Os01g0559500

From RiceWiki
Revision as of 04:45, 25 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os01g0559500| Description = Protein prenyltransferase domain containing protein| Version = NM_001049878.2 GI:297597020 GeneID:4324682| Length = ...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os01g0559500

Description

Protein prenyltransferase domain containing protein

Version

NM_001049878.2 GI:297597020 GeneID:4324682

Length

8089 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os01g0559500, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:22852277..22860365

Sequence Coding Region

22852277..22852518,22852723..22852807,22852894..22853157,22853253..22853555,22854430..22854534
,22854651..22854750,22856349..22856668,22856918..22857094,22857167..22857295
,22857586..22857670,22857772..22857821,22857968..22858166,22860352..22860365

Expression

GEO Profiles:Os01g0559500

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008394:22852277..22860365 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008394:22852277..22860365 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggaggccgccgcgtcgctgccgctccccgcctcccgcttcctctcccctcctcctcatccaacgccagcggcggcggcggcggcggcgtgctgctcccgacggaacatctcctgcgcccgcgccgccccccgggcgctggaagccccgcaggcctcgaggccgccaccgcggccgtcgcctcggcgcagcgccgtcgcggaggtcaaggccgcccccgaccccgtcgccgcactcaccaggttcgaggatgtgctgcagacacaggactgcaacataatcctgcgccactacggtgaaaccaggcgctgggatgagctatctaaggtcttcgggtggatgcaggagcacgacatgctcaacattgcgtcttacagcagttacttcaagtaccttgggttgagccgcaaccctgcccgagcgctgcaagtgtacggtgctatccgagaaaacccgacaaggatccatgtctccgtttgtaactcggtcctcgggtgcttggtgaagaacgggaggttcgatagcagcttcaagctttatgatgagatgatacgagaaggtctatcacccgatctgttcacctacagtacccttctgtcagggtgcatgaagttgaagcagggttacactaaggccatggaattagttaatgagctgaattcccgtggttttcagatggatagtgtaatatatggcactctcctggctatatgcgcgtcacataactgctgcgagaaggctgaggaatattttcagaaaatgaaggacgaaggacacaagcctaatctattccattatagctctctgttgaatgcatattcagaaaatgctaattatgaaaaggctgatctgttgatgaaagatttgaggtcctcagggttaacaccgaacaaggttatactcaccactttgttaaaggtgtattctaaaggtggtctctttgagaaggcaagggaactgctaactgaactggaagcttcaggcttcgcacaggatgagatgccttactgcatattgattgatggccttgtcaaagaacggaagatatgggaagccatgattctatttaatgatatgaaagaaaaaggtgtcaaatctgatggctatgcattcagtatcatgatatcagcattacatcgaggtggctatcgtgaagagtcaaaacaacttgcaaaagaatttgaggccaagaatgcaacatatgatctggttatgcttaatacatcacttcgtgcttactgcagcaccaatgatatggaaagtgtaatgatcatgcttaggaaaatggatgaatcgaacatatcgcctgatgctatcacatttaataccttaataaggtacttctgcatggcaaaggtctatcacctagcatacaagacaattcaagatatgcatacaaagggccatcaattgaatgaggagctttgttctgagataatgatgcagctaggagaagcgggttttccttctgaagcattttctgtgtataatatgttgagatatggaaagagaacagtgtgtaaatctcttcatgagaaggttttatgtatcttagttccagctggacttctcaaggatgcatacgtagttgttaaggacaattccgagttcatatctcgacgctcgctggggaattttgctagatctttcatggcatcaggcaacataaatttgattaacgatgttatgaaagcagtacaccgttcaggatggcgtattagccaggatatctttgggaaagcaattcagcgatacattcagaaacctgataagaagcagctactgctttgcctcttggactggatgactgcagggagcatcaaggatcacaagtcaaaggcaccaaaaatagttgataaggatccaatcaagattcatcagaattacagatctggtatttcgtatgcatgtggtgtaaagcacccatgttatgttgtaatgcctgagcttgagcttgtccattttagtcaggctattcagggtgagattccacaagagctgcagatgggactagtaagtggtaggcaagtcttgctcaagactgcaaacaggcatacaatggtgacttcctga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MEAAASLPLPASRFLSPPPHPTPAAAAAAACCSRRNISCARAAP RALEAPQASRPPPRPSPRRSAVAEVKAAPDPVAALTRFEDVLQTQDCNIILRHYGETR RWDELSKVFGWMQEHDMLNIASYSSYFKYLGLSRNPARALQVYGAIRENPTRIHVSVC NSVLGCLVKNGRFDSSFKLYDEMIREGLSPDLFTYSTLLSGCMKLKQGYTKAMELVNE LNSRGFQMDSVIYGTLLAICASHNCCEKAEEYFQKMKDEGHKPNLFHYSSLLNAYSEN ANYEKADLLMKDLRSSGLTPNKVILTTLLKVYSKGGLFEKARELLTELEASGFAQDEM PYCILIDGLVKERKIWEAMILFNDMKEKGVKSDGYAFSIMISALHRGGYREESKQLAK EFEAKNATYDLVMLNTSLRAYCSTNDMESVMIMLRKMDESNISPDAITFNTLIRYFCM AKVYHLAYKTIQDMHTKGHQLNEELCSEIMMQLGEAGFPSEAFSVYNMLRYGKRTVCK SLHEKVLCILVPAGLLKDAYVVVKDNSEFISRRSLGNFARSFMASGNINLINDVMKAV HRSGWRISQDIFGKAIQRYIQKPDKKQLLLCLLDWMTAGSIKDHKSKAPKIVDKDPIK IHQNYRSGISYACGVKHPCYVVMPELELVHFSQAIQGEIPQELQMGLVSGRQVLLKTA NRHTMVTS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..242#447..531#618..881#977..1279#2154..2258#2375..2474#4073..4392#4642..4818#4891..5019#5310..5394#5496..5545#5692..5890#8076..8089#atggaggccgccgcgtcgctgccgctccccgcctcccgcttcctctcccctcctcctcatccaacgccagcggcggcggcggcggcggcgtgctgctcccgacggaacatctcctgcgcccgcgccgccccccgggcgctggaagccccgcaggcctcgaggccgccaccgcggccgtcgcctcggcgcagcgccgtcgcggaggtcaaggccgcccccgaccccgtcgccgcactcaccaggtgcgccgcccactatatgcttctccgtagctctatcggagcattctacattttcgtcttcgtagtagtaattcgcgcgaattggatatatcgaaacgtggattcagagggaggaacaagagaaactgaggtgttggggtaggattattgttgctcgatttggagttgttagttctgcgaattctgacctttgatgctgtacaggttcgaggatgtgctgcagacacaggactgcaacataatcctgcgccactacggtgaaaccaggcgctgggatgagctatctaaggtagtcttcagtggttgtcaagttcaatcaggcgagtggagattgatgggactagtgaggcatgagtagtctgaactttgtttcaggtcttcgggtggatgcaggagcacgacatgctcaacattgcgtcttacagcagttacttcaagtaccttgggttgagccgcaaccctgcccgagcgctgcaagtgtacggtgctatccgagaaaacccgacaaggatccatgtctccgtttgtaactcggtcctcgggtgcttggtgaagaacgggaggttcgatagcagcttcaagctttatgatgagatgatacgagaaggtctatcacccgatctgttcacctacagtaccgtatgggactatgaccttttctttttctctgattagcatttagtttggtactttggttggtgtagcatttcaattgtttctcttgtcacttctagcttctgtcagggtgcatgaagttgaagcagggttacactaaggccatggaattagttaatgagctgaattcccgtggttttcagatggatagtgtaatatatggcactctcctggctatatgcgcgtcacataactgctgcgagaaggctgaggaatattttcagaaaatgaaggacgaaggacacaagcctaatctattccattatagctctctgttgaatgcatattcagaaaatgctaattatgaaaaggctgatctgttgatgaaagatttgaggtcctcagggttaacaccgaacaaggtttgcttcttattcttgttatttacttcctctgtttcacattataagacattttgttttctaatagatttatgcatggattcatatatgtacttcatatgtgtctaaatgcatatggatgttagtgaatctagacgaagaatggagaggccaaaacgtcttataatgtagaacagagggagtattaattaactctgttgctgagttttatgatttgcaggagaccccagtcttgttatttcactttttggttatggcagtagaattgatttctcattagatataatgcatacctacaccacaggttggatagtttgttgctatggatgacttgaaatgctagatagcacatacaggttgtagcttgcatagtatatggtgttggtgttttggtgcaaaagttggtttctccagctgcataatttatttggtactagtgcggtagtgccttctaacttcaccgcgtaatgtctgtgaatgatgcctgtcgatgtatatgaaaaacaaatactgccctatgatagccatcaataagcactaaacaaatgccatggttggaaagaacattctcacactaagtagagaaagcttgcacatcaaattccatcaaagttgtggtaccatgtttacttgccgcttggcacgtgatgtattgaatagagctttcgatagcttgggttaaggtggaatgtagtgctccaggataaattttttttttaaaaagcctcttaagtctccacatatcaactataactacatgttatcttgattggttgtttctttactgaacttgcatatattgctctttggttgttcaccgaaaatgttctgctactgttgccattctaatttgtaaattaaattaaatttgcaggttatactcaccactttgttaaaggtgtattctaaaggtggtctctttgagaaggcaagggaactgctaactgaactggaagcttcaggcttcgcacaggatgaggtaaaatatttggtctcacacaaaacagctgcttcatatgcatgtatgaatggctcctttaattgaactttattctgtcttgtcataatcccttaatcctttaatactatgcccagatgccttactgcatattgattgatggccttgtcaaagaacggaagatatgggaagccatgattctatttaatgatatgaaagaaaaaggtgtcaaatctggtaaggtatctaacaatgtaacaaattgatgtgcctctattgatactattctgattttttgttgtaattgggaaagttcatggagctaattccacgattttccattgacatagcacatcttccgttgatgctactgacaaaccagcttcattccatccatgccattgccattaggttgcaaaatgaccaattttaccttgctcaccattccgatttttggaatataaattactgtaattaaaatgaatacctgaaaacttgaaaattaaaattaccaaaccttataattcgaaatttaaaatgttagaatacacaaatataaaagtttattttcaaaatttttaatatttgttcaggttcaacctgattttaaaatttggattgtaggatttaaaatttgagttctattttaaaaagattggattgcaataaaatttgaattctgaaagggaatattagtgtttctgctgctactagcatgattttacaatgttgagcagggcaagttgatcttttccaccaatgtcactctaatgggaggaacacggaggcaatggtgtggaaggaatgaagttggcttgtcaatgattggaatagaaatgtgttttgtcgatggaaaatcatggaattggcttcctattgatggcatataatgatgttcaatatctggttcctaacaacacattatctgtttactgtatgcaaattagtgtgcaaaatctattgtgtgctttgtaacagaagatttattttatggttacatttatttctaattttgttatgtagccttttagtaaacaaagaatcttttgtagcatgctcattccagtctaaaaaatgatttgtgttaggcttttcaaagtcaacattacacaactttgagcacctagctctttagcataaattaaaaaagagtaaatatcaattaaaaaagagtaaatttcacaaaactacatgttttgtggttcaagttgcagaaaaccacacacattttgacacttggcacttaagtacatatattttggttgtgtagtttcacaaaaccacactatcgataaatggattcacctgcgagatgacgtggctgtttcacctaggacgaggacatgacatcctattaccagccatcgcacgaaattaatagtatgccacgtcgatggaacaaccatgtcatctcaccggtgaatccattcatcgatagtgtggttttgtgaaactaaactaccaaaatatatgtacttaagtgctaagtgtcaaaatgtgtgtggttttctgcaatttgaaccataaaacatgtagttttgtgaaatttactcattaaaaaaagaagttacataagtgaaatataatgaaatctctagttttgaaaaacttgattatgctattttcatatacctaacatttatttttttaatgatttttatgctcaaaattaacttgtgttgactggcatgataaaacaacctgtttatgaaactggtgggagtagtatgttgattttttttccctggagtattttctagtgctgctgcctgctattacccagaatttgtgtcttgttgtccttgcctaaggagcttatcttcttatttctgcagatggctatgcattcagtatcatgatatcagcattacatcgaggtggctatcgtgaagagtcaaaacaacttgcaaaagaatttgaggccaagaatgcaacatatgatctggttatgcttaatacatcacttcgtgcttactgcagcaccaatgatatggaaagtgtaatgatcatgcttaggaaaatggatgaatcgaacatatcgcctgatgctatcacatttaataccttaataaggtacttctgcatggcaaaggtctatcacctagcatacaagacaattcaagatatgcatacaaagggccatcaattgaatgaggtatgttgcttgttgtgtatttgaccgatttaatatatcgctgcttaactctatgctagattaaaccatggttactacatatttacatccttggtaatttccgctgattggaatttggactacctattattacatatgtgcagaatagagtgggtgagagttgcacatttccttgcaacatgctttgcatcaactttcagtaatagacagtttatatcagtaaccaaaattgctatacatcttctccaggagctttgttctgagataatgatgcagctaggagaagcgggttttccttctgaagcattttctgtgtataatatgttgagatatggaaagagaacagtgtgtaaatctcttcatgagaaggttttatgtatcttagttccagctggacttctcaaggatgcatacgtagttgttaaggtactatacttatgcaattcagtgttgacatctctgttgttaccttgttcactatgaatgctatttgaacaggacaattccgagttcatatctcgacgctcgctggggaattttgctagatctttcatggcatcaggcaacataaatttgattaacgatgttatgaaagcagtacaccgttcaggatggcgtattagccaggtgactgttctttgcttgcactttgttatagtttggagttgaagttgaaaccccagatttctggatgttcaaactggtaattttgtttttagagctgactaggacagagggatgcaaaaaaaaaagtgattgccataagctagctaaaagagttcatttgcacaccacatatttttagttcatgatattttcctttctttgttctttgtccttttccattttttgctggatggtgtgctaacttacgtacttaccccttcaaatggtggacacaaccattacacacgcaggatatctttgggaaagcaattcagcgatacattcagaaacctgataagaagcagctactgctttgcctcttggactggatgactggtcaaggctattctgtggactcatcatcaaggaacttgcttttgagaaatgcccaactctttggccaaaagcaacttatagctgaaatcctttccaagcagcagggagcatcaaggatcacaagtcaaaggcaccaaaaatagttgataaggtagaattcaatatatgtaaattgttcagattcatccaagaatattctttagtaaaccattgttgatgatcagtgttaacatgttcgtagggatcggttagatcatcaggtaacaagttattcaccctcatcctcatgtgtcccaggatccaatcaagattcatcagaattacagatctggtatttcgtatgcatgtggtgtaaagcacccatgttatgttgtaatgcctgagcttgagcttgtccattttagtcaggctattcagggtgagattccacaagagctgcagatgggactagtaagtggtaggcaagtcttgctcaagactgcaaacaggcatacaagtaagttctcattgcatttctttacagcaacatcagagaaagtgtatattgagtttggtgttttgtgcagttaacactatgaaccttcttgaaggaactagtatgctacatagatctggaaacctgagcagatttcaaattttgttggttgtacatacttgtttttacgtgccttgaaacatgaaaggaacaatttgctaaggcgctgaataagatggattggcaaatattcaatggaactcagagtcagaggtagaacttcagtttggacaaatatggtcgcagtttgttttcttcggtttggtgtcatcatgaaaccaagtcttggttcagaacaaggaccatgggttcacaaatactgttttggtatatggcccatgcaaaccttctactatttaataaaaatgttttcaaatgtttgtataacctgctatgaaaagtatacacttcaagtgttgaagcattttttaacaatatgcaatgcatgccacataaaatccataaagggtcagggagaatcacattctgttgtaaaaccaacatatatgattaacagtaaacatatttacattattacacgtccttttggcattgccttaattaaaaactaactcatctataatagcatgtcatgggatgctacacccaacaattagataatgagtgtggccattgtctagctagcagttttacttagaatgcaaggtgttgctttgaaggttcaacaatccatacaggcagactaaggtatggaaagggtgtacggtgagaaatcttgagtttggagcagaataagtccagttactgctattttttcctattttcattttatgatcaggaatgagtcaattgatcaataagctgatatccttttctttagaaaattatgttcataacatgctgttttctccttgctttgctgaaagaaccctaagcttcatctggagtccagcaatgcatgtgatactgaacctatttagaaccagaggattctagttacaattagattagctatgcaaattaaattttggaacaccttctagttaaaagcactgctattgtaggggattgccatgtgaaatgatccttttattgtgtgtgaccttataacttctaatagtactgtaaaatgtattatggagagttttaaactaaaattacttcatgggtgtggatcattgggtatcattgtcgaggtaaacttggatgtcaatttgttcttttgcttgaaaaaactcagttttggccaattcatacattaagacatcattttcgtagatgcgtctaaggcaagaattggcaggcagcgatgtaaaataatagctgattttttttttgtcagatgaaatactggaccagagtatctgctaattcacacgtccctttcaatgtgagatattcttttcatgctgctaagctgaacgacagaggctactctatgattgtcctcacactaactgccagttacaagatcttttgattaaaattatcctatcaatttgagtccacatatatttcgatacatgtacattagattcctgcatatatgtattagtagtattttagcttgttagtacaatcttgttgtctacggagtacctaggtaacctataaaattttgtgctgtgtatttgtcctctatctgattctctgtgctatgatcatctggtaatcagtggctgttccaagttgttctactcagcttccttccagttctttgcacccagccatcaacagataagttcgtttcatcaggacgaattctctgtgtagaaaattatcggcatatttatttgagtgggccatcatttctgtgtcagcaggcaagaatagcttccaataatcatgttgggtttctaatgctgcaggcattatcttgtcctctagtagtagttttttttccccctaaacaatctatttcatgctgtttggactttgtacggatgggggaaaataaacttaagttgcactatgcccctacgcaatcaggaacattttttttgtgattatggttttgacaaaagtcatactcccaaataaaagggctagccatactgcagatacttttttggtattttttatttgagaagattgttccatctgctcccccattagtgaattcctcagctttgaaataatcaaaagaaaagaaatcaaagaatccatccatttttcaattggtcagtggtgacttcctga</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os01g0559500, RefSeq:Os01g0559500