Os01g0624000
| Gene Name |
Os01g0624000 |
|---|---|
| Description |
Neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase family protein |
| Version |
NM_001050153.1 GI:115438676 GeneID:4326680 |
| Length |
10391 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0624000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:26570470..26580860 |
| Sequence Coding Region |
26570689..26571237,26575355..26575521,26575651..26575714,26576207..26576332,26576408..26576678 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:26570470..26580860 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:26570470..26580860 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggaggcttcatcttggttgtgctaccaagctcgtggttttggttcatccagagtatggttatggcttcttctagctcttgttcttctgaattgcagcctggtactctcagcctcgccgtatctggtcggtatggggagcttcgacataacaggacctgcagcagatgttaacatgatgggatatgcaaatactgagcagattgcatcgggaattcacttcaggctgaagtcacgtgcatttattgtggctgagcctaatggaaagcgtgttgtgtttgttaatatcgatgcttgtatggcatcacagattgtgactataaaggtgcttgaaaggctaaaagcaaggtatggtgatctttataatgagaacaacgtggctatcagtggcatccacactcatgctgggcctggaggttatcttcagtatgtagtttatattgtcacgtctcttgggtttgttcgccaatcctttgatgtaattgttgatggcatcgagcaaagcattgttgaagctcataacaacctccgtcctgggaaaatatttgtgaataaaggtgacctccttgatgctggtgtgaatcgcagcccaagtgcatacctaaataatcctgccgaagagagaagcaagtacgagtataatgttgataaagaaatgaccctcatcaagtttgtagacgatgaactgggtccagttggaagtttcaattggtttgcaactcatggaacatcaatgagccgtacaaattctttgataagtggtgataacaagggagccgctgcacgcttcatggaagactgggctgaacaaatgggcttgcccaaacagtcagctcatgcaaattctgatgatttgagatctttgcacaagacatctgtacttcctcggagagtttctactataattcctgaaccaaatgagataactgatgacttgatacaattggcatcatcctatgaggcctcaggtggcaggcggttggcaggttcaagtatcactaggcgcattagaagtactcaacaaaacaaacctaaatttgtttctgcattttgtcagtccaattgtggagatgttagtccaaatgtccttggaacattttgcatagacaccaatcttccctgtgacttcaatcacagcacatgtaatgggaaaaatgaactttgctatggacgaggcccaggataccctgatgagtttgaaagtacccgtgttattgggaataggcaatttctaaaggctagagatctctttgattcagcttctgaagaaatacaaggcaaaattgactataggcacacttatttagatttctcaaaacttgaagttaaagtttctacaagtgcaggcggtcagcagaccgtgaaaacatgcccagcagcaatgggctttgcttttgctgctggaaccacagatggccctggagcttttgatttcagacaaggagatgtcaagggaaaccctttctggaagttagtaaggaacttgttaaagacaccagggaaggaccaagttgaatgtcattctccaaaaccaatattgctagacactggtgaaatgaaggaaccatatgattgggcgcctgcgatacttccagttcaaatgattagaattggtcagctggttatcttgtgtgttcctggagaattcacaacaatggctggcaggcgtctacgtgatgctgtgaaaactgttcttacaagtggaaacagtgaatttgataaaaatattcatgttgttcttgcggggctaacaaacagctactctcagtacattacaacttttgaagaataccagatccaaagatatgagggagcatcaacgttgtatggtccccacaccttgagtgcctatatccaagaatttcagaaacttgctatggccatgattgcaaacaaagaggtcccaacaaatttccaacctcctgatatgttggacaagcaaattggactacttcctggtgttgtttttgactcaactcctcttggtgtcaagtttggggatgtcaactcggatgttcctggtaactcaacattcaacaagggtagtactgtgaatgctacattttattcagcatgcccaaggaatgaccttcttacggatggtacctttgcactcgtcgagaagctagatggtaacaataattgggttcctgtctacgatgatgatgattggtcattgcgtttcaagtggtcaaggcccgcaagattgagttcaagaagttttgcaactctagagtggacagttcctgaagacgctgctgctggtgtttacagattgaggcattttggtgcctccaaaccaatgtttggttcggtcaggcattttacaggaacctctcgtgctttcgcggtgcgttag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEASSWLCYQARGFGSSRVWLWLLLALVLLNCSLVLSASPYLVG MGSFDITGPAADVNMMGYANTEQIASGIHFRLKSRAFIVAEPNGKRVVFVNIDACMAS QIVTIKVLERLKARYGDLYNENNVAISGIHTHAGPGGYLQYVVYIVTSLGFVRQSFDV IVDGIEQSIVEAHNNLRPGKIFVNKGDLLDAGVNRSPSAYLNNPAEERSKYEYNVDKE MTLIKFVDDELGPVGSFNWFATHGTSMSRTNSLISGDNKGAAARFMEDWAEQMGLPKQ SAHANSDDLRSLHKTSVLPRRVSTIIPEPNEITDDLIQLASSYEASGGRRLAGSSITR RIRSTQQNKPKFVSAFCQSNCGDVSPNVLGTFCIDTNLPCDFNHSTCNGKNELCYGRG PGYPDEFESTRVIGNRQFLKARDLFDSASEEIQGKIDYRHTYLDFSKLEVKVSTSAGG QQTVKTCPAAMGFAFAAGTTDGPGAFDFRQGDVKGNPFWKLVRNLLKTPGKDQVECHS PKPILLDTGEMKEPYDWAPAILPVQMIRIGQLVILCVPGEFTTMAGRRLRDAVKTVLT SGNSEFDKNIHVVLAGLTNSYSQYITTFEEYQIQRYEGASTLYGPHTLSAYIQEFQKL AMAMIANKEVPTNFQPPDMLDKQIGLLPGVVFDSTPLGVKFGDVNSDVPGNSTFNKGS TVNATFYSACPRNDLLTDGTFALVEKLDGNNNWVPVYDDDDWSLRFKWSRPARLSSRS FATLEWTVPEDAAAGVYRLRHFGASKPMFGSVRHFTGTSRAFAVR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>9624..10172#5340..5506#5147..5210#4529..4654#4183..4453#3839..4094#3372..3740#2444..2652#1271..1617#atcaggagccgagccctccactttccccgccgctcgggccgctttctccattgccaagccgtaccttcgacgcttcgccttgtcagtcactgtccccttcgtggtcgtcttcgccacttctccccccgtctccacttgccccatatctgcggcagcctccctcctcctcgcggagatttgacccctgcgggctcgccttaaaatagaggcgcatcccattcccaagtggctgcttcctgcaaccacgaggtccgccgctctcgggagctccagcgagccgcgtcgccttctgcgcccgccgcccggtggccggcttaaatttgtgcgcggaggcgagccgtcgtcggtgccgcggggcttcctaattcctcccgggggagtgtggtcgagtgggggtttctggggttcttcgccacttcgccgcccgccggtgagttcgcttcctctcttccaagttccagtaagggcttgggtcactcgattgatgctgattcggcgcgtttcgcttgactgggaagttcgtcacgcgattgtcatacggttctcgcgtaattggtggcgtgtttcgatgagaatggccgttaggcttagcttgtagactgtgcaagactgtttttaggctgttgctaccgtggtctgtttggtgagaaaatggctggccttcctgattccttgtggtgttcgtagtggaatttgatgggggtctgatcgttgtggggggtcgcttgccggtgaaggaggctgctcttcggcaaatggttgggtgggtgggtcactgggtgctcaccgttttccggatctgggattctgaggtactgaaggtggtgtcgtctgtggttggggagtggtgcggttttcaagtttaggggcgtgtttaggacctgatgatgcaattgtaaatttgtaatacgatttgcaacgtccatatgtccacagcaacccaaatttattggtatagctctgatgaaacttcgggagtttcatttcagtatccctgttggtgaaaattatctcttctttcttgtattttgttcatgaagagtgatacaattaatagtattgccactgttactgtttttttctgaaaaaatttggcgccttcttttgtcttaacctgcttggatgatacgcatagttaatcacatcattaatccattatgctgtaatgatgtgtgaattttcttacaaactttgttttcttttgcagtttagtaaattcaacattttggacctacatgagttgattaacaagtccattccattgtccttcatggaggcttcatcttggttgtgctaccaagctcgtggttttggttcatccagagtatggttatggcttcttctagctcttgttcttctgaattgcagcctggtactctcagcctcgccgtatctggtcggtatggggagcttcgacataacaggacctgcagcagatgttaacatgatgggatatgcaaatactgagcagattgcatcgggaattcacttcaggctgaagtcacgtgcatttattgtggctgagcctaatggaaagcgtgttgtgtttgttaatatcgatgcttgtatggcatcacagattgtgactataaaggtgcttgaaaggctaaaagcaaggtaagagttaacatttcttgcgaccttattaatgcttgcatgtttgttgcaactttatgtgatatgcgcttatagatcgtgtataaaatgatccatcaacctttctacatgcatggtatgttccccaaaaaagcagacccgtaactcattgtcaagttactcatcatcatggattgagaatttgagatcctctgacttacttccctttgacttggagtcactgacatgtgggcccgctacctaaagggccaacatgtcggtgatccctgtcagaggtaagtaagtcataggatcctcttcctcaccatcatttgttgatggccgtcttattgttttcaaagattgttcaagtgaggcactgcctcaaaatcattggccattttgcaatgcatgttgcagaaacattgaggaacccagatgccctcatgttcactggtatgatcttgtttgaatctgttatgtcccaaagctcagtgaggcattatagcacgccatcatgtaggctggtgctgacaatgctgtagctaaggtactcatgttgcttgtctgttgtagcacgcctagagtctcagtcgagtcactttgttggaagttggaacattatctcttaaatcgactacctactcaacatggtattgtatttcctatgggtaaataaaccaaatttctagtttatattttgtccaactgaacctcaaaaccttgacttacagcatcaggattcttcccagtgcttctggccagccttgagacccttatgcagccatgcacctaataaagtctgctcagtagtttttcataacatcagggatcctcaaatttgcaggtatggtgatctttataatgagaacaacgtggctatcagtggcatccacactcatgctgggcctggaggttatcttcagtatgtagtttatattgtcacgtctcttgggtttgttcgccaatcctttgatgtaattgttgatggcatcgagcaaagcattgttgaagctcataacaacctccgtcctgggaaaatatttgtgaataaaggtataaaattagcttttgcttggactagccaaggttttccaaaaccgcctccggagccaatttttgctgctgtttaattaatgagtaaattacactttggtccaccttttattacccaagtttcactttggaccacccttaaatctatcttttcaatttggaccggataaatttaccattgttgcggtttgaaataccatgaaaaacttttcttgtcatgtctaacttccctttcggcaaacatatgaaccatacatagaggtgttcgcccgtatacaagagttgatgtgtttaaggttgttgattgtactgaaaaaaaatcgtttgtggtggtccaaatcgcaacaatggcaaatttatctggttcaaagtgaaaagatttgtttaagggtggtccaaagtgaaacttaggtcataaaatgtagcccaaagcgtaattcactcttaatgagtaaattacaatgcacctgttttctgttatttgtgacggttttaatctcacatatatgcatttcatttagttgcaagtaggccttcaaatgtcattacttgaattctggttatttctttcttatcattcagaaagctttataacaatagatgacttgaagcctgattttagatgtatgttgtgcacttacgctccccatatgatgcctactgagcatacgttgttactgcagtggttctttttttaaaaaaagggtacttgatttcaggtgacctccttgatgctggtgtgaatcgcagcccaagtgcatacctaaataatcctgccgaagagagaagcaagtacgagtataatgttgataaagaaatgaccctcatcaagtttgtagacgatgaactgggtccagttggaagtttcaattggtttgcaactcatggaacatcaatgagccgtacaaattctttgataagtggtgataacaagggagccgctgcacgcttcatggaagactgggctgaacaaatgggcttgcccaaacagtcagctcatgcaaattctgatgatttgagatctttgcacaagacatctgtacttcctcggagagtttctactataattcctgaaccaaatgagataagtatgaacctgaaccatatgccccttgatctgttcacatatatcggtgaaacatgttgggtcatgcctgaacttttattttcttcaattgctgttcagctgatgacttgatacaattggcatcatcctatgaggcctcaggtggcaggcggttggcaggttcaagtatcactaggcgcattagaagtactcaacaaaacaaacctaaatttgtttctgcattttgtcagtccaattgtggagatgttagtccaaatgtccttggaacattttgcatagacaccaatcttccctgtgacttcaatcacagcacatgtaatgggaaaaatgaactttgctatggacgaggcccagggtatccaccatgcctgaaaagtttaataaccttcctgtacatctgctagaaactgttataaatgaggttcttctttgctgctttgcagataccctgatgagtttgaaagtacccgtgttattgggaataggcaatttctaaaggctagagatctctttgattcagcttctgaagaaatacaaggcaaaattgactataggcacacttatttagatttctcaaaacttgaagttaaagtttctacaagtgcaggcggtcagcagaccgtgaaaacatgcccagcagcaatgggctttgcttttgctgctggaaccacagatggccctggagcttttgatttcagacaaggagatgtcaaggtttagcatgtcaatacatagtagcttcaaaatttgggtaacatgctactcactggtttatatatctcttaccagggaaaccctttctggaagttagtaaggaacttgttaaagacaccagggaaggaccaagttgaatgtcattctccaaaaccaatattgctagacactggtgaaatgaaggaaccatatgattgggcggtatggcttctctctctctctcttttaataatagtaggcaggcacatgtggtacctttatatttgaaacacctagttcatttactctttgagttttgatagcaaaggtcgaaggtggccattattatagagcaaatgttgctgcatgaaatcagtactgcaggtactgatataacatataattcttagtaacactgatgactggcaaatgctctaattcaatgattcggtttgtttgaccttttctggaatattcagatagtttcaaagcttaaaccatagccagtatcatgatatttatgaccagcatgatttgttgtgctagaggcaaagcaatgacatcaaatgagttgtcacttccaaacccagtcatgagtgagctccatgacatgtggactcagaagcaaaatctacaattaaactacttagtgaatttacaaaaaaaataaaatctgtttgctggtcctgtactgacttctgtagttttatgcagcctgcgatacttccagttcaaatgattagaattggtcagctggttatcttgtgtgttcctggaggtatattcccaactcctcgcccctagaatttctaccaagctaaaagtgcatatgatgtcttattccagtggattgtaatatgttatctgatactcacggtacaataattactgtcatgtttgggtacagaattcacaacaatggctggcaggcgtctacgtgatgctgtgaaaactgttcttacaagtggaaacagtgaatttgataaaaatattcatgttgttcttgcggggctaacaaacagctactctcagtacattacaacttttgaagaataccagatccaaagatatgaggtgtgtataaacttggccatctggtctatacattgacaacagtattgaatcaggcaaaatagactcatctcatagaccaattcatttatagctatctatgtgcatgtggtgtgtttattaatttagcttctttgctacgttaagtttgtacttaatctgccatgcttacatatgtccctgctcaactagaagccttagaacaactagctgggtggcccgcgcaattgcgcggctggcacccatacaaaattatctatttttaatatgattttacttataatttattcaatagatatttcattgtctttaagactttgaaagaccaaaccatatcatccccgtatttctaatgttgtaacttttataaaagtcacatcagttgttaccccttactttttttgtcaccctttctttatttgcttgttcgatctaccatggcttatattcattctccttttaacctttaaaaattggatcttatagtttttttgagtttattgtctcattgggtttcatttttttattttaagaagtcccgttaaaagctgccaatatacttctctacggcccatctgctgcttcctctctttattgtcattgggattttaaaaatcgaacataattatcgtttgagttcaatttttactttctagagtcccaccaaaccgtttgtactcctctacggctcgcccgcttcctcccactctttattatatttgagattttaaaatcgaatgtgattatcattgaggtttattttttaattttttggaaatcccgccaaccgtcgtgaccattctgcttaacggcatgtccgtcgtcactccttttaattgtcattgggattctatatggggttttgttaatagttcttagatgtctcatcaactgtcaccactctactcctttacaaccctgtaacttcttcgatatttattatcatttatcatcgttgtgttctagatgatttttttttgaaatttccatatttttcgttccgatagattttatttataaattatattcctagttgttttactctattttcagaatttattttattaattatttggaattttaattaatctcgttatgtattctagatggtgtattctttaaatagtctttattttttattacgaatttcagttacttttaaattgcattccaagttgaactcttcttttattttcttatttctaatttcggattttgttttattttttattttaaattttaattaatctcgtattgggttcttatatatggacttgtatgaaatgagggcactgtattatttttctgctgctgcagcctaagcatgctggcttggtatctccaccctatatatgtgcgggaatgtatgttggtttagaactctatactgtacagttctgcaattgatttttctaaacggacaaggactcctagtacggatggtatgatctataattagattgatatgattatcttttgtacagtaaatctatttagtaattttaaatttgtattcctactcgaactctcttttttcttttcttcttatttcagcaatttatttatttattattctgaattttaattaatcacgtattgggttcttatatggactcctctttcaatattgcttatttttaattccaaatttcagttatttttcagattgtatttctacttggactcttttttttctttttctctgattaatgtgggaatttctagcctccacagcgaacgtggtgccttcttttcgagctgtcttaataatataactagctaggtggcccacgcaattgcgcggctagcacccaaataaaatcatatatttttagtatgattttaattaaaatttattaaatagctatctcattgtcttaagactttgaaagaccaaatcttatcatcgtcgtgtttttaattatatagttttttaaaagtcacaccagttgctacccattatgtcatttccttctttatttgcttgctcgatctaccactatttctaatcattctccttagaacctttaaaaattggatcttacagtttttagagtttattgtcatgttgggttttgtttttataatttctagatgtcctgtcaaacgttgccattatactcctctatggcctgtccattgtttcttttctttattgtcattgagattttaaaaatcgaacataattatcgtttggcttcatttttactttttaaaagtcccgccaaaccatcagcgactttgccattgtacttctctacggctcgcctgctgcctcccttctttattgtcattgagattttaaaatcgaacatgattatcatttttttttactttttagaaattccgaacctttaaaaattggatcttgtagtttttagagtttattgtcttgttgggtttcattttttataatttttagaagtctcgtcaaacgatgccactatgctcctctacggcccgtccgccgtctactatttatggtcattgtgattctaaaaatcgaacatagctatcgttggaattcattttttattttctagaagtcccgtcaaccgtcggcggctctgcaactatactcctatacaccccgtccgatgcttctcctttttattgtcattgagattttaaaaatcaaatatgtttatcaatggggtttatttttttttactttctagaagtcccggcaaccgccttgctcgtctgcttcacggcctgcttatcgtccctccttttaatcgtcattaggattctatttggtgttttattaatagtttttatatgtcgtatcaaccgccaccactctactcctttatagtctagttaatttatctcgtcatgtgttttagatggtcttttctttcaatagtctttatttttatcacaaattttagttatttataaattgtattcctaattaaaatcttgtttttctttttctaatttcagaatttattttttcaaattttaattaatatcgtattgtgttctttcaatattcttattttttattttcaatttcagttgtttcaaaattgtattcctacttgaactctcttttaattaatctcgtattgggttcttatatcgatttttctttcaatattgcttatttttaattcctaatttcagctaattttaaattgtattcctacttgaactcttcttttattttcttttgctaatttcggatttatttatttttattccgaattttgattaatatcgtattgggttcttatatggattcttattttaatattccttattttttaattccgaatttcagccatttttgaattgtattcctacttggactctcatttccttttctaattttggattttattttatttttatttcgaattttgattaatctcgtattgggttcttatatggaaacttatttcaatattccttatttttaattccgaatatctgctatttttaaatcgtatttctacttggactctccttttcttttctaattttggattttattttatttttatttcgaattttgattaatttcgtattgggttcttatatggaaacttctttcaatattgcttatttttaattccgaatttcagctatttttatattgtacttctacttggactctactttttttttctttttctccgattaatgtgggaatttttagccccacaacgaacgtagtgtctcctttcaaagctgttttaataatataatagatagatagataggcctatgtgtcagcctgtcaggtactctactgcttgtttgcatgtcggcacttaaattaccatatcttgatcatgccccttatggtgcaatatatgaagtttcttaaggcgatctgttctgtttggtgccagaaaaagggtaaaaaatatgtaacttttttatatattagactctggacaattatatcagttggcagttattgatgttctgaagctgaatatgcaatttttgttttacccaaaattttcataatccttctggcagatagtgtactgtaggatcgcttgaatgaattttggatacatagtgtactgtaggatcgcttgaatgaattttggatacatgttgtctcatgaatcattcgttcaaatgaatacctttttcacagggagcatcaacgttgtatggtccccacaccttgagtgcctatatccaagaatttcagaaacttgctatggccatgattgcaaacaaagaggtcccaacaaatttccaacctcctgatatgttggacaagcaaattggactacttcctggtgttgtttttgactcaactcctcttggtgtcaagtttggggatgtcaactcggatgttcctggtaactcaacattcaacaagggtagtactgtgaatgctacattttattcagcatgcccaaggaatgaccttcttacggatggtacctttgcactcgtcgagaagctagatggtaacaataattgggttcctgtctacgatgatgatgattggtcattgcgtttcaagtggtcaaggcccgcaagattgagttcaagaagttttgcaactctagagtggacagttcctgaagacgctgctgctggtgtttacagattgaggcattttggtgcctccaaaccaatgtttggttcggtcaggcattttacaggaacctctcgtgctttcgcggtgcgttagttgatacgccttgagctttttatggcttatgaaggtttacagcaccaacttcatacatggaaaccctgccattatatccatagggcttatctgcttcttatttacttgtatttgagggtaataacactgttcaatcttatggaagtgtgaaactgctgtcccagtgcatgaactaagaatgggaaatatacagaatgtacataggtgctctttttatgt</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
