Os01g0679000
| Gene Name |
Os01g0679000 |
|---|---|
| Description |
RNA polymerase III subunit RPC82, C -terminal domain containing protein |
| Version |
NM_001050398.1 GI:115439166 GeneID:4325277 |
| Length |
8172 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0679000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:29694647..29702818 |
| Sequence Coding Region |
29694707..29694775,29694914..29695058,29695148..29695254,29696421..29696506,29696667..29696817 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:29694647..29702818 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:29694647..29702818 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggtgtcgcagcacgggatcctcctcgccgtcgccatcatctccgaccacttcggccccctcgtatccaaggtgtgccgctgcctgctccgccacggcgcgctgccgctgcaggagatcgtccgccgcctcgagctctcgccggggcaggtgaagaactcgctcctcgtcctcatccagcacaactgcgtgcaggccttcaatgcccccagaggaaatggtgataagacggtaacgcactacctggccatcttcgacaacatcgtgcacagacagcgtttctcaaagttcctttctatcatccgtgcagacatcccagagtcagaagcgctgcttgaaggattgcttcagaatggtaggctaacatttggccaacttgtggagcgaacaatttctaaagtaccagaaggcagtatcacaccagcaagggaggaaatacgaatgaacttcaacaaacttgtatttgcacattatgtggagcgttgcccgaaacctgaacctttctttgatccacttgtagatgaacaatctacctcgtcaaggaaacgtgctccaaaaactgtcgagattgctctttcaattgataagaaagttgtcaatactgcagctctttctgatgcagaaagattttctgagatcccatacatcatggaagatgcatccaatgctaatgattctccacgttcttctatttctggtgctaagaggaaacataatgccttagaaggagatgcagagctcgattcaacaattgcagagaacgaagtactttggcgggcaaattttgagaaattcacattctgtctaaagaagaagttttgtgcagaccgaaagaaacctaagttgaaggttggcacacatcctatctgggaagcatttttcgaggccagtttaatggaaagggacaacaactctgtgacatctccaataaatggtattatggagaggctaggacagaaggaaggaggtacatcgatgacacttgatcatataacaagagttttggaggagttgaattgtagtccttcctcagaggacccagattcattcattttggatttaagcagaattgttgaagcatctcgaaatgaggagatagagtcgcttgtgagaaagaaatacgggcaagaagcttttacaatttttaggctattggtcagagaacgcggtccagttgagacagataaaattattgacacaacaattcttgacaagcagattgttcatggaactttgtataagctttggaaggacgactacatcgatacagagagaatcctttctggaacaggaacagggaacacacaatattttgtatggagagtgaaaaatacattccgggaacagttcatcgataatctatgtcatgctgctttaaacctgcggcaaatggtcaattacatagctgaactcctactcgagggctcaaaggatgacacaaagttgcggaatagaaaaaatattttgatcttagccctgactagacatgacgattctctcatgctgtttcaggatttttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MVSQHGILLAVAIISDHFGPLVSKVCRCLLRHGALPLQEIVRRL ELSPGQVKNSLLVLIQHNCVQAFNAPRGNGDKTVTHYLAIFDNIVHRQRFSKFLSIIR ADIPESEALLEGLLQNGRLTFGQLVERTISKVPEGSITPAREEIRMNFNKLVFAHYVE RCPKPEPFFDPLVDEQSTSSRKRAPKTVEIALSIDKKVVNTAALSDAERFSEIPYIME DASNANDSPRSSISGAKRKHNALEGDAELDSTIAENEVLWRANFEKFTFCLKKKFCAD RKKPKLKVGTHPIWEAFFEASLMERDNNSVTSPINGIMERLGQKEGGTSMTLDHITRV LEELNCSPSSEDPDSFILDLSRIVEASRNEEIESLVRKKYGQEAFTIFRLLVRERGPV ETDKIIDTTILDKQIVHGTLYKLWKDDYIDTERILSGTGTGNTQYFVWRVKNTFREQF IDNLCHAALNLRQMVNYIAELLLEGSKDDTKLRNRKNILILALTRHDDSLMLFQDF</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>61..129#268..412#502..608#1775..1860#2021..2171#2618..2764#2961..3071#3490..3589#4057..4197#5239..5276#5390..5482#5686..5769#7043..7192#7847..7945#ctctccccccttcccgcgagggtttaggcgcggcggagccaaacctcgccgccggcgaccatggtgtcgcagcacgggatcctcctcgccgtcgccatcatctccgaccacttcggccccctcgtatccgtaagcctccccccccttctctcggcctcctccccttccatcgttcgcttcgtactcccccccccccccccgcgcgctgcgtctgcgtctcctcgtgcttgtatgccctaaccgccgccgcccgatcccctctcgcagaaggtgtgccgctgcctgctccgccacggcgcgctgccgctgcaggagatcgtccgccgcctcgagctctcgccggggcaggtgaagaactcgctcctcgtcctcatccagcacaactgcgtgcaggccttcaatgcccccagaggtgagccccatctgcaaatccgcttgcttgtatgacctgattcggtgcgctgattgtatcatatgtgactccattgtctgggttgttaggaaatggtgataagacggtaacgcactacctggccatcttcgacaacatcgtgcacagacagcgtttctcaaagttcctttctatcatccgtgcagacatcccagaggtccttgcttgtttttggttttactttatgcagtattacatggttaaaattgaaattgaccctaaaagctgccatagtttgcgaaatgctgatatgtgatttcaatgtagtcagattgtacttgtttttggttttactttatgcagtattacatggttaaaattgaaattaaccttaaaaagctgccatagttctcgaaatgctgatatgtgatttcaatgtagtcagattgtacttgtttttggttttactttatgatggttaaaattgaaattaaccctaaaagctgccatagttctcaaaatgctgatatgtgattttagtgtagtcagattgtactgtaaatcttgttctccacttttgtaatgtgggagttaaatgcatcctgaccatgattaatgttccagagtggatggcatgcggctcttcttattagcacgctaatgtttttgtatttcaaaataatctagtatgtatgcacacataagttgtctttggttgtccttgtcataatttttaccattcatagcactagaagtgccactgatgcaacaggatagctaatactttatatctggagtttgttattcagcactgtcaagctattgtactgctgatctgattttttttcttactccattaaggagcatacctgcttttcactgctaaacccctctcttgtacacaatgttttccatctcatattccccatttgttgaggtttgcagatgtaatgtttgacctaatgttttatttgtattgtcggtacatcattataaaaaaatgataactggtagaaaacattatgagtttttagtaatttactgtagaaatttctgtatcaagcctacatgtttaacttgattaatgaaagaccttagtaccttactatgttggttgtaagaaacaaaattatatgatccccatcctgaatgtttggtttttctgtcagttggtaagtaggccagcaattattggtttttaatatttatatccaaatatcttaacttattttctgatagtctatgctagtttacccacaaattttatcagttcattctcaaagctgaagaatctgcttgaatacccactattttgtggtttcgtgactcaattcttgtgacttagtttgatgaccttatgcatgcatcttatatttctttcagtcagaagcgctgcttgaaggattgcttcagaatggtaggctaacatttggccaacttgtggagcgaacaatttctaaagtaccagaaggcgagtcccattattcatgttgctattccttcgcccttggttccttttttattagtgttctctttcattttcttcttctaaacttctctttttctgtggccacaactgaccattatagttttttttttctttctcaacaatgggtcattacatgttccaggcagtatcacaccagcaagggaggaaatacgaatgaacttcaacaaacttgtatttgcacattatgtggagcgttgcccgaaacctgaacctttctttgatccacttgtagatgaacaatctacctcgtcaaggaaacgtgctccaaaagtaagttaatcattagttcctagcatgggcattgatttgtttaggtttttggagtttcaatcatctacttctactttctagtttcatcttatttatggttttctttgtttggtccgttggccaatggaagattggtagaaaatgactagacttctattagtatagtacttttgtgtttgtagttagatcacctaaaaatgataatttgttacctgcaaatgtgttagctcagtggttaaggaattttgtatcctgcttttatgttggctgtcactaaaacatatctctttttttacgtatatagatattcaatatttaaaagtggttatctactaaatccaagaccttgatgcttcgaagtgttcctgtcttttcttctcttgatgcgttctgtgtatgatgatcgggtgggtgagcttcgcctgactaatatctctttggaacagactgtcgagattgctctttcaattgataagaaagttgtcaatactgcagctctttctgatgcagaaagattttctgagatcccatacatcatggaagatgcatccaatgctaatgattctccacgttcttctatttctggtgctaaggtattgcactcttgaaccccctccaagaggtgtattggttctgccattctgttaaactagaaaaacaaaatggcattcatagattgattgttttatcaatatgttatatgcaagtattgatggccaatgaagaacctatttgagaaatttatatactttggtcatcagctaattctatgtactgttatttcatcagaggaaacataatgccttagaaggagatgcagagctcgattcaacaattgcagagaacgaagtactttggcgggcaaattttgagaaattcacattctgtctaaagaagaaggtttgctgctttacctatatataacattactttcaatagccaatttatgtaggtgcatgttttcattttttttccctgtagtggtgctatgctattttgtgtatttgcaaaagggaattttgaagcagcagccttattttgcttggtgcaagctcaatgcatttctcatattgctacttgatatgatatttttaacaaacagtagaaaggatcctaatgaaaaaattataagtatatgcacagagaagcataaagaggagataagaaatcccagggccttcttgaacagtctccatctcgaagaagagaattgccagtttttaagtatctgtctctgcatgtatgcatgatgcaactgaatgcaaggcaatgaattttgttatcgcctacaattgaattctttcttctcgtattcaagttttgtgcagaccgaaagaaacctaagttgaaggttggcacacatcctatctgggaagcatttttcgaggccagtttaatggaaagggacaacaactctggtaatagccatataagtatatcaagtaatctttcaatattagagccagaaaatacctcaatattatgttatggctgtagcttatcatttatatgtctgaacataattatttttgtttgttaggaagcttatatagttatatagaggtcatcaagaaagatcaggcatgttttgtgttgttttctactgttgaccaaattgcgctagctgttcattcgaactgcttttttagttatgtttatgcaatgacaactgatcttctatgagcaagatgagaatgacagtggtagttttttttttaattaattttcttatctcctcttcctttgtactttctgttttcctttagatttttccatttgaagggaaaggggtaagatagatatactggcacaatgacatcttaccatttaaagtagtggtttagtttaattcaagtatttaccagtagattttctatttattcagtgacatctccaataaatggtattatggagaggctaggacagaaggaaggaggtacatcgatgacacttgatcatataacaagagttttggaggagttgaattgtagtccttcctcagaggacccagattcattcattttgggtaagagattattaaatgttatgttattttttgttactatggtatagatataattcatcaaagcgacaattcatttatagcacttggtaaataggagactagagtatccaagcagtaatagtctagttttgaacttgactctggtcattgatttgattccttgatatattacaaaataatgtcaaatgtaacagttgatttgcttatggacctaatggtgtagagaagaaaatataaagctgctgctatcttattcaacgtttcctatccttactcaatatgaatgcagattggtgatttttggtgctactcttcctgtcttcctgatgcaatattattttatccttgttttcttcttttttcctttttaactcttctcatgcttttctttatgttccctttcttcatttctttcatacgatggccaacttttttaagaaaaagaataggaatacaatatcatattcccaggtttgtggtgccacagccatgtggtttgatatgtagccaagtaggcattctgtattagtgttatcaatggtgggaaggaaagtgggaattgcaattcttgcatgttcactcaatttgaaactttgatatgcccctttatttggagtttcacaaatctattaacatatcattagatttccaactctattgtgttgagtaatgaatgacctagagttgacttttggtgatacctttgctgtatggtttctcttgggggttggtacctagtgcagaatatctatacacagaaaaatgcaatggtagctaagagactaaaatgtttttgtctttaaatatttgtaaaaaaaaattagaacaatggttcatatgctcatcaacttgatcgggcacgctagattattacaagtaaaaacataatcaaatacacgagtttgcaaaatatacttttacatgtggataacgagttattttaaaaaaaaatgtcgcgcgtaaaatttgtcgcaaccttgaataaacatcagtgcttccttttgtaagattcttagatgacagtggtactactctttgtagatttaagcagaattgttgaagcatctcgaaatgaggaggtacataattgcttcacagttttatgttctatttgtttgaaagctactattataccattttacttggcgtataaagatgacagcatatttgttcctgtatttgtgcataatagatagagtcgcttgtgagaaagaaatacgggcaagaagcttttacaatttttaggctattggtcagagaacgcggtccagttgagacagataaagtaagtatctcctacagcgagcaaattttagaattctaatatatcaggttttcaattcattgctgttatgaaagcatctaggccttttcatgctttatctttattacatgctggtcttcctattttacgatgtttggttggcaaaatggtttcctgttatgaactgcagtaaataacactggacatttggtcgcaccttgcagattattgacacaacaattcttgacaagcagattgttcatggaactttgtataagctttggaaggacgactacatcgatacagaggtctgttacataatctacagagaagttacatatgttgtttggagtatggacttcctctagtttactccctccgtttcacaatgtaagtcattctagcatttcccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctacattcattaacatcaatatgaatgtgggaaatgctagaatgacttacattgtgaaacagaggaagtatattctagagtaaagagaaggcagcaaaccgctttacatgttaatgagggtttacaccttaccataccagccagacaacccttattagttttagagatgcatcaggatatattgtgtttatttccagcctaaatttatagagattagctaccattaagaaggctgtttaagcattgatgcaaagctttgaacctgccataaaattgattgtgatactaaacatagggattactgacttaaatgtggcttgaccccagaagaacttacatgcaaagagcagcctaatatgttttaaaggcatatctgggatgctggctcttttctgaatagtgctccaaacactaatgtatgccagtcaaaaaagactgtattttggaacatttaggtgttctagaggcacttatatttgatatttgatccagagcaaacaatttgtaaattttcatgcaactagcaaaaatgcacatacttatttggaaatatggtattcacttgattcaaatgaatattagactattacatactactagaaaaatatcaatgactaatttgtaagacgtgcaaatgtagtggtggtgggttggcagaaccaccaccactattgtattttatagtagtatagatatagatagatgttgcccaaaaggggagaagtttttttatctggcagctttgagcttttgcttttctggagcaaaattttcacaacacctatgttaagccaaggaatctagtcaattgaccaatctgttatgaatcaaagctgatgacaataactcctacactattatagacatgtataaccatgcaaaatatttgtaggggtgactgtgtccgtgcaactttatagttacaattttttttatgttttccctcccatatcattctcccaagtacacttcctcacctgtaggataattagtggagttaaagtgcataaatttcatatgcatgcaccatgccactgagatagttgtatatggatgttctgtatgttaaacaataaaactatgcttcgtttgaacttctattgatggtaatttcattgtgtttgcagagaatcctttctggaacaggaacagggaacacacaatattttgtatggagagtgaaaaatacattccgggaacagttcatcgataatctatgtcatgctgctttaaacctgcggcaaatggtcaattacatagctgaactcctactcgaggtcacatactgatctttaaagcattgcaaatttacaatcttcaaataagtcttaccttgcttaaatatgtgcttccattgtggatcatcatagtacatgcaacaccacattcatggcaaatcaaattgtggtgcatatattttaatcatgttcttataagcttatttggtcaggtccaggctgtgcctttcactagttaattgcaaattcagaacaggaatataagtagccactagaacatagacagtctcgaattcacatgtttgatcgttaccttttctactcagttctacaaaaatattaaaaatctaactgcatgaaagcatttttcacgacaaatctactaatgtcattttcagatattaaatcttaatgttgcatgtactaatgttttaaaataaggtttggttgtgcatattccaatatgtcatactattagatattccagaaataccaacatgtaacaaattataatgtattcaatgctctgtggctgtcataaccagaactggctgttctgcatggttgataaaacgatgtaatactaaattatgaattgggatggcatttatatttggtagcttaaaggagttttcactcaaactgctatgtactcaagtgaacctcacattgtttatacataatgcatttcagggctcaaaggatgacacaaagttgcggaatagaaaaaatattttgatcttagccctgactagacatgacgattctctcatgctgtttcaggatttttgaaacgctgtagcaggtgttccagcatctttcttccatacttaatcatacttcttttgagctagatggtggaatatcatagtttattttgcacccaggcttttattgggtcaactggcttaggattaaccaacgctttccctaggccaatcgaaccaacctttccttttggcatttcgtttcaaaccaaagttcggaaatgaaatcctttggtatattggacccttgtg</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
