Os01g0524700
| Gene Name |
Os01g0524700 |
|---|---|
| Description |
Armadillo-like helical domain containing protein |
| Version |
NM_001049757.1 GI:115437143 GeneID:4323930 |
| Length |
11207 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0524700, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:20420115..20431321 |
| Sequence Coding Region |
20420177..20420398,20421005..20421352,20421536..20421751,20424295..20424944,20425728..20425824 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:20420115..20431321 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:20420115..20431321 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgcttccgcctctcgccgccgcgccgccgcctgcgcagcacgtcgctcccgcgttccccaacctcccacggagccgccgccgccacctcctcggcctccagctccttctccgccgccaccgccccgtcagcgtcggccaccaccaccaccaccaccaccgccgccgccgccgcctcctcctcgccggcgcgtacgcgcccggcgatgggggcgcaggacaggatgttgatagttcggagagcacctctagtacaggatctgcatatattggcctctttgttcgaatgctaggcttggacaatgatcctcgtgatagagagcacgctgtttacacaatttggcaatactcccttggcggacggaagtgcattgatgagattatgcagttccatggctgtgtcgccctcatcgtcagcctcctaagatcagattctgtccgtgcctgtgaagcagctgcaggtcttttgcgtaatataacttcagtgaagttatacagggatgtggccatcgagagtggcgccatggaggaaatttttagccttctctgtaaatctacgataaccccagagatgttggagcagtctttgtgtaccatttggaacttttctattgaggaaaatttgagatacaagattttgtcaagtggtatgctaacacggatggttagatttctagatgacgaagacattaaagtcaaagaggctgctgcaggtatcatatcaaatttagctttaagtcattcaaatcatggagctttggttgaagcaggtgttattccaaaattggttcaacttttgcaaaacaaagaggacgactataagattatcagaaaggaagctaaaagttcactcttggcactatccactgatgaatattatcatactcttataatagaggagggtttagtccgggttcctctagttggctcagctgtgtataaagcatttagacctcttccacactcatggccctctttccctgatggctctgagatccagcggagttctcgcccttcaaaatatggtgctactgagttgcttcttggcctgagtgttggcgagaaggaaacggagcctgatgaagcaaaagttaatgctatgataggccgttcaaatcagcagtttcttgcgcgcattagtgctattgagttggatgatgaaggaaatgaacaatctggtggatctcaaaggaatgatctctataccattttaccatgggtagatggagttgcacgattagttttaatcattggtcttgaagatgcttctgcaattgcaaaggctgctaaagcaattggtgatgcgtcgaaaaatgaacatatgcgctcctcattcaaggaagctggagctgtcaaacctctacttcagttactgaatcatactgatgtgcctgttagaaaagccgctgtttatgcattggaaaaactaagtgtcagttccatagtctgtgagcagatcaaaacagatggtggtctaaaactgcttgcagacatagtgaaggatcccaataccccagttgagcaactggagaagataatcatcatgctttctcgaatattcaacacgggtatcagcatggtagctgtgcctgatagctcagctattaatgggtctgaggatacaatgcattctgagaagagtaatggtagctgtggtgatattgatggtggaaccaatggaacttccttcgcatatttgaaacaagaggagacatctagtgtgtcaatcatcgatttcgacgtcatttcacgcttaactagagttctgagggaagcatctccaagtttgcaagaacaagtcgcttctgtactggagcatttagcagcttttgatcagcatgcaacggcgatgactgctgctcgcattgagtcagtgattgaagctgttctggaaatgggagttattcatggtaccatgggcgatcctgaaaactttgatgagcttcctactgttgtgatcgagcaagttagtcgggctgtttctgccactgttaggttactcacaaaattactcgactttgatatttttgttcgcagcataaataccgagaaatgtattgctctgttaagaaaaatgttcaagtccagtattcctcttcagtcgaaggactggcttgcagcatgtctcattaagctacaatcaacggctggcttatcaggacatgagagtgtcagtagtatagatatggagataactatctacgagactattccgaggctagttgaccagatgatgacctcattttcttttgaaaataaaagaaatgctgtaatagagctgaataagatagtatcaggaggtgtgatggaatacacgagagcaattgccacagctggaggaatatttccactggtgaaaatgattgaagagggtgatggtgatgcattggaagctagcctagctatcttgtataatctgagcatggatccggagaatcatccagcaataattgctgctggagcagtgccgctattgaagcggattgttgttgctgaaagttcacactggaatcgtgctcttgagttgctgagaacgttgcctgtatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MLPPLAAAPPPAQHVAPAFPNLPRSRRRHLLGLQLLLRRHRPVS VGHHHHHHHRRRRRLLLAGAYAPGDGGAGQDVDSSESTSSTGSAYIGLFVRMLGLDND PRDREHAVYTIWQYSLGGRKCIDEIMQFHGCVALIVSLLRSDSVRACEAAAGLLRNIT SVKLYRDVAIESGAMEEIFSLLCKSTITPEMLEQSLCTIWNFSIEENLRYKILSSGML TRMVRFLDDEDIKVKEAAAGIISNLALSHSNHGALVEAGVIPKLVQLLQNKEDDYKII RKEAKSSLLALSTDEYYHTLIIEEGLVRVPLVGSAVYKAFRPLPHSWPSFPDGSEIQR SSRPSKYGATELLLGLSVGEKETEPDEAKVNAMIGRSNQQFLARISAIELDDEGNEQS GGSQRNDLYTILPWVDGVARLVLIIGLEDASAIAKAAKAIGDASKNEHMRSSFKEAGA VKPLLQLLNHTDVPVRKAAVYALEKLSVSSIVCEQIKTDGGLKLLADIVKDPNTPVEQ LEKIIIMLSRIFNTGISMVAVPDSSAINGSEDTMHSEKSNGSCGDIDGGTNGTSFAYL KQEETSSVSIIDFDVISRLTRVLREASPSLQEQVASVLEHLAAFDQHATAMTAARIES VIEAVLEMGVIHGTMGDPENFDELPTVVIEQVSRAVSATVRLLTKLLDFDIFVRSINT EKCIALLRKMFKSSIPLQSKDWLAACLIKLQSTAGLSGHESVSSIDMEITIYETIPRL VDQMMTSFSFENKRNAVIELNKIVSGGVMEYTRAIATAGGIFPLVKMIEEGDGDALEA SLAILYNLSMDPENHPAIIAAGAVPLLKRIVVAESSHWNRALELLRTLPV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>63..284#891..1238#1422..1637#4181..4830#5614..5710#5791..5844#5926..6056#7439..7629#8558..9195#aaacaatcctatcgccgcgacacaccacactgttcctctcgctcgctcgctcgacgcccgccatgcttccgcctctcgccgccgcgccgccgcctgcgcagcacgtcgctcccgcgttccccaacctcccacggagccgccgccgccacctcctcggcctccagctccttctccgccgccaccgccccgtcagcgtcggccaccaccaccaccaccaccaccgccgccgccgccgcctcctcctcgccggcgcgtacgcgcccggcgatgggggcgcaggacaggtgaggtcgcttcccctcccccctcgttggatggatacaccaccctcggctcgaggccctggtgcttcgggcctactcgccaccctccacgctgatatttgctttgagcctttgatgtcagaaatgttccgtgtctgctcgcttgattttgattgtgcagtagaacatgcacacttcgcatgtgggaaatgattggttagttgtgatggcacggctcagtcctcagccttcaccttgttgactggctgtgctgttggttgaaccagccattgaaatttttgcttatttgattcgcgttccacacaacatcagctcattgctcacataagcgacataaatactgctttatgactggtttgattgagctacaaatggtggtcttcaacagcaatgttcacaacgtgtaggctcaaatgctaactaattaggaaattaaacccacgtgctctctgttgtcttgccagccatgtatgtattctccagtacttccacagcatatacttttaactgttcttgatgtatgttatgttttcggcacattaagggaaactttatttacgtgtcactctgttccggaactttgactacattgctttgttttgttaggatgttgatagttcggagagcacctctagtacaggatctgcatatattggcctctttgttcgaatgctaggcttggacaatgatcctcgtgatagagagcacgctgtttacacaatttggcaatactcccttggcggacggaagtgcattgatgagattatgcagttccatggctgtgtcgccctcatcgtcagcctcctaagatcagattctgtccgtgcctgtgaagcagctgcaggtcttttgcgtaatataacttcagtgaagttatacagggatgtggccatcgagagtggcgccatggaggaaatttttagccttctctgtaaatctacgataaccccagaggtaattgcaaacataatcagcagcgatccatgttcttccccttccatggttctgcaaaaggacctttgactgttaccgtgaccgtaaatggcatattttatggataaccagatgagatattctctcttgtaggaagaatgttgactttcctgattcttatccaaacatgctattctcttgcagatgttggagcagtctttgtgtaccatttggaacttttctattgaggaaaatttgagatacaagattttgtcaagtggtatgctaacacggatggttagatttctagatgacgaagacattaaagtcaaagaggctgctgcaggtatcatatcaaatttagctttaagtcattcaaatcatggagctttggttgaagcaggtgttattccaaaattggtaagtggtagtatcttttttcgtccctattgaacttactagtcttggtctgcttgtatcgagttgactttggcagctacaaaaactatgtagatttctttaaaaaaaatattatggacttatttttatttctgaattctgactggttgaatgcttttggcattagtttattgctttttaacagataggtcctcaattaatttagtatcagattttgctaactatatgcaaccaaccacaaatatatgtattaagttagccaaggtaaggatggttacccttgagcgaaacgtatgtaagccaggctctatcaattgaggatttaataagttaatgctctatggcaattcagcgatactacctccgttcttgaataactgtcagtgttgtccacagcctgctcactttgaccataaattacttctaaatgattatattatgttgagagaaagttgcatgtttatatttaggacaccacatacttatctaatataacatgttttcaagtatttagattttttttgcaaaaagacaagcggttaaagtttataaacttgaatagtgccactgtcaattattctagaacctatgaacttgtggtcatcagttaactgaagaaagtttggtaattttctaagttgtaatatgtgtagtgtcaactgtgctattgtgtattcttaagtaactgctacagtgctccctgaacctttagtgcacttgtatctttagatcgtctgttcgcaatatcaacataacataacctttttcctctgcccagagttaaagtaagttgaaataagtattggttctgtgataatttatctcaactgacagtgttgtttgaacttgcaagcttatcatgcatccaggaaaccattgttttgtatcttctgttattttcatgttttccccagtgcttaaaactatattttttgggggcatttgaatggttctggtgcatgtggaatcttagaatacatttctttctttgtcggcatgcctttccattatccgaataggcaatcaccagttacattgttccttttgtatagttctcgtttgctatggttaaaatttcaacttactggtatgtttttattttcctttataataaactgtatggggtagtcacaacatttgctaactcttgaattgattgcttcttcaaaggtcatatctggaagtcattgccaattgcaaacaggatatttcacaatttaattgtgaatttatctgtttaatatacagatgtccagtctcttacctttcattctacacaatttctttgttcctttttctttcttcctcttcaagagcgactgtcattagccagtaataaatacgtgcaatttactgtacaagtgtatatgctcacgtggcatattttttaataatctaccttggacctttcatcacattaataattgaaacgttaatatagataaaatagaatgcttaggacctagaaaattttatccttgacttgtgagggtaacctcaccatgcaagaaagaggtgaacatattccgtctcttgcaaccaaccaaacaaaggagcaacaatcaaccatgcatttcatacaaccaaccaaacaacacctcatcccatccaggctaaactcatgcaggcatacagcatcagaagggtctgaatatgctggtaactctagtagcatgggagctgtggaaacaccgccatgagtgtgttttcaatggtgctgctctaagtgaaacatggacagtcaaaagaggtgggagccctgtgttgtgcagctgtggctcatgacctctagagcctccgttctagttctttggtcggtttctagtccttctgtggcgcgtacgtacttcttgtgttaggaaggtgtggtggtgtgttgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtagtattgcgcttttcggtgtactctcttctccatgaaatgatacgcagatcatctcctgtgtattaaagacaaaaaactcatacaagcaaccaaacagagctatttgcatcatatccctctctgggcgagcccaatctagggtgactcatgcgagcctgcctaggggcatacaaaggggcagaggcaagcctatggcagctagggcttgagcgctaggcttgcctccctaatcttgtttaaattctcttattttaccatttaaaattggaagaaaacctatagcccactagttgagccctaggtgagccttaggcttcgataatttctggctccgcatacatgcaaccaaacaagcgctacttatatcaatctattgaaactcctacatatatataactatctcttctctttctttctttttttctttttttctttttttttttgcgtagaaaggaaataaggaatcgttggactggaacttgctaggcaaggatatattgctaatattttatgatgaagtacctttacagttgtatgatcaaaataactctatgcagttcctaccctttgtctaaaatttcaatctctgattgtatcattcggctgaaactccttcactacaatcttcttggttgtttataggttcaacttttgcaaaacaaagaggacgactataagattatcagaaaggaagctaaaagttcactcttggcactatccactgatgaatattatcatactcttataatagaggagggtttagtccgggttcctctagttggctcagctgtgtataaagcatttagacctcttccacactcatggccctctttccctgatggctctgagatccagcggagttctcgcccttcaaaatatggtgctactgagttgcttcttggcctgagtgttggcgagaaggaaacggagcctgatgaagcaaaagttaatgctatgataggccgttcaaatcagcagtttcttgcgcgcattagtgctattgagttggatgatgaaggaaatgaacaatctggtggatctcaaaggaatgatctctataccattttaccatgggtagatggagttgcacgattagttttaatcattggtcttgaagatgcttctgcaattgcaaaggctgctaaagcaattggtgatgcgtcgaaaaatgaacatatgcgctcctcattcaaggaagctggagctgtcaaacctctacttcagttactgaatcatactgatgtgcctgttagaaaagccgctgtttatgcattggaaaaactaagtgtcaggtatattatttccctttcttcaaactcaagcgttttttagcaattagatcacacagtattctgtagaacagtcttacatattaatcccattacttatttgctttacttttagttgcttaggtgtagctgttatgagtgttatgacttaaaagaatgggatttgaaaaccagcccgaccacttgatgatcatataccctgtcgaaagggggaaaaaggaaataatcatgccaaatgcttggaaggggctgtatgggctcaatgtgcttcattttgacaacaatttccattgacatgacagttggcaacaatagtttgtgtcttatctttttgtaggagcatcttatgtcttaggaatagctatatagttcaaagcatctctaaacagaagttggtaggacctatcactataaaagagaaggcaaccggttgagattcaagaaatgaagagaagtttgttcgtctatctcttccttacccttttgatgtcgttaaagatcatcagacattggtcacgcagcttgggtccatggtgatctaatcatagtgcgccatgtaaaagaaaacttgtttattatagtatagcatattaaagaggaaatttatgctgtagtgaagttttcattcagcagagaccatatagtggcttcaacgttctgaagtatatgtaaatttctttttttcttcctgaaaggagtactaaatggtttctcaatttgttgtgatatccatatattttccccttttctataaccttcattcctttttttttctctcttttgtagttccatagtctgtgagcagatcaaaacagatggtggtctaaaactgcttgcagacatagtgaaggatcccaataccccagttgagcaactggagaaggtcatgagctttaaaaaagcctagttattctattgtaattttgtatcatgccaagtactgactagataatttttgtacagataatcatcatgctttctcgaatattcaacacgggtatcagcatggtagctgtggtgagtcaggcatctacatgtgtcaactgtattttgttatatttttccaaaccggtgtttacaatgttgtgaatttatcagcctgatagctcagctattaatgggtctgaggatacaatgcattctgagaagagtaatggtagctgtggtgatattgatggtggaaccaatggaacttccttcgcatatttgaaacaagaggagacatctaggttcgttacagctttgaaacatgcctaaatattatcttacactagtactagttaaaagagggatttatgagccttatggctgcaaatatgtaggcatgtttgtcatatttaaaagcatatttagtttggatctgttgcaatgcacggatatgatgctagtttacttaaacaaagttcacaactgatttgtttgctcttatttcatcatccttaaatatacgcatttttagcttcttttttgcgcacagatataaagaattgttataagattactatcctaggcatattctgtttacccctatactactactagaggactagtaattgacattaagcatcagggcactgaaaagtaaatgaactgctttgtttggtacatctaaaaatatccaattattttttcccccgtatggctcatcgaccacttcaaattatttcattactcttacaaatagggatgtctgattaggacatattgaatcttgctatcatatagagatagttatttagaaaaaacataatgcctttgtactaatgaaaaaccagacatttttgtaaaataattattatttatggatggaagatgtactttctactgctgaaaagttcacttccctgagggaaaagtctgaatttaatatcatatcaagctgcatgattaacaagaacaagtttctatcttccttatctgtttttcagaatttactactagaacaagtacaatggtatattgaattgattacgtacatgattgtcagtaaaagaaatagttcgatgactgaaaaactgccttgagagcttaaattttgttaatgtaattaaatattttgtctgaaagcttgttaacttcataatgttttctgtgttgcgatcaatgttctctgatcaggcgatcagccctgatcgcctaggcaccgatcaggacgatcagagcgattaatcgaggctgatcggtcagtatatagtaggagtgtccagcagaccatatatgctacatattatgtactaagtactctatagtctgtagtatatggtaaaaagcaagcatcatttggtcagagaagaagaagaagaagcatcgtttgctgcccattaatcgccctgatcgtcctgatcgacgattaatcgccctgatcgacgattaatcggacgatcaactttcctgatcggctgatcgacttacctgtgcctgatcggaggtaggggagcgatcaggacgattaatcggacgatcagataacattggttgcgatagatcaccagatcctttgatccagtctttttcacaaagtatgcagaagctgctgattatcatctgttgtgggtgtgctagcatttgctttgtcaattgcatactgatgtgattcttttaacttgtatagtgtgtcaatcatcgatttcgacgtcatttcacgcttaactagagttctgagggaagcatctccaagtttgcaagaacaagtcgcttctgtactggagcatttagcagcttttgatcagcatgcaacggcgatgactgctgctcgcattgagtcagtgattgaagctgttctggaaatgggagttattcatggtaaatagcttgtttggttttgcataaaaaaaaaagatgcacacttgaacttttttcttatctatattattgaatggttggtactatttggtcattagcatttgacaggagtactgagcttaatgtagcatgctgatacgctttgatttctgtaagtgtgaataaggctatactccctccatcccaaaatataaggctcaaccactcataacacaaagaccaagataacatttaatcatcttcttggttggatcatcttgatgcatgcaaacaatgtgattgggaggtttgatggtataggatttaaaacaaatcaattctattggaccaagaggtgctaataaatgtatgcatgcatacacgccttatattatgagatataagagaaaagtggttgtgccttatattttgggatggagggagtatataagtgtggtaattgaagagtacaatattttatcattataagctaattatgttttattgatttattttaaaattctaatctacataagtcaacctatgtttgtttcacaataaccattctctaccacggtaaacttgtatgggaaccatgagtatcaattattcaaattgatgatattttaagatatggtactcatatgaagcttcacttctgacctgaagttcctttagggataaagagttcatgcattttgcaggggcaaccagtgatgcccttcaatcgagagtcaaaaccagatatcttgtacaaattaccttggcacaaataatattatatttaattcagaaatattatattgaatcagttttcatgctgaattcctcacttaaattttctgtcaaagcattatcattaacaacagcttttcttttatgagacatgcttgaaatctctaaatgatgtatggtgcctttctacagtaatttgtgttctatctttcaggtaccatgggcgatcctgaaaactttgatgagcttcctactgttgtgatcgagcaagttagtcgggctgtttctgccactgttaggttactcacaaaattactcgactttgatatttttgttcgcagcataaataccgagaaatgtattgctctgttaagaaaaatgttcaagtccagtattcctcttcagtcgaaggactggcttgcagcatgtctcattaagctacaatcaacggctggcttatcaggacatgagagtgtcagtagtatagatatggagataactatctacgagactattccgaggctagttgaccagatgatgacctcattttcttttgaaaataaaagaaatgctgtaatagagctgaataagatagtatcaggaggtgtgatggaatacacgagagcaattgccacagctggaggaatatttccactggtgaaaatgattgaagagggtgatggtgatgcattggaagctagcctagctatcttgtataatctgagcatggatccggagaatcatccagcaataattgctgctggagcagtgccgctattgaagcggattgttgttgctgaaagttcacactggaatcgtgctcttgagttgctgagaacgttgcctgtatgacatctcgatgacaaatgaccaattgttctcagtacaccttttaaacttcaccttattgcactgacaggtatgttattaaatttctgacctatttctatcaactgtttttatccaaattgttagtcggtggtcctggaatggtcatttagacactgtttgtcctactaaatatatcaaatttggggcccattattttaacatataatctctggatcagtactgcaaagtagtagtagtagttcttacttagctagtaagaaaatataaggctgcttaacagctggtaggagtagtaactttggattttacttcagctgtaaacaatagactgagcagtatgtcggttactgtaacatgtactgtagcacagactttaaagtcccatgaaaggacatgtacccttgctaagttagtaagcttttcagcaacacaaatcagagtttcagttcagaagtgatcctaccaacacattacactatttttctggttaactgaagttattgggggattataaaatggtcctgtttgccctacttgtggcagattttccaaccagttttgagaaaataagttttagattaaaaaaggagttaatataaataactacattttacatcagggatgcaaaaacttagtactacctccgtttcaggttataagactttctagcattgtccacattcatatagatgttaatgaatctaaacacacatatatgtctagattcattaatatatatatgaatgtgggtaatggtagaaattcttataatatgaaacagaggaagtagtattgaagggtattttcacacattcacacattgaaaacttaggtatttaaggttcatgcttattagatttttgcattgttgttcactttcttatgaataatatgaaaacacagttattgtgtgttttccgcgtcctttttcaacttctacttacagaaatcagtacttgaaaacctaaaatctttcccctcatcaagaggcagttcttcacatcagagcacttgtatcagcgcaaactttctgctcatggtgtaatctttgtttgccacatgatttgtgctacatgaatttttcctctatgatggtcttctgactcttggtgcttcttggtatgttgggcataactaactattacagtgttgtaatagtaaccaaatggccaacaaaatatcccgaatattgacaatttgcagattgcacttacggtggtaccaagctggctcaaatatgtcatgtagatagataattttcatggcaatgaagaagcattggtggagccttctatgaaatcaggggtgttcctgatttccggcaactcgacaatgatttcaccatttcatgaccgaccaccagtttatcaagcaacctgtgacctgagcaggatgaataacttttttgtgctgacaggtaaagggacaaaagtgtgcgccagacatagtagcagttcttgatagtaccaagacactgcagaaaattcacattgttgcggaaatccacaatgtgctgacgctgcttctgtaaatgattctaaagagtagaattctggtgttacttcatcatccttgtcctactgccacagttaattttgcccttctcccagttagattattgcattggggagagtatttccccaacatgtaactgaagtattatgagcttagcaaatgtagtacttgaagtaaaaaaaaaagcctaacaatcagcttgaagcaatgggtgactgtagctgcgagtctggttcgtctgtcccatggcgttgaagttgaacccagagggacgcgtcgtatatgatgctattgggtcatcacgtgcagctcacgtaatttctggaattgtttttccttcacctatgttggcattcatgatggatgcttggtaactgggaggaaatatgtagtggtaactgttggagtaagtattgcattcaacgtttcctactgtgttcagacctacagctcgatcagttccttcatcagcatatgcatttacgttcgggacaagc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
