Os01g0601675
| Gene Name |
Os01g0601675 |
|---|---|
| Description |
Leucine rich repeat, N-terminal domain containing protein |
| Version |
NM_001185523.1 GI:297720180 GeneID:9268844 |
| Length |
3227 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0601675, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:25296500..25299726 |
| Sequence Coding Region |
25296832..25299693 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggacgtgtttagatgcatccacgttctaatagccttagccttgcttttgttcaccccaatcatctccaatgaggcctcagccaatgccaatagcacaggtggttgtattccaagtgagagatctgcacttatcagcttcaaatcaggattattagaccctggaaacctcctttcgtcatgggagggtgacgattgttgtcaatggaatggcgtgtggtgcaacaacgagaccgggcatattgttgagctaaatctcccaggaggtagctgcaacatcttgcccccatgggttccgctggaaccaggactcggaggcagcataggcccctcgttgcttggcttaaagcaactggagcatctcgacctcagctgcaacaatttcagtgggacgctaccggagttcttgggttctctccacaacctgagatctctcgacctatcctggtcgacattcgttgggacagtgccaccgcagctgggtaatctctccaacttgcgctacttcagtcttggttctaatgataattctagcttatattcaacggatgtatcctggttgtcacggttatcttctctcgagcatctagacatgagccttgtgaatctcagtgcggttgtggactgggtttcggtggtgaacaagcttccatctcttagatttctccgtttgtttggatgccagcttagcagcacggtcgattctgttccgaacaacaacctaacatctcttgaaactctggacctttcacttaataatttcaacaagaggattgcacccaattggttttgggatttaactagtcttaaacttctagatatctcagatagcggtttctatggaccatttccaaacgagataggcaatatgacctctattgtggatattgatttatcaggcaataatcttgtgggaatgataccatttaacctgaagaacctatgtaacttggagaaatttaatgttgctggaaccaacatcaatgggaatataacggaaatattcaatagattgcctagatgctcatggaataagttacaagtgttgtttctaccggactgcaacttgactggaagcctaccaacaacactagaacccttgagcaatttgagcatgcttgagcttggtaataacaatatcacaggtcccatcccactttggataggagagctcagtaatctaacaatgttgggcctcagctccaacaatctagatggggtcatacatgaaggccatttatcaggcctagaaagtctagatttgttgatcttgtctgataataaccacatagccatcaaggtgaattctacctgggttcctcctttcaagcaaataacagatattgaacttcggtcctgtcagttagggcctaaattcccaacatggctcaggtatctaacagatgtatacaatcttgatatctcaaacacaagcatatcagacaaggttcctgactggttttggaaagcagcgtcatcagtaacacatttaaatatgagaaacaatcagattgcaggtgcccttccatctacattggaatacatgagaacgatcgtaatggatctcagttctaataagtttagtggtccaatacccaagcttcctgtcagtctaaccagcttagacttctcaaagaacaatttatccgggcctctaccatcagacataggagcgtcagctctagtatcacttgttctgtatggcaactccctttctggttcaattccatcttatttgtgcaagatgcagtctctggaactgttggatatatcaagaaacaagataactgggccaatttctgattgtgcaatcgattcaagctcagcaaactacacatgtacgaatattatcaatataagcttaagaaaaaataacctctcaggacaatttccttcgttctttaagaactgcaaaaaccttgtttttctggatcttgctgaaaatcaattctctgggacactgcctgcatggattggggaaaaattaccttctttggtattcttacggctgcgttctaatagctttagtggtcatattccaattgaacttaccagtctggcgggtcttcaatatttagaccttgcacataacaacttttcaggatgcataccgaattctttggcgaaatttcataggatgacactcgaacaagataaagaagacagattttcaggggctattagacatggaattgggatcaatgataatgacatggttaattatattgagaacatatctgtagtcacaaaaggtcaagaacgcctatatacaggtgaaatcgtatacatggtgaacattgatttatctagtaacaatcttactggagagattcctgaagagattatcagtcttgttgcgttgacaaacctgaacttatcatggaatagcttaagtggacaaattcctgagaagattggttccttgtcacaattggagtcccttgatttgtcacacaatgtgctttctggtgggattcccagcagtatagcatctcttacctacttgagccacatgaatttgtcgtacaacaatctttctggaagaattccagcaggaaatcaactcgacattcttgaagaccctgcatctatgtatgttggaaacatcgatctctgtgggcatcctctaccaaataactgctctatcaatggtgatactaaaattgaacgagatgacttggtcaacatgtcatttcacttcagcatgatcatcggtttcatggttggcctcttgctagtattctattttatgctcttcagcagaagatggagaaatacttgctttgtgtttgtcgatggcttgtatgacagaacgtatgttcaagtggccgtaacctgcaggaggttatggaggagaaactga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDVFRCIHVLIALALLLFTPIISNEASANANSTGGCIPSERSAL ISFKSGLLDPGNLLSSWEGDDCCQWNGVWCNNETGHIVELNLPGGSCNILPPWVPLEP GLGGSIGPSLLGLKQLEHLDLSCNNFSGTLPEFLGSLHNLRSLDLSWSTFVGTVPPQL GNLSNLRYFSLGSNDNSSLYSTDVSWLSRLSSLEHLDMSLVNLSAVVDWVSVVNKLPS LRFLRLFGCQLSSTVDSVPNNNLTSLETLDLSLNNFNKRIAPNWFWDLTSLKLLDISD SGFYGPFPNEIGNMTSIVDIDLSGNNLVGMIPFNLKNLCNLEKFNVAGTNINGNITEI FNRLPRCSWNKLQVLFLPDCNLTGSLPTTLEPLSNLSMLELGNNNITGPIPLWIGELS NLTMLGLSSNNLDGVIHEGHLSGLESLDLLILSDNNHIAIKVNSTWVPPFKQITDIEL RSCQLGPKFPTWLRYLTDVYNLDISNTSISDKVPDWFWKAASSVTHLNMRNNQIAGAL PSTLEYMRTIVMDLSSNKFSGPIPKLPVSLTSLDFSKNNLSGPLPSDIGASALVSLVL YGNSLSGSIPSYLCKMQSLELLDISRNKITGPISDCAIDSSSANYTCTNIINISLRKN NLSGQFPSFFKNCKNLVFLDLAENQFSGTLPAWIGEKLPSLVFLRLRSNSFSGHIPIE LTSLAGLQYLDLAHNNFSGCIPNSLAKFHRMTLEQDKEDRFSGAIRHGIGINDNDMVN YIENISVVTKGQERLYTGEIVYMVNIDLSSNNLTGEIPEEIISLVALTNLNLSWNSLS GQIPEKIGSLSQLESLDLSHNVLSGGIPSSIASLTYLSHMNLSYNNLSGRIPAGNQLD ILEDPASMYVGNIDLCGHPLPNNCSINGDTKIERDDLVNMSFHFSMIIGFMVGLLLVF YFMLFSRRWRNTCFVFVDGLYDRTYVQVAVTCRRLWRRN</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>34..2895#ggattagatcgagttgcattgcaaaaacaatacatggacgtgtttagatgcatccacgttctaatagccttagccttgcttttgttcaccccaatcatctccaatgaggcctcagccaatgccaatagcacaggtggttgtattccaagtgagagatctgcacttatcagcttcaaatcaggattattagaccctggaaacctcctttcgtcatgggagggtgacgattgttgtcaatggaatggcgtgtggtgcaacaacgagaccgggcatattgttgagctaaatctcccaggaggtagctgcaacatcttgcccccatgggttccgctggaaccaggactcggaggcagcataggcccctcgttgcttggcttaaagcaactggagcatctcgacctcagctgcaacaatttcagtgggacgctaccggagttcttgggttctctccacaacctgagatctctcgacctatcctggtcgacattcgttgggacagtgccaccgcagctgggtaatctctccaacttgcgctacttcagtcttggttctaatgataattctagcttatattcaacggatgtatcctggttgtcacggttatcttctctcgagcatctagacatgagccttgtgaatctcagtgcggttgtggactgggtttcggtggtgaacaagcttccatctcttagatttctccgtttgtttggatgccagcttagcagcacggtcgattctgttccgaacaacaacctaacatctcttgaaactctggacctttcacttaataatttcaacaagaggattgcacccaattggttttgggatttaactagtcttaaacttctagatatctcagatagcggtttctatggaccatttccaaacgagataggcaatatgacctctattgtggatattgatttatcaggcaataatcttgtgggaatgataccatttaacctgaagaacctatgtaacttggagaaatttaatgttgctggaaccaacatcaatgggaatataacggaaatattcaatagattgcctagatgctcatggaataagttacaagtgttgtttctaccggactgcaacttgactggaagcctaccaacaacactagaacccttgagcaatttgagcatgcttgagcttggtaataacaatatcacaggtcccatcccactttggataggagagctcagtaatctaacaatgttgggcctcagctccaacaatctagatggggtcatacatgaaggccatttatcaggcctagaaagtctagatttgttgatcttgtctgataataaccacatagccatcaaggtgaattctacctgggttcctcctttcaagcaaataacagatattgaacttcggtcctgtcagttagggcctaaattcccaacatggctcaggtatctaacagatgtatacaatcttgatatctcaaacacaagcatatcagacaaggttcctgactggttttggaaagcagcgtcatcagtaacacatttaaatatgagaaacaatcagattgcaggtgcccttccatctacattggaatacatgagaacgatcgtaatggatctcagttctaataagtttagtggtccaatacccaagcttcctgtcagtctaaccagcttagacttctcaaagaacaatttatccgggcctctaccatcagacataggagcgtcagctctagtatcacttgttctgtatggcaactccctttctggttcaattccatcttatttgtgcaagatgcagtctctggaactgttggatatatcaagaaacaagataactgggccaatttctgattgtgcaatcgattcaagctcagcaaactacacatgtacgaatattatcaatataagcttaagaaaaaataacctctcaggacaatttccttcgttctttaagaactgcaaaaaccttgtttttctggatcttgctgaaaatcaattctctgggacactgcctgcatggattggggaaaaattaccttctttggtattcttacggctgcgttctaatagctttagtggtcatattccaattgaacttaccagtctggcgggtcttcaatatttagaccttgcacataacaacttttcaggatgcataccgaattctttggcgaaatttcataggatgacactcgaacaagataaagaagacagattttcaggggctattagacatggaattgggatcaatgataatgacatggttaattatattgagaacatatctgtagtcacaaaaggtcaagaacgcctatatacaggtgaaatcgtatacatggtgaacattgatttatctagtaacaatcttactggagagattcctgaagagattatcagtcttgttgcgttgacaaacctgaacttatcatggaatagcttaagtggacaaattcctgagaagattggttccttgtcacaattggagtcccttgatttgtcacacaatgtgctttctggtgggattcccagcagtatagcatctcttacctacttgagccacatgaatttgtcgtacaacaatctttctggaagaattccagcaggaaatcaactcgacattcttgaagaccctgcatctatgtatgttggaaacatcgatctctgtgggcatcctctaccaaataactgctctatcaatggtgatactaaaattgaacgagatgacttggtcaacatgtcatttcacttcagcatgatcatcggtttcatggttggcctcttgctagtattctattttatgctcttcagcagaagatggagaaatacttgctttgtgtttgtcgatggcttgtatgacagaacgtatgttcaagtggccgtaacctgcaggaggttatggaggagaaactgaggacaaatggtatgtcttggtaaaaaataattagaaaaatagtcatgcatagaacgggtagatgtgaaaaattgaaacgtagtttctatagcaaatgctggctatataaaaaaattcccaagctttttttctcatccaccactgggcatggggaaaaaatgtttgtattttcctggagatttaattcttgaacatagtacatgcttttagtggtaaagcacgtacccgcactacatgatgttatgtctctactatctcatttgaatgtgtaaaggatacatatctaattgggcacgtgcctgcactacatgatgttatgtctctacaatctc</dnaseqindica> |
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