Os01g0507900
| Gene Name |
Os01g0507900 |
|---|---|
| Description |
Similar to NClpP3 (ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP3) |
| Version |
NM_001049690.1 GI:115436865 GeneID:4324049 |
| Length |
5647 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0507900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:19403207..19408853 |
| Sequence Coding Region |
19403283..19403561,19404867..19404981,19407553..19407728,19408058..19408153,19408239..19408517 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggaggcagcggcagccatggcggccctccccgcttctccctgctcatcctcctcgtccccgtcgtcccttttcctcgctcccaacccgtgctgctggaaggcggcgccaagagctacggtccgcgcatcggcgtcggcggcacggcggacgctctcctccgcgtgggaacttcccgggccgtcggcggctcggcctgcggcaaggaagccgcgcctcgaggagctggacaccaccaacatgctccttcgccagcgcatcgtcttcctcggctccccggtggatgatatgagtgctgatcttatcatcagccaactcttgctgctggatgctgaggataaaactaaggacatcaaattgtttattaactcacctggaggctccataacagcaggaatgggagtttatgatgccatgaaattttgcaaggctgatatatcaactgtctgctttggactggcggcttccatgggtgcatttttgctagctgctgggacaaaggggaagagattttgcatgcctaatgcgagaattatgatccatcaaccatcagggggtgctggtgggaaggtcacagagatgggattacagatacgagagatgatgtatgagaagataaagatcaacaaaatactgtcaagaatcaccgggaagcctgaagagcagattgatgaggatacaaagtttgactatttcatgagtccttgggaagccaaggattatggcatagttgacagcgttatagatgaagggaagccggggttggttgctcctttggcaggagctgtgccacctccaaaatcgcgtgtgtggtacttatggaatgcttcaggaccaactagaaaaatcatgaaaaatctaccttcagaggagaagcttattcaaaatggtaatggcagtgcaagtggagacgatgggaagttcaaggagatctcaacagcttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEAAAAMAALPASPCSSSSSPSSLFLAPNPCCWKAAPRATVRAS ASAARRTLSSAWELPGPSAARPAARKPRLEELDTTNMLLRQRIVFLGSPVDDMSADLI ISQLLLLDAEDKTKDIKLFINSPGGSITAGMGVYDAMKFCKADISTVCFGLAASMGAF LLAAGTKGKRFCMPNARIMIHQPSGGAGGKVTEMGLQIREMMYEKIKINKILSRITGK PEEQIDEDTKFDYFMSPWEAKDYGIVDSVIDEGKPGLVAPLAGAVPPPKSRVWYLWNA SGPTRKIMKNLPSEEKLIQNGNGSASGDDGKFKEISTA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>77..355#1661..1775#4347..4522#4852..4947#5033..5311#gttccttctccaaacccctgcgcaggataacacacactagcaggcagcagcagcagaagcagccgcgagccaagaaatggaggcagcggcagccatggcggccctccccgcttctccctgctcatcctcctcgtccccgtcgtcccttttcctcgctcccaacccgtgctgctggaaggcggcgccaagagctacggtccgcgcatcggcgtcggcggcacggcggacgctctcctccgcgtgggaacttcccgggccgtcggcggctcggcctgcggcaaggaagccgcgcctcgaggagctggacaccaccaacatgctccttcgccagcgcatcgtcttcctcggctccccggttagccttttcttcttcccccccccaaatcgcactgtgtgtgttgttattacccattaagcagttcttgttcaattattaatatcgaaatgtttgcgaattttatggtgtgaaaaaagttaagtgtaatttcctcgccatttttttttaaaaaaaacgaaatgcactagtttaggaataagaaagatttgcaattcaattatgtcaaccaaaatgtagcccaatatgttctttggtatgcccattgtcacatatttgtttccttgaggattatggcttcttatatgcgtgtggtaaaagtgtattgacttatataaacttatgttgtctcaaacttatgtagtttgcaaagaactagaagcattttagtaacacttaatgggcatccaagattttatatggcatgctatgatcaccctctagtatacattatgtgatattctgttgttgctgttgtccaaattgttctagttgttcccatcttgattttttttttcttaatactttttctagctcagaatgtgcataagatatgtaaatgggatatattttgtttcctttttgccaaccttgtgaatcaagaatctttcatgctgagaattacatttacatgagtgctgtttgttgaatgattagatgtcaccttggtaatgttgcatcttcttgaacaaactaaggctgtgtttggatactggggttggaaacccatctccccgcacggaaaacggagcggttcattagcgcgtgattaattaagtattagctatttttttttaaatggattaatttgaatttttttaagcaactttcgtatagaaatttttttgcaaaaaacgcaccgtttagcattttgaaaagcgtgtgcgcggaaaacgagggagagtggttgggaacttggagctccgaacacagcctaaatgcttgagatggttagggtcagaatcaaactctttcctgagtcgtatgtcgttttactttcttttccttgttgtatgggccatattattttggtaggaataattagcagaagtgacttcagggaacacttttttctgtttgaactaacacattcttgttatatcatgttttcttgacattacaatctgacggtttattaatgatttgcccactgatcaagcactatgcttcaccttcatggtactgttctctgaacaaatttcatgtcactgtattgtgtacacaaatgaaaatatttgttctgtgtaataaatagcacttttattatgccataactgactgtgcaaaataatgtatctattgttttcaatgccttgtgctgactaggtggatgatatgagtgctgatcttatcatcagccaactcttgctgctggatgctgaggataaaactaaggacatcaaattgtttattaactcacctggaggctccataacagcaggtatgtgttctcaacctcttattgtaataacttgtgccttgtgctctttgtgttgatagagagaaattgactaacttcattttaagtatcttgtaacgtaaatgccttgcagattatatttgatgaaaagttttggatcctttgctgtaacactacaagatttatctaaccttaaatgccaatgatttttaagaacctttaccttttttgctactatttcctgatttctgttagtcaaacagtaatgaaactgtgcaaagatcattttgccctgactatccaaattttgccttcttttttatcaagagcctttaccttattcgctattatttcccaatttctgttagtcaagcagtgatggagctgtgcaaagatcattttgtcctgactatactatataccctcttttttatttggccagccgcacatgacattctgtcctacatctttcttcttcctctccaatggagggcatcagttcatcctgttattgtggtagatgatgagttccgagtttctttttcttttcttttcttttccttttggggtgggaagagttcagttttatcattgattggctcaggtataatgtgtctttgtgcccttaatctagtggattctaaggtggctgcaaaacagaaagaataacaagtttacatgtgaatgaactgatttatgataccaagctcgctgattaacaggaccaaggttggctgtttggccgagttgactttaaaaagaagattttcttgctaattttgaggaagaatacgcagataccattccccttacattggtaatcaaatggaatttacaatagtagcaagtagatagaagggtaagattttgatttttcaaaaggcagtggcatataaagtagtgttggttttggcattttgctgtgtcaatttaagggtccttgtatataataaactggcctcttatctgattgggttatgcggcattggtgatgcattcagttacaaatgtctctggtctacatatctgcctatgagttctttatattacttggagaaaattgcactttactcatgttgaagatcgctttgtttcgttttatgccatgttttgcaccaggatatgttgaaataaatttcactttgcatcacggggtgttctgaaattccagcgaaaccttgtgaaaacacatgagtgaaatcttgtgagctctaaatggtgcatgtgacataccactcagtgcacatagattatgggaatgaatcaagaattagttaacgaaatcaattcaagttcaacttctctgatagaacttttaaaccacagccatggttcagaaatcgaaaaataactatactcacttttttcgttggacaggtcttgtgtaatagaaacactaaacatgcacatgaaatgtagaactgatggactgtattttgatttttgtttagttaatttatattttctgcataattttgatttcttattctttacctgtccttttaatctttggtgtgtcaaatatgctgatgataatctggcaataacaaaatgataagttttatgctacatgataatggcatcaacttgataactatccaagccaattatatgcaatacgatgttttgcatataaggaaatgcgtgctccaacattaggaatttgaaaaaagctcctattttctctctagtgaagtcttatgctgcatactttttgctgatgcatttaccaaattcatacatactgaaaaggtgctgtacaagttcatcaaatacaagaaaattaaacctgaagtttaataatctgttctcttttttcgtttcaagatttacacatgctttttgtggagtctcttttttatacctaggatctgcattcataatcattctaaagcgctttaatgtcagcaatagaacaactttaactttcctgagattgttcatgagtgaacagtgtacagtgccgagctcaacagtaacagtgataaatggtttcaggttcagcaccttagattggatcttatgcatgttgtgcaatatctccatgaaaatcatgattttatatattatataacctgtgtttgataaaccttatgcctttaggagacactgggggctgttcactgtttgtgccacattgctgtacatgtttaattctgatatgaacccaatcttatcagttcgttatcaccaatccatgcaaacttgggaataaattgcagaatatctcaaaacatctagaatatttactgaaatatgaaagtgaatccatcttgtaacataattccaatatagtggcttaaatcttttactgtcttcccaatctgcttcactcaagttcaccaaaacctagtcagttcaatcagctctgtttcttttatatttgacccttttaagccccttaccgttttaggctctttgtacttgagtttttaaagtccaactgcctaaactgaactggactcatgttcctgaatgtacaattattcttgataacttttatgccgatcaccagagaaatatttagttttgtgttaatgctgccatactggtatcgtatgatgcaataaacatgcccacatcaatatacaggaatgggagtttatgatgccatgaaattttgcaaggctgatatatcaactgtctgctttggactggcggcttccatgggtgcatttttgctagctgctgggacaaaggggaagagattttgcatgcctaatgcgagaattatgatccatcaaccatcagggggtgctggtgggaaggtaagcttttttatgttgtttaactcttttactagacgaacttgctcggaaattgcctaaggaatcgtgggaaacaattggaagctttggcttcaaccaaacactcctgaaataaaatcataacctccattttatatgataatatcatattaagactaaaatcataactatcaatattgctttttgaaaagaataattctcggttggcttaatttctgaccattgtgccctatggcaatatatgtgctaccatgaaatgcaatgctactttcagaaatgggtcatcctttttttttcaatagaatatgttaatttgtgccatctggcaggtcacagagatgggattacagatacgagagatgatgtatgagaagataaagatcaacaaaatactgtcaagaatcaccgggaa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