Os01g0369000
| Gene Name |
Os01g0369000 |
|---|---|
| Description |
Similar to Cullin-1 |
| Version |
NM_001049583.1 GI:115436579 GeneID:4325735 |
| Length |
8562 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0369000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:15362557..15371118 |
| Sequence Coding Region |
15363159..15363260,15363630..15363797,15364691..15364909,15364983..15365126,15365238..15365520 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:15362557..15371118 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:15362557..15371118 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgacccacgagcggaagacgatcgatctggagcaggggtgggagttcatgcagaagggcatcaccaagctgaagaacatcctcgaggggaagcccgaaccccagttcagctccgaggactacatgatgctctacacgacgatttacaacatgtgcacgcagaagccgccgcacgactactcgcagcagctctacgagaagtaccgcgagtccttcgaggagtacatcacgtccatggtcttaccttcattaagagagaaacatgatgagtttatgctgagagagctagtaaaacggtggtcaaaccataaagtgatggttcggtggctatcacgcttcttccattatcttgatcggtactttatttcaaggaggtccctaccacaactaagtgaagttgggcttagctgtttccgggatctggtatatcaagagatcaaaggaaaagtaaaaagtgcggtgatatccttgatagatcaagaacgtgagggtgaacaaattgatagggccctgttaaagaatgttctggatatatttgttgagattggcttgactagcatggactactacgaaaatgattttgaagatttcttgctcaaagatactgcagactattactctataaaagcccagacctggattcttgaggactcttgtccagattacatgttaaaggcagaggagtgtctgaaaagggagaaagagcgagttgctcattatttgcactccagtagtgaacagaagttgttggagaaagtgcaacatgagttgctaactcaatacgcaagtcagctcctggagaaggagcattctggatgccatgcattgcttcgtgatgacaaggttgatgatctctctagaatgtacaggctcttttccagaataactcgtggtttagaacctgtttctcaaatatttaagcagcatgttactaatgagggcactgccttagtgaagcaagccgaagatgctgctagtaataagaagccagagaagaaggagatagttggtttacaggaacaggtttttgtccggaaaatcattgagcttcatgacaagtatgtagcttatgttacggattgttttcaggggcacactctcttccataaggcacttaaggaggcttttgaagttttttgcaacaaaggtgtttctggcagttcaagtgctgaattactagctaccttctgtgacaatatcttaaagaaaggcggtagtgaaaagcttagtgatgaagcaattgaagatacccttgagaaggttgtaaggttacttgcctacattagtgacaaggacttgtttgctgagttctatagaaagaagcttgcaaggagattgctttttgacaagagtgctaatgatgaacatgagagaagcatccttaccaagctaaagcaacaatgtggagggcagttcacttccaaaatggagggcatggttactgatctcactgtggcaagagatcaccaggctaaatttgaagagttcataagcacacactcagagttgaatcctggaatagccttagctgttactgtcctcacaacaggattttggccaagttacaaatcttttgatataaatctacctgcagaaatggtgaaatgtgtagaggttttcaaggagttttaccaaacaagaacaaaacacaggaaacttacctggatttattcactgggaacctgtaatattaatgctaaatttgaggccaaaactattgagctcattgttacaacttatcaggctgcattgctgctgctgtttaatggagttgatagactcagctattctgagattgtgacacagttaaatctctcagatgatgatgttgttcgattgctccattctctatcttgtgcaaaatacaagattcttagcaaagaaccaaataatagatctatttcaccaaatgatgtcttcgagttcaactcaaagtttactgacaagctgcgaagattaaagatacctcttcctccagttgatgagaagaagaaagtagttgaagatgttgataaggatcgcagatacgcaattgatgcatcaattgtgcgtattatgaagagtcgcaaagtattgggtcatcagcaacttgtgatggaatgtgtggagcagcttggacgcatgtttaagcctgacttcaaggcaataaagaagcgaattgaggatcttatcacaagggattacttggagagggataaagacaacccaaatgtgtacagatacttggcttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MATHERKTIDLEQGWEFMQKGITKLKNILEGKPEPQFSSEDYMM LYTTIYNMCTQKPPHDYSQQLYEKYRESFEEYITSMVLPSLREKHDEFMLRELVKRWS NHKVMVRWLSRFFHYLDRYFISRRSLPQLSEVGLSCFRDLVYQEIKGKVKSAVISLID QEREGEQIDRALLKNVLDIFVEIGLTSMDYYENDFEDFLLKDTADYYSIKAQTWILED SCPDYMLKAEECLKREKERVAHYLHSSSEQKLLEKVQHELLTQYASQLLEKEHSGCHA LLRDDKVDDLSRMYRLFSRITRGLEPVSQIFKQHVTNEGTALVKQAEDAASNKKPEKK EIVGLQEQVFVRKIIELHDKYVAYVTDCFQGHTLFHKALKEAFEVFCNKGVSGSSSAE LLATFCDNILKKGGSEKLSDEAIEDTLEKVVRLLAYISDKDLFAEFYRKKLARRLLFD KSANDEHERSILTKLKQQCGGQFTSKMEGMVTDLTVARDHQAKFEEFISTHSELNPGI ALAVTVLTTGFWPSYKSFDINLPAEMVKCVEVFKEFYQTRTKHRKLTWIYSLGTCNIN AKFEAKTIELIVTTYQAALLLLFNGVDRLSYSEIVTQLNLSDDDVVRLLHSLSCAKYK ILSKEPNNRSISPNDVFEFNSKFTDKLRRLKIPLPPVDEKKKVVEDVDKDRRYAIDAS IVRIMKSRKVLGHQQLVMECVEQLGRMFKPDFKAIKKRIEDLITRDYLERDKDNPNVY RYLA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>7859..7960#7322..7489#6210..6428#5993..6136#5599..5881#5448..5503#5223..5372#5054..5140#4941..4976#4631..4693#4472..4552#4297..4386#4013..4090#3726..3929#3604..3651#3306..3491#430..529#193..332#atcccccctcctcctcccctcttcgcctccgtccacctcgcgtgcggcgggagggaacccaccgacctcgttcccctccccccacgtacacgacagcgaagagccccccccaagctagggctccccggcggatcctcggcggggtgggtctcgcgccgcccttcccccgattcggcggcggcgccggccgcgatggcgacccacgagcggaagacgatcgatctggagcaggggtgggagttcatgcagaagggcatcaccaagctgaagaacatcctcgaggggaagcccgaaccccagttcagctccgaggactacatgatgctctacacgtgcgtgtgcccgccctcctcgatttctctcccgatttattcgatttttttcttccccgcgcgctgatctgatttagggttcgtctccgtgctccaggacgatttacaacatgtgcacgcagaagccgccgcacgactactcgcagcagctctacgagaagtaccgcgagtccttcgaggagtacatcacgtccatggtgagcggctgttgggttcctcccttcattgactagctcgattaatgcgctcctgtgttgaattttctaacgcagatgggttagggatagcgttgaaattatgccaatcatgtcgtatgtaccaatggactaatagcacacgcattgagagtttatagctgtttacatagagaagatagattcgatgccgaaagatgctgctctaattttgatcattgtcgatactttggagcaatcgagatattttttgttggcttcttctgataggtagataattgtactttcttaactaaggaggaccgcactaagtactgcagtattacttcatgtttttttgaatatagcttactgcgttttgcttattatttggtcactgtgctcttagatgctgtctgctaaaagtactttagtttgtactgcctgtgtccactatacaattttttttgatttgcttggagagcatgagttgctcaatttagcatgattttattcagtgcatttggatttgatcttactggaagtaggctactaacatcatcactacagaagtactccaattcactgcctgtgcatttatataaacttcgcgatttacttagagagcattgattattcaatttgggatgattttcttcagcacatttggatttgttgttacccagagcagactagcatcatttttaccgaaaaggctcatgccctgctttactgaaagcttcaaaggttcaacaaaatagcatcatattgagttttgttttctgaattggaatccctttatgttgaaatgattgttctttcatgattttgtcccttttcatcatggcagcatgtactgtgcaaccacactttattgtgtaatcactttctgtttgggcgccaaatcgacatgagaagttttgagaaatactgaatttgcaaggcatatgttcctttcaactatgaattgtgattgtaggatcaattgagcaaccactgtgggtagaatgctagatgcctggatgcatattactgttgtttctttatcctccctcagtcccttgtattgacctttacttctttcccaataaattattatccacaaaaggatcaatttctttagtaaatgtaccttgcaccaggttgcatcatgaaatcggaggaaaacctcatgaaatttgagtgaagccttatgaaacttgatgaatcttgaccatgtttgacaaagtttcatttagggcttatggcatttcttgggatatatattagttcgatgatgtaatctggtgcgaaatgtgtgccacacctcatgcaaagtgaaatacggtgcttaccgtgctttacttggtgcaaaatgcagtttattcatttttgttcaaagctaatctttgattttgttacctgttgattgcatgatgtgtcataaacacttcgaagatattgtgatttgaactgtttatggtttaatgtcacatctttcatatctgagagaatttacataatgaccatatgcatatctattacactctccctcactcattttgcattggatcattttaatgctgagcaaagtgctcctcaagtcctcatgtaattcaccagaaaaaatgcttttcaatgttctgaattgtgccgcgtctattgtctaatatgttaactttgtttttcaaggtgtaagtttttcgaggtcataacttgcttgctaagcatcgattacttgatttagtgatgctggaacagttgctgctgctgaaatctgtccatactacatccattccatttgaaatatcggtttccttttccctttgcatcaacaggacctttatagtatcatcctggcatatagatatgcatatgtttctaggatgtatgtgttcattgctatttagtgtgcagcgacttgtattaaatatgtaaatatgctaattgctatttgttgttgataagttaagtatatctcaaatatatggttgatcatataattgatacaacattttctataactagatattgcaatgcatacgattctatggtcgggaccctggttccccgccatattgaggatctgtatatgaagtcctgagcttagttgctccctgtcctgtttcccttcctatttggagaaagtctatttctcgtccctcaatttttgactcagtttagttttgtacctcaattgcaaaacagggttaaatatgtcccactcccacaattctgaaaaccgggtaaaagttgcccctccaccatgtttggtgatagtttggacccaaatagatagtggggcccatttgtcatagagtgtcatggctgattgtgtaagattcaccattctccagtccatttcccaaatagatagtggggccccacctgctgagtcaaaatcactataggatagggcagtgggataagttttgtttggttttgagagttgatgggcagcttttatatggttttatagttgagggatgaaattaaaacgtgtgaagtgttgagagatgaaaacagactttttccatcctattatgataggattgagatcctctgacttacttctctctaacgtggtcactgacatgtgcgccctctactcagcggtcccacttgtcaataactcaaagttagaggatcctcttccattatgatatagttcattagtagttctagctaattatcatgcactacaaattcaatgaagtttaattactcttcatcatttgcatgttgcctatctcagatcttcttttgtattgttcacttcttttggaagataagtcctttatttggtttcaatattttgtaggtcttaccttcattaagagagaaacatgatgagtttatgctgagagagctagtaaaacggtggtcaaaccataaagtgatggttcggtggctatcacgcttcttccattatcttgatcggtactttatttcaaggaggtccctaccacaactaagtgaagttgggcttagctgtttccgggatctggtaacactacttgcttgattactcatgattctcgttttttatgcaatacaacttgcatttctttgcttgatgactatatctagaatttaatcagttttatttattgtaacaggtatatcaagagatcaaaggaaaagtaaaaagtgcggtgatatccttggtgagtcattgtatcttgtgatgctatctttttttattgtgtatggctggtgatagacatactttctcgaacagatagatcaagaacgtgagggtgaacaaattgatagggccctgttaaagaatgttctggatatatttgttgagattggcttgactagcatggactactacgaaaatgattttgaagatttcttgctcaaagatactgcagactattactctataaaagcccagacctggattcttgaggactcttgtccagattacatgttaaaggtattctcaagaatgtttcatgaacatccctatctgtaggtaagcataatatatattttttctaatggttgtttgtttcataggcagaggagtgtctgaaaagggagaaagagcgagttgctcattatttgcactccagtagtgaacagaagttgttggaggttagtgaattgtctgctgttgcttctactccacagtccacattttagagcatactttttgatatttaatctacgtttgctaagtgcatacacaccacatgtccatatacaatttataattgtatgttcagaaatcagaatatatttttttcctgatagagcattatgtataattcactttctccggtatgacatgattttcacagaaagtgcaacatgagttgctaactcaatacgcaagtcagctcctggagaaggagcattctggatgccatgcattgcttcgtgatgacaaggtttcttggagaagctccacgtctctcaacagtttatcaggaacaaatgaagtctgctaacatagcatcttctgttttactccaggttgatgatctctctagaatgtacaggctcttttccagaataactcgtggtttagaacctgtttctcaaatatttaagcaggtattttgtttttcagaagagagtggtttatttcttaaatctattttgatgatgtaatggaatgttgcttctgtgtagcatgttactaatgagggcactgccttagtgaagcaagccgaagatgctgctagtaataagaaggtgcacagtctatatattaacttttgtttgtattaatgttgtcttagtacattcatcttattgtgtacttggggtggtatcaattggttaggatatttaatcaattagctagactttgtactcaactcttgctggtaacatatgtagtgatatttactctgctgatctgtacatatagctctgcactccgccaaacactttggatttgcacttgaagtaattttgctttttctttgttatactgcagccagagaagaaggagatagttggtttacaggaacaggttttgtttcaataactttttatatattctttcgtggctctacacttgtttcaattactcactgtttgttatcttaggtttttgtccggaaaatcattgagcttcatgacaagtatgtagcttatgttacggattgttttcaggggcacactctcttccataaggtttgctatttgatatgctcacaccattattgtcataatgatatcaaaatattggatcatgttctgtatcctgtttatgcaggcacttaaggaggcttttgaagttttttgcaacaaaggtgtttctggcagttcaagtgctgaattactagctaccttctgtgacaatatcttaaagaaaggcggtagtgaaaagcttagtgatgaagcaattgaagatacccttgagaaggtacaaccatcaatttgttatgtttgatctattagtgtcattagtaagtcctaatcttgaatgggtgattaccaggttgtaaggttacttgcctacattagtgacaaggacttgtttgctgagttctataggtaagctgttattatcttgcatgcttattctttttgtctttaaattcttgcgcatggattcatgcagttgttaacctctggggctaaatttgcagaaagaagcttgcaaggagattgctttttgacaagagtgctaatgatgaacatgagagaagcatccttaccaagctaaagcaacaatgtggagggcagttcacttccaaaatggagggcatggttactgatctcactgtggcaagagatcaccaggctaaatttgaagagttcataagcacacactcagagttgaatcctggaatagccttagctgttactgtcctcacaacaggattttggccaagttacaaatcttttgatataaatctacctgcagaaatggtaagtttgccttgaggcttttaaaaggccggagtttgccttattttgcataaaatttgtggttggcattctgctctacacacagtgattgttttatttttttatttttaggtgaaatgtgtagaggttttcaaggagttttaccaaacaagaacaaaacacaggaaacttacctggatttattcactgggaacctgtaatattaatgctaaatttgaggccaaaactattgagctcattgttacaacttatcaggtagttcgaaatcacattatccacttccctcttgtattatgacttctgaaatgcctttcacttttgttggtaggctgcattgctgctgctgtttaatggagttgatagactcagctattctgagattgtgacacagttaaatctctcagatgatgatgttgttcgattgctccattctctatcttgtgcaaaatacaagattcttagcaaagaaccaaataatagatctatttcaccaaatgatgtcttcgagttcaactcaaagtttactgacaagctgcgaagattaaaggtatcttcaatttatttgttttataggtttgataatttacttctggcaacattggttatgtagcttcggaagtttgtatttttagttttatacccctcaaatttttgggttcattttattaccaaggtcacaccgttgcatcttttaaccaattcaatgatgctgagaccacctgttgttatctttgatcatgtggcctcatccgatcagacagcaaggttggctacccaaccaagaagccaacacaggcttgaattagtctccatatgctcagccattaaattgtacacaagcaagctgcacaccaacaaaagagaatggaaactatggcaatgtaagatgtagaatgtggcagtgctggcaaaggcatcattggcaggtgccagtaagcggccgctagccaatatgggtgcatgctaaggatgatgggttttgcgtcctcagttctggataaagttaaagaaaaatgaaaaaaaaaaactccctccgtcccaaattataggacgtcctctttttaaggaaaatcaaacttggtaatttttttttactaataatcatactaatcatatatatgctacatattatgcatgttatatcactagattcatatttgttggaaacataacatggtataaattaatggtcaaagtatgtcattgaagaccatgtaaaaaaatataggccttataattttggatggagggagtactaaggaatatgtatagagtggtaaagaaaatcagcagtgagatcttctgacggcaataaagtgaacccatattcagtggtataatatgaaagcgtgaacttctgatgttgcataatcaattatgcttgtacttttctgatttctctggttcaatgtattatctttgtgtttgtgctgtttttagatacctcttcctccagttgatgagaagaagaaagtagttgaagatgttgataaggatcgcagatacgcaattgatgcatcaattgtgcgtattatgaagagtcgcaaagtattgggtcatcagcaacttgtgatggaatgtgtggagcagcttggacgcatgtttaaggtacgagttatttcttcaagaaagttcttgcacttgttagtgaaagcattttaaacacactccatttatgtaagtgctgggctcaatccattatgttcttttaaggtcatggtgttcctacgaaattcttggtacaactcattaattgtactttgttgatgtagagtttgttgattgccttgatgggctagcaccgttttgttcagttagacttggaccaccgtcttgttggtgtttccttattctgaaatatactataattattaaatataatgaatctgacatccgggaaatgtgtaaagcacttgtttgctcgaaactcctttgatgtcttcaccatcacaagtttttttctcttttccgttgcagcctgacttcaaggcaataaagaagcgaattgaggatcttatcacaagggattacttggagagggataaagacaacccaaatgtgtacagatacttggcttgatgggttttctgctggtggacggatacttgccggagcctgacttctgtgccctgcggtgctgcatttacgaatgggaaaatgataaaagtcgtcttgtggtacaacaccactggctgctttgagttttcaggcaatggttggtctgtcaaaaactcagcagagtccgccaggacaaagatttgctgctgggacttcgcaaggttctcctaaatgttgtaatcttatactaggtgatgccttatttgttacttttctgcatatcatatagttttgttgattttcaatatgttgtctagaatctagataaatggagggatactatgagttagcgatccaaccgtgccctactctcaagtcacaaagcagtaagatggccatctctgctgtaatatttattgtgtatgatgtcgtagatatgctggaagcactaatgataatggtgcattgcttcgccccacatcgtggtttattgtacaagttgagctactttgttaagtactatttgtgcttgtaattttgcaagtttgcggtacttttttttttggcataaaatgttgattaagccgtgacccccaataaagtgttattagatcccttatttc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
