVLQAISMCAFLLVDARAVRLYPSLQEENNSLGQYLLHA APNQKMMLYKTFMMSNSILTRKVVHDINSAKVSYFATHQSTGPNENYYGLRATMDVYG HELKPGQLSGGALWVSHFGDDGKLSSYNAVGAGWHVSNYNI</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>34..129#940..1077#1379..1576#tgttctcatatcctttctctatgggtacccaaaatgtttagacttgttcaagtgttgcaagcaatttctatgtgtgcgttcttgcttgtagatgcaagagctgtccgattgtatccttctcttcaagaggtactgtatttatgtgaatgttatatcgtttcttacacgtatattctatatgtctccagaacatattatcttgcatgcagtggcaattgctttcatttgatatgatataatattaatgcatccattctggtgatttgattatgtttcactattttcaagagttgacacattcttccgttgggtgttagaacattaattttatatgagaggtgaaattaacgcacaattagtttagaaattaattgtgtgtctgattaacttgtacagtagttgtgttggaattttagagatatattatttctccagctttcagtagaagagttggttttgtacttcttgacataatgacatttacggtgtaataagcatgtacggtgtaagatgactgattcatgatgtgatggtcttatatatacacggttagtgggatgaatccactaagcatgtgtttttcatgaatgacgaattgatggacaaacccaatcggtttgtcaaacaaacatgtcaagccataggtatacgtattcacagcaaatttttagacattaaaacactcgtacatctaacaataaatgttactccctcagtctcaaaattcccaaaatatagctacttgaggaagtacattaattggttgtatggaaagaacatgcatatatatgaattggttgactggttgttttattatttccattaaaaaataaacagtacattttagtcgatacctaatttttagccagaaagataaaactagcattaactttcccctgttaacacccagctaatttcttttctttgcgcttcattcaggaaaataattcattagggcaatatctgctacatgctgcacccaatcagaagatgatgctgtataagacattcatgatgtcaaactccattctgacaagaaaagttgtacacgacattaattcagcgaaggtgtcatatgtgagttaaaaattatattattggtgtcaatttaattattgcaggatcaatttaatcttgcaattgttactgtttttttcgcggggattgcaattgttattcaaagtcgatcttgtcaaaacaaaataaagtacgctttatatttttggtcagggggaagcaattgaatgtctagcgcatatttatatttctaaacagtaataaatagctagattcctggtttttggagttgctgttggtttcattgatatgtttagcagcggtatagtttgtctgactgattactgtactgtacgtgcagtttgccacgcatcaatctactggtcctaatgagaattactacgggctacgtgcgacgatggatgtgtatggtcatgaactaaaacccggtcagctgagtggaggtgcactttgggtcagtcatttcggtgacgatggcaaactatcaagctataatgcagttggcgctggttggcatgtaagcaactataatatttaaccttttttatttaaatgctgtgttcaactgtagtcagccgctatgaatgaaattttaatgatatatatgactgcttagacatgcatcttcctttttcccatttgtgtttgtgtttacagattgatcctgaacgctatggcgactctcgtcctcacttttatacttcctggacggtatgtgaaaactgatgacaggattaattgcagctaagtactaatatgtactgttctgttaaattttgtgtgtgtatatatatatatatatattttactttgcgtatatgaaacagagagatggctatgcgaccactgggtgctacaatatggactgcccaggttttgaacgagcaaacggtgctgcggttgcaccaggtgcttctattgacccagtttcagatgacaaaagcctacagagtattacagttgaagtgctgttggtaagagtttcatccttttagcgtaacaaaattttatggtcattagtaacggcggaagaggccttattagtcaacctaacttctccctatgtccaaaaaaaactcaattcttaagttgttgtgtccaacgtttgaccgtccgtcttatataaaatttttttatgattagtattttcattattgttagatgataaaacatgaataatactttatacatgacttatcttttaaattttttcataattttttttaaataagacggacggtctaacgttagatacggaaacccaagaattgaatttttttgggacggagggagtacgtcatagcccaaagcctatgacgaaaagtttatggtttctggaataaaatatttaattcactagtggtgtagtagttccattcacttggattcaaattccggtgccaacgaatattatacacatactagtgggctttcaacatgattttggtaagatcagcgatgtgccactggtttccattttctggagcgtgtgttaagtaacccatatgcggggtgtgatgtggtgttacatgtgtagtaatatatgcgcggtgtatctgccgtgtaataagaaaaatatttaactgaaaccctcgccaattgcaggacagggacaagtggagattggtgggtgtactatggcttcaacggtgttcccacgggggtgggctcttacccaaaatctctgttcactaatatggcagagaaggcgaatgctatcgcgtttggtggctatgtggttactcgacgagcactgcctactccaccaatgggaagcgggtctcacccacatactaataagagccgtgctgcatcactgactaatcttggtgtgatcaatcaggatggaaacaccaaccctatcaacgcagacttgcctacttatatgggcaatgagtaatgctactctattactcctgttgcgcaggctgagtgcttttatggcgggcctggtggatgcatgccctaacttgttttctttttcgaactttgatctatccagaaagttattttgatct</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os01g0365300, RefSeq:Os01g0365300