Os01g0540800
| Gene Name |
Os01g0540800 |
|---|---|
| Description |
Conserved hypothetical protein |
| Version |
NM_001185469.1 GI:297720072 GeneID:9270848 |
| Length |
6891 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0540800, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:21531593..21538483 |
| Sequence Coding Region |
21536120..21536165,21536600..21536751 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:21531593..21538483 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:21531593..21538483 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ttctcagcatgcttgtctgaaaagcagattgacctgagtttgtgtgctatagctgatgatggaattttttttaaaagtaatatgattttaatggaaaatcgcaaaactataggtcagttaggcgaaatcgcaagtttagcaccctatcgaacaaccgtggttcgacaaggtacctatcgaacaaccacagttcgatag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>FSACLSEKQIDLSLCAIADDGIFFKSNMILMENRKTIGQLGEIA SLAPYRTTVVRQGTYRTTTVR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>4528..4573#5008..5159#ctctccctccgctctctcgccgccgtcgccgccacgcgctgccacctccgtctccccctcgcgccaccgcgtctactgccgccgccgccgccgcgtccaccgcagccgcctcgggcgggtccacctctcctccaccgccgcgtccacttccgccgccgtcgccgcgtccaccgcagccgccttcgccgcgtccacctccgccgccgccgcgtccaccgcagccgcctcggtcgcgtccacctctgctgccgccgcatccatttccgccgccgctgccgcgacgctgtctccgagcgccgtcgccatcatcgaggcgagcagccatctcgagcgccgccgctgccaagtgcctcctccggccgccggcgtccggatccggactccatgtggtcgggagacgtcgatctgaccggcggatgtgacgaggagctcggccgcgccacacggagctcaacctcggcggattgggcgacggcgtcggcctcggcggtgaaaagtctctgttgctgctgccgccgtcgggcagtcaaggtttttcctgccggtagaggtaaaagaactccttgtgttggtttagggctagatctttgataattttacctctaaagatatagtgttttgcctttgatttgaattgttttccccctgatggctgatgcacttatgcagtatggaaaaagaatcttccatgtgctagggcaaggaagccttttgtagtcagctctctagacttgcttatgcttctgcagtgagcacccagcaataggttagctacatttttcttgactgaatggttcggtacgaatacatgtaatcttaacagtaggattaatagtcatgccttatccttggatattaattaaagttgttccttttcgtttatggtaagatcaagttcatttttactatatatgaagtgcggtacttatctaaatgctgttgtgattttaaaggcacaaaaaatgtagttgcaaggtttttaattattttcctactgtttatgtatatttatccttttagtaacctaaaaaaactaattgctactcttcttctgatagtatgttgctttgtttgtgtgtttttaaggtaaatctgctctcttggttctctgaattaaaaggacatacaactatagcatgatgatcttgcaggaaattatcatgtcttttcagcaaggtactataaccaaaagcacaagtaaattctgatgatggtttttttattgtgcctaaattgatcgtttactagaagttctttgctttagattgctctatatgaatcgagttgtcgaaaaaggtgccatttagtccacgggcttcacgaaaatcagtgtttcaaagaaacaaaccttgaaacattccatggggttctcaggttagtttaatcaaactacatccatgggatttcgtgattcattatgtataaatttcatgaatttagatgtggtcgcagatcgcggatggcggcggccaccaggcggatgtggtcaagggaggactggcagcgctgagcaacgacgtctaggaatagcatctcaggtcagtcctcttgctccctcatctcgctccttacatatttctggattattcagttgaggagaaggaattcacaaaggaactgctcctgcacccactccccaatcgcaacgcgctggcccacttccactcctctgcgcatccctctgctgccaacggacgctagcaacatgtcaaaccccaaggccatcccccagctggtatgtgccccgtgttcccctttccccagtacacaggtcttgcgactgctactgcccttagtaagttaggattcgacggttagtgttgtttcgaattgggcttgtcttgtgtggattggccgtgcggagctgtagaatcaggtgatactaaatgggaatagagcaattagcttatttttatcagcaggaacaatgagtgtagcaactgcttcatagcttttttcagttcattcgctttagttgggacttgggactggatgaggattatcactgtttttttttttttgcattatgttgactatgtcagtcttagtttttttttgggacttgggactggatgaggattttcactttagtgtcctctttttaagtaatctactgtgaaatcagttgctggatgtttcagtaaccatgacgtgtgggttagtaaatatgtgcggattattaccgggtagtgcatttacccacatactgattcagaggaacaaaatatattgccattgattatttattctgctgtgaggtaaaggaggatttaggttgcaattaataaaattgtactactgcatttgtccctaagaagtcacaactctttctggtaaaaaatttagcatgctgttttacaacttctagatttatttgtttttcagtgcaagtcactgactttacggtattggagttcgagtagaagatcagctgctccgtcatcgacgatggcctgatccacagatgaattttggtgctgatacttccagggaggtaaattattgttctatttggcacatgctggtggggtgcgatgtcatctgtgccaaatggacctaaaaatattgttagctagcctgactgtcatcagccaatgcttttcagttgggtgctcgaagttcagaaaaagctgctaggtggatcaggacaatggaatctgccttaaaggttggagtttttcttatttattttatttcacacaatcattatgttcaaaaaagcactaacatgatgtctgtcatgtgagcagcccccaagaaaggatgaacttgttagctgttcacatacaagatggcaagcttttaggtaagctgctatgcagatcaatctttattttgtcaattacttagcaatggactggagattcatgcactgtttatttattgagaaatgctcttactgttagactcatccttttcttttctttttcagtttataaagtttttcctctttttgtatctttttcattgaaaacagtatgtagattctaaaggctactgtcaaatgtttggcacacatttcataaaatttccaaattatctaccattgtgctagccctcttttttgaaaggcctcctcttgttagtgctggaaacaatcagtagttatggctgtatgaaatgccatgagatcatttactttagattgaatcattgaactaaatagtttttactgtttttagatgggatgcagcacatgctcgtgctttcaagttacaagagaacaatgatgcctatatgtaattttatacatcaccttttcttttcttttctttttttgtaaaaatataattaatcatatgactgatgctttgttctgagtttgactgctagcctctacagtcctatgctccatcctctgttgtacatatttggatagaagtttcattttcttcatcacttgggttgatgtttaattataataaaaaagtacccaactgtccttgttctattggctaatctgtggctatatctttgcaggctaagccgctgcagtaaccgcatgcactcaataggtaactatcgtcttataatgtactccctctctagaataaacaaaattctagaaatgttatagttaagtttttctaatcattttcacataaaataatcaacatatgaatattgaaagtgatagtaaaagtttcttcttggaggctgtaaaatggcaaagttgagtaaatattcttaaattaagggagcaagacgaaattatagtactacttttagtgattcaattaactatctttatttctttaacatgtcaaacaataaaacctgtgtctctttactgtcattgttttccttatttttactgttctgtgcaaaatattctaccaggttggactgtattttcttctgtccataacgatcctatggcatctgatgttattgcaccttctccatggacaatatttgactgtaaaaatggtaagtataaaaaaaatctcatttctttacatcactagattttgcgctgaatccgacttacatttaggattccgtttgtttactgaggcaaaagatggtggttcagaggggaaggtaattcttgtatgaaacaaaggttgcatatccttcttatgacgattctagcaaggtaaggttgattcttgcttgtgtgccttcatttggttaattacatagcagagcttgccctttcatgttcatgagctggttctatttattgccaattgacttctctccatattagcttgccaattgatttggttaatcttgacacctccactatattagctggataatacatgcacttgggtggaaggattcatgtggtctcaattgattatttaacttgaaattggtaccttggattaatctcagtggattaatctttgcgttaagagttttttttttgttgatgatgagagaggaaatagggtgtccatgcttcatgattactggttatgtatgcttccttcattctttttcatgctaatgtacgtttccttgtatgatcaaggtcggtattgccatgggtgccttggagcttaatcatttgcctgattctcagcatgcttgtctgaaaagcagattgacctgagtttgtgtggtaagtggaggtgtccctgcaaagtgaagtcctcggtttattccagcttccattacataggaggagccccattgatagcacatttgaaccggtggctcatgataaaccagttagttgactgaaggagctgctccatctgcttttctctttgatcatttagcatatcgatgcatacgaactatgaaggagctggtccatctgcttttttgtcgcaatgatctgtgtacatgccccctccttatctcttcgtctttaaggaataatgtagtttgatccaatggacgaatgagattgttttggttggatgtttacatcatcagaacgaacagaataactagatgtgttatgataaataccaattgttctttatcttcagcgttcaatttatgggttgccttggccaataaccttactttttttatgatctatttcagctatagctgatgatggaattttttttaaaagtaatatgattttaatggaaaatcgcaaaactataggtcagttaggcgaaatcgcaagtttagcaccctatcgaacaaccgtggttcgacaaggtacctatcgaacaaccacagttcgatagggtacctgtcgaactgcggtagttcgacaggtgattaaaaaaatcaaaaaaagagaaaaatcactgttgcacactgttcacaataccctatcgaactaaggcagttcgatatgtgtctgcgagcactgtagcatcactgttcacgcaaccctatcgaactttggctgttcgatatgtccctgcctagcattgtagtgatactgttcatgtaattttttatttgtttttggaccacctaccctgtcgaactgacgcagttcgacatgtacctgtcgaactgtggttgttcgataggtatccctgtcgaaccgcggttgttcgacagggtgctaaacttgcgatttcgcctaactgatctatagttttgcgattttccattaaaatcatattgtttttaaaaaaaattcctgatgaacttcctgaccccactctccgtggacgaccaccgtgcctccttgcggtcttctcatcgctctctggtggaggtgatccagcacgcttgaacggcagtgatgtcaacaatgaccgtgtgtggacatctgatccccctccctatacacaggtagaaccaatttttcctttttctcttcctgctgcctttttatgttaactgaatttatgaagcaggaatttgtttgaatacatttgttgtcataattccaatttgataaatacataaatggattctacaattgacataaatatgtgaaaatatgaacagggagttggggcttcagacaaatgatgaaatgagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatttatgataatgaaaccagtttgctgcagttgtcagataaggtgtagattttggatattctctctttgcaactgctttcgatttctgtataattttttttgtctgataagaaaaactgaaaaaacaagcctctaggttcagtttcagaactgcatggtacaactgttccacagggttgcaaaatgcttagatgattttgacttacaaataagttctttccaaattcacaattctaatttgaagtgggcatcgagtaatagttgttcataaattgtttctcctctgtgtatcatgttcagctttaatatttgcaactatctgttcctaaaaatgcttgtagtacatgatttaaaaaattaacatgttttttctagataagggggatggcataagatttccttcatgaagtacttgcagagctatttatttatcagttgaatttgctaaaaaagaaacaggttaaattcagactgttaatagatacaggatttattgatatatgttgttgtactctacgggctcagttacccacataaacattgtagtattctgctgaacctattacttgaattctgaggttgcaacttctcaattgattctctgaagcctctgactatactatgactaacttaaaataatcttacttggattgtctctgtgttgctaggataaggacaccaatgaggcaatgaaaggtgaggttgatgttctttgtgttggttacatgatgagatgcttgagactgaaaatcatcatctcctattttgcaatttttgtagttattttcaggtattctcttctgccctataggctgataggttaatgtttccagctgtcagaacaaacaaatcagtagttcttgatgtatttcaattagaaccttaattttccattttaccatgaggatcccatgtgtttcttttccttgatttgtaccattatttccagaattgtgc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |