Os01g0631900
| Gene Name |
Os01g0631900 |
|---|---|
| Description |
Similar to Senescence-associated protein 4 |
| Version |
NM_001050185.1 GI:115438740 GeneID:4326588 |
| Length |
5097 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0631900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:26948184..26953280 |
| Sequence Coding Region |
26948184..26948702,26948813..26948873,26949375..26949469,26949562..26949674,26950215..26950383 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:26948184..26953280 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:26948184..26953280 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgggtcacacagccagtcggatatgtacccttctctcgatcctcttcgtttcttgtatgcttgcatctgctgccaatgatggactgatccgcatcgcgctgaagaagagaccgatcatggagagcatctacggtgaactagttcccaagagtggtacagtggaccacgaggttgcacttgggtattctggcgtcaggatgaattcggcagatgagggattctacgatccggtcacggaagccattaaccatgttcgtgtgcatcagcaaagaatgctcagggacatagaggctgcagccatggaagggaggctcaagcatttctggagttacagagggttcagagaaaggggtagcctgaaaaatggcactcagaatcatcctctagcgctgaagaactttctgaacgctcagtattttggggagatcggagttggctgcccaccgcagaattttacggtggtctttgacaccgggagctccaacctctgggtcccttccgccaagtgcgttttttcgcttgcctgttacttccatcggaagtatgaatcaagaagttccagtacttacatggagaatggaacacctgcttccattcactatggaacaggatctattcatggttattacagtcaagatcaagttaccattggtgatctagttgtcaataatcaggaattcattgaagctactcatgagcctggtcttacgtttctagcagcaaaatttgatggcatccttggacttggatttaaggaaatttcagttgaaggtgcagacccagtctggtacaatatgattcaacaaagccttgtgactgacaaggtattttccttttggttaaatcgaaatgcaaacgatatcaatgggggtgagattgtgtttggaggtgctgacgagagccattacaaaggtgatcatacatacacccgagttactcggaaagcttattggcagtttgaaatgggagattttcttattggaggcaggagcactggaatttgtgttgacggttgtgctgtcatagcagactcaggaacttcgttgattgctggtcctatagctgctattgcgcagatccatgcacatattggagccaccggtgtggcaaacgaagagtgcaaacaagttgttgctagacatgggcatgaaatgctagagttgctgcaagataagacaccaccagcacaagtgtgttccaaaattgggctctgcaaatccgatggagcgcatggaattagcgatggcattgagagtgtgctgggtgagacgcacaaatctgcagacgaagtttctgacgctacgtgtaatgcatgtgagatggcagttacatggatgcagagcgaatttgttcagaaccatacaaaggagggcaagttggagtatgctaatcagctctgtggcaacatgcctagcccagtaggatcatatgtggactgcagacacatcggtcacttgccgaacgtcgcattcagcataggtggaagagcatttgagctgacaccggagcagaattttttcacccgttgcaacgcacgggtatttttgctagtggattataaaatataa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGHTASRICTLLSILFVSCMLASAANDGLIRIALKKRPIMESIY GELVPKSGTVDHEVALGYSGVRMNSADEGFYDPVTEAINHVRVHQQRMLRDIEAAAME GRLKHFWSYRGFRERGSLKNGTQNHPLALKNFLNAQYFGEIGVGCPPQNFTVVFDTGS SNLWVPSAKCVFSLACYFHRKYESRSSSTYMENGTPASIHYGTGSIHGYYSQDQVTIG DLVVNNQEFIEATHEPGLTFLAAKFDGILGLGFKEISVEGADPVWYNMIQQSLVTDKV FSFWLNRNANDINGGEIVFGGADESHYKGDHTYTRVTRKAYWQFEMGDFLIGGRSTGI CVDGCAVIADSGTSLIAGPIAAIAQIHAHIGATGVANEECKQVVARHGHEMLELLQDK TPPAQVCSKIGLCKSDGAHGISDGIESVLGETHKSADEVSDATCNACEMAVTWMQSEF VQNHTKEGKLEYANQLCGNMPSPVGSYVDCRHIGHLPNVAFSIGGRAFELTPEQNFFT RCNARVFLLVDYKI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..519#630..690#1192..1286#1379..1491#2032..2200#2329..2368#2458..2522#2702..2815#2950..3014#3124..3277#3350..3466#5041..5097#atgggtcacacagccagtcggatatgtacccttctctcgatcctcttcgtttcttgtatgcttgcatctgctgccaatgatggactgatccgcatcgcgctgaagaagagaccgatcatggagagcatctacggtgaactagttcccaagagtggtacagtggaccacgaggttgcacttgggtattctggcgtcaggatgaattcggcagatgagggattctacgatccggtcacggaagccattaaccatgttcgtgtgcatcagcaaagaatgctcagggacatagaggctgcagccatggaagggaggctcaagcatttctggagttacagagggttcagagaaaggggtagcctgaaaaatggcactcagaatcatcctctagcgctgaagaactttctgaacgctcagtattttggggagatcggagttggctgcccaccgcagaattttacggtggtctttgacaccgggagctccaacctctgggtcccttccgccaagtgcgttttttcggtaagaagctacggcaacacatgttttttcttccttacttttgcattttgggattcatgttatgctaggttgataactcacttatttcttttttgctgttgtgggaacagcttgcctgttacttccatcggaagtatgaatcaagaagttccagtacttacatggagaatggtattctttctctaccagatatctaccaatttagtacattgtggattgtttgttgctcagattctgtactagttctcaaatttgaaaaaaatctgtgataggaaaacttagaaggggaaagtgtgggtgtgctctgtgacaagttcaagtcaactttaactcaattttgtgttaccatctattgtcaaatcatttatctaacaattcagcttccaattgctagatattctcagctgaatgaacttcatgtgggttaactactcacccaatatactttaggtgaaaaagccataaaaataagatataaattggtttcttagttgaattatatttgatttgacatcatttcagcctctgtttctttctatccgtgttatacatttttttttctgatagtacttgccaaagaatacatattttttattattattatacatagtgcttctaataggactaatacttcgtgatgatctcacctctccatttccatgtgttattcaggaacacctgcttccattcactatggaacaggatctattcatggttattacagtcaagatcaagttaccattggtgatctagttgtcaataatcaggttcttttatcattttcgaaattatatgcttaatctgacagaacactatgaactgtcaatgctcatgttactgaactgaattatgttcccaggaattcattgaagctactcatgagcctggtcttacgtttctagcagcaaaatttgatggcatccttggacttggatttaaggaaatttcagttgaaggtgcagacccagtctggtatgataatttcaactatgatattactgtagtttttcaggatgtttgaataatgaattagtcggtgccattgttctggtgtttgtttgtttttttttatgacccttatttgacatgaatcaatcaccacatcttgattcagtccgggagtgatctcaagatggttgtatcatcttgatgtaattatctttatttcaataaaatctttcttttctaaaaacatcttgattcagaagttgggatggaagtaatccttttttccactgcatacttcaatggctgtctccttttttttaatggtcaagccaattttatgacacaaatcctaataacaacgacagcacaaatcttgctgatatatattgctatcatttaccacggtaacacctgcaatatcacctagtgtttggttttctttgtgaacctcttgttgttcattaaatgggaacctgatacaaagtatgccataaatatttttgtgacttatcacttgactgtcctgtttttttgtggcatttaacattttcagtagtctaccaggtacaatatgattcaacaaagccttgtgactgacaaggtattttccttttggttaaatcgaaatgcaaacgatatcaatgggggtgagattgtgtttggaggtgctgacgagagccattacaaaggtgatcatacatacacccgagttactcggaaagcttattggcaggttagcagtaagtttcagtcttcataagttacatagtacagttgcctgacctgaatcttctataatttgtcctttctacaaacttttttgaaaatttaactttgtttccatcatcggtaaacgtgcagtttgaaatgggagattttcttattggaggcaggagcactggtaatgctctatgctagtttgcttttccagttccaggtctacaaataattgcgttcctcttgcctgattgatgatgtatgtcatgacaggaatttgtgttgacggttgtgctgtcatagcagactcaggaacttcgttgattgctggtcctatagtaagcgatccatatccttccacatgtttcatcttaactttgataattttcttttatgtttgttgcatagcaaatcaaagtactcactgaatccatcgtctcagtgagaggtttacttttatttttattttattttatgtttttgagaggtttatattggattacttgctgttgtgtaggctgctattgcgcagatccatgcacatattggagccaccggtgtggcaaacgaagagtgcaaacaagttgttgctagacatgggcatgaaatgctagagttgctgcaagataaggttggagctctcttcttcagagtgacttgcatttgctgtacttactacttcgtcagcaagatgcaatgtctccatttctgtttctttcacttcagaatctcaactccatatgcatggttggatgttgattgcagacaccaccagcacaagtgtgttccaaaattgggctctgcaaatccgatggagcgcatggaattaggtgctgtggcaaattaaacaacatttttctagaaaaagaaattcttctttgtactttgtctattttggatttccatcataatcgtatatgcttcttctgaattcatcagcgatggcattgagagtgtgctgggtgagacgcacaaatctgcagacgaagtttctgacgctacgtgtaatgcatgtgagatggcagttacatggatgcagagcgaatttgttcagaaccatacaaaggagggcaagttggagtatgctaatcaggtatggctatacgaagtgttactgtttttattcatcgaacagttctaaaccagtagccgtgttgaatgacagctctgtggcaacatgcctagcccagtaggatcatatgtggactgcagacacatcggtcacttgccgaacgtcgcattcagcataggtggaagagcatttgagctgacaccggagcaggtattgctctctaatagagtattagtattatgtctttctttctttctgttttgctgcttccctgaatattccccggaattccaactcttattagaatatacttctctactacttaaaaaaataagggatgcttacttcgtctgtcaaaaaaaatagcgaaaaaataaaaaaaagtccgactccttcgtctgtaaaaaaaatagcgaaaaaataataataaaaaaggtacgactccttcgtccgtaaaaaaaatagcgaaaaaataaaaaaaaaagtccgactcctattcctctcagaaaaaaaaagtccgactctatatccgattcccctttaaaaaggaaaaaataaaaggcaccacttatttcggtttgagtctgagatcccaggcaccctcctctcggtttcaatctatacaatgatatcacatacatcttggtgaaaaaaattgatgtgccgaattgaagatctatttgcaaaaatggaacctacaggtcgagagcatttcattttcatatgattttaattacttttgcattcgagtccctataatttttatatttacatttgagtccctataattttgcaataaggtacttgaggttgtttttgttaaaaaaatgataaaagtgagagaacaaaggcagaaaggtgcataaaaagaaaaagaaaagccgcaaaaaaaaaaggaaaaacaacaacaacaaaagtccgtttcccctaagtgaaaaaaatggttcgtaaaaaataagaagctggttcgtataaaataaaaaatgcatgtgagaaaaaaatggaaagggcgaaacaaagtccgatttctaatcagtatatatctcttctctatctctaatctaatctaactatttaaaaatagaaaatacacgagaaaataaaaaccgttcaaaaaacgcgtgagaaaaaagtcagaaaaaagcacaaaaaaaacacactaaaaaggttttacatcttccataaaacaaaaaaaaaagcgcgagaaaaattatttccatcgctggtaaaaaatttttaaaaaaaacatgcgaggagaaaactgtcaaaaaaagcgccatttctaaaaaaaatggtttgaaaaaaccgcgcaagaaaaaaaaacaccatctattaaaaaacaaatcgctctgaaaaaactgtcagaaaaaacactaaattgatggacacttgagtcggatagaatccattgattttttgccatctactacacggcttttatttcgtcacatattctcctgtattggaaaaaagcaaaaaataacatttgaaaaaaacaagaaaaaaacgcgtgagaaaatgattgttagaaaaaacatgcaaaaaacacacgagaaaataaaagaaaaaaaggggagaaaaatatggttttcatcgtcagtaaaaaaagtaaaaaaaaacatggtaggaaaaaactataagaaagaaatgcgccatttctgaataatagttcgagaaaatcacgcaagaaaaaaaaacaccgtttataaaaaaacaagccgctcatcataatacaaacattgtcattaacatgattatgcatgaaaaacatatattatcattagaattttttcacccgttgcaacgcacgggtatttttgctagtggattataaaatataa</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
